Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400052414
CDS Infomation

pacid=37457321 polypeptide=PGSC0003DMP400035340 locus=PGSC0003DMG400020346 ID=PGSC0003DMT400052414.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCGATGTTACCCAAGAAGCTTTCCCCAAAATCCCTCTTAAAGCTTCTCAAATCCGAG
AAGAATCCCAACGCAGCACTCTCCTTATTCGATATAGCTTCTCAACACCCAAATTACACT
CACGACTCCATTATCTTCCACCATATTCTCAGGAAACTATCCGACCAAAGATTCATCCCT
CACATGACCCGAATCGTTGATATGATTCAAACCCAGAAATGTTTATGCTCTGAGGATGTT
GCATTGACTGTTATTAAAGGGTATGCGAAGAATTCCATGGTTGATAAAGCTATGGAAGTT
TTTCAGAATATGAAGAATATTTTTGGTTGTATACCTGGGGTTAGGTCTTTTAATACATTG
CTTAATGCTTTTGTTGTTTCGAATCAGTTGAGTAGAGCTGAGTTGTTTTTCAAGTATTTT
GGAACAATGGGTGTGTCTCCAAATTTGGAAACTTATAATGTTTTGATTAAACTTGCTTGT
AAAAAGGGGCAATTTGATAAGGCGAAAGAGTTGTTGGATTGGATGTGGGAGAGTAAGTTG
ATGCCAGATGTGTATAGTTATGGAACTTTGATCAATGGACTTGCAAAGAATGGACATTTG
GGTAAGGCCTTAGAGGTGTTTGATGAAATGTTTGAAAGAGGGTTGTATCCAGATGTGACC
TGTTATAATATTCTAATTGATGTATTTTTGAAAAGTGGTGATTATGATAGTGGTAAGATG
ATTTGGGCGCGGTTGATAAATACGTCGAATGTTTACCCTAACGTGGTTAGCTATAATGTC
ATGATTAATGGTTTATGTAGATGTGGTAAGTTTAATGAGGGATTGGAACTCTGGGACAGG
ATGAAGAAAAATGCACAAAAAATGGACTTGTTCACGTGTAGTACGTTGATTCATGGTTTG
TGTGAATTGGGCAATGTCAATGGGGCTGAGAGGATTTTTAAGGAAATGATTGAGACTGGA
CTATTACCTGATGTTGTGGTATATGGTGCTTTGCTTAATGGTTATTGTAAGGTCGGGGAG
ATTATAAAGTGTTTTGAGTTGTGGGAGCTGATGGGGAAGGAAGATTGTCGCAACGTTACT
AGTTATAATATATTGATGAGAGGTTTGTTCGAGAATCGAATGGTGGATGAAGCGGTTTCT
ATTTGGAAGCTTATGAATGAGAATGGTGTTGTTGCTGATTCAACATCTTACGGAATCCTA
ATTCAAGGGTTGTGTAACAATGGGTATCTGAACAAGGCTTTGGAGGTCTTGCAAGCTGAA
AATCATGGAGAAAGATTTATGGATTCATATGCATACTCGTCTATTGTTAAGGGGTTGTGC
AGAGAAGGAAGATTAAAAGAAGCAAATGCTATAATTGATTTGATGGCTAAACAGGGATGT
ACACTAAGTTCTCATGTTTGCAATGCACTAATCAATGGCTTCATCAAAGCATCTAAAATT
GCAGAGGCACTCAGATTTTTTGGTGAAATGAGTAGTCGGAATTGTTCGCCAACAGTAGTA
ACCTATAATGTGCTGATTGATGGATTATGCAAAGCTGAAAGATTTGGTGACGCCTATAAG
CTTGTGGAGGACATGCTGCAGAAAGGGTGGACGCCTGACATGATAACATATAGCTTATTG
ATGGATGGCCTTTGCCAAAGCAAAAAAGTAGACCTGGCCCTGAAGTTATTGAGTCAAATT
GTTAGCAAGGGATTCAAGCCTGATGTGACCATGGTTAACATTATAATTCATGGCCTTTGC
TCTGCTGGAAACCTTGATAACGCATTGCAGCTCTTTTTGAGCATGTGCCAATGGGAATGT
CTCCCGAATCTCGTCACATATAACACCCTTATGGAGGGATTTTATAAAGCTAGAGACTGC
AAAAACGCTTCAGCAGTTTGGGCTCTCATTTTAAAAGGTGGGTTTCAGCCCGATATTATT
TCTTATAATATTACTCTTAAAGGGCTTTGTTCTTGCCATAGAATGTCGGATGCCATATTA
TTCTTTAGTGATGCCCTTAATAGGAACATCCGTCCAACTGCAATTACATGGAATATACTT
GTCAGAGCAGTTATTTATGGCTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400035340
PEP Infomation

