Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400051436
CDS Infomation

pacid=37431965 polypeptide=PGSC0003DMP400034671 locus=PGSC0003DMG400019981 ID=PGSC0003DMT400051436.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGGGCAACACCCAACTCAACCCTTTTTGGCGAATAACACTATCATGTTCAAGTATTCT
GTATTCGGTGATATCTGCATTGCACGCAAGGTGTTTGATAATATGTCCAAAAGAAATGTT
GCGTCATACAATACAATGATTAGTGGTTATAGTCGCAATGGAAGTATATTAGAGGCTTGG
AAGTTGTTTTCTGAGATGAGGGGTTGTGGATATGTGCCGACTCAGTTTAGTTTTGGTGGG
GTTTTGGGTTGTGAGTGTTTGGATGTTATTCAAGGATTTCAGTTGCAAGCGTTGGCTGAA
AAATTGGGGCTGTTTTTCGTTGATGCTGTAACAGGGACTGCATTATTGGGTTTACTTGGA
AGGAAAGGATGGTTAGATGAAGCTATGCAGGTTTTCGACGAAATGCCTAAAAGGAATTTG
GTGACTTTGAATTGTATGATATCCTTGTTTGGACAGTATGAATGTGTTGAGGAGTCAATG
ATGGTGTTAAGGAGGTTATTAAGGAGTGGAATGGCTCCTTCCGAGAGCACTTTCGTGGGC
ATATTGGCCGGTTTTGTTGGGGAACTTGATTTGATATTAGGGGAACTAGTACATGGGTTG
GTAGTGAAAAATGGACTGGATTTTTCTGTTTCAGTGAATAATTCATTGATTAACATGTAT
GCGAAATGCTCTGACATACATATGGCGGAGAAAATGTTTGAAGATGTTCCTGTTAAGGAT
GTTGTGTCGTGGAATACAATGGTTGGTGCAATGGCGAAGATTGAAAGAGCAGATAGGGCA
TTGGTTGTTTTTAGGAAAATGTGTGTAAGTGGCTTATTGCCTAATGATACGAGTTATGTG
AGTGCCCTAAGTTGCTGCACTAGCCAGCAGTTTCGATTGCTTGGGGAGTCCATCCATGCG
AAAGTAATCCAGAAAAAGTTTGAATCTGATGTATATGTCGGTAGTGCTTTACTTGACTTT
TATGTTAAATGTGATAGATTGGATGATGCTCATGTTTGCTTTGATGAAATATCGGAGAAG
AATGTGGTTTCTTGGAATACGTTGATGTTGGGTTATTCGAGTAAAGGTTCTTCTTATGTT
ATTACGCTGCTTCAACAAATGATTCACTCGGGTTGTCTTCCCACTGAGTTTTCTTTTTCT
ATTGCTGTGAAATCGTCAGGACTATTAGAGGTACTTCAGCTCCATTCTTTGTCCATAAAA
ATGGGTTACATTGATAATGATTATGTCTCTAGCAGTTTCATTTCTTCGTATGCAAAATCT
AGTTCAGTTGATGATGCCCTAAGGTTTGTCACTACCAATGACATGCCACTTCCTGTTGTT
GCATCCAATATGATCGCAAATATTTATAACAGAAATGGACAATTCGATAAGACTCAAGAG
TTGTTTTCGGACCTTGAAAATCCAGATACTGTATCTTGGAATATCTTGATTGCAGCCTGT
TCTAGAAATGGTGATTACGAAGAAGTTTTTGAACTTCTTGGACACATGCGGATGGCTAGA
GTATCTCCTGATAGATACACATATGTTAGCCTGTTTAGTGTGTGCACCAAGCTTTGTAAC
CTTGGTCTAGGTAGCTCACTTCATGGCCTCATTATAAAGACTGATTTTAAGCGTTGTGAC
ACATTTGTCTGCAATATCATGATTGACATGTATGGCAAATGCGGGAGTCTTGCAAGTTCA
ATCAAGATTTTCAATGAAATGACGACTAAAAATGTGATCACATGGACAACCATTGTTTCA
GCCCTTGGACTGCACGGTTATGCACACGAGGCATTAGAGAAATTCAAGGAGATGGATATG
AACGGAATTAAACCTGATAAGGTTGTTTTCGTAGCTGTGCTTTCAGCATGTAGGCACGTT
GGATTAGTGAAAGAGGGAATGAAATTGTTTGGGCAGATGAAAGGGAAATATGGGGTAGAA
CCAGAGATGGATCACTATCTTATTGCAGTGGACTTGTTGGCTAGGTATGGCTATTTGACA
GAAGCCGAGCAGTTAATCACTGGGATGCCTTTCCCTCCAAATGCTCTAATATGGCGCATT
TTTTTGGAAGGCTGCAAGAAAAAGAGAAGCATAGACGACACTCTCGCTCTTGCTTCATAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400034671
PEP Infomation

