Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400050126
CDS Infomation

pacid=37467453 polypeptide=PGSC0003DMP400033842 locus=PGSC0003DMG400019465 ID=PGSC0003DMT400050126.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGGGTTTGAGGGTATGAAAAAGTTGAAGCCTTTATTGCATTTGTTGTTGCCATTATGT
GTTCATTGGATTGCTGAAGAGATGACTGTTTCTGTGCTTGTTGATGTTACTACTGGTGCT
CTTTGTCCAGGCAAAACCACTTGTTCTGAAGCTATTTACATCAATGGTGTTCAACAAACA
GTCGTTGGAATATTCAAGATGATAGTCCTTCCTATCCTAGGTCAGCTTGCAGATGAGTAT
GGGCGTAAACCGCTTCTTATTCTCACTGTATCTACAACAATTATTCCTTTCGGTTTACTC
ACCATCAATAAGTCAAGGGAAATGGTCTATGCTTATTATATCTTGCGGACGATTTCCTAT
ATCATAAGTCAAGGGAGCATTTTCTGTATCTCTGTTGCTTATGCGGCAGATGTTGTTGAC
GTGAGTAGTAGAGCTGCAGTTTTTAGTTGGATTACAGGCCTTTTTTCTGCATCCCATGTT
CTCGGAAATGTCCTCGCACGTTTTCTTCCCGTGGGCTACATTTTCCAGGTTTCAATAGGT
CTCTTGATCTTTGTTCCTGTTTATATGCAAGTGTTTCTAGAAGAGACTGTAGCACCAAAA
ACAGAGGTGAGCCAAAGTTCGACACTAAAGAGCAATACCTTGAAGATTGTCAAGGAACGA
TATAACTCAATGCGATATGCTGCAAATCTTGTCACTAGCAGCCCAACACTGAAGTGCATT
TCTCTTGTATCTTTCTTCTACGAGTTGGGAATGTCCGGGATCAGCGGCGTTTTACTGTAC
TATTTGAAATCAGCCTTTGGCTTCAACAAGAATCAGTTCTCAGAAATTTTGATGATGGTG
GGAGTCGGTTCCATAGTCTCACAGATTGTGGTGCTTCCTCTCATCAATCCTCTTTTTGGG
GAGAAAGTGATACTTTGTATGGCCTTGCTTTCATCAATTGCCTATGCAATGCTCTATGGA
TTAGCATGGGCACCTTGGGTGCCATATTTAAGTGCTTCTTTTGGGGTCATCTACATCCTT
GTTAAACCTTCTACTTATGCTGTAATATCTAAAGCAGCACTTTCAGCAGATCAGGGCAAA
GCACAGGGATTTGTTGCTGGTATTCAATCAGTCGCGAGTTTGTTATCTCCAATTGTAATG
AGTCCATTGACCTCATGGTTTTTATCCCGCGATGCACCTTTCAACTGCAAAGGATTCAGT
ATACTCTGTGCTTCTTTATGCATGGTGGTTTCACTGTGTTATGCTAGCACGCTAAAAGTT
GAGGCACCACGAGAGAGGACCTTCGATGAAAATGCAGAGAACATTGAAGCACCACTTTTG
ACATGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400033842
PEP Infomation

pacid=37467453 transcript=PGSC0003DMT400050126 locus=PGSC0003DMG400019465 ID=PGSC0003DMT400050126.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MGFEGMKKLKPLLHLLLPLCVHWIAEEMTVSVLVDVTTGALCPGKTTCSEAIYINGVQQT
VVGIFKMIVLPILGQLADEYGRKPLLILTVSTTIIPFGLLTINKSREMVYAYYILRTISY
IISQGSIFCISVAYAADVVDVSSRAAVFSWITGLFSASHVLGNVLARFLPVGYIFQVSIG
LLIFVPVYMQVFLEETVAPKTEVSQSSTLKSNTLKIVKERYNSMRYAANLVTSSPTLKCI
SLVSFFYELGMSGISGVLLYYLKSAFGFNKNQFSEILMMVGVGSIVSQIVVLPLINPLFG
EKVILCMALLSSIAYAMLYGLAWAPWVPYLSASFGVIYILVKPSTYAVISKAALSADQGK
AQGFVAGIQSVASLLSPIVMSPLTSWFLSRDAPFNCKGFSILCASLCMVVSLCYASTLKV
EAPRERTFDENAENIEAPLLT*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400050126
Transcript Infomation

pacid=37467453 locus=PGSC0003DMG400019465 ID=PGSC0003DMT400050126.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGGGTTTGAGGGTATGAAAAAGTTGAAGCCTTTATTGCATTTGTTGTTGCCATTATGT
GTTCATTGGATTGCTGAAGAGATGACTGTTTCTGTGCTTGTTGATGTTACTACTGGTGCT
CTTTGTCCAGGCAAAACCACTTGTTCTGAAGCTATTTACATCAATGGTGTTCAACAAACA
GTCGTTGGAATATTCAAGATGATAGTCCTTCCTATCCTAGGTCAGCTTGCAGATGAGTAT
GGGCGTAAACCGCTTCTTATTCTCACTGTATCTACAACAATTATTCCTTTCGGTTTACTC
ACCATCAATAAGTCAAGGGAAATGGTCTATGCTTATTATATCTTGCGGACGATTTCCTAT
ATCATAAGTCAAGGGAGCATTTTCTGTATCTCTGTTGCTTATGCGGCAGATGTTGTTGAC
GTGAGTAGTAGAGCTGCAGTTTTTAGTTGGATTACAGGCCTTTTTTCTGCATCCCATGTT
CTCGGAAATGTCCTCGCACGTTTTCTTCCCGTGGGCTACATTTTCCAGGTTTCAATAGGT
CTCTTGATCTTTGTTCCTGTTTATATGCAAGTGTTTCTAGAAGAGACTGTAGCACCAAAA
ACAGAGGTGAGCCAAAGTTCGACACTAAAGAGCAATACCTTGAAGATTGTCAAGGAACGA
TATAACTCAATGCGATATGCTGCAAATCTTGTCACTAGCAGCCCAACACTGAAGTGCATT
TCTCTTGTATCTTTCTTCTACGAGTTGGGAATGTCCGGGATCAGCGGCGTTTTACTGTAC
TATTTGAAATCAGCCTTTGGCTTCAACAAGAATCAGTTCTCAGAAATTTTGATGATGGTG
GGAGTCGGTTCCATAGTCTCACAGATTGTGGTGCTTCCTCTCATCAATCCTCTTTTTGGG
GAGAAAGTGATACTTTGTATGGCCTTGCTTTCATCAATTGCCTATGCAATGCTCTATGGA
TTAGCATGGGCACCTTGGGTGCCATATTTAAGTGCTTCTTTTGGGGTCATCTACATCCTT
GTTAAACCTTCTACTTATGCTGTAATATCTAAAGCAGCACTTTCAGCAGATCAGGGCAAA
GCACAGGGATTTGTTGCTGGTATTCAATCAGTCGCGAGTTTGTTATCTCCAATTGTAATG
AGTCCATTGACCTCATGGTTTTTATCCCGCGATGCACCTTTCAACTGCAAAGGATTCAGT
ATACTCTGTGCTTCTTTATGCATGGTGGTTTCACTGTGTTATGCTAGCACGCTAAAAGTT
GAGGCACCACGAGAGAGGACCTTCGATGAAAATGCAGAGAACATTGAAGCACCACTTTTG
ACATGA