Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400048387
CDS Infomation

pacid=37462206 polypeptide=PGSC0003DMP400032766 locus=PGSC0003DMG401018797 ID=PGSC0003DMT400048387.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGATATCAATTACTACAAGTTGGTTGGCTCGTAAGCACACAATCGTTCAAATTCATCAA
CACTTAAAGTATTCACAAAATCCAACTCAACATTATGCTTCTCTTCTCCAATCTTGCATT
GGTCGAAAAGCAGTTGAGCCTGGAAAGCAGCTCCATGCGCATCTATGCCTCACGGGTTTA
GGCTACAACATCAATTTAGCAACAAAGCTTGTTAATCTTTATAGCGTTTGTGACAAATTG
CCGAATGCCCATCACCTGTTTGATAGAATTCCTAAAGGAAATATTTTTCTTTGGAATGTT
TTGATTCGTGGGTATGCTTGGAATGGACCGTACGAGGCTGCAATTTCTCTGTATTATCAA
ATGATTGATTATGGGCATGTGCCTGATAATTTTACTTTTCCGTTTGTACTTAAAGCGTGC
TCGGCCTTGTCTGCGATTGAAGTGGGGAAGGATATACATGAATATGCCAAGAGAACGAAG
TGGGATAAGGATGTTTTCGTGGGTGCTGCTCTTATTGATATGTATGCTAAATGTGGTTGT
GTTGGTAGGTCAAGGGAGGTGTTTGAGGATGTCGTTGAGAGGGATGTAGTTGTTTGGAAT
TCAATGCTTGCTGCTTACTCGCAAAATGGTCACCCTGAGGATTGTTTGGATTTATGTGGT
GAAATGGCGTGCGGAGGTGTTAGACCCACGGAGGCGACCTTGGTGACTGCAATTTCTGCT
TCTGCTGATGTTGCAGCCCTTCGACAGGGGATGGAGCTTCATGGGTATAGTTGGAGACAG
GGTTTTGACTCTCTTGACAAAGTGAAGACAGCACTTGTGGATATGTATGCCAAGAGTGGG
TCTGTGAAGGTTGCTAGGATCTTGTTCGAAGGACTCCAGGAGAAAAGAGTTGTTTCTTGG
AATGCTATGATCACTGGATATGCAATGCATGGTCATGCTAATGCAGCACTTGGTCTGTTT
AATGAGATGGTTGGCAAAGCTAAGCCGGATCATATAACTTTTGTAGGTGTTTTATCAGCT
TGTAATCATGGAGGTCTGTTGAGTGAAGGGAGGATGTATTTTGATTCAATGGCAAAAGAT
TATGGAATTGAACCAACTATTCAGCACACTACATGCATGGTTGATCTCCTAGGTCATTCT
GGTCGCTTAGATGAGGCTTATGGACTTATAACGCAGATGAAAGTTATGCCGGATGCTGGT
GTCTGGGGTGCATTTCTTAATTCATGTAAAATCCATGGTTATGTGGAATTTGCAGAATTG
GCATTAGAGAGGTTGATTGAGCTTGAGCCTGATGATGCAGGCAATTACGTGATCCTTTCA
AATATTTATGCCCAAGCAGGTAGATGGGAAGGTGTTGCAAAGCTTAGAGAACTAATGAAC
GAAAGAGGTGTAAAGAAAACCACCGCATATAGTTGGATTGAAGTTAAAAACAAAGTACAT
GCATTTCTCTCTGGGGATACATCTCATCCTATGTCTAACAAGATTTATGCAGAGTTACAG
AGCTTAGGAGCACGACTAGTACAAGCTGGCTATATCCCAAACATTACGCCTGTTTTCCAT
GATGTGGAAGATGATGAGAAGAGCAGAATGGTGTGCAGCCACAGTGAAAGGCTAGCGATT
GCTTTTGGACTAATTAGTACACCCCCAGGGACAAAGCTGTTGATCACCAAGAACCTCCGA
GTTTGCGAGGACTGTCATGTTGCAATCAAGTTTATCTCAAAGTTAACAGAGAGAGAAATC
ACTGTCAGAGATGTCAATCGCTATCATCATTTCAAAGATGGCATCTGTTCTTGTGGAGAT
TATTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400032766
PEP Infomation

