Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400052255
CDS Infomation

pacid=37424650 polypeptide=PGSC0003DMP400035228 locus=PGSC0003DMG400020271 ID=PGSC0003DMT400052255.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCTCAAATTCCTTTCTTGGGAATCAAACATCATCGTAAGAAACGTGCAGCAGTTCAA
ATTCCCAGGAAATCTTTCTTCTGGTGTACTCTTCTTCTTGTCTGCTTTGCTGCCTTCACT
TTCTCTTCTCGAGGGTTTCATCCCTGGCGGCCGGCGGCAACCACAGCCCTACCCGGTGTT
AAGCCGATTGTTCCAGTTATAGAAACCGTCCAATTCCCGGACGAGACAGTTGTTTTCCTA
AAATACCCTCCTTCAACTCCCTTATTCACCAAATATGACCTATACTGCCTCTACCTTAAT
CCTAACTCTTCTCAACCTCCTGAATCAGTTGAAAACGATGAATTATTGGGCCAACAGCTC
GTTCGATGTCCCCTGATTAAGCCACGTGGAGTCCTGACGTCACTTTCCGTCAAGTCTACC
GGTTACAACCTCTCAATTGGGCCATCACGTCGGTGGAATTCGTTGGCCTATGAGGCCATG
ATCGATCGCGATAACACGACCATCGTGTTTGTTAAAGGGTTTAATCTTCGTGGTGGAAAA
CAATCGGACGCTTCAAAATTCAAGTGTGTTTATGGTTGGGATGTTAAGAATCCCAAATTT
GTGTTACAATCAGATGTTGTATCCATTGCTCAAGAAGTTGTTCGATGTAATACCCCAGTG
AGCATACTGAATAATCCACAGAGGTTTGTTGGTACGACTAGTAACATGAATCAGCCCATT
AAGGTTTCTGTTAGAATGGTTGGTAAGGAACCTTTAGAGTCCATAGCGAGACCTAAACGC
CGTCTGCAGCTCAACTTGCCAGGTCAAAAACAGCACGAGATGTGTGTCTGCACAATGTTA
AGAAACCAGGCCAGCTTCTTGAAAGAGTGGATCATGTACCATACTAGAATCGGAGTACAG
CGTTGGTTTATTTATGATAATAACAGCTTGGACGATATTGATGACGTCATTAAGCTATTA
TCCATGGATGGGAACATAAATGTGACACGACATGTTTGGCCTTGGATCAAGACTCAAGAG
GCAGGTTTTGCTCATTGTGCATTACGAGCTAGAGATGTATGTGAATGGGTTGGTTTTATG
GATGTTGATGAGTTCTTCCACTTGCCTACTGGTATGTCACTGCTTGACATATTAAGAAAC
CAATCAAGGAGTAGTAATAGTAAAGTTGCTGAGTTGCGGGTGTCATGTCATAATTTTGGA
CCATCTGGTCTCAAACATGTCCCGACACAAGGGGTCACCATGGGGTACAATTGCAGGATG
ATTGCACCTGAGAGGCACAAGAGTATTGTGAAACCGGAAGCGTTGAATTCAACATTAATC
AATGTGGTTCACCATTTTCATTTAAAGTCTGAGTTTAGATATGCAAATATGGATAGAAAT
GTGCTGGTGATTAACCATTACAAGTATCAAGTTTGGGATGTCTTCAAGGAGAAGTTCTAC
AGGAGGGTGGCTACTTATGTTTCTGATTGGCAACAACACAGAAATGTTGGGTCCAGGGAT
CGTGCCCCAGGTTTAGGGACACGAGCTGTTGAACCACCAGATTGGTCTAGTCGATTTTGT
GAAGTTACTGACACTGGCCTTAAGGATCGAGTAGCACAGATGTTCACCGACCCAAACACT
GGCAAGTTACCCTGGCAAAAGTCACTGACATGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400035228
PEP Infomation

