Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400052553
CDS Infomation

pacid=37445769 polypeptide=PGSC0003DMP400035427 locus=PGSC0003DMG400020391 ID=PGSC0003DMT400052553.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAGGAAAATAAGGTACCATTTCTTACTTCAATTACACCTTCAAAGGCTTCATTTGAT
GCCGACGAAGATGATATTAAAGCGATTAATGGTGTGAAAAGCTTCGTAAAGGAATTTCAT
TACGAATCGAAAAAGTTGTGGTACTTAGCAGGACCTGCCATTTTCACTTCCCTTTGTCAA
TACTCATTAGGTGCTGTTACTCAAATCTTTGCTGGACATGTTGGAACCATTCAACTTGCT
GCTGTTTCTATCCAAATCTCTGTTATTGCTGGATTTTCAGAAGGAATACTGTTGGGAATG
GGAAGCGCACTAGAGACACTGTGTGGACAAGCATATGGAGCTAAACAGAAAGATATGCTT
GGAATTTATATGCAGAGATCATGGATAATACTGCACGCAACTGCGCTAGTTTTAATGTTT
TTGAATATATTTGCCACACAAATTCTAAGATTAATTGGGCAACAAGAGAAAATAGCGGAA
TGGGCAGGGCAATTTTCGTTATGGATGATACCAATGGTTTTTGCTTATGCCTTTGAATTT
CCTATCATGAAATTTCTTCAAGCTCAAAGCAAAATTATGACTATGGCCGTCATAGCTGGA
GTTTCATTTGCTATGCACACTTTGTTAACTTGGCTGTTTATGTTGAAATTGGGTTGGGGT
TTGGCCGCTGGCGCAGTGGTTCTAAATTGTTCGTGGTGGTTTATGGTGACTGCAAAAATG
ATGTATATTTTGTGGGGGAATTCATGTGGTGAAGCTTGGTCTGGATTTTCATGGGAGGCC
TTCAAAAATCTTTGGGGATTTGTTAGATTATCTCTTGCATCTGGGGTCATGATATGCTTA
GAACTTTGGTATTTCATGTCCTTGATTCTAGCCGCAGGGTACGTTGAGGATGCAGAAATC
GCTGTCGATGCTACTTCCATATGTGCAAACATAATAGGATGGACATTCATGTTGTGTATT
GGATTCAATGCTGCAATAAGTGTAAGGGTATCAAATGAACTAGGAGCAGGACATCCAAGA
AGAGCAAAGTTTTCAGTGTTAGTGGTGTCAATCACTTCACTTGTAATTGGTGCATTATTG
ACACTTGTACTCATACTTACACGAAGCCAATATCCACTTTTGTTCACAAATAATGTGAAA
GTACAAAAGATGGTATATGATCTTACTCCTGTATTGGGACTTACACTCTTCGTCAACACA
CTCCAACCTACACTCTCTGGGGTGGCAATTGGAGCAGGGTGGCAAGAACATGTTGCTTAT
GTGAACATTATATGTTATTATGTCATTGGAATTCCTTTGGGTCTCTTTCTTACCTTTTTC
ATCAAATGGGGCATGCCGGGCATGTGGTATGGGATGTTATTAGGAACTACAACTCAAACA
ACTGTTCTCATTTGGATAACTGCAAGAACTGATTGGGACAAGGAGGCTTCTCTTGCTGGA
GAGAGAATAAAGCAACTAGGAGGAAGCAAAAGCTTGAATGTCATTGATGGATATGCCATC
AATTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400035427
PEP Infomation

