Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400049308
CDS Infomation

pacid=37443628 polypeptide=PGSC0003DMP400033291 locus=PGSC0003DMG400019163 ID=PGSC0003DMT400049308.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCAAGCTAATTTGCTTTCCCCACCTCTACACCCCACCACCCCCAAAATCCCATCTTTT
AATACCCAATGTAGACCCTACTACAGTAGACTCCCACCCACCCTCACCATCCGAGCCGCC
GGAGCACCACCGGAGACTACCAACTCAACAATCCCATCTCAAAAACTCAACAAATTCAGC
AGCCGGATTACTGAACCCAAGTCCCAAGGTGGTTCACAAGCGATTCTGTACGGTGTAGGA
TTATCTGATGATGATATGAAAAAACCCCAAATTGGGATTTCATCTGTTTGGTATGAAGGG
AACACTTGTAATATGCATTTGTTGAAACTTGCTGAAGCTGTTAAAGAAGGGGTTCTAGAA
GCTGATATGGTGGGATTCAGGTTTAATACTATAGGTGTTAGTGATGCTATTTCTATGGGA
ACTAGAGGAATGTGTTTTAGTTTGCAGTCAAGAGATTTGATTGCTGATAGTATTGAAACT
GTTATGTCTGCTCAGTGGTATGATGGGAATATTGCTATACCTGGATGTGATAAAAATATG
CCAGGCACAATTATGGCGATGGGAAGATTAAACAGGCCAAGTATCATGATATATGGTGGA
ACCATTAAGCCTGGTCATTTTCAAGGGCACACATTCGACATAATATCGGCCTTCCAGGTG
TATGGAGAGTATGTTAGTGGTGGTGTCAGTGATGAGCAAAGGATGAATGTAGTTCGTAAT
TCATGTCCGGGTGCGGGGGCTTGTGGTGGAATGTATACTGCAAACACCATGGCATCTGCT
ATTGAGACATTGGGCATGTCGCTGCCTTATAGCTCTTCCACACCTGCTGAAGATCCACTG
AAGTTGGATGAGTGCCGCCTAGCGGGGAAATATCTTTTGGAATTGTTGAAGATGGACTTG
AAGCCTCGAGATATCATCACAAAAAGGTCACTTCGAAATGCAATGGTGATGGTCATGGCA
CTTGGTGGATCTACAAATGCTGTACTACATTTAATTGCTATTGCAAGATCTGTTGGCCTG
GAATTAACTCTAGATGACTTCCAGAAGGTTAGCGATAAGGTTCCTTTCCTTGCAGATCTG
AAGCCTAGTGGAAAATACGTCATGGAGGATGTGCACAAGATTGGAGGTACACCTGCAGTC
ATCCGCCACCTGTTGGAGCTTGGGTATTTGGATGGAGACTGTATGACTGTCACGGGAAAG
ACTCTGGCTGAAAATGCAAAGCTATTTCCTTCTTTAGCTGAAGGTCAGCAAATTATAAGG
CCGTTGTCAAACCCCATCAAAGAAACAGGCCATATTCAGATATTATATGGAAACCTTGCA
CCAGAGGGCAGCGTGGCAAAGATCACTGGAAAAGAAGGGATGTACTTTAAAGGCCCCGCT
CTAGTGTTTGAAGGAGAGGAAGCTATGATTGCGGCTATCTCAGAAGACCCTTTGAGTTTT
AAGGGAAAAGTTGTAGTCATTAGAGGAGAGGGGCCTAAGGGAGGACCAGGAATGCCTGAA
ATGCTGACACCCACAAGTGCAATTATGGGCGCTGGTCTTGGGAAGGATGTTGCATTACTT
ACTGATGGAAGATTTTCTGGAGGTTCTCATGGATATGTCGTTGGGCATATATGTCCTGAA
GCACAGGAAGGAGGTCCAATCGGTCTTGTTCAAAATGGAGACATTATAACAATCGACATT
CAAAAGAAGAAAATGGACGTGCAGTTATCAGACGAGGAGTTGGAGCAACGTAGAAAGAAT
TGGACTCCCCCTGCATATAAAGCTGATCGAGGTGTTCTCTACAAGTATATAAAAAATGTG
CAATCTGCATCCAAGGGATGTGTTACTGATGAATAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400033291
PEP Infomation

