Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400053572
CDS Infomation

pacid=37467811 polypeptide=PGSC0003DMP400036122 locus=PGSC0003DMG400020783 ID=PGSC0003DMT400053572.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAGGCAGGTGCTGGAATGGTAGCTGGATCTCACAAGCGCAATGAGTTGGTTAGGATT
CGACATGATTCTGATAGTGGGCCGAAACCCTTGAAGCCTCTCAACAGTCAAATATGCCAA
ATTTGTGGTGATACTGTTGGGTTGACTGCTACTGGTGATGTATTCATTGCTTGTAATGAG
TGTGCCTTTCCTGTTTGCCGGGCTTGTTATGAGTACGAGCGTAAAGATGGAAATCAATCA
TGTCCTCAATGCAAGACCAGATACAAGAGGTTCAAGGGGAGTCCACGAGTGGATGGAGAT
GATGACGAGGAAGATGTTGATGATATCGACAATGAGTTCAATTATGCTCAAGGAAACAGC
AAGGCCAGACAGCAATGGCAGGGTGATGATGCTGGTCTCTCTTCATCCTCTAGACACGAA
TCTCAGCAACCGATCCCTCTTCTTACAAATGGCCAGCCAGTATCTGGTGATTTTCCTAGT
GCAACAACTGATACACAATCTGTAAGAAGTATGTCAGGACCCTTGGGCCCTGGAGACAAA
CATTCATCCCTGTCTTATGTTGATCCAAGACAGCCTGTTCCTGTAAGAATTGTGGACCCC
TCAAAGGACTTGAATTCTTACGGGCTTGGAAGTGTTGACTGGAAGGAGAGAGTAGAGGGT
TGGAAACTGAAACAGGAGAAAAATCTGGTGCATTCGACAAACAGATATGCCGAAGGGAAA
GGCGGAGACATTGAAGGGACAGGGTCGAATGGAGAAGAGCTACAAATGGCTGACGATGCT
CGCCAGCCTATGAGCCGTGTGGTGCCTATTCCTTCATCCCATCTTACCCCATATCGGGTT
GTTATCATTTTGCGGTTGATCATCTTGGGCTTTTTCATGCAATACCGTCTAACTCATCCA
GTGAATGATGCATATCCTCTGTGGCTAGTATCAGTTATTTGTGAGGTTTGGTTTGCCTTG
TCCTGGCTTCTCGATCAGTTTCCAAAATGGTCACCAGTCAATCGTGAGACATTCCTTGAC
AGGCTAGCTTTGAGACATGATAGAGAAGGGGAGCCTTCGCAGCTTGCACCTGTTGACGTC
TTTGTCAGTACAGTGGATCCTTTGAAAGAACCTCCTCTCATTACTGCAAACACAGTGTTG
TCCATCCTTGCTGTTGATTATCCTGTGGACAAGGTCTCATGCTATGTGTCAGATGATGGT
TCAGCAATGCTAACGTTTGAAGCCCTTTCTGAGACCGCAGAGTTTGCAAGGAGATGGGTA
CCCTTCTGCAAGAAATTCAGCATTGAGCCTCGGGCCCCTGAATTTTATTTTGCTCAAAAG
ATAGATTATTTGAAGGACAAGGTTCAGCCTTCTTTTGTGAAAGAGCGCAGGGCAATGAAG
AGGGAATATGAAGAATTTAAAATACGTATCAATGCTCTTGTTGCAAAAGCACAAAAAATG
CCTGAAGAAGGTTGGACAATGCAAGATGGAACAGCTTGGCCTGGAAATAACCCTAGGGAT
CATCCAGGAATGATCCAGGTCTTTTTGGGGCATAGCGGGGGCCTTGATACTGATGGAAAT
GAACTTCCTCGTCTGGTTTATGTTTCTCGTGAGAAGCGACCAGGTTTCCAACACCACAAG
AAAGCTGGAGCTATGAATGCTTTGATTCGTGTTTCTGCAGTTCTTACCAATGGAGCATAT
CTTTTGAATGTCGATTGTGATCACTACTTTAACAACAGCAAAGCACTTAAAGAAGCTATG
TGTTTCCTCATGGATCCTGTTCTTGGAAAGAAGACATGCTATGTTCAGTTCCCTCAGCGA
TTTGATGGCATTGACTTGCACGATCGATATGCTAACCGAAACATTGTGTTCTTTGATATC