pacid=37431965 transcript=PGSC0003DMT400051436 locus=PGSC0003DMG400019981 ID=PGSC0003DMT400051436.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MGQHPTQPFLANNTIMFKYSVFGDICIARKVFDNMSKRNVASYNTMISGYSRNGSILEAW
KLFSEMRGCGYVPTQFSFGGVLGCECLDVIQGFQLQALAEKLGLFFVDAVTGTALLGLLG
RKGWLDEAMQVFDEMPKRNLVTLNCMISLFGQYECVEESMMVLRRLLRSGMAPSESTFVG
ILAGFVGELDLILGELVHGLVVKNGLDFSVSVNNSLINMYAKCSDIHMAEKMFEDVPVKD
VVSWNTMVGAMAKIERADRALVVFRKMCVSGLLPNDTSYVSALSCCTSQQFRLLGESIHA
KVIQKKFESDVYVGSALLDFYVKCDRLDDAHVCFDEISEKNVVSWNTLMLGYSSKGSSYV
ITLLQQMIHSGCLPTEFSFSIAVKSSGLLEVLQLHSLSIKMGYIDNDYVSSSFISSYAKS
SSVDDALRFVTTNDMPLPVVASNMIANIYNRNGQFDKTQELFSDLENPDTVSWNILIAAC
SRNGDYEEVFELLGHMRMARVSPDRYTYVSLFSVCTKLCNLGLGSSLHGLIIKTDFKRCD
TFVCNIMIDMYGKCGSLASSIKIFNEMTTKNVITWTTIVSALGLHGYAHEALEKFKEMDM
NGIKPDKVVFVAVLSACRHVGLVKEGMKLFGQMKGKYGVEPEMDHYLIAVDLLARYGYLT
EAEQLITGMPFPPNALIWRIFLEGCKKKRSIDDTLALAS*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400051436
Transcript Infomation

pacid=37431965 locus=PGSC0003DMG400019981 ID=PGSC0003DMT400051436.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGGGCAACACCCAACTCAACCCTTTTTGGCGAATAACACTATCATGTTCAAGTATTCT
GTATTCGGTGATATCTGCATTGCACGCAAGGTGTTTGATAATATGTCCAAAAGAAATGTT
GCGTCATACAATACAATGATTAGTGGTTATAGTCGCAATGGAAGTATATTAGAGGCTTGG
AAGTTGTTTTCTGAGATGAGGGGTTGTGGATATGTGCCGACTCAGTTTAGTTTTGGTGGG
GTTTTGGGTTGTGAGTGTTTGGATGTTATTCAAGGATTTCAGTTGCAAGCGTTGGCTGAA
AAATTGGGGCTGTTTTTCGTTGATGCTGTAACAGGGACTGCATTATTGGGTTTACTTGGA
AGGAAAGGATGGTTAGATGAAGCTATGCAGGTTTTCGACGAAATGCCTAAAAGGAATTTG
GTGACTTTGAATTGTATGATATCCTTGTTTGGACAGTATGAATGTGTTGAGGAGTCAATG
ATGGTGTTAAGGAGGTTATTAAGGAGTGGAATGGCTCCTTCCGAGAGCACTTTCGTGGGC
ATATTGGCCGGTTTTGTTGGGGAACTTGATTTGATATTAGGGGAACTAGTACATGGGTTG
GTAGTGAAAAATGGACTGGATTTTTCTGTTTCAGTGAATAATTCATTGATTAACATGTAT
GCGAAATGCTCTGACATACATATGGCGGAGAAAATGTTTGAAGATGTTCCTGTTAAGGAT
GTTGTGTCGTGGAATACAATGGTTGGTGCAATGGCGAAGATTGAAAGAGCAGATAGGGCA
TTGGTTGTTTTTAGGAAAATGTGTGTAAGTGGCTTATTGCCTAATGATACGAGTTATGTG
AGTGCCCTAAGTTGCTGCACTAGCCAGCAGTTTCGATTGCTTGGGGAGTCCATCCATGCG
AAAGTAATCCAGAAAAAGTTTGAATCTGATGTATATGTCGGTAGTGCTTTACTTGACTTT
TATGTTAAATGTGATAGATTGGATGATGCTCATGTTTGCTTTGATGAAATATCGGAGAAG
AATGTGGTTTCTTGGAATACGTTGATGTTGGGTTATTCGAGTAAAGGTTCTTCTTATGTT
ATTACGCTGCTTCAACAAATGATTCACTCGGGTTGTCTTCCCACTGAGTTTTCTTTTTCT
ATTGCTGTGAAATCGTCAGGACTATTAGAGGTACTTCAGCTCCATTCTTTGTCCATAAAA
ATGGGTTACATTGATAATGATTATGTCTCTAGCAGTTTCATTTCTTCGTATGCAAAATCT
AGTTCAGTTGATGATGCCCTAAGGTTTGTCACTACCAATGACATGCCACTTCCTGTTGTT
GCATCCAATATGATCGCAAATATTTATAACAGAAATGGACAATTCGATAAGACTCAAGAG
TTGTTTTCGGACCTTGAAAATCCAGATACTGTATCTTGGAATATCTTGATTGCAGCCTGT
TCTAGAAATGGTGATTACGAAGAAGTTTTTGAACTTCTTGGACACATGCGGATGGCTAGA
GTATCTCCTGATAGATACACATATGTTAGCCTGTTTAGTGTGTGCACCAAGCTTTGTAAC
CTTGGTCTAGGTAGCTCACTTCATGGCCTCATTATAAAGACTGATTTTAAGCGTTGTGAC
ACATTTGTCTGCAATATCATGATTGACATGTATGGCAAATGCGGGAGTCTTGCAAGTTCA
ATCAAGATTTTCAATGAAATGACGACTAAAAATGTGATCACATGGACAACCATTGTTTCA
GCCCTTGGACTGCACGGTTATGCACACGAGGCATTAGAGAAATTCAAGGAGATGGATATG
AACGGAATTAAACCTGATAAGGTTGTTTTCGTAGCTGTGCTTTCAGCATGTAGGCACGTT
GGATTAGTGAAAGAGGGAATGAAATTGTTTGGGCAGATGAAAGGGAAATATGGGGTAGAA
CCAGAGATGGATCACTATCTTATTGCAGTGGACTTGTTGGCTAGGTATGGCTATTTGACA
GAAGCCGAGCAGTTAATCACTGGGATGCCTTTCCCTCCAAATGCTCTAATATGGCGCATT
TTTTTGGAAGGCTGCAAGAAAAAGAGAAGCATAGACGACACTCTCGCTCTTGCTTCATAA