Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400049574
CDS Infomation

pacid=37434689 polypeptide=PGSC0003DMP400033461 locus=PGSC0003DMG400019257 ID=PGSC0003DMT400049574.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCTTCCACCTTGGCTTCCTCTGTTATTTCCAAGACTAATTTCATTGACACACACAAA
TCATCCTTCTATGGCGTTCCAATTTCATCACAAGCTCGATTGAAAATCGTTAAATCGACT
CCACAAAACATGGCTGTTTCCATGTCTGCTGATGCTTCTCCTCCTCCTCCTCCTTACGAT
CTCGGAAGTTTCAGTTTTAATCCGATTAAGGAATCGATTGTTGCTCGGGAAATGACACGG
AGGTATATGACGGATATGATCACTTATGCTGATACTGATGTTGTTATTGTTGGTGCTGGA
TCTGCTGGTTTATCTTGTGCTTATGAACTCAGCAAGAACCCTGATGTTCAGGTGGCCATT
CTTGAGCAATCTGTGAGCCCTGGTGGAGGTGCTTGGCTAGGCGGACAACTCTTCTCTGCT
ATGGTTGTGCGTAAGCCAGCACATCTTTTCCTGAACGAGCTAGGCATTGACTACGACGAG
CAAGACCACTACGTGGTCATCAAACACGCTGCCTTGTTCACCTCAACCATCATGAGCAAG
CTTTTGGCCAGGCCAAATGTGAAGCTCTTCAATGCTGTTGCAACAGAGGACCTTATCGTG
AAGAACGGAAGAGTCGGTGGTGTTGTCACTAACTGGTCTTTGGTTTCCCAGAACCATGAC
ACACAATCATGCATGGACCCTAATGTTATGGAGGCTAAGGTTGTGGTCAGTTCCTGCGGC
CACGACGGCCCCATGGGCGCCACCGGTGTTAAGAGGCTCAGGAGCATTGGCATGATTAAC
AGTGTTCCTGGAATGAAAGCTTTGGACATGAACGCTGCTGAGGACGCGATTGTTAGACTT
ACCAGAGAAGTTGTACCTGGTATGATTGTTACAGGAATGGAAGTTGCTGAAATTGATGGA
GCACCACGAATGGGTCCAACTTTTGGAGCTATGATGATATCAGGACAGAAGGCAGCTCAC
CTCGCCCTACGAGCGTTGGGATTGCCCAACGCCCTTGATGGAACTGCAGAAACAAGCATC
CTCCCAGAGCTTATGTTGGCTGCAGCTGATGAAGCTGAAATTGCTGATGCTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400033461
PEP Infomation

pacid=37434689 transcript=PGSC0003DMT400049574 locus=PGSC0003DMG400019257 ID=PGSC0003DMT400049574.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MASTLASSVISKTNFIDTHKSSFYGVPISSQARLKIVKSTPQNMAVSMSADASPPPPPYD
LGSFSFNPIKESIVAREMTRRYMTDMITYADTDVVIVGAGSAGLSCAYELSKNPDVQVAI
LEQSVSPGGGAWLGGQLFSAMVVRKPAHLFLNELGIDYDEQDHYVVIKHAALFTSTIMSK
LLARPNVKLFNAVATEDLIVKNGRVGGVVTNWSLVSQNHDTQSCMDPNVMEAKVVVSSCG
HDGPMGATGVKRLRSIGMINSVPGMKALDMNAAEDAIVRLTREVVPGMIVTGMEVAEIDG
APRMGPTFGAMMISGQKAAHLALRALGLPNALDGTAETSILPELMLAAADEAEIADA*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400049574
Transcript Infomation

pacid=37434689 locus=PGSC0003DMG400019257 ID=PGSC0003DMT400049574.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCTTCCACCTTGGCTTCCTCTGTTATTTCCAAGACTAATTTCATTGACACACACAAA
TCATCCTTCTATGGCGTTCCAATTTCATCACAAGCTCGATTGAAAATCGTTAAATCGACT
CCACAAAACATGGCTGTTTCCATGTCTGCTGATGCTTCTCCTCCTCCTCCTCCTTACGAT
CTCGGAAGTTTCAGTTTTAATCCGATTAAGGAATCGATTGTTGCTCGGGAAATGACACGG
AGGTATATGACGGATATGATCACTTATGCTGATACTGATGTTGTTATTGTTGGTGCTGGA
TCTGCTGGTTTATCTTGTGCTTATGAACTCAGCAAGAACCCTGATGTTCAGGTGGCCATT
CTTGAGCAATCTGTGAGCCCTGGTGGAGGTGCTTGGCTAGGCGGACAACTCTTCTCTGCT
ATGGTTGTGCGTAAGCCAGCACATCTTTTCCTGAACGAGCTAGGCATTGACTACGACGAG
CAAGACCACTACGTGGTCATCAAACACGCTGCCTTGTTCACCTCAACCATCATGAGCAAG
CTTTTGGCCAGGCCAAATGTGAAGCTCTTCAATGCTGTTGCAACAGAGGACCTTATCGTG
AAGAACGGAAGAGTCGGTGGTGTTGTCACTAACTGGTCTTTGGTTTCCCAGAACCATGAC
ACACAATCATGCATGGACCCTAATGTTATGGAGGCTAAGGTTGTGGTCAGTTCCTGCGGC
CACGACGGCCCCATGGGCGCCACCGGTGTTAAGAGGCTCAGGAGCATTGGCATGATTAAC
AGTGTTCCTGGAATGAAAGCTTTGGACATGAACGCTGCTGAGGACGCGATTGTTAGACTT
ACCAGAGAAGTTGTACCTGGTATGATTGTTACAGGAATGGAAGTTGCTGAAATTGATGGA
GCACCACGAATGGGTCCAACTTTTGGAGCTATGATGATATCAGGACAGAAGGCAGCTCAC
CTCGCCCTACGAGCGTTGGGATTGCCCAACGCCCTTGATGGAACTGCAGAAACAAGCATC
CTCCCAGAGCTTATGTTGGCTGCAGCTGATGAAGCTGAAATTGCTGATGCTTGA