pacid=37443628 transcript=PGSC0003DMT400049308 locus=PGSC0003DMG400019163 ID=PGSC0003DMT400049308.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MQANLLSPPLHPTTPKIPSFNTQCRPYYSRLPPTLTIRAAGAPPETTNSTIPSQKLNKFS
SRITEPKSQGGSQAILYGVGLSDDDMKKPQIGISSVWYEGNTCNMHLLKLAEAVKEGVLE
ADMVGFRFNTIGVSDAISMGTRGMCFSLQSRDLIADSIETVMSAQWYDGNIAIPGCDKNM
PGTIMAMGRLNRPSIMIYGGTIKPGHFQGHTFDIISAFQVYGEYVSGGVSDEQRMNVVRN
SCPGAGACGGMYTANTMASAIETLGMSLPYSSSTPAEDPLKLDECRLAGKYLLELLKMDL
KPRDIITKRSLRNAMVMVMALGGSTNAVLHLIAIARSVGLELTLDDFQKVSDKVPFLADL
KPSGKYVMEDVHKIGGTPAVIRHLLELGYLDGDCMTVTGKTLAENAKLFPSLAEGQQIIR
PLSNPIKETGHIQILYGNLAPEGSVAKITGKEGMYFKGPALVFEGEEAMIAAISEDPLSF
KGKVVVIRGEGPKGGPGMPEMLTPTSAIMGAGLGKDVALLTDGRFSGGSHGYVVGHICPE
AQEGGPIGLVQNGDIITIDIQKKKMDVQLSDEELEQRRKNWTPPAYKADRGVLYKYIKNV
QSASKGCVTDE*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400049308
Transcript Infomation

pacid=37443628 locus=PGSC0003DMG400019163 ID=PGSC0003DMT400049308.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCAAGCTAATTTGCTTTCCCCACCTCTACACCCCACCACCCCCAAAATCCCATCTTTT
AATACCCAATGTAGACCCTACTACAGTAGACTCCCACCCACCCTCACCATCCGAGCCGCC
GGAGCACCACCGGAGACTACCAACTCAACAATCCCATCTCAAAAACTCAACAAATTCAGC
AGCCGGATTACTGAACCCAAGTCCCAAGGTGGTTCACAAGCGATTCTGTACGGTGTAGGA
TTATCTGATGATGATATGAAAAAACCCCAAATTGGGATTTCATCTGTTTGGTATGAAGGG
AACACTTGTAATATGCATTTGTTGAAACTTGCTGAAGCTGTTAAAGAAGGGGTTCTAGAA
GCTGATATGGTGGGATTCAGGTTTAATACTATAGGTGTTAGTGATGCTATTTCTATGGGA
ACTAGAGGAATGTGTTTTAGTTTGCAGTCAAGAGATTTGATTGCTGATAGTATTGAAACT
GTTATGTCTGCTCAGTGGTATGATGGGAATATTGCTATACCTGGATGTGATAAAAATATG
CCAGGCACAATTATGGCGATGGGAAGATTAAACAGGCCAAGTATCATGATATATGGTGGA
ACCATTAAGCCTGGTCATTTTCAAGGGCACACATTCGACATAATATCGGCCTTCCAGGTG
TATGGAGAGTATGTTAGTGGTGGTGTCAGTGATGAGCAAAGGATGAATGTAGTTCGTAAT
TCATGTCCGGGTGCGGGGGCTTGTGGTGGAATGTATACTGCAAACACCATGGCATCTGCT
ATTGAGACATTGGGCATGTCGCTGCCTTATAGCTCTTCCACACCTGCTGAAGATCCACTG
AAGTTGGATGAGTGCCGCCTAGCGGGGAAATATCTTTTGGAATTGTTGAAGATGGACTTG
AAGCCTCGAGATATCATCACAAAAAGGTCACTTCGAAATGCAATGGTGATGGTCATGGCA
CTTGGTGGATCTACAAATGCTGTACTACATTTAATTGCTATTGCAAGATCTGTTGGCCTG
GAATTAACTCTAGATGACTTCCAGAAGGTTAGCGATAAGGTTCCTTTCCTTGCAGATCTG
AAGCCTAGTGGAAAATACGTCATGGAGGATGTGCACAAGATTGGAGGTACACCTGCAGTC
ATCCGCCACCTGTTGGAGCTTGGGTATTTGGATGGAGACTGTATGACTGTCACGGGAAAG
ACTCTGGCTGAAAATGCAAAGCTATTTCCTTCTTTAGCTGAAGGTCAGCAAATTATAAGG
CCGTTGTCAAACCCCATCAAAGAAACAGGCCATATTCAGATATTATATGGAAACCTTGCA
CCAGAGGGCAGCGTGGCAAAGATCACTGGAAAAGAAGGGATGTACTTTAAAGGCCCCGCT
CTAGTGTTTGAAGGAGAGGAAGCTATGATTGCGGCTATCTCAGAAGACCCTTTGAGTTTT
AAGGGAAAAGTTGTAGTCATTAGAGGAGAGGGGCCTAAGGGAGGACCAGGAATGCCTGAA
ATGCTGACACCCACAAGTGCAATTATGGGCGCTGGTCTTGGGAAGGATGTTGCATTACTT
ACTGATGGAAGATTTTCTGGAGGTTCTCATGGATATGTCGTTGGGCATATATGTCCTGAA
GCACAGGAAGGAGGTCCAATCGGTCTTGTTCAAAATGGAGACATTATAACAATCGACATT
CAAAAGAAGAAAATGGACGTGCAGTTATCAGACGAGGAGTTGGAGCAACGTAGAAAGAAT
TGGACTCCCCCTGCATATAAAGCTGATCGAGGTGTTCTCTACAAGTATATAAAAAATGTG
CAATCTGCATCCAAGGGATGTGTTACTGATGAATAG