Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400047291
CDS Infomation

pacid=37433629 polypeptide=PGSC0003DMP400032005 locus=PGSC0003DMG400018365 ID=PGSC0003DMT400047291.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGTGCTTCAAACATACACTTCCATGGTGATTGGAACACCTTATGAAGCTCCACTTCAA
TCTCAACCTATTACTTCATCTCAAAACCTTAATTCTCATTTCAATTTTAGGGTTTTTCTA
GGGTTTAACTTACACAGTTTTACCCAAAAACAAATCTGTAAATCTCAACCTTCATCCAAA
ACTAACCACCCATTACACAGAAACATCAAGATTCTGCAACCCCACAAGCTAAAACTTCAA
GGAGATGATAAAGATAGGGTTTTTATAGGGTTTAAGCTACAGTGTCATTCAAAGGCTGAA
GCTTTACCTTCAAGAACGGTTATTAATGGTAAAAGGAAGGGATATGGAGGTATATTACCT
TCGATTTTGCGTTCTTTACGCACAGAAAGTGATGTTGAGAAAACCCTTAATTTGTATTAT
GGGAAGCTTAGTCCTAAAGAGCAAACTGTGATTCTTAAAGAGCAGAGTAATTGGGGAAAA
GCTCTTCGGGTATTCGAGTGGATGAAATCGCAGAAAGATTATGTTCCGAATGTAATTCAC
TATAATGTTATACTTAGAGCACTAGGTAGAGCTAAGAAATGGGATGAGTTGAGACTTTGT
TGGATTGAAATGGCGAAGAATGGTGTTTTTCCGACGAATAATACTTATGGAATGCTTGTT
GATGTGTATGGGAAAGCAGGGTTGGTGAAGGAGGCTCTTTTATGGATTAAACATATGAAG
TTGAGGGGAATTTTTCCGGATGAGGTTACGATGAATACAGTTGTTAAAGTTTTAAAGGAT
GCAGGGGAATATGATAGAGCAGATAGGTTTTATAAGGATTGGTGTACTGGGAAGATTGAA
TTGGATGATTTTGATTTGGATTCTATAGATGACTCTGAACCTTTTAGTTTGAAACAGTTT
TTGTTGACTGAGCTTTTCAGGACCGGAGGGAGGAACCCGTCTAGAGTTTTAGATAATGAG
AAAACTTGTAGGAAACCTCAAATGACAGCCACCTACAATACTCTGATTGATTTGTATGGA
AAAGCTGGTCGCTTGAAGGACGCTGCAAATGTGTTTAATGAGATGTTGAAATCCGGTGTG
GCTTTGGACGCTGTAACATTTAACACTATGATCTTTATTTGTGGAAGTCATGGCTACTTG
GAAGAGGCAGAAGCATTGCTGAATAAGATGGAGGAAAGAGGAATATCTCCTGATACTAAA
ACATACAACATCTTCCTGTCTCTTTATGCTAATGCAGGTAAGATTGATAGGGCTCTTCAG
TGGTACAGAAAGATAAGGAGGACGGGACTTTTCCCTGATGCTGTGACTTGTAGGGCTATT
ATTCGAACACTATGCAAGCAAAATATGGTCCAGGAGGTTGAAAATGTGATTAGTGAAATT
GAAAGTTTAGGTATGTATATAGATGAACACTCTCTCCCTGTTATTATGAGAATGTACATC
AATGCAGGGTTGATCGATCGTGCAAAGGCAATTTTTGAGAAGTGTCAATTGAACGGTGGG
TTCTCATCGCCAGCTTATGCTGCCATCATTGATGCATATGCTAGTAAGGGACTTTGGGCA
GAAGCCGAGGATGTGTTCTTTGGTAGAACAGACAAGGTTATTCAGAAGAAAGCAATTGCA
GAATATAATGTCATGATCAAGGCATATGGAATCGCAAAGCTATATGATAAAGCTTTCTCG