pacid=37457321 transcript=PGSC0003DMT400052414 locus=PGSC0003DMG400020346 ID=PGSC0003DMT400052414.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MAMLPKKLSPKSLLKLLKSEKNPNAALSLFDIASQHPNYTHDSIIFHHILRKLSDQRFIP
HMTRIVDMIQTQKCLCSEDVALTVIKGYAKNSMVDKAMEVFQNMKNIFGCIPGVRSFNTL
LNAFVVSNQLSRAELFFKYFGTMGVSPNLETYNVLIKLACKKGQFDKAKELLDWMWESKL
MPDVYSYGTLINGLAKNGHLGKALEVFDEMFERGLYPDVTCYNILIDVFLKSGDYDSGKM
IWARLINTSNVYPNVVSYNVMINGLCRCGKFNEGLELWDRMKKNAQKMDLFTCSTLIHGL
CELGNVNGAERIFKEMIETGLLPDVVVYGALLNGYCKVGEIIKCFELWELMGKEDCRNVT
SYNILMRGLFENRMVDEAVSIWKLMNENGVVADSTSYGILIQGLCNNGYLNKALEVLQAE
NHGERFMDSYAYSSIVKGLCREGRLKEANAIIDLMAKQGCTLSSHVCNALINGFIKASKI
AEALRFFGEMSSRNCSPTVVTYNVLIDGLCKAERFGDAYKLVEDMLQKGWTPDMITYSLL
MDGLCQSKKVDLALKLLSQIVSKGFKPDVTMVNIIIHGLCSAGNLDNALQLFLSMCQWEC
LPNLVTYNTLMEGFYKARDCKNASAVWALILKGGFQPDIISYNITLKGLCSCHRMSDAIL
FFSDALNRNIRPTAITWNILVRAVIYG*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400052414
Transcript Infomation

pacid=37457321 locus=PGSC0003DMG400020346 ID=PGSC0003DMT400052414.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCGATGTTACCCAAGAAGCTTTCCCCAAAATCCCTCTTAAAGCTTCTCAAATCCGAG
AAGAATCCCAACGCAGCACTCTCCTTATTCGATATAGCTTCTCAACACCCAAATTACACT
CACGACTCCATTATCTTCCACCATATTCTCAGGAAACTATCCGACCAAAGATTCATCCCT
CACATGACCCGAATCGTTGATATGATTCAAACCCAGAAATGTTTATGCTCTGAGGATGTT
GCATTGACTGTTATTAAAGGGTATGCGAAGAATTCCATGGTTGATAAAGCTATGGAAGTT
TTTCAGAATATGAAGAATATTTTTGGTTGTATACCTGGGGTTAGGTCTTTTAATACATTG
CTTAATGCTTTTGTTGTTTCGAATCAGTTGAGTAGAGCTGAGTTGTTTTTCAAGTATTTT
GGAACAATGGGTGTGTCTCCAAATTTGGAAACTTATAATGTTTTGATTAAACTTGCTTGT
AAAAAGGGGCAATTTGATAAGGCGAAAGAGTTGTTGGATTGGATGTGGGAGAGTAAGTTG
ATGCCAGATGTGTATAGTTATGGAACTTTGATCAATGGACTTGCAAAGAATGGACATTTG
GGTAAGGCCTTAGAGGTGTTTGATGAAATGTTTGAAAGAGGGTTGTATCCAGATGTGACC
TGTTATAATATTCTAATTGATGTATTTTTGAAAAGTGGTGATTATGATAGTGGTAAGATG
ATTTGGGCGCGGTTGATAAATACGTCGAATGTTTACCCTAACGTGGTTAGCTATAATGTC
ATGATTAATGGTTTATGTAGATGTGGTAAGTTTAATGAGGGATTGGAACTCTGGGACAGG
ATGAAGAAAAATGCACAAAAAATGGACTTGTTCACGTGTAGTACGTTGATTCATGGTTTG
TGTGAATTGGGCAATGTCAATGGGGCTGAGAGGATTTTTAAGGAAATGATTGAGACTGGA
CTATTACCTGATGTTGTGGTATATGGTGCTTTGCTTAATGGTTATTGTAAGGTCGGGGAG
ATTATAAAGTGTTTTGAGTTGTGGGAGCTGATGGGGAAGGAAGATTGTCGCAACGTTACT
AGTTATAATATATTGATGAGAGGTTTGTTCGAGAATCGAATGGTGGATGAAGCGGTTTCT
ATTTGGAAGCTTATGAATGAGAATGGTGTTGTTGCTGATTCAACATCTTACGGAATCCTA
ATTCAAGGGTTGTGTAACAATGGGTATCTGAACAAGGCTTTGGAGGTCTTGCAAGCTGAA
AATCATGGAGAAAGATTTATGGATTCATATGCATACTCGTCTATTGTTAAGGGGTTGTGC
AGAGAAGGAAGATTAAAAGAAGCAAATGCTATAATTGATTTGATGGCTAAACAGGGATGT
ACACTAAGTTCTCATGTTTGCAATGCACTAATCAATGGCTTCATCAAAGCATCTAAAATT
GCAGAGGCACTCAGATTTTTTGGTGAAATGAGTAGTCGGAATTGTTCGCCAACAGTAGTA
ACCTATAATGTGCTGATTGATGGATTATGCAAAGCTGAAAGATTTGGTGACGCCTATAAG
CTTGTGGAGGACATGCTGCAGAAAGGGTGGACGCCTGACATGATAACATATAGCTTATTG
ATGGATGGCCTTTGCCAAAGCAAAAAAGTAGACCTGGCCCTGAAGTTATTGAGTCAAATT
GTTAGCAAGGGATTCAAGCCTGATGTGACCATGGTTAACATTATAATTCATGGCCTTTGC
TCTGCTGGAAACCTTGATAACGCATTGCAGCTCTTTTTGAGCATGTGCCAATGGGAATGT
CTCCCGAATCTCGTCACATATAACACCCTTATGGAGGGATTTTATAAAGCTAGAGACTGC
AAAAACGCTTCAGCAGTTTGGGCTCTCATTTTAAAAGGTGGGTTTCAGCCCGATATTATT
TCTTATAATATTACTCTTAAAGGGCTTTGTTCTTGCCATAGAATGTCGGATGCCATATTA
TTCTTTAGTGATGCCCTTAATAGGAACATCCGTCCAACTGCAATTACATGGAATATACTT
GTCAGAGCAGTTATTTATGGCTGA