Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400050740
CDS Infomation

pacid=37474841 polypeptide=PGSC0003DMP400034245 locus=PGSC0003DMG400019703 ID=PGSC0003DMT400050740.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCATTCTTTGGGTCTTAGATGTAATGAGTTTACATTTCCTAGTGTGCTTAAGGCATGT
TCTATTGAGAAGGAGCTTTTTCTTGGTAAGCAGCTTCATGGGGTTGTTGTGGTTACAGGA
TTCGATTCTGATGTTTTCGTTGCGAATACTTTGGTTGTGATGTACGCAAAATGTGGCGAG
TTTGTGGATTCTAGGATGTTGTTTGAGGAAATCCCAGAAAGAAATGTTGTTTCTTGGAAT
GCGTTGTTTTCTTGTTACACGCAAAATGATTTTTTTAGTGAGGCGATGTGTATGTTTCGT
GACATGATTGGTAGTGGAGTTAGGCCGGATGAATATAGTTTGTCCAATATATTGAATGCT
TGTACTGGGTTAGGAGATATTCTTGAAGGAAAGAAAATACATGGGTATTTGGTGAAGCTT
GGCTATGGTTCTGATCCGTTCTCTTCTAATGCACTCGTCGACATGTATGCAAAAGGGGGA
GATCTTAAGGATGCCATTACAGCTTTTGAGGGAATTGTGGTACCTGACATTGTTTCATGG
AATGCTATTATTGCTGGTTGTGTTCTTCATGAATGCCAATGGCAAGCTATAGATATGTTG
AATCAGATGAGAAGGTCAGGAATTTGGCCAAACATGTTCACATTGTCGAGTGCTCTCAAG
GCTTGTGCTGCACTAGAGCTCCCTGAGTTGGGTAAAGGGTTGCACTCTCTTTTGATAAAG
AAAGATATAATTTTGGATCCATTTGTGAGTGTTGGTCTTATTGATATGTATTGCAAGTGT
AATTTAACCAAGGATGCGAGGTTGATCTATGATCTGATGCCTGGGAAGGACTTAATTGCA
TTGAATGCTATGATCTCTGGTTATTCGCAGAATGAGGCAGACGATGCATGCCTAGACCTT
TTTACTCAGACATTCACCCAAGGAATTGGATTTGATCAGACAACCTTACTTGCCATTCTC
AACTCTGCTGCGGGCTTGCAGGCTGCCAACGTCTGCAAACAAGTGCATGGACTCTCTGTG
AAGTCGGGATTTCTGTGTGACACCTTTGTTATAAACAGTCTTGTTGATTCTTATGGAAAA
TGTACCCAGTTGGATGATGCAGCTAGAATTTTTTACGAGTGCCCTACTCTGGATTTGCCA
TCTTTTACCTCTCTCATAACAGCTTATGCTCTACTTGGTCAAGGTGAAGAAGCTATGAAA
CTGTATCTGAAGTTACAAGACATGGATCTCAAGCCAGACTCATTTGTTTGCAGTTCTCTC
CTAAATGCATGTGCAAATTTATCAGCGTACGAACAGGGGAAACAAATACATGCTCATGTG
TTGAAGTTTGGGTTCATGTCAGATGTGTTTGCTGGTAACTCTCTAGTTAACATGTATGCC
AAGTGTGGAAGTATAGAAGATGCTAGCTGTGCTTTCCATGAGGTTCCTAAGAAAGGTATC
GTTTCATGGTCGGCAATGATTGGAGGACTTGCCCAACATGGACATGCGAAACAGGCGCTT
CATTTATTTGGTGAGATGTTAAAAGATGATGTATCTCCAAATCACATAACATTAGTTAGT
GTCCTTTATGCATGTAATCATGCTGGCTTAGTTGCAGAAGCCAAGAAGTATTTTGAAACA
ATGAAAGACTCGTTTAGGATCGAACCAACTCAAGAGCATTATGCATGCATGATTGATGTC
CTGGGCCGAGCAGGAAAACTAGATGATGCTATTGAGCTCGTAAATAAGATGCCTTTTGAA
GCTAATGCATCTGTCTGGGGTGCACTTCTTGGTGCTGCAAGAATCCATAAGAATGTAGAG