CTCTTCAAGGGAATGAAAAACCAAGGGACATGGCCAGATGAGTGCACTTATAACTCTCTA
ATCCAAATGTTCTCTGGGGGTGATTTAGTTGACCAAGCCAAAGAGCTCTTAGCCGAAATG
CAAGGATTGAGATTTAAACCTTCATGTTCTACCTTCTCTGCACTCATTGCTAGTTATGTG
CGCATGAATAGGCTTTCTGATGCAGTTGATGTCTTTGATGAAATGTCCGAAGCAGGTGTA
AAACCAAATGAGGTTGTCTATGGTACTTTAATTGATGGGTTTGCTGAAGCTGGTAAATTT
GAAGAAGCTATGCATTATTTCCATGTCATGAATGACTCTGGGATTCAAGCTAATCAGATA
ATCTTGACTTCAATGATTAAGGCTTATAGTAAGCTTGGATCAGTAGAGGGAGCGAAAAAA
CTGTATGAGCAGATTAAAAACTTGCATGGAGGTCCTGACATCATTGCATCCAATAGTATG
CTCAATCTGTATGCAGACTTTGGAATGGTCTCGGAAGCAAAAATGATATTTAATCATTTG
AGGGAGAAAGGTCAGGCTGATGGTGTTACTTTTGCAACCTTGATTTATGCATACAAGAAT
ATGGGTATGCTTGATGAAGCCATTGAGATAGCAGAGGAGATGAAGCAGTCTGGACTTTTA
AGAGATTGTATGACATTCAATAAGGTAATGGCATGTTATGCCACAAATGGGCAGCTTGTT
GAATGTGGGGAATTGCTGCATGAAATGATTAACCAGAAACTTCTGCCAGATGGGGGCACA
TTTAAGGTTTTATTCACAATATTGAAAAAGGGAGGTTTTTCGGTAGAGGCAGTTAGACAG
CTCGAGTTGTCTTACCGAGAAGGTAAACCTTATGCCAGACAGGCAGTGATAAGTGCTGTT
TACTCTGCAGTAGGCTTGCACACATTTGCAATTGAATCCTGCAGCGTTATCACACAACCA
GGACTGGGACTCCATCTCTTTGCTTACAATGTTGCAATATATGTGTATGGAGCTTCATCC
CAAATTGATGAGGCACTAAAAATATTTATGCGAATTCAAGATGAAGGACTGGAACCAGAT
ATTGTCACATTTATTAATCTTGTAGGTTGCTATGGGAAAGCTGGCATGGTTGAAGGTATA
AAGCGGATATATGGCCAGTTAAAATATGGACACATCGAGCCCAATGAGTCATTATACAAC
GCAATCATAGATGCCTATAGTGATGCAGGCAGATATGACCTTGCTGATTTGGTTAGTCAG
GAAATGGAACTCGATTTAGTTGTGAAGAAGCTTACAGAATCTGAAGGTGTTGTGGATGAA
GTTTCTGAAGGTGGCAAAGGAGTAGATTCAGAAGGTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400032005
PEP Infomation

pacid=37433629 transcript=PGSC0003DMT400047291 locus=PGSC0003DMG400018365 ID=PGSC0003DMT400047291.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MVLQTYTSMVIGTPYEAPLQSQPITSSQNLNSHFNFRVFLGFNLHSFTQKQICKSQPSSK
TNHPLHRNIKILQPHKLKLQGDDKDRVFIGFKLQCHSKAEALPSRTVINGKRKGYGGILP
SILRSLRTESDVEKTLNLYYGKLSPKEQTVILKEQSNWGKALRVFEWMKSQKDYVPNVIH
YNVILRALGRAKKWDELRLCWIEMAKNGVFPTNNTYGMLVDVYGKAGLVKEALLWIKHMK
LRGIFPDEVTMNTVVKVLKDAGEYDRADRFYKDWCTGKIELDDFDLDSIDDSEPFSLKQF
LLTELFRTGGRNPSRVLDNEKTCRKPQMTATYNTLIDLYGKAGRLKDAANVFNEMLKSGV