pacid=37445769 transcript=PGSC0003DMT400052553 locus=PGSC0003DMG400020391 ID=PGSC0003DMT400052553.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MEENKVPFLTSITPSKASFDADEDDIKAINGVKSFVKEFHYESKKLWYLAGPAIFTSLCQ
YSLGAVTQIFAGHVGTIQLAAVSIQISVIAGFSEGILLGMGSALETLCGQAYGAKQKDML
GIYMQRSWIILHATALVLMFLNIFATQILRLIGQQEKIAEWAGQFSLWMIPMVFAYAFEF
PIMKFLQAQSKIMTMAVIAGVSFAMHTLLTWLFMLKLGWGLAAGAVVLNCSWWFMVTAKM
MYILWGNSCGEAWSGFSWEAFKNLWGFVRLSLASGVMICLELWYFMSLILAAGYVEDAEI
AVDATSICANIIGWTFMLCIGFNAAISVRVSNELGAGHPRRAKFSVLVVSITSLVIGALL
TLVLILTRSQYPLLFTNNVKVQKMVYDLTPVLGLTLFVNTLQPTLSGVAIGAGWQEHVAY
VNIICYYVIGIPLGLFLTFFIKWGMPGMWYGMLLGTTTQTTVLIWITARTDWDKEASLAG
ERIKQLGGSKSLNVIDGYAIN*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400052553
Transcript Infomation

pacid=37445769 locus=PGSC0003DMG400020391 ID=PGSC0003DMT400052553.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAGGAAAATAAGGTACCATTTCTTACTTCAATTACACCTTCAAAGGCTTCATTTGAT
GCCGACGAAGATGATATTAAAGCGATTAATGGTGTGAAAAGCTTCGTAAAGGAATTTCAT
TACGAATCGAAAAAGTTGTGGTACTTAGCAGGACCTGCCATTTTCACTTCCCTTTGTCAA
TACTCATTAGGTGCTGTTACTCAAATCTTTGCTGGACATGTTGGAACCATTCAACTTGCT
GCTGTTTCTATCCAAATCTCTGTTATTGCTGGATTTTCAGAAGGAATACTGTTGGGAATG
GGAAGCGCACTAGAGACACTGTGTGGACAAGCATATGGAGCTAAACAGAAAGATATGCTT
GGAATTTATATGCAGAGATCATGGATAATACTGCACGCAACTGCGCTAGTTTTAATGTTT
TTGAATATATTTGCCACACAAATTCTAAGATTAATTGGGCAACAAGAGAAAATAGCGGAA
TGGGCAGGGCAATTTTCGTTATGGATGATACCAATGGTTTTTGCTTATGCCTTTGAATTT
CCTATCATGAAATTTCTTCAAGCTCAAAGCAAAATTATGACTATGGCCGTCATAGCTGGA
GTTTCATTTGCTATGCACACTTTGTTAACTTGGCTGTTTATGTTGAAATTGGGTTGGGGT
TTGGCCGCTGGCGCAGTGGTTCTAAATTGTTCGTGGTGGTTTATGGTGACTGCAAAAATG
ATGTATATTTTGTGGGGGAATTCATGTGGTGAAGCTTGGTCTGGATTTTCATGGGAGGCC
TTCAAAAATCTTTGGGGATTTGTTAGATTATCTCTTGCATCTGGGGTCATGATATGCTTA
GAACTTTGGTATTTCATGTCCTTGATTCTAGCCGCAGGGTACGTTGAGGATGCAGAAATC
GCTGTCGATGCTACTTCCATATGTGCAAACATAATAGGATGGACATTCATGTTGTGTATT
GGATTCAATGCTGCAATAAGTGTAAGGGTATCAAATGAACTAGGAGCAGGACATCCAAGA
AGAGCAAAGTTTTCAGTGTTAGTGGTGTCAATCACTTCACTTGTAATTGGTGCATTATTG
ACACTTGTACTCATACTTACACGAAGCCAATATCCACTTTTGTTCACAAATAATGTGAAA
GTACAAAAGATGGTATATGATCTTACTCCTGTATTGGGACTTACACTCTTCGTCAACACA
CTCCAACCTACACTCTCTGGGGTGGCAATTGGAGCAGGGTGGCAAGAACATGTTGCTTAT
GTGAACATTATATGTTATTATGTCATTGGAATTCCTTTGGGTCTCTTTCTTACCTTTTTC
ATCAAATGGGGCATGCCGGGCATGTGGTATGGGATGTTATTAGGAACTACAACTCAAACA
ACTGTTCTCATTTGGATAACTGCAAGAACTGATTGGGACAAGGAGGCTTCTCTTGCTGGA
GAGAGAATAAAGCAACTAGGAGGAAGCAAAAGCTTGAATGTCATTGATGGATATGCCATC
AATTGA