Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400052714
CDS Infomation

pacid=37449920 polypeptide=PGSC0003DMP400035538 locus=PGSC0003DMG400020461 ID=PGSC0003DMT400052714.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGTTAAGTTATGGTATTTGGCCTAATAAGTTTACCTACCCTTTTGTGCTTAAGGCTTGT
GCTGGGATTGGTGAGTTGAAATTAGGCCAGACTGTTCATGGGTCAGTGGTGAAACTTGGG
TTTGATGATGATTCTCATGTTTTGAATACTATGGTTCACATGTATTGTTGTTGTGATGGT
GGGGTTGAGTATGGGCGGAAGGTGTTTGATGAAATGCGTAACTGGGATTCAGTAGGGTGG
AGTGCGATGATAGGTGGTTATGTGAGATGGGGTTTGTCTAGTGAGGCTGTAGGGTTGTTT
AGAGAAATGCAGGTTGTTGGGGTAGAACCTGATGAAGTTACGATGGTTTGTTTGTTGTCT
GCGTGTATAGATTTGGGTGCCCTTGAGCTAGGGAAGTGGCTCGAGGCATATATCGAGAGG
GAGAATGTTCCAAAGAGTGCTGTTCTTTGGAATGCTTTAATTGATATGTTTGCAAAATGT
GGTGATGTTGATAAAGCTCTGAGTTTGTTCAGGAGCATGAGTCAAAGGAATATTGTTTCT
TGGACTTCAGTTATAGATGGTATGGCGATGCATGGCCGGGGAACTGAGGCTGTTTCTTTA
TTTGAGGAGATGAAGAAAGATGGGGTTGTACCTGATGATGTTTCCTTTATTGGGTTACTT
ACTGCTTGTAGCCATTCGGCTTTAGTTGAGCAAGGTAAGGGCTACTTTTATTCGATGACA
AAGGAATTTGGGATTTCACCTAAGATAGAACACTACGGATGCATGGTTGATCTGTTATGT
AGAGCTGGACATGTGCAAGAAGCATTGGATTTTGTTCAGAGAATGCCCATTAAGCCAAAT
CCAGTAATTTGGAGAACACTTATTAATGCTTGCCGTGCTCATGGTGAGCTGACGATTGGT
GAAAAAATAACAAAAGAGCTGATAAAATATGAGCCTATGCATGACTCTAATTACGTAATG
CTTTCTAACATTTATGCAAAAATGTTTTCTTGGGAGAAGAAGACCATGATTAGGGAAGTT
ATGGCGAAGAAGGGAATGAGAAAAGTTCCAGGGAGCACTATGATTGAACTATACAACGAA
ATCTATGAATTTGTGTCAGGAGATAAAAGTCATAGTGAGTACAAAATTATTCATCAGATG
GTGGATGATATTGGAAAGGAGATTAGAAAAGCTGGATTTGTTGCTTCAACATCAGAAGTG
TTACTTGATATCGATGAAGAAGATAAAGAAGGCGCTGTAAATAGGCATAGTGAAAAGCTT
GCTATTGCATTTGCCCTTATGAAGACACCTCCTGGAACTCCTATCCGAATAGTGAAAAAC
TTACGAGTCTGTGAAGATTGCCACTCTGCAACTAAATTCATCTCAAAGACTTACAAGCGA
GAAATATTGGTCAGGGACAGAAACCGATTTCACCGTTTCATAGATGGGGTTTGCTCATGC
AAAGATTTCTGGTAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400035538
PEP Infomation

