Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400050860
CDS Infomation

pacid=37460905 polypeptide=PGSC0003DMP400034330 locus=PGSC0003DMG400019758 ID=PGSC0003DMT400050860.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGTCATCCTCAATTACAAATTGCTGCCATTTCTATGTTGAACGTGCCAGAACAACAAAC
AGGAGAACTGCAACATGGAAGTCACCAAGAGCAGCAGTAATTCCATGTATCCACCTCCCG
ATGCGCAGTAATGAAGTTAAAAATAGGACATTTGCCGAGGACATAAAAAAACTTCGATTG
ATTACTGCAATTAAAACCCCATATCTACCAGATGGAAGATTCGATCTTGAGGCTTATGAC
GCCTTAGTAAATTTGCAAATTGAAAATGGTGTCGAGGGTGTGATTGTTGGTGGCACTACA
GGTGAAGGTCAATTGATGAGCTGGGATGAACACATCATGCTCATTGGTCATACCATCAAT
TGTTTTGGTGGATCAATTAAAGTCATTGGAAACACAGGAAGCAACTCCACGAGGGAAGCA
ATCCATGCGACAGAACAAGGATTTGCTGTAGGTATGCATGCAGCTCTTCACATTAATCCT
TACTATGGGAAGACCTCCATAGAGGGTTTGATTTCTCACTTTGACAGTGTGCTCCCTATG
GGCCCTACTATCATTTACAATGTGCCATCACGAACTGGTCAAGACATTCCCCCTCATGTA
ATCCAGACATTAGCAAAGAGCCCTAACCTTGCTGGTGTCAAAGAGTGTGTAGGAAATGAT
AGAGTGGAGCAGTATACAAGTAATGGGTTGGTTGTGTGGAGTGGGAATGATGATGAATGC
CATGACTCAAGGTGGCATCATGGTGCTACGGGAGTTATTTCTGTCACCAGCAACTTGGTT
CCTGGTCTGATGCGTGATCTAATGTTTGGAGGAAATAACCCTGTTTTGAACTCAAAGCTA
ATGCCCTTGGTTGAATGGTTGTTTCATGAGCCAAACCCCATTGCTCTGAATACAGCTTTA
GCTCAACTTGGGGTTGTGAGGCCTGTTTTTCGCCTTCCCTATGTTCCACTTACAAAGGCA
AAGAGAGAGGAGTTTGTGAAGATTGTTGAGAAAATTGGACGGGAAAACTTTATTGGGGAA
AGAGATGTCCAAGTTTTGGATGATAATGATATTTTTTTGGTTGGTAGGTATTAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400034330
PEP Infomation

pacid=37460905 transcript=PGSC0003DMT400050860 locus=PGSC0003DMG400019758 ID=PGSC0003DMT400050860.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MSSSITNCCHFYVERARTTNRRTATWKSPRAAVIPCIHLPMRSNEVKNRTFAEDIKKLRL
ITAIKTPYLPDGRFDLEAYDALVNLQIENGVEGVIVGGTTGEGQLMSWDEHIMLIGHTIN
CFGGSIKVIGNTGSNSTREAIHATEQGFAVGMHAALHINPYYGKTSIEGLISHFDSVLPM
GPTIIYNVPSRTGQDIPPHVIQTLAKSPNLAGVKECVGNDRVEQYTSNGLVVWSGNDDEC
HDSRWHHGATGVISVTSNLVPGLMRDLMFGGNNPVLNSKLMPLVEWLFHEPNPIALNTAL
AQLGVVRPVFRLPYVPLTKAKREEFVKIVEKIGRENFIGERDVQVLDDNDIFLVGRY*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400050860
Transcript Infomation

pacid=37460905 locus=PGSC0003DMG400019758 ID=PGSC0003DMT400050860.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGTCATCCTCAATTACAAATTGCTGCCATTTCTATGTTGAACGTGCCAGAACAACAAAC
AGGAGAACTGCAACATGGAAGTCACCAAGAGCAGCAGTAATTCCATGTATCCACCTCCCG
ATGCGCAGTAATGAAGTTAAAAATAGGACATTTGCCGAGGACATAAAAAAACTTCGATTG
ATTACTGCAATTAAAACCCCATATCTACCAGATGGAAGATTCGATCTTGAGGCTTATGAC
GCCTTAGTAAATTTGCAAATTGAAAATGGTGTCGAGGGTGTGATTGTTGGTGGCACTACA
GGTGAAGGTCAATTGATGAGCTGGGATGAACACATCATGCTCATTGGTCATACCATCAAT
TGTTTTGGTGGATCAATTAAAGTCATTGGAAACACAGGAAGCAACTCCACGAGGGAAGCA
ATCCATGCGACAGAACAAGGATTTGCTGTAGGTATGCATGCAGCTCTTCACATTAATCCT
TACTATGGGAAGACCTCCATAGAGGGTTTGATTTCTCACTTTGACAGTGTGCTCCCTATG
GGCCCTACTATCATTTACAATGTGCCATCACGAACTGGTCAAGACATTCCCCCTCATGTA
ATCCAGACATTAGCAAAGAGCCCTAACCTTGCTGGTGTCAAAGAGTGTGTAGGAAATGAT
AGAGTGGAGCAGTATACAAGTAATGGGTTGGTTGTGTGGAGTGGGAATGATGATGAATGC
CATGACTCAAGGTGGCATCATGGTGCTACGGGAGTTATTTCTGTCACCAGCAACTTGGTT
CCTGGTCTGATGCGTGATCTAATGTTTGGAGGAAATAACCCTGTTTTGAACTCAAAGCTA
ATGCCCTTGGTTGAATGGTTGTTTCATGAGCCAAACCCCATTGCTCTGAATACAGCTTTA
GCTCAACTTGGGGTTGTGAGGCCTGTTTTTCGCCTTCCCTATGTTCCACTTACAAAGGCA
AAGAGAGAGGAGTTTGTGAAGATTGTTGAGAAAATTGGACGGGAAAACTTTATTGGGGAA
AGAGATGTCCAAGTTTTGGATGATAATGATATTTTTTTGGTTGGTAGGTATTAG