Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400052088
CDS Infomation

pacid=37424293 polypeptide=PGSC0003DMP400035102 locus=PGSC0003DMG400020219 ID=PGSC0003DMT400052088.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGATAGTGTTCGGCCATTCTGGTGCCGGAGTTGGTTTCCTCGCCGGCAAACAGGTCTTT
CCGGTGAACTACGAGGCTGAAGTTTCCCGTCGTCTTCTTGAAGCGTCGCATTCAAACGAT
CTGACATTAGCTCTTGAATGTATCGCCGATCCGTTCGTAGACGTTAATTTCGTCGGCGAT
GTGTGTTTAAAGGTTCGAAAGGCAGAGGTCGTGACTCATGACGAGTTGCCGAACGAAGTT
AGGATAATTTACGAGGAGTTCAAAACCGACGTTACGGCTTTGTTCCTCGCCGCTCATAAT
GGAAATGTTGCTCTAGTGAGAAAACTACTGAGCACTGGAGCCGATGTAAACCATAAACTT
TTCAGGGGATTCCCAACCACGTCAGCTGTGAGGGAGGGACACCTTGAGATCTTGGAGATG
TTAGTTAAAGCTGGGTCATCCCAGCAGGCTTGTGAGGAAGCTCTGTTGGAGGCCAGCTGT
CATGGGCATGCAAGAATTGTGGAGGTGCTCATGGGATCAGACCTGATTCGACCTCGTATT
GCTATACATGCTTTCTTCACTGCATGCTGCCGGGGATATGTAAATGTGGTGGACACTCTC
CTTAAGCTTGGAGTGACCGTGGATGCTACAAATCGCGTGCTGCTCCAATCAAGTAAACCT
TCTCTGCATACAAATGTTGACTGCACAGCACTTGTGGCTGCTATTGTCAGTAGGCAAGTC
TCTGTAGTTCGTCTGTTGCTTGAGGCTGGTGCAAAAACTGATGGACCAGTGCAACTTGGA
GCCTGGTCCTGGGATGCAGCTTCAGGTGAAGAATTTCGAGTAGGTGCTGGGTTAGCAGAT
CCCTATGCCATTACTTGGTGTGCTGTGGAGTATTTTGAAGGAACTGGCACTATTTTGCAA
ATGCTCCTCCAGCGGCTTGATTCCTGCACATCTCACAGTGGAAGAACTATTCTCCATCAT
GCTATTCTTTGTGGTAATGCAGGAGCAGTTTCGGTGCTTTTGAAATGCGGTGCTTATGTG
GAATCTCCAGTTAAAACCACCCGGAACATTGAGTTTCGTCCTATACACATGGCATCCCGA
CGTGGGTTCTCAAGCGTTCTTAAATGCTTGATTGACTTTGGCTGTGATCTGGATGCAAGA
ACGGACACAGGAGATACAGCTTTAATGATCTCTGCAAGATTCAAGAGTGAAGACTGCCTC
AAAGTATTGACTAGAGCAGGTACTGATTTTGGTTTGGTTAATGTAGCTGGTGAATCTGCA
ATCTCCATTGCTGCGTCCAATCGATGGAAGCTCAGTTTTCAGGGTGCAGTTCTGGAAGTC
ATCCAGAGCGGAAAGGTTCCCAAGTCAAGCAACACATCTGTCTTTTCACCATTACTGTTT
GTGGCTCAATCCAGGGACCTTTTGTCCCTGAAGGTGCTGGTTGGACGAGGAGAGATTGAT
CTGGATAGCCAAGATGACCAAGGTTTCTCTGCTGTAATGATCACAGCTGCAGAGGGTCAT
GTCGAGGGCTTCAGGTTGCTTGTTTACGCTGGGGCTAATGTCAAGCTGCAAAACAAGTCT
GGGGAGACTGCTGTTACCCTCTGTGTGCTAAATCCAAATCGTGATCGATTTGAAAAGGTT
CTGCTCGACTTTGCTCTTGAACAGGGTAGTCGAAATGCTGCAGGTTTCTATGCACTGCAT
TGTGCAGCTCGATGTGGTGACTTGGATGCAGTTAAGCTGTTAACAACCAGGGGCTACGAC