AACTTGAAAGGGTTGGATGGTCTTCAGGGTCCTATGTATGTGGGAACTGGGTGTTGTTTT
AACAGGCAGGCTCTATACGGGTATGATCCTGTCTTAACTGAGGCAGATTTGGAGCCAAAC
ATCATTGTGAAGAGCTGTTGTGGTGGGTCAAGGAAGAAGGGAAGGAGTGGAAACAAGAAA
TACATTGATAAGAAGAGGGCTGTAAAAAGAACAGAATCCACTATCCCAATTTTCAATATG
GAAGACATTGAAGAAGGTGTAGAAGGATATGATGAGGAGAAGTCACTGCTTATGTCACAG
AGGAGCTTGGAGAAGCGGTTTGGTCAATCACCAGTGTTTATTGCTGCCACCTTTATGGAA
CAAGGAGGCATTCCCGCATCCACTAATCCTGCATCTCTTTTGAAAGAAGCAATTCATGTT
ATTAGCTGTGGCTACGAGGACAAGACTGAATGGGGAAAAGAGATTGGGTGGATCTATGGA
TCTGTCACTGAAGATATTTTGACTGGGTTTAAGATGCATGCACGAGGATGGTATTCCCTA
TATTGCATGCCTCCTCGACCAGCGTTTAAAGGGTCTGCTCCTATCAATCTTTCTGATCGT
TTAAACCAGGTGCTCCGGTGGGCCTTGGGTTCTGTTGAAATCCTGTTGAGTAGGCATTGC
CCGATATGGTATGGCTACAGTGGCAGATTGATGCTTCTGGAGAGATTAGCCTATATTAAT
ACCATCGTCTATCCTCTCACATCTTTACCTTTGCTTGCTTACTGTACGCTTCCTGCCATC
TGTCTTCTGACCGGGAAATTTATCATTCCTGAGATAAGCAACTATGCTGGCATGTGGTTC
ATTCTACTCTTTCTTTCCATTTTCGCAACTGGTATATTGGAGCTTAGGTGGAGTGGTGTG
AGTATTGAAGACTGGTGGAGAAATGAACAGTTCTGGGTCATTGGTGGTACATCAGCTCAC
TTGTTTGCAGTTTTCCAAGGTCTCCTGAAAGTGCTTGCTGGGATTGATACCAACTTTACA
GTCACGTCAAAGGCAAACGATGAGGATGGAGATTTTGCTGAGCTTTATGTGTTCAAATGG
ACGACTCTCCTTATTCCTCCCACAGCAATCCTTATCATGAATCTGGTAGGAATTGTGGCG
GGTGTTTCATATGCCATAAACAGTGGATACCAATCATGGGGTCCTCTATTTGGGAAGTTG
TTCTTTGCCATTTGGGTCATTGTCCATTTGTACCCTTTCCTCAAAGGTTTGTTGGGACGT
CAGAATCGTACTCCTACCATTGTCATTGTCTGGGCAGTTCTCCTTGCATCCATATTCTCA
TTGCTTTGGGTGCGTATCGATCCTTTCACATCAGACGCGTCAAAGACTGCTGCAAGAGGT
CAATGTGGTATCAACTGCTAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400036122
PEP Infomation

pacid=37467811 transcript=PGSC0003DMT400053572 locus=PGSC0003DMG400020783 ID=PGSC0003DMT400053572.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MEAGAGMVAGSHKRNELVRIRHDSDSGPKPLKPLNSQICQICGDTVGLTATGDVFIACNE
CAFPVCRACYEYERKDGNQSCPQCKTRYKRFKGSPRVDGDDDEEDVDDIDNEFNYAQGNS
KARQQWQGDDAGLSSSSRHESQQPIPLLTNGQPVSGDFPSATTDTQSVRSMSGPLGPGDK
HSSLSYVDPRQPVPVRIVDPSKDLNSYGLGSVDWKERVEGWKLKQEKNLVHSTNRYAEGK
GGDIEGTGSNGEELQMADDARQPMSRVVPIPSSHLTPYRVVIILRLIILGFFMQYRLTHP
VNDAYPLWLVSVICEVWFALSWLLDQFPKWSPVNRETFLDRLALRHDREGEPSQLAPVDV
FVSTVDPLKEPPLITANTVLSILAVDYPVDKVSCYVSDDGSAMLTFEALSETAEFARRWV
