Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400047828
CDS Infomation

pacid=37467283 polypeptide=PGSC0003DMP400032388 locus=PGSC0003DMG400018589 ID=PGSC0003DMT400047828.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCTGGATTTGGAGGAAAATTGAAGATTTTGAGGCCAGTTTTGTCTATTTTATGGAGT
TTTCTTTTAGCTGCTATTTTTGTATCAGCAGAAAGAAGAATCAAGAGGGAAGTTATTGAA
CAAAATGCAGCTGAGCTTTCAGATGCAGATTACCTTTCAGCTGTTGCCAACTTCTTATGG
AAGCCTAATGAATCTGGTTACCAACATGTTTGGCCGGATATGAAATTTGGATGGCAAATT
GTTCTTGGTTCCACAATTGGATTCTTGGGCGCAGCATTTGGGAGTGTAGGTGGTGTTGGT
GGTGGTGGCATATTCGTACCCATGCTTAGTCTTATTGTCGGATTTGATCCGAAATCAGCT
ACAGCAATTTCAAAATGTATGATCATGGGAGCTGCAGTCTCTACTGTTTACTATAACTTA
AAGCTCAGGCATCCCACAATTGCCATGCCTATTATTGATTATGACTTGGCTGTGCTCATT
CAGCCAATGTTGATGCTTGGCATTAGTATTGGAGTCACTTTCAATGTGATATTTGCAGAT
TGGATGGTTACGGTTCTGCTAATTGTTCTCTTTTTTGGCACGTCAACCAAGGCCTTTCTA
AGAGGGGTTGAGACATGGAAGAAAGAAACTATTGTGAAAAAGGAGGCTGCTGCTAAACTT
TTAGGAACAAATGGCACGGTTGATGAAGCAGAATACAAGCTCCTTCCTGGAGGTCCAGCC
AATGGTGATGCCAAGGGTGCAGTTGAACCACAGGTCCCTATCATGGAGAACGTTTGCTGG
AAGGAATTTGGACTTCTCAGTTTTGTTTGGGTTGCATATCTAGCACTGCAAATTGGAAAG
ATTTACACATCTACTTGCTCGGCATGGTACTGGGTGGTGAATTTGTTGCAGGTCCCAGTT
TCTGTTGGGGTATCTTTTTATGAAGCTATTAGCCTGTACAAAGGATGGAGAAGGATTCAA
TCCAAAGGAGATGATGGCACCGATTTCCGAGTGACACAACTGATTGCTTATTGCTCTTTT
GGAATACTAGCTGGTATGGTTGGTGGACTTCTTGGTCTTGGTGGAGGATTTATCATGGGT
CCACTGTTTTTGGAGCTCGGCGTCCCTCCTCAGGTCTCAAGTGCCACGGCTACCTTTGCG
ATGATGTTCTCCTCATCAATGTCCGTGGTGGAGTATTACCTTCTAAAGCGTTTCCCAGTT
CCTTATGCTCTCTACTTTGTTGCTGTGGCAACTATTGCTGCTTTCGTTGGGCAACATGTC
GTGAGGAGGTTGATTTTTGTATTAGGACGGGCATCACTTATCATCTTCATCCTTGCCTTC
ACAATTTTTGTGAGCGCAATATCACTAGGTGGAGTCGGGATCTCAAATATGATTGGGAAG
ATCCAACGCGATGAATACATGGGATTCGAAAACCTTTGCAAATATAGGATTTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400032388
PEP Infomation