GTAAACATGTCAAATGGGGATGGTTATACCCCACTCATGCTGGCAGCAAGGGAAGGACAT
GGCCGCACATGTGAATTCTTGATCTCCTGTGGAGCACGTTGTGATATGAAGAACGCAATG
GGTGAAACTGCACTATCGCTTGCTAGAAAGATGCAGAAAAATGAGGCAGAGCGGGTGATA
CTGGATGAACTTGCTAGGAAGTTGGTCTTAACTGGTGCTCAGGTGAAGAAGCACATAAAG
GGAGGTAAAGGGTCTCCACATATGAAAGTTCTTACAATGGTTGAAGCTGCTGGAATATTG
CGTTGGGGAAAATCGAGCAGGCGTAATGTGGTATGCCAAGAGGCAGAAGTGGGACCAAGT
TTGGGGTTTCAAAAGATGAGGCAAAGGAAAGGGGATGCTGAGCTTCCTGGAATCTTTAGG
GTGATCACAGCCAAGAACAAGGAAGTGCACTTTGTGTGTGAGGGTGGTTCTGAGATGGCA
GCGCTTTGGGTGAGGGGGATAAAGCTTGTGACAAGAGAAGCTATTTTTCGCTAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400035102
PEP Infomation

pacid=37424293 transcript=PGSC0003DMT400052088 locus=PGSC0003DMG400020219 ID=PGSC0003DMT400052088.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MIVFGHSGAGVGFLAGKQVFPVNYEAEVSRRLLEASHSNDLTLALECIADPFVDVNFVGD
VCLKVRKAEVVTHDELPNEVRIIYEEFKTDVTALFLAAHNGNVALVRKLLSTGADVNHKL
FRGFPTTSAVREGHLEILEMLVKAGSSQQACEEALLEASCHGHARIVEVLMGSDLIRPRI
AIHAFFTACCRGYVNVVDTLLKLGVTVDATNRVLLQSSKPSLHTNVDCTALVAAIVSRQV
SVVRLLLEAGAKTDGPVQLGAWSWDAASGEEFRVGAGLADPYAITWCAVEYFEGTGTILQ
MLLQRLDSCTSHSGRTILHHAILCGNAGAVSVLLKCGAYVESPVKTTRNIEFRPIHMASR
RGFSSVLKCLIDFGCDLDARTDTGDTALMISARFKSEDCLKVLTRAGTDFGLVNVAGESA
ISIAASNRWKLSFQGAVLEVIQSGKVPKSSNTSVFSPLLFVAQSRDLLSLKVLVGRGEID
LDSQDDQGFSAVMITAAEGHVEGFRLLVYAGANVKLQNKSGETAVTLCVLNPNRDRFEKV
LLDFALEQGSRNAAGFYALHCAARCGDLDAVKLLTTRGYDVNMSNGDGYTPLMLAAREGH
GRTCEFLISCGARCDMKNAMGETALSLARKMQKNEAERVILDELARKLVLTGAQVKKHIK
GGKGSPHMKVLTMVEAAGILRWGKSSRRNVVCQEAEVGPSLGFQKMRQRKGDAELPGIFR
VITAKNKEVHFVCEGGSEMAALWVRGIKLVTREAIFR*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400052088
Transcript Infomation

pacid=37424293 locus=PGSC0003DMG400020219 ID=PGSC0003DMT400052088.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGATAGTGTTCGGCCATTCTGGTGCCGGAGTTGGTTTCCTCGCCGGCAAACAGGTCTTT
CCGGTGAACTACGAGGCTGAAGTTTCCCGTCGTCTTCTTGAAGCGTCGCATTCAAACGAT
CTGACATTAGCTCTTGAATGTATCGCCGATCCGTTCGTAGACGTTAATTTCGTCGGCGAT
GTGTGTTTAAAGGTTCGAAAGGCAGAGGTCGTGACTCATGACGAGTTGCCGAACGAAGTT
AGGATAATTTACGAGGAGTTCAAAACCGACGTTACGGCTTTGTTCCTCGCCGCTCATAAT
