Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400052363
CDS Infomation

pacid=37456265 polypeptide=PGSC0003DMP400035299 locus=PGSC0003DMG400020326 ID=PGSC0003DMT400052363.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGTTGTTAAATTTTGTCATACTAGTGTCTCTCTTCTTTGTACCAACTTCTTGTGAAGTT
GATGGATTCATTTACAATGGATTCAAATCAAGTAATATTAGCTTAGATGGCATTGCTAAT
ATTACATCCAATGGTCTTTTGTTGTTAACCGATTCCAAAACACAAGATCAAGGCCATGCT
TTCTATCCAAATCCAATTCATTTCAAGAATTCACCTAATGGTAATGCATTTTCATTCTCT
ACAACCTTTGTGTTCGCGATAACGTCTGATTATCCACCATTGGATGGTCATGGACTAGTT
TTTGTTATCGCGCCACAGAGAGGAATTCAGAAGGCTTTGGCAAACCACTATCTTGGCCTT
TTTAACTCAAGTAATAATGGGGATAAATCAAACCATGTTGTTGGAGTTGAGTTTGATACA
ATATATAGCGCGGATTTTGGTGATATGAATGACAATCATGTTGGAATTGATATAAATGGA
TTGAGGTCTGTAGCAAATCACACAGCAGGTTATTTTGATGATACTGGTTTGTTCAACAAC
TTTACTCTGATTAGTGGCAAGGCAATGCAAGTTTGGGTGGATTATGATGGCAGAACTAAG
CTAATCAATGTGACAGTAGCTCCTTTACATATGGAAAAACCAGTTAGTCCACTTTTGGCT
TTGAAATATGATCTTTCGCCGATTCTTAATCAGATTATGTATGTTGGTTTTTCATCATCA
ACTGGTTCAGTCCCAACACATCATTATATCTTGGGATGGAGCTTTAAGGCAAATGGGAAA
GCTCAAGAACTTTCTCAACTTCCTAGTCTTCCTCGTGTTGGGCGCAAAGGGACTTCAAGA
TTTGTAACGATTGGTTTACCGGTGATCTCTTTGGTTTCAATTGTTGTAGCAACCTTAGTG
GTGGTTTACTATGTAAGAAGGAAGAAGTATGAAGAAGTTCTTGAAGATTGGGAACGTGAG
TATAGACCGCAAAGGTTCAGTTATAAAGATTTGTACACTGCTACTAAAGGATTCAGAGAA
AAGGAGCTGTTGGGAGCTGGAGGATTTGGTAAAGTTTATAAAGGAGTGATGCCTGTAACC
AAACTTGAGATAGCTGTAAAGAAGATATCTCATGAATCAAGACAAGGGATGAAGGAATTT
GTTTCGGAGATTGTAAGTATAGGCCGTATACAACATAGGAATGTAGTACCACTTTTGGGC
TATTGTAGGCGAAAAGGGGAATTACTTTTGGTTTATGAATTCATGTCTAATGGAAGTCTA
GACAAGTATTTATACGACCAACCAAGACTCACCCTCGATTGGAACCAAAGATTCAGAGTC
ATTCGAGGTGTAGCATCAGGACTATTTTTCCTACATGAAGAATGTGACCATGTAGTGATT
CATAGGGATATTAAGGCTAGTAATGTCTTGTTGGATGGTGAACTAAATGGCAGGCTAGGA
GACTTTGGACTCGCGAGGCTATATGGTCATGGGACCGATCCTCAATCAACTCGTGTCGTT
GGTACTCTTGGTTATCTTGCACCAGAGCATACTAGAACTGGCAGGGCAACACCTAGTAGT
GATGTATTTTCCTTTGGGGCTTTTCTGCTTGAAGTTGCCTGTGGTAGGAGGCCGATAGAA
CCAAGACAAGCCGGTGATGATCTGATTTTAGTCGATTGGGTGTTTTCGTGCTGGAATAGA
GGTAATATTCTTGAGGCTGTTGATCCAAACTTAGGCAATGATTTTGTTCCAGGGCAAGTG
GAGTTGGTTTTAAGTCTAGGCTTGTTCTGCTCTCATTCAGAGCCCTCATTTAGGCCAACC
ATGCGACAAAACGTGTTGTTCTTAGATGGTGTTGTGGCCTTGCCAGAGTTATCAGCCCTC
GGTGTTTCATCTGCTGGTCTAACATTTGACCATCGCGGAGGTTTTGATGATTTTATCAAG
TCGTATCCAGCTTCTTCTGTTAATGCACATTCCCCCGCTTCATCTGTAGCAGAATCACTC
CTTTCTGATCCCCGATGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400035299
PEP Infomation