pacid=37467283 transcript=PGSC0003DMT400047828 locus=PGSC0003DMG400018589 ID=PGSC0003DMT400047828.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MAGFGGKLKILRPVLSILWSFLLAAIFVSAERRIKREVIEQNAAELSDADYLSAVANFLW
KPNESGYQHVWPDMKFGWQIVLGSTIGFLGAAFGSVGGVGGGGIFVPMLSLIVGFDPKSA
TAISKCMIMGAAVSTVYYNLKLRHPTIAMPIIDYDLAVLIQPMLMLGISIGVTFNVIFAD
WMVTVLLIVLFFGTSTKAFLRGVETWKKETIVKKEAAAKLLGTNGTVDEAEYKLLPGGPA
NGDAKGAVEPQVPIMENVCWKEFGLLSFVWVAYLALQIGKIYTSTCSAWYWVVNLLQVPV
SVGVSFYEAISLYKGWRRIQSKGDDGTDFRVTQLIAYCSFGILAGMVGGLLGLGGGFIMG
PLFLELGVPPQVSSATATFAMMFSSSMSVVEYYLLKRFPVPYALYFVAVATIAAFVGQHV
VRRLIFVLGRASLIIFILAFTIFVSAISLGGVGISNMIGKIQRDEYMGFENLCKYRI*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400047828
Transcript Infomation

pacid=37467283 locus=PGSC0003DMG400018589 ID=PGSC0003DMT400047828.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCTGGATTTGGAGGAAAATTGAAGATTTTGAGGCCAGTTTTGTCTATTTTATGGAGT
TTTCTTTTAGCTGCTATTTTTGTATCAGCAGAAAGAAGAATCAAGAGGGAAGTTATTGAA
CAAAATGCAGCTGAGCTTTCAGATGCAGATTACCTTTCAGCTGTTGCCAACTTCTTATGG
AAGCCTAATGAATCTGGTTACCAACATGTTTGGCCGGATATGAAATTTGGATGGCAAATT
GTTCTTGGTTCCACAATTGGATTCTTGGGCGCAGCATTTGGGAGTGTAGGTGGTGTTGGT
GGTGGTGGCATATTCGTACCCATGCTTAGTCTTATTGTCGGATTTGATCCGAAATCAGCT
ACAGCAATTTCAAAATGTATGATCATGGGAGCTGCAGTCTCTACTGTTTACTATAACTTA
AAGCTCAGGCATCCCACAATTGCCATGCCTATTATTGATTATGACTTGGCTGTGCTCATT
CAGCCAATGTTGATGCTTGGCATTAGTATTGGAGTCACTTTCAATGTGATATTTGCAGAT
TGGATGGTTACGGTTCTGCTAATTGTTCTCTTTTTTGGCACGTCAACCAAGGCCTTTCTA
AGAGGGGTTGAGACATGGAAGAAAGAAACTATTGTGAAAAAGGAGGCTGCTGCTAAACTT
TTAGGAACAAATGGCACGGTTGATGAAGCAGAATACAAGCTCCTTCCTGGAGGTCCAGCC
AATGGTGATGCCAAGGGTGCAGTTGAACCACAGGTCCCTATCATGGAGAACGTTTGCTGG
AAGGAATTTGGACTTCTCAGTTTTGTTTGGGTTGCATATCTAGCACTGCAAATTGGAAAG
ATTTACACATCTACTTGCTCGGCATGGTACTGGGTGGTGAATTTGTTGCAGGTCCCAGTT
TCTGTTGGGGTATCTTTTTATGAAGCTATTAGCCTGTACAAAGGATGGAGAAGGATTCAA
TCCAAAGGAGATGATGGCACCGATTTCCGAGTGACACAACTGATTGCTTATTGCTCTTTT
GGAATACTAGCTGGTATGGTTGGTGGACTTCTTGGTCTTGGTGGAGGATTTATCATGGGT
CCACTGTTTTTGGAGCTCGGCGTCCCTCCTCAGGTCTCAAGTGCCACGGCTACCTTTGCG
ATGATGTTCTCCTCATCAATGTCCGTGGTGGAGTATTACCTTCTAAAGCGTTTCCCAGTT
CCTTATGCTCTCTACTTTGTTGCTGTGGCAACTATTGCTGCTTTCGTTGGGCAACATGTC
GTGAGGAGGTTGATTTTTGTATTAGGACGGGCATCACTTATCATCTTCATCCTTGCCTTC
ACAATTTTTGTGAGCGCAATATCACTAGGTGGAGTCGGGATCTCAAATATGATTGGGAAG
ATCCAACGCGATGAATACATGGGATTCGAAAACCTTTGCAAATATAGGATTTAA