pacid=37462206 transcript=PGSC0003DMT400048387 locus=PGSC0003DMG401018797 ID=PGSC0003DMT400048387.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MISITTSWLARKHTIVQIHQHLKYSQNPTQHYASLLQSCIGRKAVEPGKQLHAHLCLTGL
GYNINLATKLVNLYSVCDKLPNAHHLFDRIPKGNIFLWNVLIRGYAWNGPYEAAISLYYQ
MIDYGHVPDNFTFPFVLKACSALSAIEVGKDIHEYAKRTKWDKDVFVGAALIDMYAKCGC
VGRSREVFEDVVERDVVVWNSMLAAYSQNGHPEDCLDLCGEMACGGVRPTEATLVTAISA
SADVAALRQGMELHGYSWRQGFDSLDKVKTALVDMYAKSGSVKVARILFEGLQEKRVVSW
NAMITGYAMHGHANAALGLFNEMVGKAKPDHITFVGVLSACNHGGLLSEGRMYFDSMAKD
YGIEPTIQHTTCMVDLLGHSGRLDEAYGLITQMKVMPDAGVWGAFLNSCKIHGYVEFAEL
ALERLIELEPDDAGNYVILSNIYAQAGRWEGVAKLRELMNERGVKKTTAYSWIEVKNKVH
AFLSGDTSHPMSNKIYAELQSLGARLVQAGYIPNITPVFHDVEDDEKSRMVCSHSERLAI
AFGLISTPPGTKLLITKNLRVCEDCHVAIKFISKLTEREITVRDVNRYHHFKDGICSCGD
YW*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400048387
Transcript Infomation

pacid=37462206 locus=PGSC0003DMG401018797 ID=PGSC0003DMT400048387.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGATATCAATTACTACAAGTTGGTTGGCTCGTAAGCACACAATCGTTCAAATTCATCAA
CACTTAAAGTATTCACAAAATCCAACTCAACATTATGCTTCTCTTCTCCAATCTTGCATT
GGTCGAAAAGCAGTTGAGCCTGGAAAGCAGCTCCATGCGCATCTATGCCTCACGGGTTTA
GGCTACAACATCAATTTAGCAACAAAGCTTGTTAATCTTTATAGCGTTTGTGACAAATTG
CCGAATGCCCATCACCTGTTTGATAGAATTCCTAAAGGAAATATTTTTCTTTGGAATGTT
TTGATTCGTGGGTATGCTTGGAATGGACCGTACGAGGCTGCAATTTCTCTGTATTATCAA
ATGATTGATTATGGGCATGTGCCTGATAATTTTACTTTTCCGTTTGTACTTAAAGCGTGC
TCGGCCTTGTCTGCGATTGAAGTGGGGAAGGATATACATGAATATGCCAAGAGAACGAAG
TGGGATAAGGATGTTTTCGTGGGTGCTGCTCTTATTGATATGTATGCTAAATGTGGTTGT
GTTGGTAGGTCAAGGGAGGTGTTTGAGGATGTCGTTGAGAGGGATGTAGTTGTTTGGAAT
TCAATGCTTGCTGCTTACTCGCAAAATGGTCACCCTGAGGATTGTTTGGATTTATGTGGT
GAAATGGCGTGCGGAGGTGTTAGACCCACGGAGGCGACCTTGGTGACTGCAATTTCTGCT
TCTGCTGATGTTGCAGCCCTTCGACAGGGGATGGAGCTTCATGGGTATAGTTGGAGACAG
GGTTTTGACTCTCTTGACAAAGTGAAGACAGCACTTGTGGATATGTATGCCAAGAGTGGG
TCTGTGAAGGTTGCTAGGATCTTGTTCGAAGGACTCCAGGAGAAAAGAGTTGTTTCTTGG
AATGCTATGATCACTGGATATGCAATGCATGGTCATGCTAATGCAGCACTTGGTCTGTTT
AATGAGATGGTTGGCAAAGCTAAGCCGGATCATATAACTTTTGTAGGTGTTTTATCAGCT
TGTAATCATGGAGGTCTGTTGAGTGAAGGGAGGATGTATTTTGATTCAATGGCAAAAGAT
TATGGAATTGAACCAACTATTCAGCACACTACATGCATGGTTGATCTCCTAGGTCATTCT
GGTCGCTTAGATGAGGCTTATGGACTTATAACGCAGATGAAAGTTATGCCGGATGCTGGT
GTCTGGGGTGCATTTCTTAATTCATGTAAAATCCATGGTTATGTGGAATTTGCAGAATTG
GCATTAGAGAGGTTGATTGAGCTTGAGCCTGATGATGCAGGCAATTACGTGATCCTTTCA
AATATTTATGCCCAAGCAGGTAGATGGGAAGGTGTTGCAAAGCTTAGAGAACTAATGAAC
GAAAGAGGTGTAAAGAAAACCACCGCATATAGTTGGATTGAAGTTAAAAACAAAGTACAT
GCATTTCTCTCTGGGGATACATCTCATCCTATGTCTAACAAGATTTATGCAGAGTTACAG
AGCTTAGGAGCACGACTAGTACAAGCTGGCTATATCCCAAACATTACGCCTGTTTTCCAT
GATGTGGAAGATGATGAGAAGAGCAGAATGGTGTGCAGCCACAGTGAAAGGCTAGCGATT
GCTTTTGGACTAATTAGTACACCCCCAGGGACAAAGCTGTTGATCACCAAGAACCTCCGA
GTTTGCGAGGACTGTCATGTTGCAATCAAGTTTATCTCAAAGTTAACAGAGAGAGAAATC
ACTGTCAGAGATGTCAATCGCTATCATCATTTCAAAGATGGCATCTGTTCTTGTGGAGAT
TATTGGTGA