Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID	PGSC0003DMT400048045
CDS Infomation	pacid=37463649 polypeptide=PGSC0003DMP400032538 locus=PGSC0003DMG400018670 ID=PGSC0003DMT400048045.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGGGTTTGAAAAAGATAAAGCAAGTTCGTCCTCTCATGTTTTACAAATCCCAAGAGAA GATACACCATTATTATCCAAGAATCATCAACATCTTTCTTCACCTTCAAAGACATTTGCT AATGTATTCATAGCCATAGTTGGAGCAGGGGTTCTTGGTCTTCCATATACATTCAAGAGA ACAGGATGGGTAATGGGTGCTCTTATGTTATTTACAGTTGCATTTTTAACTTACCATTGT ATGATGCTTCTTGTATATTCTAGAAGAAAGATTGAATCCCATCTCAAGATTTCACAAATT TCATCTTTTGGTGATTTGGGGTTTGCTGTTTGTGGACCTTTTGGTAGGTTTGCTGTTGAT GCTATGATTGTTCTGTCACAAGCTGGTTTTTGTATTAGTTACATGATTTTCATAGCAAAT ACTTTAGCATATTGTTTTAATTACTCTAAAACTAATCCAAATCCTAAAATCTTTGGGTTT CCACCTAAAGCTGTGTATATTTGGAGCTGTTTCCCTTTTCAGTTGGGGTTGAATTCAATT CCTACTCTTACCCTTTTAGCCCCTTTGAGTATTTTTGCTGATGTTGTTGAATTAGGAGCT ATGGGGGTTGTGATGGTTAAAGATGTGATGATTTATGTAAAGAGTAGTCATGTTCTTGAA GCTTTTGGTGGATTTAGTGTGTTTTTCTATGGTCTTGGTGTAGCTGTTTATGCTTTTGAA GGTGTTGGAATGGTGTTGCCTTTGGAAGCTGAGACAAAAGATAAGGCAAAGTTTGGGAAA ATCTTGGGCTTTTCAATGGCTTTGATATCTCTAATGTATGGTGCTTTTGGTGTATTGGGA TATTTCGCTTTTGGTGAAGATACAAAGGATATAATTACGACGAATCTTGGACAAGGATTG CTTAGCAGCCTAGTTCAAATTGGTCTTTGCATAAACTTGTTCTTTACTTTCCCTCTGATG ATGAATCCAGTTTACGAAGTAGTTGAAAGGAGGTTTTGTGAAGGGAGGTACTGTGTTTGG ATAAGATGGATTATGGTTTTGGCAGTGACGTTTGTGGCGTTGTTTGTGCCAAATTTTGCT GATTTCTTGTCATTGGTTGGGAGTAGTGTGTGCATAATTCTTGGCTTTGTGTTGCCTGCT TTGTTTCATCTGATTGTATTCAAAGATGAGCTAAGATGGCATAGTTTGGCTTGTGATGGT GCAATTATTGTAGTGGCTGCTTTTTTTTCAGTCTATGGAACCTACTCTTCATTGCTGGAG ATATTTGTTGGAGCAAAGGAATAA

Peptide Sequence

PEP ID	PGSC0003DMP400032538
PEP Infomation	pacid=37463649 transcript=PGSC0003DMT400048045 locus=PGSC0003DMG400018670 ID=PGSC0003DMT400048045.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	MGFEKDKASSSSHVLQIPREDTPLLSKNHQHLSSPSKTFANVFIAIVGAGVLGLPYTFKR TGWVMGALMLFTVAFLTYHCMMLLVYSRRKIESHLKISQISSFGDLGFAVCGPFGRFAVD AMIVLSQAGFCISYMIFIANTLAYCFNYSKTNPNPKIFGFPPKAVYIWSCFPFQLGLNSI PTLTLLAPLSIFADVVELGAMGVVMVKDVMIYVKSSHVLEAFGGFSVFFYGLGVAVYAFE GVGMVLPLEAETKDKAKFGKILGFSMALISLMYGAFGVLGYFAFGEDTKDIITTNLGQGL LSSLVQIGLCINLFFTFPLMMNPVYEVVERRFCEGRYCVWIRWIMVLAVTFVALFVPNFA DFLSLVGSSVCIILGFVLPALFHLIVFKDELRWHSLACDGAIIVVAAFFSVYGTYSSLLE IFVGAKE*

Transcript Sequence

Transcript ID	PGSC0003DMT400048045
Transcript Infomation	pacid=37463649 locus=PGSC0003DMG400018670 ID=PGSC0003DMT400048045.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGGGTTTGAAAAAGATAAAGCAAGTTCGTCCTCTCATGTTTTACAAATCCCAAGAGAA GATACACCATTATTATCCAAGAATCATCAACATCTTTCTTCACCTTCAAAGACATTTGCT AATGTATTCATAGCCATAGTTGGAGCAGGGGTTCTTGGTCTTCCATATACATTCAAGAGA ACAGGATGGGTAATGGGTGCTCTTATGTTATTTACAGTTGCATTTTTAACTTACCATTGT ATGATGCTTCTTGTATATTCTAGAAGAAAGATTGAATCCCATCTCAAGATTTCACAAATT TCATCTTTTGGTGATTTGGGGTTTGCTGTTTGTGGACCTTTTGGTAGGTTTGCTGTTGAT GCTATGATTGTTCTGTCACAAGCTGGTTTTTGTATTAGTTACATGATTTTCATAGCAAAT ACTTTAGCATATTGTTTTAATTACTCTAAAACTAATCCAAATCCTAAAATCTTTGGGTTT CCACCTAAAGCTGTGTATATTTGGAGCTGTTTCCCTTTTCAGTTGGGGTTGAATTCAATT CCTACTCTTACCCTTTTAGCCCCTTTGAGTATTTTTGCTGATGTTGTTGAATTAGGAGCT ATGGGGGTTGTGATGGTTAAAGATGTGATGATTTATGTAAAGAGTAGTCATGTTCTTGAA GCTTTTGGTGGATTTAGTGTGTTTTTCTATGGTCTTGGTGTAGCTGTTTATGCTTTTGAA GGTGTTGGAATGGTGTTGCCTTTGGAAGCTGAGACAAAAGATAAGGCAAAGTTTGGGAAA ATCTTGGGCTTTTCAATGGCTTTGATATCTCTAATGTATGGTGCTTTTGGTGTATTGGGA TATTTCGCTTTTGGTGAAGATACAAAGGATATAATTACGACGAATCTTGGACAAGGATTG CTTAGCAGCCTAGTTCAAATTGGTCTTTGCATAAACTTGTTCTTTACTTTCCCTCTGATG ATGAATCCAGTTTACGAAGTAGTTGAAAGGAGGTTTTGTGAAGGGAGGTACTGTGTTTGG ATAAGATGGATTATGGTTTTGGCAGTGACGTTTGTGGCGTTGTTTGTGCCAAATTTTGCT GATTTCTTGTCATTGGTTGGGAGTAGTGTGTGCATAATTCTTGGCTTTGTGTTGCCTGCT TTGTTTCATCTGATTGTATTCAAAGATGAGCTAAGATGGCATAGTTTGGCTTGTGATGGT GCAATTATTGTAGTGGCTGCTTTTTTTTCAGTCTATGGAACCTACTCTTCATTGCTGGAG ATATTTGTTGGAGCAAAGGAATAA