PFCKKFSIEPRAPEFYFAQKIDYLKDKVQPSFVKERRAMKREYEEFKIRINALVAKAQKM
PEEGWTMQDGTAWPGNNPRDHPGMIQVFLGHSGGLDTDGNELPRLVYVSREKRPGFQHHK
KAGAMNALIRVSAVLTNGAYLLNVDCDHYFNNSKALKEAMCFLMDPVLGKKTCYVQFPQR
FDGIDLHDRYANRNIVFFDINLKGLDGLQGPMYVGTGCCFNRQALYGYDPVLTEADLEPN
IIVKSCCGGSRKKGRSGNKKYIDKKRAVKRTESTIPIFNMEDIEEGVEGYDEEKSLLMSQ
RSLEKRFGQSPVFIAATFMEQGGIPASTNPASLLKEAIHVISCGYEDKTEWGKEIGWIYG
SVTEDILTGFKMHARGWYSLYCMPPRPAFKGSAPINLSDRLNQVLRWALGSVEILLSRHC
PIWYGYSGRLMLLERLAYINTIVYPLTSLPLLAYCTLPAICLLTGKFIIPEISNYAGMWF
ILLFLSIFATGILELRWSGVSIEDWWRNEQFWVIGGTSAHLFAVFQGLLKVLAGIDTNFT
VTSKANDEDGDFAELYVFKWTTLLIPPTAILIMNLVGIVAGVSYAINSGYQSWGPLFGKL
FFAIWVIVHLYPFLKGLLGRQNRTPTIVIVWAVLLASIFSLLWVRIDPFTSDASKTAARG
QCGINC*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400053572
Transcript Infomation

pacid=37467811 locus=PGSC0003DMG400020783 ID=PGSC0003DMT400053572.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAGGCAGGTGCTGGAATGGTAGCTGGATCTCACAAGCGCAATGAGTTGGTTAGGATT
CGACATGATTCTGATAGTGGGCCGAAACCCTTGAAGCCTCTCAACAGTCAAATATGCCAA
ATTTGTGGTGATACTGTTGGGTTGACTGCTACTGGTGATGTATTCATTGCTTGTAATGAG
TGTGCCTTTCCTGTTTGCCGGGCTTGTTATGAGTACGAGCGTAAAGATGGAAATCAATCA
TGTCCTCAATGCAAGACCAGATACAAGAGGTTCAAGGGGAGTCCACGAGTGGATGGAGAT
GATGACGAGGAAGATGTTGATGATATCGACAATGAGTTCAATTATGCTCAAGGAAACAGC
AAGGCCAGACAGCAATGGCAGGGTGATGATGCTGGTCTCTCTTCATCCTCTAGACACGAA
TCTCAGCAACCGATCCCTCTTCTTACAAATGGCCAGCCAGTATCTGGTGATTTTCCTAGT
GCAACAACTGATACACAATCTGTAAGAAGTATGTCAGGACCCTTGGGCCCTGGAGACAAA
CATTCATCCCTGTCTTATGTTGATCCAAGACAGCCTGTTCCTGTAAGAATTGTGGACCCC
TCAAAGGACTTGAATTCTTACGGGCTTGGAAGTGTTGACTGGAAGGAGAGAGTAGAGGGT
TGGAAACTGAAACAGGAGAAAAATCTGGTGCATTCGACAAACAGATATGCCGAAGGGAAA
GGCGGAGACATTGAAGGGACAGGGTCGAATGGAGAAGAGCTACAAATGGCTGACGATGCT
CGCCAGCCTATGAGCCGTGTGGTGCCTATTCCTTCATCCCATCTTACCCCATATCGGGTT
GTTATCATTTTGCGGTTGATCATCTTGGGCTTTTTCATGCAATACCGTCTAACTCATCCA
GTGAATGATGCATATCCTCTGTGGCTAGTATCAGTTATTTGTGAGGTTTGGTTTGCCTTG
TCCTGGCTTCTCGATCAGTTTCCAAAATGGTCACCAGTCAATCGTGAGACATTCCTTGAC
AGGCTAGCTTTGAGACATGATAGAGAAGGGGAGCCTTCGCAGCTTGCACCTGTTGACGTC
TTTGTCAGTACAGTGGATCCTTTGAAAGAACCTCCTCTCATTACTGCAAACACAGTGTTG
TCCATCCTTGCTGTTGATTATCCTGTGGACAAGGTCTCATGCTATGTGTCAGATGATGGT
