Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400050201
CDS Infomation

pacid=37465080 polypeptide=PGSC0003DMP400033883 locus=PGSC0003DMG400019493 ID=PGSC0003DMT400050201.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGTTAACATCACCGGTCCACGATGACACGACCATCTCCTCAGCGTCTGCAACTGTCAGC
TCGACCACGTTAGAGGTAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGTTCGTGTTAGCGTGGACATGGAG
GTGGAAACAAACATGTTCAATGTACATACCTCATTTTCATCCTCTACCAAGCCCCATGCA
ACGTGTAGAGATCCATGCTGGAACGTCATGCAATCAGAAGTCTCGAGTTTGAGCCTGGAC
GATTTTTGCTTCATTAGGAAACTTGGGAGTGGTGACATTGGTTCTGTGTATCTTGTTGAG
TTGAAGGGTAATAATAAAGGGTGTTTGTTTGCAGCTAAAGTGATGGATAAAGAGGAATTG
GTTAGTAGGAGTAAAGAAGGTAGAGCAGGGACAGAAAGGGAAATATTGGAAATGTTGGAT
CATCCTTTTTTGCCTACACTTTACACTACTTTGGATACTGATAAATGGTCTCTTTTGTTG
ACTGAGTTTTGTCCTGGTGGTGATCTTCATGTTCTCCGGCAACGGCTGCCGGAAAAAAGA
TTCGATGAAGCCGCGGTTCGGTTTTACACATCAGAAGTTGTGGTTGCTTTAGAGTATCTA
CATATGATGGGAATAATTTATCGTGATTTAAAGCCAGAAAATGTGTTAGTAAGATCAGAT
GGTCATATTATGTTAACTGATTTTGATCTTTCACTAAAATGTGATGATTTAGTAATGCCT
CAACTTGTTCATGATGAGGGTACTAGTCCAAATTACATACATTATAATAATTCAAATGAT
CATAATTCGCCTTCGTATAATTCATCGTCACCGTGCATCTTGCCTAATTGTATCGTGCCA
CAGTACGTCTCGTGTTGGTACTCTAAGCACATGAGAAGACGAAGAAGAAGAAGAGGAAGA
GGAGGAACGAGTACTGAGAGACCCTTGAGGTTGATAGCTGAGCCGATTGAGGCTCGGTCG
ATGTCGTTTGTCGGGACCCACGAGTACTTGGCCCCGGAGATCGTGTCGGGGGAAGGACAT
GGTAATGCGGTGGATTGGTGGACGCTAGGGATTTTCATGTACGAGTTGCTTTATGGTGTG
ACACCTTTTAGAGGACTTGATAATGAGTTCACCCTATCGAACATTGTGGCTCGAGCCTTT
GAGTTCCCTAAAGAGCCATTGGTCCCAAACATGGCTAAGGACTTGATCACTCAACTTTTG
GTCAAGGACCCCACCATGAGAATGGGGTCCATGATGGGGGCCACAACAATAAAACAACAT
CCTTTCTTTGATGGTGTGAATTGGGCACTATTAAGATGTACTACCCCACCTCATATTCCA
ACAAATTTCAATAGTACTAGAGACTTTGTCTCAGCTTATGATGATGATTATGTAGATTAT
TATTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400033883
PEP Infomation