GTAGGAAAACATGCTGCTGAGATGCTTTTTAGCCTTGAACCAGAGAAATCTGGCACTCAT
GTTCTCCTTGCAAATATTTATGCATCAGTTGGGTTGTGGGGAGATGTCGCAAAAGTAAGA
AGATTTATGAAGAACAGTAGAGTAAAAAAGGAACCTGGTATGAGTTGGATTGAAGTGAAA
GATAGTATTTACACATTTATAGTAGGAGACAGAAGCCATCCGCGAAGTGATGATATATAT
GCCAAACTGGAGGAACTGGGACAGCTAATGGCTAAAGCTGGTTATGTTCCTATGGTAGAT
ATTGATCTCCATGATGTAGAGAGGAGACAAAAGGAGATTCTTCTCTCCTATCATAGTGAG
AAACTAGCTGTTGCATTTGGGCTGATTGTTACACCTCCTGGTGCTCCTATTAGAGTGAAG
AAGAATCTTCGGATTTGTTTGGACTGCCATACAGCATTCAAGTTCATTTGTAAAATTGTC
TCAAGGGAGATCATTATTAGAGATATTAACCGGTTCCACCATTTCAAAGATGGCTCTTGC
TCATGTGGGGATTACTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400034245
PEP Infomation

pacid=37474841 transcript=PGSC0003DMT400050740 locus=PGSC0003DMG400019703 ID=PGSC0003DMT400050740.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MHSLGLRCNEFTFPSVLKACSIEKELFLGKQLHGVVVVTGFDSDVFVANTLVVMYAKCGE
FVDSRMLFEEIPERNVVSWNALFSCYTQNDFFSEAMCMFRDMIGSGVRPDEYSLSNILNA
CTGLGDILEGKKIHGYLVKLGYGSDPFSSNALVDMYAKGGDLKDAITAFEGIVVPDIVSW
NAIIAGCVLHECQWQAIDMLNQMRRSGIWPNMFTLSSALKACAALELPELGKGLHSLLIK
KDIILDPFVSVGLIDMYCKCNLTKDARLIYDLMPGKDLIALNAMISGYSQNEADDACLDL
FTQTFTQGIGFDQTTLLAILNSAAGLQAANVCKQVHGLSVKSGFLCDTFVINSLVDSYGK
CTQLDDAARIFYECPTLDLPSFTSLITAYALLGQGEEAMKLYLKLQDMDLKPDSFVCSSL
LNACANLSAYEQGKQIHAHVLKFGFMSDVFAGNSLVNMYAKCGSIEDASCAFHEVPKKGI
VSWSAMIGGLAQHGHAKQALHLFGEMLKDDVSPNHITLVSVLYACNHAGLVAEAKKYFET
MKDSFRIEPTQEHYACMIDVLGRAGKLDDAIELVNKMPFEANASVWGALLGAARIHKNVE
VGKHAAEMLFSLEPEKSGTHVLLANIYASVGLWGDVAKVRRFMKNSRVKKEPGMSWIEVK
DSIYTFIVGDRSHPRSDDIYAKLEELGQLMAKAGYVPMVDIDLHDVERRQKEILLSYHSE
KLAVAFGLIVTPPGAPIRVKKNLRICLDCHTAFKFICKIVSREIIIRDINRFHHFKDGSC
SCGDYW*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400050740
Transcript Infomation

pacid=37474841 locus=PGSC0003DMG400019703 ID=PGSC0003DMT400050740.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCATTCTTTGGGTCTTAGATGTAATGAGTTTACATTTCCTAGTGTGCTTAAGGCATGT
TCTATTGAGAAGGAGCTTTTTCTTGGTAAGCAGCTTCATGGGGTTGTTGTGGTTACAGGA
TTCGATTCTGATGTTTTCGTTGCGAATACTTTGGTTGTGATGTACGCAAAATGTGGCGAG
TTTGTGGATTCTAGGATGTTGTTTGAGGAAATCCCAGAAAGAAATGTTGTTTCTTGGAAT
GCGTTGTTTTCTTGTTACACGCAAAATGATTTTTTTAGTGAGGCGATGTGTATGTTTCGT