TCAGCAATGCTAACGTTTGAAGCCCTTTCTGAGACCGCAGAGTTTGCAAGGAGATGGGTA
CCCTTCTGCAAGAAATTCAGCATTGAGCCTCGGGCCCCTGAATTTTATTTTGCTCAAAAG
ATAGATTATTTGAAGGACAAGGTTCAGCCTTCTTTTGTGAAAGAGCGCAGGGCAATGAAG
AGGGAATATGAAGAATTTAAAATACGTATCAATGCTCTTGTTGCAAAAGCACAAAAAATG
CCTGAAGAAGGTTGGACAATGCAAGATGGAACAGCTTGGCCTGGAAATAACCCTAGGGAT
CATCCAGGAATGATCCAGGTCTTTTTGGGGCATAGCGGGGGCCTTGATACTGATGGAAAT
GAACTTCCTCGTCTGGTTTATGTTTCTCGTGAGAAGCGACCAGGTTTCCAACACCACAAG
AAAGCTGGAGCTATGAATGCTTTGATTCGTGTTTCTGCAGTTCTTACCAATGGAGCATAT
CTTTTGAATGTCGATTGTGATCACTACTTTAACAACAGCAAAGCACTTAAAGAAGCTATG
TGTTTCCTCATGGATCCTGTTCTTGGAAAGAAGACATGCTATGTTCAGTTCCCTCAGCGA
TTTGATGGCATTGACTTGCACGATCGATATGCTAACCGAAACATTGTGTTCTTTGATATC
AACTTGAAAGGGTTGGATGGTCTTCAGGGTCCTATGTATGTGGGAACTGGGTGTTGTTTT
AACAGGCAGGCTCTATACGGGTATGATCCTGTCTTAACTGAGGCAGATTTGGAGCCAAAC
ATCATTGTGAAGAGCTGTTGTGGTGGGTCAAGGAAGAAGGGAAGGAGTGGAAACAAGAAA
TACATTGATAAGAAGAGGGCTGTAAAAAGAACAGAATCCACTATCCCAATTTTCAATATG
GAAGACATTGAAGAAGGTGTAGAAGGATATGATGAGGAGAAGTCACTGCTTATGTCACAG
AGGAGCTTGGAGAAGCGGTTTGGTCAATCACCAGTGTTTATTGCTGCCACCTTTATGGAA
CAAGGAGGCATTCCCGCATCCACTAATCCTGCATCTCTTTTGAAAGAAGCAATTCATGTT
ATTAGCTGTGGCTACGAGGACAAGACTGAATGGGGAAAAGAGATTGGGTGGATCTATGGA
TCTGTCACTGAAGATATTTTGACTGGGTTTAAGATGCATGCACGAGGATGGTATTCCCTA
TATTGCATGCCTCCTCGACCAGCGTTTAAAGGGTCTGCTCCTATCAATCTTTCTGATCGT
TTAAACCAGGTGCTCCGGTGGGCCTTGGGTTCTGTTGAAATCCTGTTGAGTAGGCATTGC
CCGATATGGTATGGCTACAGTGGCAGATTGATGCTTCTGGAGAGATTAGCCTATATTAAT
ACCATCGTCTATCCTCTCACATCTTTACCTTTGCTTGCTTACTGTACGCTTCCTGCCATC
TGTCTTCTGACCGGGAAATTTATCATTCCTGAGATAAGCAACTATGCTGGCATGTGGTTC
ATTCTACTCTTTCTTTCCATTTTCGCAACTGGTATATTGGAGCTTAGGTGGAGTGGTGTG
AGTATTGAAGACTGGTGGAGAAATGAACAGTTCTGGGTCATTGGTGGTACATCAGCTCAC
TTGTTTGCAGTTTTCCAAGGTCTCCTGAAAGTGCTTGCTGGGATTGATACCAACTTTACA
GTCACGTCAAAGGCAAACGATGAGGATGGAGATTTTGCTGAGCTTTATGTGTTCAAATGG
ACGACTCTCCTTATTCCTCCCACAGCAATCCTTATCATGAATCTGGTAGGAATTGTGGCG
GGTGTTTCATATGCCATAAACAGTGGATACCAATCATGGGGTCCTCTATTTGGGAAGTTG
TTCTTTGCCATTTGGGTCATTGTCCATTTGTACCCTTTCCTCAAAGGTTTGTTGGGACGT
CAGAATCGTACTCCTACCATTGTCATTGTCTGGGCAGTTCTCCTTGCATCCATATTCTCA
TTGCTTTGGGTGCGTATCGATCCTTTCACATCAGACGCGTCAAAGACTGCTGCAAGAGGT
CAATGTGGTATCAACTGCTAG