Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400052242
CDS Infomation

pacid=37427652 polypeptide=PGSC0003DMP400035220 locus=PGSC0003DMG400020266 ID=PGSC0003DMT400052242.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGGAACTCAAGCTCCATCAAATTACGATGACTCCAAGATTGATACAAGAACAGAAGAA
GAGAAGGCAATTGATGCGTGGCTTCCGATTACTTCTTCGAGGAATGCAAAATGGTGGTAT
TCAGCTTTTCACAATGTTACTGCTATGGTTGGTGCTGGTGTCCTCAGTCTTCCTTATGCC
ATGTCTGAGCTTGGATGGGGACCTGGTGTAACTGTGATGGTTGTATCTTGGATTATCACT
TTATACACACTATGGCAAATGGTTGAAATGCACGAAATGATTCCAGGGAAACGTTTTGAT
AGATATCATGAGTTGGGGCAACATGCTTTTGGGGAAAAGCTTGGATTATGGATTGTTGTT
CCCCAACAACTAATTGTCGAAGTTGGTGTTGACATTGTTTATATGGTCACCGGAGGAAAA
TCACTTCAGAAGGTGCACCAATTGGTTTGCAAACCAGAAGACGGCTGCGCAGATATCAAA
CTTTCATACTTCATCATGATATTTGCCTCTGTCCATTTTGTGCTATCTCATCTTCCCAAT
TTCAATTCCATATCTGGTGTGTCTTTGGCAGCAGCTGTTATGTCCTTAAGTTACTCTACA
ATTGCTTGGGGAGCATCAGTTAAGAAGGGTGTACAACCAAATGTGGATTACGGGTACAAG
GCACACAGCACTGCAGGAACTGTGTTTGATTTTCTAAGCGGATTGGGAGAAGTGGCTTTT
GCATACGCGGGTCATAATGTGGTGTTGGAGATTCAAGCTACAATTCCTTCAACACCTGAC
AAACCTTCCAAAGTACCTATGTGGAGGGGAGTTGTTGTTGCTTACATAGTTGTGGCCCTC
TGTTACTTCCCTGTTGCTTTTATTGGATACTGGATGTTTGGAAATGCAGTGGAAGACAAC
ATTCTCATGTCTTTGAACAAACCTACCTGGCTCATTATCATGGCTAACATGTTTGTCGTT
GTCCATGTTATTGGAAGCTATCAGATCTATGCAATGCCAGTGTTTGACATGATTGAGACC
GTGCTTGTTAAGAAACTTAGGTTCAAGCCTACTTGGTATTTGCGATTTGTTACCAGAAAC
ATCTATGTTGCTTTCACAATGTTTGTTGGAATCACCTTCCCTTTCTTTGGTGGCCTTCTT
GGATTCTTTGGAGGATTTGCTTTTGCCCCAACAACATATTTTCTGCCTTGCATCATGTGG
CTAGCAATCTACAAGCCAAGGAGATGGAGTCTCTCTTGGATTGCTAATTGGATTTGCATT
ATTTTTGGAGTTTTGTTGATGGTTTTAGCACCAATTGGTGGGTTGAGATCCATCATAGTA
CAAGCAAAGACCTACAAATTTTACAATTAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400035220
PEP Infomation

pacid=37427652 transcript=PGSC0003DMT400052242 locus=PGSC0003DMG400020266 ID=PGSC0003DMT400052242.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MGTQAPSNYDDSKIDTRTEEEKAIDAWLPITSSRNAKWWYSAFHNVTAMVGAGVLSLPYA
MSELGWGPGVTVMVVSWIITLYTLWQMVEMHEMIPGKRFDRYHELGQHAFGEKLGLWIVV
PQQLIVEVGVDIVYMVTGGKSLQKVHQLVCKPEDGCADIKLSYFIMIFASVHFVLSHLPN
FNSISGVSLAAAVMSLSYSTIAWGASVKKGVQPNVDYGYKAHSTAGTVFDFLSGLGEVAF
AYAGHNVVLEIQATIPSTPDKPSKVPMWRGVVVAYIVVALCYFPVAFIGYWMFGNAVEDN
ILMSLNKPTWLIIMANMFVVVHVIGSYQIYAMPVFDMIETVLVKKLRFKPTWYLRFVTRN
IYVAFTMFVGITFPFFGGLLGFFGGFAFAPTTYFLPCIMWLAIYKPRRWSLSWIANWICI
IFGVLLMVLAPIGGLRSIIVQAKTYKFYN*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400052242
Transcript Infomation

pacid=37427652 locus=PGSC0003DMG400020266 ID=PGSC0003DMT400052242.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGGAACTCAAGCTCCATCAAATTACGATGACTCCAAGATTGATACAAGAACAGAAGAA
GAGAAGGCAATTGATGCGTGGCTTCCGATTACTTCTTCGAGGAATGCAAAATGGTGGTAT
TCAGCTTTTCACAATGTTACTGCTATGGTTGGTGCTGGTGTCCTCAGTCTTCCTTATGCC
ATGTCTGAGCTTGGATGGGGACCTGGTGTAACTGTGATGGTTGTATCTTGGATTATCACT
TTATACACACTATGGCAAATGGTTGAAATGCACGAAATGATTCCAGGGAAACGTTTTGAT
AGATATCATGAGTTGGGGCAACATGCTTTTGGGGAAAAGCTTGGATTATGGATTGTTGTT
CCCCAACAACTAATTGTCGAAGTTGGTGTTGACATTGTTTATATGGTCACCGGAGGAAAA
TCACTTCAGAAGGTGCACCAATTGGTTTGCAAACCAGAAGACGGCTGCGCAGATATCAAA
CTTTCATACTTCATCATGATATTTGCCTCTGTCCATTTTGTGCTATCTCATCTTCCCAAT
TTCAATTCCATATCTGGTGTGTCTTTGGCAGCAGCTGTTATGTCCTTAAGTTACTCTACA
ATTGCTTGGGGAGCATCAGTTAAGAAGGGTGTACAACCAAATGTGGATTACGGGTACAAG
GCACACAGCACTGCAGGAACTGTGTTTGATTTTCTAAGCGGATTGGGAGAAGTGGCTTTT
GCATACGCGGGTCATAATGTGGTGTTGGAGATTCAAGCTACAATTCCTTCAACACCTGAC
AAACCTTCCAAAGTACCTATGTGGAGGGGAGTTGTTGTTGCTTACATAGTTGTGGCCCTC
TGTTACTTCCCTGTTGCTTTTATTGGATACTGGATGTTTGGAAATGCAGTGGAAGACAAC
ATTCTCATGTCTTTGAACAAACCTACCTGGCTCATTATCATGGCTAACATGTTTGTCGTT
GTCCATGTTATTGGAAGCTATCAGATCTATGCAATGCCAGTGTTTGACATGATTGAGACC
GTGCTTGTTAAGAAACTTAGGTTCAAGCCTACTTGGTATTTGCGATTTGTTACCAGAAAC
ATCTATGTTGCTTTCACAATGTTTGTTGGAATCACCTTCCCTTTCTTTGGTGGCCTTCTT
GGATTCTTTGGAGGATTTGCTTTTGCCCCAACAACATATTTTCTGCCTTGCATCATGTGG
CTAGCAATCTACAAGCCAAGGAGATGGAGTCTCTCTTGGATTGCTAATTGGATTTGCATT
ATTTTTGGAGTTTTGTTGATGGTTTTAGCACCAATTGGTGGGTTGAGATCCATCATAGTA
CAAGCAAAGACCTACAAATTTTACAATTAG