pacid=37449920 transcript=PGSC0003DMT400052714 locus=PGSC0003DMG400020461 ID=PGSC0003DMT400052714.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MLSYGIWPNKFTYPFVLKACAGIGELKLGQTVHGSVVKLGFDDDSHVLNTMVHMYCCCDG
GVEYGRKVFDEMRNWDSVGWSAMIGGYVRWGLSSEAVGLFREMQVVGVEPDEVTMVCLLS
ACIDLGALELGKWLEAYIERENVPKSAVLWNALIDMFAKCGDVDKALSLFRSMSQRNIVS
WTSVIDGMAMHGRGTEAVSLFEEMKKDGVVPDDVSFIGLLTACSHSALVEQGKGYFYSMT
KEFGISPKIEHYGCMVDLLCRAGHVQEALDFVQRMPIKPNPVIWRTLINACRAHGELTIG
EKITKELIKYEPMHDSNYVMLSNIYAKMFSWEKKTMIREVMAKKGMRKVPGSTMIELYNE
IYEFVSGDKSHSEYKIIHQMVDDIGKEIRKAGFVASTSEVLLDIDEEDKEGAVNRHSEKL
AIAFALMKTPPGTPIRIVKNLRVCEDCHSATKFISKTYKREILVRDRNRFHRFIDGVCSC
KDFW*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400052714
Transcript Infomation

pacid=37449920 locus=PGSC0003DMG400020461 ID=PGSC0003DMT400052714.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGTTAAGTTATGGTATTTGGCCTAATAAGTTTACCTACCCTTTTGTGCTTAAGGCTTGT
GCTGGGATTGGTGAGTTGAAATTAGGCCAGACTGTTCATGGGTCAGTGGTGAAACTTGGG
TTTGATGATGATTCTCATGTTTTGAATACTATGGTTCACATGTATTGTTGTTGTGATGGT
GGGGTTGAGTATGGGCGGAAGGTGTTTGATGAAATGCGTAACTGGGATTCAGTAGGGTGG
AGTGCGATGATAGGTGGTTATGTGAGATGGGGTTTGTCTAGTGAGGCTGTAGGGTTGTTT
AGAGAAATGCAGGTTGTTGGGGTAGAACCTGATGAAGTTACGATGGTTTGTTTGTTGTCT
GCGTGTATAGATTTGGGTGCCCTTGAGCTAGGGAAGTGGCTCGAGGCATATATCGAGAGG
GAGAATGTTCCAAAGAGTGCTGTTCTTTGGAATGCTTTAATTGATATGTTTGCAAAATGT
GGTGATGTTGATAAAGCTCTGAGTTTGTTCAGGAGCATGAGTCAAAGGAATATTGTTTCT
TGGACTTCAGTTATAGATGGTATGGCGATGCATGGCCGGGGAACTGAGGCTGTTTCTTTA
TTTGAGGAGATGAAGAAAGATGGGGTTGTACCTGATGATGTTTCCTTTATTGGGTTACTT
ACTGCTTGTAGCCATTCGGCTTTAGTTGAGCAAGGTAAGGGCTACTTTTATTCGATGACA
AAGGAATTTGGGATTTCACCTAAGATAGAACACTACGGATGCATGGTTGATCTGTTATGT
AGAGCTGGACATGTGCAAGAAGCATTGGATTTTGTTCAGAGAATGCCCATTAAGCCAAAT
CCAGTAATTTGGAGAACACTTATTAATGCTTGCCGTGCTCATGGTGAGCTGACGATTGGT
GAAAAAATAACAAAAGAGCTGATAAAATATGAGCCTATGCATGACTCTAATTACGTAATG
CTTTCTAACATTTATGCAAAAATGTTTTCTTGGGAGAAGAAGACCATGATTAGGGAAGTT
ATGGCGAAGAAGGGAATGAGAAAAGTTCCAGGGAGCACTATGATTGAACTATACAACGAA
ATCTATGAATTTGTGTCAGGAGATAAAAGTCATAGTGAGTACAAAATTATTCATCAGATG
GTGGATGATATTGGAAAGGAGATTAGAAAAGCTGGATTTGTTGCTTCAACATCAGAAGTG
TTACTTGATATCGATGAAGAAGATAAAGAAGGCGCTGTAAATAGGCATAGTGAAAAGCTT
GCTATTGCATTTGCCCTTATGAAGACACCTCCTGGAACTCCTATCCGAATAGTGAAAAAC
TTACGAGTCTGTGAAGATTGCCACTCTGCAACTAAATTCATCTCAAAGACTTACAAGCGA
GAAATATTGGTCAGGGACAGAAACCGATTTCACCGTTTCATAGATGGGGTTTGCTCATGC
AAAGATTTCTGGTAG