Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400049675
CDS Infomation

pacid=37456203 polypeptide=PGSC0003DMP400033531 locus=PGSC0003DMG400019301 ID=PGSC0003DMT400049675.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGTTGTGAAGATATGTGAAAAGTTGCCATGGAGTTATTCACATGTTGGTGTGGAGTTG
GTTTTGGATCATAAGAATTCACCTTTTTTGAAACCAACTAGTGATCTTGTTTGTGCACAG
AATTTGGAGGCTCATTTGCACTTGCTTGACGGGTGCATGGATGACATATATGATGCTTTG
GCCGAACACCTTGTTTCAACTGCAGCAGCAGCATCAAGCCCTTATTTCAAGCATATTGTT
GGTCTTGCTGGTCCTCCCGGTGCTGGAAAGAGCACTGTCGCATCTGAAGTAGCTAAGAGA
GTCAATAAGATATGGCCCCAAAAGTCTCCTTCCTTTGATTCTCAAGTTGAGCCTCCAGAA
GTTGCCATTGTTCTTCCAATGGATGGATTCCACCTTTATCGCCATCAGCTTGATGCAATG
GAGGATCCAGAGGAAGCACATGCGAGAAGGGGTGCTCCATGGACGTTTGACCCCAATTTA
CTACTAGAATGCCTTAAGACTCTTAAAGATCAGGGATCAGTGTACTGTCCATCTTTTGAC
CATGGTGTAGGAGATCCTATAGAAGATGATATCTTTGTGAACCTTCAACACAAAATAGTG
ATAGTTGAAGGTAATTATCTGCTGCTTGGAGATGGTGCTTGGAAGGAGGTATCATCCATG
TTTGATGAGAAGTGGTTCGTCGATGTTGATCTTGAGAAAGCAATGCAACGTGTCCTGAAG
AGACATATATCTACAGGGAAGTCCCCTGATGTTGCTAAATGGAGGATAGATTACAATGAC
AGGCCCAATGCTGAGCTAATTATGAAGTCCAAGAACAATGCAGATTTGGTGATCAAGTCG
ATTGACGAATTGAGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400033531
PEP Infomation

pacid=37456203 transcript=PGSC0003DMT400049675 locus=PGSC0003DMG400019301 ID=PGSC0003DMT400049675.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MVVKICEKLPWSYSHVGVELVLDHKNSPFLKPTSDLVCAQNLEAHLHLLDGCMDDIYDAL
AEHLVSTAAAASSPYFKHIVGLAGPPGAGKSTVASEVAKRVNKIWPQKSPSFDSQVEPPE
VAIVLPMDGFHLYRHQLDAMEDPEEAHARRGAPWTFDPNLLLECLKTLKDQGSVYCPSFD
HGVGDPIEDDIFVNLQHKIVIVEGNYLLLGDGAWKEVSSMFDEKWFVDVDLEKAMQRVLK
RHISTGKSPDVAKWRIDYNDRPNAELIMKSKNNADLVIKSIDELR*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400049675
Transcript Infomation

pacid=37456203 locus=PGSC0003DMG400019301 ID=PGSC0003DMT400049675.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGTTGTGAAGATATGTGAAAAGTTGCCATGGAGTTATTCACATGTTGGTGTGGAGTTG
GTTTTGGATCATAAGAATTCACCTTTTTTGAAACCAACTAGTGATCTTGTTTGTGCACAG
AATTTGGAGGCTCATTTGCACTTGCTTGACGGGTGCATGGATGACATATATGATGCTTTG
GCCGAACACCTTGTTTCAACTGCAGCAGCAGCATCAAGCCCTTATTTCAAGCATATTGTT
GGTCTTGCTGGTCCTCCCGGTGCTGGAAAGAGCACTGTCGCATCTGAAGTAGCTAAGAGA
GTCAATAAGATATGGCCCCAAAAGTCTCCTTCCTTTGATTCTCAAGTTGAGCCTCCAGAA
GTTGCCATTGTTCTTCCAATGGATGGATTCCACCTTTATCGCCATCAGCTTGATGCAATG
GAGGATCCAGAGGAAGCACATGCGAGAAGGGGTGCTCCATGGACGTTTGACCCCAATTTA
CTACTAGAATGCCTTAAGACTCTTAAAGATCAGGGATCAGTGTACTGTCCATCTTTTGAC
CATGGTGTAGGAGATCCTATAGAAGATGATATCTTTGTGAACCTTCAACACAAAATAGTG
ATAGTTGAAGGTAATTATCTGCTGCTTGGAGATGGTGCTTGGAAGGAGGTATCATCCATG
TTTGATGAGAAGTGGTTCGTCGATGTTGATCTTGAGAAAGCAATGCAACGTGTCCTGAAG
AGACATATATCTACAGGGAAGTCCCCTGATGTTGCTAAATGGAGGATAGATTACAATGAC
AGGCCCAATGCTGAGCTAATTATGAAGTCCAAGAACAATGCAGATTTGGTGATCAAGTCG
ATTGACGAATTGAGGTGA