ALDAVTFNTMIFICGSHGYLEEAEALLNKMEERGISPDTKTYNIFLSLYANAGKIDRALQ
WYRKIRRTGLFPDAVTCRAIIRTLCKQNMVQEVENVISEIESLGMYIDEHSLPVIMRMYI
NAGLIDRAKAIFEKCQLNGGFSSPAYAAIIDAYASKGLWAEAEDVFFGRTDKVIQKKAIA
EYNVMIKAYGIAKLYDKAFSLFKGMKNQGTWPDECTYNSLIQMFSGGDLVDQAKELLAEM
QGLRFKPSCSTFSALIASYVRMNRLSDAVDVFDEMSEAGVKPNEVVYGTLIDGFAEAGKF
EEAMHYFHVMNDSGIQANQIILTSMIKAYSKLGSVEGAKKLYEQIKNLHGGPDIIASNSM
LNLYADFGMVSEAKMIFNHLREKGQADGVTFATLIYAYKNMGMLDEAIEIAEEMKQSGLL
RDCMTFNKVMACYATNGQLVECGELLHEMINQKLLPDGGTFKVLFTILKKGGFSVEAVRQ
LELSYREGKPYARQAVISAVYSAVGLHTFAIESCSVITQPGLGLHLFAYNVAIYVYGASS
QIDEALKIFMRIQDEGLEPDIVTFINLVGCYGKAGMVEGIKRIYGQLKYGHIEPNESLYN
AIIDAYSDAGRYDLADLVSQEMELDLVVKKLTESEGVVDEVSEGGKGVDSEG*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400047291
Transcript Infomation

pacid=37433629 locus=PGSC0003DMG400018365 ID=PGSC0003DMT400047291.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGTGCTTCAAACATACACTTCCATGGTGATTGGAACACCTTATGAAGCTCCACTTCAA
TCTCAACCTATTACTTCATCTCAAAACCTTAATTCTCATTTCAATTTTAGGGTTTTTCTA
GGGTTTAACTTACACAGTTTTACCCAAAAACAAATCTGTAAATCTCAACCTTCATCCAAA
ACTAACCACCCATTACACAGAAACATCAAGATTCTGCAACCCCACAAGCTAAAACTTCAA
GGAGATGATAAAGATAGGGTTTTTATAGGGTTTAAGCTACAGTGTCATTCAAAGGCTGAA
GCTTTACCTTCAAGAACGGTTATTAATGGTAAAAGGAAGGGATATGGAGGTATATTACCT
TCGATTTTGCGTTCTTTACGCACAGAAAGTGATGTTGAGAAAACCCTTAATTTGTATTAT
GGGAAGCTTAGTCCTAAAGAGCAAACTGTGATTCTTAAAGAGCAGAGTAATTGGGGAAAA
GCTCTTCGGGTATTCGAGTGGATGAAATCGCAGAAAGATTATGTTCCGAATGTAATTCAC
TATAATGTTATACTTAGAGCACTAGGTAGAGCTAAGAAATGGGATGAGTTGAGACTTTGT
TGGATTGAAATGGCGAAGAATGGTGTTTTTCCGACGAATAATACTTATGGAATGCTTGTT
GATGTGTATGGGAAAGCAGGGTTGGTGAAGGAGGCTCTTTTATGGATTAAACATATGAAG
TTGAGGGGAATTTTTCCGGATGAGGTTACGATGAATACAGTTGTTAAAGTTTTAAAGGAT
GCAGGGGAATATGATAGAGCAGATAGGTTTTATAAGGATTGGTGTACTGGGAAGATTGAA
TTGGATGATTTTGATTTGGATTCTATAGATGACTCTGAACCTTTTAGTTTGAAACAGTTT
TTGTTGACTGAGCTTTTCAGGACCGGAGGGAGGAACCCGTCTAGAGTTTTAGATAATGAG
AAAACTTGTAGGAAACCTCAAATGACAGCCACCTACAATACTCTGATTGATTTGTATGGA
AAAGCTGGTCGCTTGAAGGACGCTGCAAATGTGTTTAATGAGATGTTGAAATCCGGTGTG