GACATGATTGGTAGTGGAGTTAGGCCGGATGAATATAGTTTGTCCAATATATTGAATGCT
TGTACTGGGTTAGGAGATATTCTTGAAGGAAAGAAAATACATGGGTATTTGGTGAAGCTT
GGCTATGGTTCTGATCCGTTCTCTTCTAATGCACTCGTCGACATGTATGCAAAAGGGGGA
GATCTTAAGGATGCCATTACAGCTTTTGAGGGAATTGTGGTACCTGACATTGTTTCATGG
AATGCTATTATTGCTGGTTGTGTTCTTCATGAATGCCAATGGCAAGCTATAGATATGTTG
AATCAGATGAGAAGGTCAGGAATTTGGCCAAACATGTTCACATTGTCGAGTGCTCTCAAG
GCTTGTGCTGCACTAGAGCTCCCTGAGTTGGGTAAAGGGTTGCACTCTCTTTTGATAAAG
AAAGATATAATTTTGGATCCATTTGTGAGTGTTGGTCTTATTGATATGTATTGCAAGTGT
AATTTAACCAAGGATGCGAGGTTGATCTATGATCTGATGCCTGGGAAGGACTTAATTGCA
TTGAATGCTATGATCTCTGGTTATTCGCAGAATGAGGCAGACGATGCATGCCTAGACCTT
TTTACTCAGACATTCACCCAAGGAATTGGATTTGATCAGACAACCTTACTTGCCATTCTC
AACTCTGCTGCGGGCTTGCAGGCTGCCAACGTCTGCAAACAAGTGCATGGACTCTCTGTG
AAGTCGGGATTTCTGTGTGACACCTTTGTTATAAACAGTCTTGTTGATTCTTATGGAAAA
TGTACCCAGTTGGATGATGCAGCTAGAATTTTTTACGAGTGCCCTACTCTGGATTTGCCA
TCTTTTACCTCTCTCATAACAGCTTATGCTCTACTTGGTCAAGGTGAAGAAGCTATGAAA
CTGTATCTGAAGTTACAAGACATGGATCTCAAGCCAGACTCATTTGTTTGCAGTTCTCTC
CTAAATGCATGTGCAAATTTATCAGCGTACGAACAGGGGAAACAAATACATGCTCATGTG
TTGAAGTTTGGGTTCATGTCAGATGTGTTTGCTGGTAACTCTCTAGTTAACATGTATGCC
AAGTGTGGAAGTATAGAAGATGCTAGCTGTGCTTTCCATGAGGTTCCTAAGAAAGGTATC
GTTTCATGGTCGGCAATGATTGGAGGACTTGCCCAACATGGACATGCGAAACAGGCGCTT
CATTTATTTGGTGAGATGTTAAAAGATGATGTATCTCCAAATCACATAACATTAGTTAGT
GTCCTTTATGCATGTAATCATGCTGGCTTAGTTGCAGAAGCCAAGAAGTATTTTGAAACA
ATGAAAGACTCGTTTAGGATCGAACCAACTCAAGAGCATTATGCATGCATGATTGATGTC
CTGGGCCGAGCAGGAAAACTAGATGATGCTATTGAGCTCGTAAATAAGATGCCTTTTGAA
GCTAATGCATCTGTCTGGGGTGCACTTCTTGGTGCTGCAAGAATCCATAAGAATGTAGAG
GTAGGAAAACATGCTGCTGAGATGCTTTTTAGCCTTGAACCAGAGAAATCTGGCACTCAT
GTTCTCCTTGCAAATATTTATGCATCAGTTGGGTTGTGGGGAGATGTCGCAAAAGTAAGA
AGATTTATGAAGAACAGTAGAGTAAAAAAGGAACCTGGTATGAGTTGGATTGAAGTGAAA
GATAGTATTTACACATTTATAGTAGGAGACAGAAGCCATCCGCGAAGTGATGATATATAT
GCCAAACTGGAGGAACTGGGACAGCTAATGGCTAAAGCTGGTTATGTTCCTATGGTAGAT
ATTGATCTCCATGATGTAGAGAGGAGACAAAAGGAGATTCTTCTCTCCTATCATAGTGAG
AAACTAGCTGTTGCATTTGGGCTGATTGTTACACCTCCTGGTGCTCCTATTAGAGTGAAG
AAGAATCTTCGGATTTGTTTGGACTGCCATACAGCATTCAAGTTCATTTGTAAAATTGTC
TCAAGGGAGATCATTATTAGAGATATTAACCGGTTCCACCATTTCAAAGATGGCTCTTGC
TCATGTGGGGATTACTGGTGA