Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID	PGSC0003DMT400050551
CDS Infomation	pacid=37442744 polypeptide=PGSC0003DMP400034131 locus=PGSC0003DMG400019644 ID=PGSC0003DMT400050551.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGTCACAAAATGGTGTACATATCTTAATTTTTCCATTTCCAGCACAAGGACACATACTT CCCCTTCTTGATTTTACTCATCAACTTCTTCTTCATGGCTTTAAAATTACTATTTTAGTG ACACCTAAAAATGTCCCGATTCTTGATCCTCTTATTTCTAACCACCCATCTGTTGAAATT CTTGTTTTTCCGTTCCCCGGCCACCCATCTCTTCCCGCCGGTGTTGAAAACGTTAAGGAT GTTGGAAACTCCGGCAGTACCCCAATTATTGCTGGGCTTAGTAAGCTTCGTGGCCCAATC TTAGAGTGGTTTAAGGCCCAATCAAATCCTCCTGTGGCGATTATTTATGATTTCTTCTTG GGCTGGACTTTAGATTTGGCCCAAGAAGTTGGTGTACCCGGAATTGTATTTTATAGTTCC GGGCCTTTATTGGTTTCTATACTTGTTGATCTTTGGAAGAATTTGTGGGCTTATAAAGGT TTGGACTTTGTTGAGTTTAATGGGCTTCCAAAAAGCCCAAGGCTTGTGAGGGAACATCTT CCTTCAGTGTTTCTCAAGTTTAAAGAGGATGATCCAACTTGGGAGATTGTTAGAAATGGG TTTATTGCAAATGGTAGGAGTTTTGGGTCAATTTTCAATACTTTTGAGGCTTTGGAGAGT GATTATTTGGGCTTTTTGAAGAAGGAAATGGGCCATGAGCGTGTGTATTCAATTGGGCCT ATAAATTTGGTTGGTGGGCCTGGTAGAATTGGGAAGTCTAATGTTGATGCAAATGAGAGA GTTTTTACTTGGCTTGATGAGTGTCCTAATGAATCTGTTCTTTATGTAGCTTTTGGAAGC CAAAAGTTACTAACAAAGGCCCAAATGGAGGCCTTAACTATTGGGCTTGAGAAAAGTGGA ATGAGGTTCATTTTAGTAGCTAAACAATTGACAGCCCAACAAGAGGAACAAGGTTTTGGA TCAGTGCCAAAAGGGTTTGAGGAGAGAGTCTTCGGGAAAGGCCTAGTAATAAAGGGTTGG GCCCCACAAGTGGAGATATTGGGCCATCGAGCCGTTAGTGGGTTTTTGAGTCACTGTGGA TGGAATTCAGTGTTGGAAGCGATAGTGGCGGGAGTAGTAATTTTAGGATGGCCCATGGAG GCCGACCAATTCATAAACACGTGGTTGTTGGTGGATAATATGAAGACATCGGTCCGAGTT TGTGAGGGCTCAGACTCGGTGCCTGACCCGATAGAGTTGGGTCGGAAAATTAATGAGGCA ATGAGTAATGATTTGTTTAAGGAGAGGGCCAAAAAAATGAGAGATGAAGCACTTAAAGCT GTTAAAATTGGAGGGGGCTCTAAAAAGGATTTGGATTCTATTGTAAAAGAGTTGGGCCAA CTAAGAGTTGAAAATTCATGCAAATGGGCTAAACACTTTTAA

