Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400048397
CDS Infomation

pacid=37447847 polypeptide=PGSC0003DMP400032775 locus=PGSC0003DMG400018800 ID=PGSC0003DMT400048397.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCTCCTTCAAGCAAGGCTGATAAGAAGGCTGCAGGTGATGTGGCTGCATGGATGTTC
AATGTGGTCACTTCAGTTGGAATCATTATTGTTAACAAAGCCTTAATGGCTAACTACGGG
TTTTTCTTTGCAACAACATTAACGGGGATGCATTTTGTTACAACAACTTTGATGACGATT
CTTCTTAGGTGGCTCGGGTACATCCAAGCTTCTCATTTACCCCTTCTAGATCTTCTAAAA
TTTGTACTGTGTGCAAACTTCTCTATTGTTGGGATGAACATCAGTTTGATGTGGAACTCG
GTGGGATTCTACCAGATTGCAAAGTTGAGTATGATCCCTGTCTCATGCTTACTAGAAGTT
TCCTTTGACAAGATCCGCTATTCAAGGGACACAAAGCTGAGCATTGTTGTGGTACTCCTA
GGTGTTGCTGTTTGCACAGTTACGGACGTGAGTGTTAATACCAAAGGCTTCATTGCTGCC
TTTGTAGCTGTATGGAGCACTGCTCTACAACAGTATTATGTTCATTACCTTCAAAGGAAA
TACTCCCTTAGTTCTTTCAATTTGCTGGGACATACTGCACCAGTTCAGGCTGGAAGTCTG
CTGCTATTAGGCCCGCTTGTGGATTATTGGTTGACCAACAAGAGGATTGATCACTTTGAC
TTCACTTTTCCATCTTTGGTATTCATCATTCTTTCATGCACTATAGCTATAGGCACCAAT
CTCAGCCAGTTCATATGCATTGGAAGATTCACTGCTGTTTCATTCCAAGTTATCGGTCAT
ATGAAAACAATCCTCGTTTTGATACTGGGATTCTTGTTTTTCGGGAAAGAAGGTCTCAAC
ATGCAAGTGGTAGTTGGCATGCTCATAGCAGTTTGCGGAATGATCTGGTATGGGAATGCC
TCATCTAAACCTGGTGGGAAAGAGCGTCGTAGCCATTCAATCAAGCATGGATCAGATTCG
TCACAAGCGGATGATAAGGTGTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400032775
PEP Infomation

pacid=37447847 transcript=PGSC0003DMT400048397 locus=PGSC0003DMG400018800 ID=PGSC0003DMT400048397.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MAPSSKADKKAAGDVAAWMFNVVTSVGIIIVNKALMANYGFFFATTLTGMHFVTTTLMTI
LLRWLGYIQASHLPLLDLLKFVLCANFSIVGMNISLMWNSVGFYQIAKLSMIPVSCLLEV
SFDKIRYSRDTKLSIVVVLLGVAVCTVTDVSVNTKGFIAAFVAVWSTALQQYYVHYLQRK
YSLSSFNLLGHTAPVQAGSLLLLGPLVDYWLTNKRIDHFDFTFPSLVFIILSCTIAIGTN
LSQFICIGRFTAVSFQVIGHMKTILVLILGFLFFGKEGLNMQVVVGMLIAVCGMIWYGNA
SSKPGGKERRSHSIKHGSDSSQADDKV*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400048397
Transcript Infomation

pacid=37447847 locus=PGSC0003DMG400018800 ID=PGSC0003DMT400048397.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCTCCTTCAAGCAAGGCTGATAAGAAGGCTGCAGGTGATGTGGCTGCATGGATGTTC
AATGTGGTCACTTCAGTTGGAATCATTATTGTTAACAAAGCCTTAATGGCTAACTACGGG
TTTTTCTTTGCAACAACATTAACGGGGATGCATTTTGTTACAACAACTTTGATGACGATT
CTTCTTAGGTGGCTCGGGTACATCCAAGCTTCTCATTTACCCCTTCTAGATCTTCTAAAA
TTTGTACTGTGTGCAAACTTCTCTATTGTTGGGATGAACATCAGTTTGATGTGGAACTCG
GTGGGATTCTACCAGATTGCAAAGTTGAGTATGATCCCTGTCTCATGCTTACTAGAAGTT
TCCTTTGACAAGATCCGCTATTCAAGGGACACAAAGCTGAGCATTGTTGTGGTACTCCTA
GGTGTTGCTGTTTGCACAGTTACGGACGTGAGTGTTAATACCAAAGGCTTCATTGCTGCC
TTTGTAGCTGTATGGAGCACTGCTCTACAACAGTATTATGTTCATTACCTTCAAAGGAAA
TACTCCCTTAGTTCTTTCAATTTGCTGGGACATACTGCACCAGTTCAGGCTGGAAGTCTG
CTGCTATTAGGCCCGCTTGTGGATTATTGGTTGACCAACAAGAGGATTGATCACTTTGAC
TTCACTTTTCCATCTTTGGTATTCATCATTCTTTCATGCACTATAGCTATAGGCACCAAT
CTCAGCCAGTTCATATGCATTGGAAGATTCACTGCTGTTTCATTCCAAGTTATCGGTCAT
ATGAAAACAATCCTCGTTTTGATACTGGGATTCTTGTTTTTCGGGAAAGAAGGTCTCAAC
ATGCAAGTGGTAGTTGGCATGCTCATAGCAGTTTGCGGAATGATCTGGTATGGGAATGCC
TCATCTAAACCTGGTGGGAAAGAGCGTCGTAGCCATTCAATCAAGCATGGATCAGATTCG
TCACAAGCGGATGATAAGGTGTAA