GGAAATGTTGCTCTAGTGAGAAAACTACTGAGCACTGGAGCCGATGTAAACCATAAACTT
TTCAGGGGATTCCCAACCACGTCAGCTGTGAGGGAGGGACACCTTGAGATCTTGGAGATG
TTAGTTAAAGCTGGGTCATCCCAGCAGGCTTGTGAGGAAGCTCTGTTGGAGGCCAGCTGT
CATGGGCATGCAAGAATTGTGGAGGTGCTCATGGGATCAGACCTGATTCGACCTCGTATT
GCTATACATGCTTTCTTCACTGCATGCTGCCGGGGATATGTAAATGTGGTGGACACTCTC
CTTAAGCTTGGAGTGACCGTGGATGCTACAAATCGCGTGCTGCTCCAATCAAGTAAACCT
TCTCTGCATACAAATGTTGACTGCACAGCACTTGTGGCTGCTATTGTCAGTAGGCAAGTC
TCTGTAGTTCGTCTGTTGCTTGAGGCTGGTGCAAAAACTGATGGACCAGTGCAACTTGGA
GCCTGGTCCTGGGATGCAGCTTCAGGTGAAGAATTTCGAGTAGGTGCTGGGTTAGCAGAT
CCCTATGCCATTACTTGGTGTGCTGTGGAGTATTTTGAAGGAACTGGCACTATTTTGCAA
ATGCTCCTCCAGCGGCTTGATTCCTGCACATCTCACAGTGGAAGAACTATTCTCCATCAT
GCTATTCTTTGTGGTAATGCAGGAGCAGTTTCGGTGCTTTTGAAATGCGGTGCTTATGTG
GAATCTCCAGTTAAAACCACCCGGAACATTGAGTTTCGTCCTATACACATGGCATCCCGA
CGTGGGTTCTCAAGCGTTCTTAAATGCTTGATTGACTTTGGCTGTGATCTGGATGCAAGA
ACGGACACAGGAGATACAGCTTTAATGATCTCTGCAAGATTCAAGAGTGAAGACTGCCTC
AAAGTATTGACTAGAGCAGGTACTGATTTTGGTTTGGTTAATGTAGCTGGTGAATCTGCA
ATCTCCATTGCTGCGTCCAATCGATGGAAGCTCAGTTTTCAGGGTGCAGTTCTGGAAGTC
ATCCAGAGCGGAAAGGTTCCCAAGTCAAGCAACACATCTGTCTTTTCACCATTACTGTTT
GTGGCTCAATCCAGGGACCTTTTGTCCCTGAAGGTGCTGGTTGGACGAGGAGAGATTGAT
CTGGATAGCCAAGATGACCAAGGTTTCTCTGCTGTAATGATCACAGCTGCAGAGGGTCAT
GTCGAGGGCTTCAGGTTGCTTGTTTACGCTGGGGCTAATGTCAAGCTGCAAAACAAGTCT
GGGGAGACTGCTGTTACCCTCTGTGTGCTAAATCCAAATCGTGATCGATTTGAAAAGGTT
CTGCTCGACTTTGCTCTTGAACAGGGTAGTCGAAATGCTGCAGGTTTCTATGCACTGCAT
TGTGCAGCTCGATGTGGTGACTTGGATGCAGTTAAGCTGTTAACAACCAGGGGCTACGAC
GTAAACATGTCAAATGGGGATGGTTATACCCCACTCATGCTGGCAGCAAGGGAAGGACAT
GGCCGCACATGTGAATTCTTGATCTCCTGTGGAGCACGTTGTGATATGAAGAACGCAATG
GGTGAAACTGCACTATCGCTTGCTAGAAAGATGCAGAAAAATGAGGCAGAGCGGGTGATA
CTGGATGAACTTGCTAGGAAGTTGGTCTTAACTGGTGCTCAGGTGAAGAAGCACATAAAG
GGAGGTAAAGGGTCTCCACATATGAAAGTTCTTACAATGGTTGAAGCTGCTGGAATATTG
CGTTGGGGAAAATCGAGCAGGCGTAATGTGGTATGCCAAGAGGCAGAAGTGGGACCAAGT
TTGGGGTTTCAAAAGATGAGGCAAAGGAAAGGGGATGCTGAGCTTCCTGGAATCTTTAGG
GTGATCACAGCCAAGAACAAGGAAGTGCACTTTGTGTGTGAGGGTGGTTCTGAGATGGCA
GCGCTTTGGGTGAGGGGGATAAAGCTTGTGACAAGAGAAGCTATTTTTCGCTAG