pacid=37456265 transcript=PGSC0003DMT400052363 locus=PGSC0003DMG400020326 ID=PGSC0003DMT400052363.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MLLNFVILVSLFFVPTSCEVDGFIYNGFKSSNISLDGIANITSNGLLLLTDSKTQDQGHA
FYPNPIHFKNSPNGNAFSFSTTFVFAITSDYPPLDGHGLVFVIAPQRGIQKALANHYLGL
FNSSNNGDKSNHVVGVEFDTIYSADFGDMNDNHVGIDINGLRSVANHTAGYFDDTGLFNN
FTLISGKAMQVWVDYDGRTKLINVTVAPLHMEKPVSPLLALKYDLSPILNQIMYVGFSSS
TGSVPTHHYILGWSFKANGKAQELSQLPSLPRVGRKGTSRFVTIGLPVISLVSIVVATLV
VVYYVRRKKYEEVLEDWEREYRPQRFSYKDLYTATKGFREKELLGAGGFGKVYKGVMPVT
KLEIAVKKISHESRQGMKEFVSEIVSIGRIQHRNVVPLLGYCRRKGELLLVYEFMSNGSL
DKYLYDQPRLTLDWNQRFRVIRGVASGLFFLHEECDHVVIHRDIKASNVLLDGELNGRLG
DFGLARLYGHGTDPQSTRVVGTLGYLAPEHTRTGRATPSSDVFSFGAFLLEVACGRRPIE
PRQAGDDLILVDWVFSCWNRGNILEAVDPNLGNDFVPGQVELVLSLGLFCSHSEPSFRPT
MRQNVLFLDGVVALPELSALGVSSAGLTFDHRGGFDDFIKSYPASSVNAHSPASSVAESL
LSDPR*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400052363
Transcript Infomation

pacid=37456265 locus=PGSC0003DMG400020326 ID=PGSC0003DMT400052363.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGTTGTTAAATTTTGTCATACTAGTGTCTCTCTTCTTTGTACCAACTTCTTGTGAAGTT
GATGGATTCATTTACAATGGATTCAAATCAAGTAATATTAGCTTAGATGGCATTGCTAAT
ATTACATCCAATGGTCTTTTGTTGTTAACCGATTCCAAAACACAAGATCAAGGCCATGCT
TTCTATCCAAATCCAATTCATTTCAAGAATTCACCTAATGGTAATGCATTTTCATTCTCT
ACAACCTTTGTGTTCGCGATAACGTCTGATTATCCACCATTGGATGGTCATGGACTAGTT
TTTGTTATCGCGCCACAGAGAGGAATTCAGAAGGCTTTGGCAAACCACTATCTTGGCCTT
TTTAACTCAAGTAATAATGGGGATAAATCAAACCATGTTGTTGGAGTTGAGTTTGATACA
ATATATAGCGCGGATTTTGGTGATATGAATGACAATCATGTTGGAATTGATATAAATGGA
TTGAGGTCTGTAGCAAATCACACAGCAGGTTATTTTGATGATACTGGTTTGTTCAACAAC
TTTACTCTGATTAGTGGCAAGGCAATGCAAGTTTGGGTGGATTATGATGGCAGAACTAAG
CTAATCAATGTGACAGTAGCTCCTTTACATATGGAAAAACCAGTTAGTCCACTTTTGGCT
TTGAAATATGATCTTTCGCCGATTCTTAATCAGATTATGTATGTTGGTTTTTCATCATCA
ACTGGTTCAGTCCCAACACATCATTATATCTTGGGATGGAGCTTTAAGGCAAATGGGAAA
GCTCAAGAACTTTCTCAACTTCCTAGTCTTCCTCGTGTTGGGCGCAAAGGGACTTCAAGA
TTTGTAACGATTGGTTTACCGGTGATCTCTTTGGTTTCAATTGTTGTAGCAACCTTAGTG
GTGGTTTACTATGTAAGAAGGAAGAAGTATGAAGAAGTTCTTGAAGATTGGGAACGTGAG
TATAGACCGCAAAGGTTCAGTTATAAAGATTTGTACACTGCTACTAAAGGATTCAGAGAA
AAGGAGCTGTTGGGAGCTGGAGGATTTGGTAAAGTTTATAAAGGAGTGATGCCTGTAACC
AAACTTGAGATAGCTGTAAAGAAGATATCTCATGAATCAAGACAAGGGATGAAGGAATTT
GTTTCGGAGATTGTAAGTATAGGCCGTATACAACATAGGAATGTAGTACCACTTTTGGGC
TATTGTAGGCGAAAAGGGGAATTACTTTTGGTTTATGAATTCATGTCTAATGGAAGTCTA
GACAAGTATTTATACGACCAACCAAGACTCACCCTCGATTGGAACCAAAGATTCAGAGTC
ATTCGAGGTGTAGCATCAGGACTATTTTTCCTACATGAAGAATGTGACCATGTAGTGATT
CATAGGGATATTAAGGCTAGTAATGTCTTGTTGGATGGTGAACTAAATGGCAGGCTAGGA
GACTTTGGACTCGCGAGGCTATATGGTCATGGGACCGATCCTCAATCAACTCGTGTCGTT
GGTACTCTTGGTTATCTTGCACCAGAGCATACTAGAACTGGCAGGGCAACACCTAGTAGT
GATGTATTTTCCTTTGGGGCTTTTCTGCTTGAAGTTGCCTGTGGTAGGAGGCCGATAGAA
CCAAGACAAGCCGGTGATGATCTGATTTTAGTCGATTGGGTGTTTTCGTGCTGGAATAGA
GGTAATATTCTTGAGGCTGTTGATCCAAACTTAGGCAATGATTTTGTTCCAGGGCAAGTG
GAGTTGGTTTTAAGTCTAGGCTTGTTCTGCTCTCATTCAGAGCCCTCATTTAGGCCAACC
ATGCGACAAAACGTGTTGTTCTTAGATGGTGTTGTGGCCTTGCCAGAGTTATCAGCCCTC
GGTGTTTCATCTGCTGGTCTAACATTTGACCATCGCGGAGGTTTTGATGATTTTATCAAG
TCGTATCCAGCTTCTTCTGTTAATGCACATTCCCCCGCTTCATCTGTAGCAGAATCACTC
CTTTCTGATCCCCGATGA