pacid=37424650 transcript=PGSC0003DMT400052255 locus=PGSC0003DMG400020271 ID=PGSC0003DMT400052255.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MAQIPFLGIKHHRKKRAAVQIPRKSFFWCTLLLVCFAAFTFSSRGFHPWRPAATTALPGV
KPIVPVIETVQFPDETVVFLKYPPSTPLFTKYDLYCLYLNPNSSQPPESVENDELLGQQL
VRCPLIKPRGVLTSLSVKSTGYNLSIGPSRRWNSLAYEAMIDRDNTTIVFVKGFNLRGGK
QSDASKFKCVYGWDVKNPKFVLQSDVVSIAQEVVRCNTPVSILNNPQRFVGTTSNMNQPI
KVSVRMVGKEPLESIARPKRRLQLNLPGQKQHEMCVCTMLRNQASFLKEWIMYHTRIGVQ
RWFIYDNNSLDDIDDVIKLLSMDGNINVTRHVWPWIKTQEAGFAHCALRARDVCEWVGFM
DVDEFFHLPTGMSLLDILRNQSRSSNSKVAELRVSCHNFGPSGLKHVPTQGVTMGYNCRM
IAPERHKSIVKPEALNSTLINVVHHFHLKSEFRYANMDRNVLVINHYKYQVWDVFKEKFY
RRVATYVSDWQQHRNVGSRDRAPGLGTRAVEPPDWSSRFCEVTDTGLKDRVAQMFTDPNT
GKLPWQKSLT*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400052255
Transcript Infomation

pacid=37424650 locus=PGSC0003DMG400020271 ID=PGSC0003DMT400052255.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCTCAAATTCCTTTCTTGGGAATCAAACATCATCGTAAGAAACGTGCAGCAGTTCAA
ATTCCCAGGAAATCTTTCTTCTGGTGTACTCTTCTTCTTGTCTGCTTTGCTGCCTTCACT
TTCTCTTCTCGAGGGTTTCATCCCTGGCGGCCGGCGGCAACCACAGCCCTACCCGGTGTT
AAGCCGATTGTTCCAGTTATAGAAACCGTCCAATTCCCGGACGAGACAGTTGTTTTCCTA
AAATACCCTCCTTCAACTCCCTTATTCACCAAATATGACCTATACTGCCTCTACCTTAAT
CCTAACTCTTCTCAACCTCCTGAATCAGTTGAAAACGATGAATTATTGGGCCAACAGCTC
GTTCGATGTCCCCTGATTAAGCCACGTGGAGTCCTGACGTCACTTTCCGTCAAGTCTACC
GGTTACAACCTCTCAATTGGGCCATCACGTCGGTGGAATTCGTTGGCCTATGAGGCCATG
ATCGATCGCGATAACACGACCATCGTGTTTGTTAAAGGGTTTAATCTTCGTGGTGGAAAA
CAATCGGACGCTTCAAAATTCAAGTGTGTTTATGGTTGGGATGTTAAGAATCCCAAATTT
GTGTTACAATCAGATGTTGTATCCATTGCTCAAGAAGTTGTTCGATGTAATACCCCAGTG
AGCATACTGAATAATCCACAGAGGTTTGTTGGTACGACTAGTAACATGAATCAGCCCATT
AAGGTTTCTGTTAGAATGGTTGGTAAGGAACCTTTAGAGTCCATAGCGAGACCTAAACGC
CGTCTGCAGCTCAACTTGCCAGGTCAAAAACAGCACGAGATGTGTGTCTGCACAATGTTA
AGAAACCAGGCCAGCTTCTTGAAAGAGTGGATCATGTACCATACTAGAATCGGAGTACAG
CGTTGGTTTATTTATGATAATAACAGCTTGGACGATATTGATGACGTCATTAAGCTATTA
TCCATGGATGGGAACATAAATGTGACACGACATGTTTGGCCTTGGATCAAGACTCAAGAG
GCAGGTTTTGCTCATTGTGCATTACGAGCTAGAGATGTATGTGAATGGGTTGGTTTTATG
GATGTTGATGAGTTCTTCCACTTGCCTACTGGTATGTCACTGCTTGACATATTAAGAAAC
CAATCAAGGAGTAGTAATAGTAAAGTTGCTGAGTTGCGGGTGTCATGTCATAATTTTGGA
CCATCTGGTCTCAAACATGTCCCGACACAAGGGGTCACCATGGGGTACAATTGCAGGATG
ATTGCACCTGAGAGGCACAAGAGTATTGTGAAACCGGAAGCGTTGAATTCAACATTAATC
AATGTGGTTCACCATTTTCATTTAAAGTCTGAGTTTAGATATGCAAATATGGATAGAAAT
GTGCTGGTGATTAACCATTACAAGTATCAAGTTTGGGATGTCTTCAAGGAGAAGTTCTAC
AGGAGGGTGGCTACTTATGTTTCTGATTGGCAACAACACAGAAATGTTGGGTCCAGGGAT
CGTGCCCCAGGTTTAGGGACACGAGCTGTTGAACCACCAGATTGGTCTAGTCGATTTTGT
GAAGTTACTGACACTGGCCTTAAGGATCGAGTAGCACAGATGTTCACCGACCCAAACACT
GGCAAGTTACCCTGGCAAAAGTCACTGACATGA