GCTTTGGACGCTGTAACATTTAACACTATGATCTTTATTTGTGGAAGTCATGGCTACTTG
GAAGAGGCAGAAGCATTGCTGAATAAGATGGAGGAAAGAGGAATATCTCCTGATACTAAA
ACATACAACATCTTCCTGTCTCTTTATGCTAATGCAGGTAAGATTGATAGGGCTCTTCAG
TGGTACAGAAAGATAAGGAGGACGGGACTTTTCCCTGATGCTGTGACTTGTAGGGCTATT
ATTCGAACACTATGCAAGCAAAATATGGTCCAGGAGGTTGAAAATGTGATTAGTGAAATT
GAAAGTTTAGGTATGTATATAGATGAACACTCTCTCCCTGTTATTATGAGAATGTACATC
AATGCAGGGTTGATCGATCGTGCAAAGGCAATTTTTGAGAAGTGTCAATTGAACGGTGGG
TTCTCATCGCCAGCTTATGCTGCCATCATTGATGCATATGCTAGTAAGGGACTTTGGGCA
GAAGCCGAGGATGTGTTCTTTGGTAGAACAGACAAGGTTATTCAGAAGAAAGCAATTGCA
GAATATAATGTCATGATCAAGGCATATGGAATCGCAAAGCTATATGATAAAGCTTTCTCG
CTCTTCAAGGGAATGAAAAACCAAGGGACATGGCCAGATGAGTGCACTTATAACTCTCTA
ATCCAAATGTTCTCTGGGGGTGATTTAGTTGACCAAGCCAAAGAGCTCTTAGCCGAAATG
CAAGGATTGAGATTTAAACCTTCATGTTCTACCTTCTCTGCACTCATTGCTAGTTATGTG
CGCATGAATAGGCTTTCTGATGCAGTTGATGTCTTTGATGAAATGTCCGAAGCAGGTGTA
AAACCAAATGAGGTTGTCTATGGTACTTTAATTGATGGGTTTGCTGAAGCTGGTAAATTT
GAAGAAGCTATGCATTATTTCCATGTCATGAATGACTCTGGGATTCAAGCTAATCAGATA
ATCTTGACTTCAATGATTAAGGCTTATAGTAAGCTTGGATCAGTAGAGGGAGCGAAAAAA
CTGTATGAGCAGATTAAAAACTTGCATGGAGGTCCTGACATCATTGCATCCAATAGTATG
CTCAATCTGTATGCAGACTTTGGAATGGTCTCGGAAGCAAAAATGATATTTAATCATTTG
AGGGAGAAAGGTCAGGCTGATGGTGTTACTTTTGCAACCTTGATTTATGCATACAAGAAT
ATGGGTATGCTTGATGAAGCCATTGAGATAGCAGAGGAGATGAAGCAGTCTGGACTTTTA
AGAGATTGTATGACATTCAATAAGGTAATGGCATGTTATGCCACAAATGGGCAGCTTGTT
GAATGTGGGGAATTGCTGCATGAAATGATTAACCAGAAACTTCTGCCAGATGGGGGCACA
TTTAAGGTTTTATTCACAATATTGAAAAAGGGAGGTTTTTCGGTAGAGGCAGTTAGACAG
CTCGAGTTGTCTTACCGAGAAGGTAAACCTTATGCCAGACAGGCAGTGATAAGTGCTGTT
TACTCTGCAGTAGGCTTGCACACATTTGCAATTGAATCCTGCAGCGTTATCACACAACCA
GGACTGGGACTCCATCTCTTTGCTTACAATGTTGCAATATATGTGTATGGAGCTTCATCC
CAAATTGATGAGGCACTAAAAATATTTATGCGAATTCAAGATGAAGGACTGGAACCAGAT
ATTGTCACATTTATTAATCTTGTAGGTTGCTATGGGAAAGCTGGCATGGTTGAAGGTATA
AAGCGGATATATGGCCAGTTAAAATATGGACACATCGAGCCCAATGAGTCATTATACAAC
GCAATCATAGATGCCTATAGTGATGCAGGCAGATATGACCTTGCTGATTTGGTTAGTCAG
GAAATGGAACTCGATTTAGTTGTGAAGAAGCTTACAGAATCTGAAGGTGTTGTGGATGAA
GTTTCTGAAGGTGGCAAAGGAGTAGATTCAGAAGGTTGA