Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400047634
CDS Infomation

pacid=37463125 polypeptide=PGSC0003DMP400032258 locus=PGSC0003DMG400018513 ID=PGSC0003DMT400047634.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCCTTGTCAACAGGATGTTATAGCCTGTGATGTAATCAACCCTGATCATATAGATGTG
GAATTTGATTCCATTGGTGGATTGGAATCTATTAAACAAGCTCTATTTGAATTGGTAATT
CTTCCCTTGAGGAGGCCTGAACTCTTTCATGGGAAGCTTCTGGGTCCTCAAAAAGGAGTT
TTGCTCTATGGACCCCCTGGAACTGGAAAGACAATGCTTGCCAAAGCAATTGCTAAGGAA
TCAAGTGCTGTTTTTATTAACGTGAGAACATCGAATTTGATGAGCAAATGGTTTGGTGAT
GCCCAAAAACTCGTTGCTGCAGTGTTTAGTTTGGCGCATAAACTTCAGCCAGCAATTATA
TTCATTGACGAAGTGGATAGCTTTTTGGGTCAGCGCAAGTCTACTGACAATGAGGCGTCA
ACAAACATGAAGACTGAATTCATGGCTTTATGGGATGGTTTTACCACAGATCAAAATGCA
CGGGTTATGGTTCTTGCTGCTACTAATCGGCCATCTGAGCTTGATGAAGCAATTCTTCGA
CGTCTTCCTCAAGCCTTTGAGATTGGAATGCCTGACCACAGAGAAAGAACTGAGATTTTG
AAGGTGATCCTGAGGGGTGAGAAGGTAGAAGGTAACATCGACTATGACGGCATTGCTAGT
CTCTGTGATGGATACACTGGTTCTGATCTTCTAGAGCTATGTAAAAAAGCTGCCTACTTC
CCCATCCGGGAATTGCTTAATGATGAGAAGAGTGGAAAGCTAACAGCGGAGCCGAGGCCA
CTGTTGGAATTGGATTTGGAAAAGGCTTTAGCTATGTCGAAAAAGACAAAGGTTGCTGCA
AGTGAATACAGCAGGTTAAGTTCAAGGCATGCAGATTCAGATTCTGCAATTAACGAGATT
TCTAAGCTTGTGGTTTCCCATATTCTGAATCTCCAGTCAGATAACTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400032258
PEP Infomation

pacid=37463125 transcript=PGSC0003DMT400047634 locus=PGSC0003DMG400018513 ID=PGSC0003DMT400047634.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MPCQQDVIACDVINPDHIDVEFDSIGGLESIKQALFELVILPLRRPELFHGKLLGPQKGV
LLYGPPGTGKTMLAKAIAKESSAVFINVRTSNLMSKWFGDAQKLVAAVFSLAHKLQPAII
FIDEVDSFLGQRKSTDNEASTNMKTEFMALWDGFTTDQNARVMVLAATNRPSELDEAILR
RLPQAFEIGMPDHRERTEILKVILRGEKVEGNIDYDGIASLCDGYTGSDLLELCKKAAYF
PIRELLNDEKSGKLTAEPRPLLELDLEKALAMSKKTKVAASEYSRLSSRHADSDSAINEI
SKLVVSHILNLQSDN*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400047634
Transcript Infomation

pacid=37463125 locus=PGSC0003DMG400018513 ID=PGSC0003DMT400047634.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCCTTGTCAACAGGATGTTATAGCCTGTGATGTAATCAACCCTGATCATATAGATGTG
GAATTTGATTCCATTGGTGGATTGGAATCTATTAAACAAGCTCTATTTGAATTGGTAATT
CTTCCCTTGAGGAGGCCTGAACTCTTTCATGGGAAGCTTCTGGGTCCTCAAAAAGGAGTT
TTGCTCTATGGACCCCCTGGAACTGGAAAGACAATGCTTGCCAAAGCAATTGCTAAGGAA
TCAAGTGCTGTTTTTATTAACGTGAGAACATCGAATTTGATGAGCAAATGGTTTGGTGAT
GCCCAAAAACTCGTTGCTGCAGTGTTTAGTTTGGCGCATAAACTTCAGCCAGCAATTATA
TTCATTGACGAAGTGGATAGCTTTTTGGGTCAGCGCAAGTCTACTGACAATGAGGCGTCA
ACAAACATGAAGACTGAATTCATGGCTTTATGGGATGGTTTTACCACAGATCAAAATGCA
CGGGTTATGGTTCTTGCTGCTACTAATCGGCCATCTGAGCTTGATGAAGCAATTCTTCGA
CGTCTTCCTCAAGCCTTTGAGATTGGAATGCCTGACCACAGAGAAAGAACTGAGATTTTG
AAGGTGATCCTGAGGGGTGAGAAGGTAGAAGGTAACATCGACTATGACGGCATTGCTAGT
CTCTGTGATGGATACACTGGTTCTGATCTTCTAGAGCTATGTAAAAAAGCTGCCTACTTC
CCCATCCGGGAATTGCTTAATGATGAGAAGAGTGGAAAGCTAACAGCGGAGCCGAGGCCA
CTGTTGGAATTGGATTTGGAAAAGGCTTTAGCTATGTCGAAAAAGACAAAGGTTGCTGCA
AGTGAATACAGCAGGTTAAGTTCAAGGCATGCAGATTCAGATTCTGCAATTAACGAGATT
TCTAAGCTTGTGGTTTCCCATATTCTGAATCTCCAGTCAGATAACTAA