pacid=37465080 transcript=PGSC0003DMT400050201 locus=PGSC0003DMG400019493 ID=PGSC0003DMT400050201.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MLTSPVHDDTTISSASATVSSTTLEVGEGEGEVRVSVDMEVETNMFNVHTSFSSSTKPHA
TCRDPCWNVMQSEVSSLSLDDFCFIRKLGSGDIGSVYLVELKGNNKGCLFAAKVMDKEEL
VSRSKEGRAGTEREILEMLDHPFLPTLYTTLDTDKWSLLLTEFCPGGDLHVLRQRLPEKR
FDEAAVRFYTSEVVVALEYLHMMGIIYRDLKPENVLVRSDGHIMLTDFDLSLKCDDLVMP
QLVHDEGTSPNYIHYNNSNDHNSPSYNSSSPCILPNCIVPQYVSCWYSKHMRRRRRRRGR
GGTSTERPLRLIAEPIEARSMSFVGTHEYLAPEIVSGEGHGNAVDWWTLGIFMYELLYGV
TPFRGLDNEFTLSNIVARAFEFPKEPLVPNMAKDLITQLLVKDPTMRMGSMMGATTIKQH
PFFDGVNWALLRCTTPPHIPTNFNSTRDFVSAYDDDYVDYY*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400050201
Transcript Infomation

pacid=37465080 locus=PGSC0003DMG400019493 ID=PGSC0003DMT400050201.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGTTAACATCACCGGTCCACGATGACACGACCATCTCCTCAGCGTCTGCAACTGTCAGC
TCGACCACGTTAGAGGTAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGTTCGTGTTAGCGTGGACATGGAG
GTGGAAACAAACATGTTCAATGTACATACCTCATTTTCATCCTCTACCAAGCCCCATGCA
ACGTGTAGAGATCCATGCTGGAACGTCATGCAATCAGAAGTCTCGAGTTTGAGCCTGGAC
GATTTTTGCTTCATTAGGAAACTTGGGAGTGGTGACATTGGTTCTGTGTATCTTGTTGAG
TTGAAGGGTAATAATAAAGGGTGTTTGTTTGCAGCTAAAGTGATGGATAAAGAGGAATTG
GTTAGTAGGAGTAAAGAAGGTAGAGCAGGGACAGAAAGGGAAATATTGGAAATGTTGGAT
CATCCTTTTTTGCCTACACTTTACACTACTTTGGATACTGATAAATGGTCTCTTTTGTTG
ACTGAGTTTTGTCCTGGTGGTGATCTTCATGTTCTCCGGCAACGGCTGCCGGAAAAAAGA
TTCGATGAAGCCGCGGTTCGGTTTTACACATCAGAAGTTGTGGTTGCTTTAGAGTATCTA
CATATGATGGGAATAATTTATCGTGATTTAAAGCCAGAAAATGTGTTAGTAAGATCAGAT
GGTCATATTATGTTAACTGATTTTGATCTTTCACTAAAATGTGATGATTTAGTAATGCCT
CAACTTGTTCATGATGAGGGTACTAGTCCAAATTACATACATTATAATAATTCAAATGAT
CATAATTCGCCTTCGTATAATTCATCGTCACCGTGCATCTTGCCTAATTGTATCGTGCCA
CAGTACGTCTCGTGTTGGTACTCTAAGCACATGAGAAGACGAAGAAGAAGAAGAGGAAGA
GGAGGAACGAGTACTGAGAGACCCTTGAGGTTGATAGCTGAGCCGATTGAGGCTCGGTCG
ATGTCGTTTGTCGGGACCCACGAGTACTTGGCCCCGGAGATCGTGTCGGGGGAAGGACAT
GGTAATGCGGTGGATTGGTGGACGCTAGGGATTTTCATGTACGAGTTGCTTTATGGTGTG
ACACCTTTTAGAGGACTTGATAATGAGTTCACCCTATCGAACATTGTGGCTCGAGCCTTT
GAGTTCCCTAAAGAGCCATTGGTCCCAAACATGGCTAAGGACTTGATCACTCAACTTTTG
GTCAAGGACCCCACCATGAGAATGGGGTCCATGATGGGGGCCACAACAATAAAACAACAT
CCTTTCTTTGATGGTGTGAATTGGGCACTATTAAGATGTACTACCCCACCTCATATTCCA
ACAAATTTCAATAGTACTAGAGACTTTGTCTCAGCTTATGATGATGATTATGTAGATTAT
TATTAA