Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400050767
CDS Infomation

pacid=37424939 polypeptide=PGSC0003DMP400034267 locus=PGSC0003DMG400019717 ID=PGSC0003DMT400050767.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCAAATCAGAAAAGGGTTCTCTTACTATGTGGAGATTACGTTGAAGACTATGAGGTG
ATGGTACCATTTCAAGCTCTACTAGCCTATGGAGTAGCCGTTGATGCAGTTTGTCCTGGA
AAGAAATCCGGTGACATTTGCCGCACTGCCGTCCATCAGCTTTCTGGTCACCAGACATAT
TCAGAGTCCCGCGGACACAATTTTGCTCTTAATGCAACTTTTGATGAAATCGAGGCTTCA
AAGTATGATGGCTTGTTCATACCAGGAGGACGTGCTCCAGAATATCTGGCCATGAATGAA
TCTGTGTTGGACTTAGTGAAAAGTTTTGCCAACGCTAAAAAGCCAATTGTCGCTATCTGT
CATGGACAATTGATCCTGGCTGCTGCAGATGTGGTCAGTGGCCGAAGGTGCACAGCTTAT
CCTGCTGTCAAGCCGGTGCTTGTTGCTGCTGGTGCCCATTGGGAAGAGCCAGAAACCCTG
GCCTCATGTACCATCGATGGTAATCTCATCACTGGATCTACTTATGAAGGAAATCCTGAA
TTCATTCGACTCTTTGTCAAGGCACTTGGTGGCAGCATAGTTGGTTCTGGTAAAAGAATC
CTATTTCTATGTGGGGATTTCATGGAAGACTATGAAGTCAAGGTACCTTTTCAGTCCCTC
CAAGCTCTTGAATGCCATGTTGATGCTGTTTGCCCCAAGAAGAAAGCCGGAGAGAAATGC
CCCACGGCTGTGCACGACTTTGAAGGTGACCAGACTTATAGTGAGAAGCCAGGTCATGAT
TTTACCCTAAATGCCAATTTTGAAAGTGTGGATGTTTCAAGCTATGATGGACTTGTAATT
CCTGGAGGCCGAGCTCCAGAATACCTTGCCCTGGATGATGATGTTATTAAGTTGGTCCAG
GAATTTATGGAGTCCAAAAAACCAGTTGCATCAATCTGCCATGGCCAACAGATACTATCT
GCTGCTGGTGTTCTCAAGGTATCTATCTCTGTTAACATCATTTAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400034267
PEP Infomation

pacid=37424939 transcript=PGSC0003DMT400050767 locus=PGSC0003DMG400019717 ID=PGSC0003DMT400050767.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MANQKRVLLLCGDYVEDYEVMVPFQALLAYGVAVDAVCPGKKSGDICRTAVHQLSGHQTY
SESRGHNFALNATFDEIEASKYDGLFIPGGRAPEYLAMNESVLDLVKSFANAKKPIVAIC
HGQLILAAADVVSGRRCTAYPAVKPVLVAAGAHWEEPETLASCTIDGNLITGSTYEGNPE
FIRLFVKALGGSIVGSGKRILFLCGDFMEDYEVKVPFQSLQALECHVDAVCPKKKAGEKC
PTAVHDFEGDQTYSEKPGHDFTLNANFESVDVSSYDGLVIPGGRAPEYLALDDDVIKLVQ
EFMESKKPVASICHGQQILSAAGVLKVSISVNII*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400050767
Transcript Infomation

pacid=37424939 locus=PGSC0003DMG400019717 ID=PGSC0003DMT400050767.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCAAATCAGAAAAGGGTTCTCTTACTATGTGGAGATTACGTTGAAGACTATGAGGTG
ATGGTACCATTTCAAGCTCTACTAGCCTATGGAGTAGCCGTTGATGCAGTTTGTCCTGGA
AAGAAATCCGGTGACATTTGCCGCACTGCCGTCCATCAGCTTTCTGGTCACCAGACATAT
TCAGAGTCCCGCGGACACAATTTTGCTCTTAATGCAACTTTTGATGAAATCGAGGCTTCA
AAGTATGATGGCTTGTTCATACCAGGAGGACGTGCTCCAGAATATCTGGCCATGAATGAA
TCTGTGTTGGACTTAGTGAAAAGTTTTGCCAACGCTAAAAAGCCAATTGTCGCTATCTGT
CATGGACAATTGATCCTGGCTGCTGCAGATGTGGTCAGTGGCCGAAGGTGCACAGCTTAT
CCTGCTGTCAAGCCGGTGCTTGTTGCTGCTGGTGCCCATTGGGAAGAGCCAGAAACCCTG
GCCTCATGTACCATCGATGGTAATCTCATCACTGGATCTACTTATGAAGGAAATCCTGAA
TTCATTCGACTCTTTGTCAAGGCACTTGGTGGCAGCATAGTTGGTTCTGGTAAAAGAATC
CTATTTCTATGTGGGGATTTCATGGAAGACTATGAAGTCAAGGTACCTTTTCAGTCCCTC
CAAGCTCTTGAATGCCATGTTGATGCTGTTTGCCCCAAGAAGAAAGCCGGAGAGAAATGC
CCCACGGCTGTGCACGACTTTGAAGGTGACCAGACTTATAGTGAGAAGCCAGGTCATGAT
TTTACCCTAAATGCCAATTTTGAAAGTGTGGATGTTTCAAGCTATGATGGACTTGTAATT
CCTGGAGGCCGAGCTCCAGAATACCTTGCCCTGGATGATGATGTTATTAAGTTGGTCCAG
GAATTTATGGAGTCCAAAAAACCAGTTGCATCAATCTGCCATGGCCAACAGATACTATCT
GCTGCTGGTGTTCTCAAGGTATCTATCTCTGTTAACATCATTTAG