Peptide Sequence

PEP ID	PGSC0003DMP400034131
PEP Infomation	pacid=37442744 transcript=PGSC0003DMT400050551 locus=PGSC0003DMG400019644 ID=PGSC0003DMT400050551.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	MSQNGVHILIFPFPAQGHILPLLDFTHQLLLHGFKITILVTPKNVPILDPLISNHPSVEI LVFPFPGHPSLPAGVENVKDVGNSGSTPIIAGLSKLRGPILEWFKAQSNPPVAIIYDFFL GWTLDLAQEVGVPGIVFYSSGPLLVSILVDLWKNLWAYKGLDFVEFNGLPKSPRLVREHL PSVFLKFKEDDPTWEIVRNGFIANGRSFGSIFNTFEALESDYLGFLKKEMGHERVYSIGP INLVGGPGRIGKSNVDANERVFTWLDECPNESVLYVAFGSQKLLTKAQMEALTIGLEKSG MRFILVAKQLTAQQEEQGFGSVPKGFEERVFGKGLVIKGWAPQVEILGHRAVSGFLSHCG WNSVLEAIVAGVVILGWPMEADQFINTWLLVDNMKTSVRVCEGSDSVPDPIELGRKINEA MSNDLFKERAKKMRDEALKAVKIGGGSKKDLDSIVKELGQLRVENSCKWAKHF*

Transcript Sequence

Transcript ID	PGSC0003DMT400050551
Transcript Infomation	pacid=37442744 locus=PGSC0003DMG400019644 ID=PGSC0003DMT400050551.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGTCACAAAATGGTGTACATATCTTAATTTTTCCATTTCCAGCACAAGGACACATACTT CCCCTTCTTGATTTTACTCATCAACTTCTTCTTCATGGCTTTAAAATTACTATTTTAGTG ACACCTAAAAATGTCCCGATTCTTGATCCTCTTATTTCTAACCACCCATCTGTTGAAATT CTTGTTTTTCCGTTCCCCGGCCACCCATCTCTTCCCGCCGGTGTTGAAAACGTTAAGGAT GTTGGAAACTCCGGCAGTACCCCAATTATTGCTGGGCTTAGTAAGCTTCGTGGCCCAATC TTAGAGTGGTTTAAGGCCCAATCAAATCCTCCTGTGGCGATTATTTATGATTTCTTCTTG GGCTGGACTTTAGATTTGGCCCAAGAAGTTGGTGTACCCGGAATTGTATTTTATAGTTCC GGGCCTTTATTGGTTTCTATACTTGTTGATCTTTGGAAGAATTTGTGGGCTTATAAAGGT TTGGACTTTGTTGAGTTTAATGGGCTTCCAAAAAGCCCAAGGCTTGTGAGGGAACATCTT CCTTCAGTGTTTCTCAAGTTTAAAGAGGATGATCCAACTTGGGAGATTGTTAGAAATGGG TTTATTGCAAATGGTAGGAGTTTTGGGTCAATTTTCAATACTTTTGAGGCTTTGGAGAGT GATTATTTGGGCTTTTTGAAGAAGGAAATGGGCCATGAGCGTGTGTATTCAATTGGGCCT ATAAATTTGGTTGGTGGGCCTGGTAGAATTGGGAAGTCTAATGTTGATGCAAATGAGAGA GTTTTTACTTGGCTTGATGAGTGTCCTAATGAATCTGTTCTTTATGTAGCTTTTGGAAGC CAAAAGTTACTAACAAAGGCCCAAATGGAGGCCTTAACTATTGGGCTTGAGAAAAGTGGA ATGAGGTTCATTTTAGTAGCTAAACAATTGACAGCCCAACAAGAGGAACAAGGTTTTGGA TCAGTGCCAAAAGGGTTTGAGGAGAGAGTCTTCGGGAAAGGCCTAGTAATAAAGGGTTGG GCCCCACAAGTGGAGATATTGGGCCATCGAGCCGTTAGTGGGTTTTTGAGTCACTGTGGA TGGAATTCAGTGTTGGAAGCGATAGTGGCGGGAGTAGTAATTTTAGGATGGCCCATGGAG GCCGACCAATTCATAAACACGTGGTTGTTGGTGGATAATATGAAGACATCGGTCCGAGTT TGTGAGGGCTCAGACTCGGTGCCTGACCCGATAGAGTTGGGTCGGAAAATTAATGAGGCA ATGAGTAATGATTTGTTTAAGGAGAGGGCCAAAAAAATGAGAGATGAAGCACTTAAAGCT GTTAAAATTGGAGGGGGCTCTAAAAAGGATTTGGATTCTATTGTAAAAGAGTTGGGCCAA CTAAGAGTTGAAAATTCATGCAAATGGGCTAAACACTTTTAA