Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400046817
CDS Infomation

pacid=37461486 polypeptide=PGSC0003DMP400031682 locus=PGSC0003DMG400018177 ID=PGSC0003DMT400046817.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGTTCATCCCCTTCAACTCCCTTCTTGCTCAACTGTCAAAGCCGAAGCTTCCAATCTCA
AGAACCAAAGAGCTTCACGCTTTCATAATCAAGACTCATCTCTCACACGACCCATTTTAC
GCTACAAGAATTATAAGATTCTATGCTCTAAACAACGACATCATCTCAGCACACAACCTG
TTTGATAAAACTCCCCACCGAAGCATTTACCTGTGGAACTCCTTAATTCGAGCTTATGCT
AGAGCCCACAAATTTAGAAATGCATTTTCGCTGTTTAATGATATGCTTTATTCTGAAATA
ATGCCTGATAACTTCACTTATGCATGCCTTGTAAAAGCCAGCTCTGAGAATTTTGATTTG
CACAGCTTAAGAGTTTTACATGGAGGGGTTGTTCTATCTGGGTTGCAGTTGGACTTTATC
TGTAGTAGTCAACTGGTAAGTGCTTATTCAAGATTAGGCTGTATAGCTGATGCAAGCAAG
GTGTTTTCTGGGATAACGGGACCGGATTTGGTCCTATGGAATTCGATGATATCAGGTTAT
GGGGGTCTTGGGGAATTGGAGAAGGGGATAGAGTTGTTTAGTGAAATGCAGATAATGGGG
GTGCGGCCTGATGAGTACTCAATGGTAGGCCTGATTATGACTATAGATGATCCCAGTGTG
CTGATTATAGGTGAAGCAATCCATGCATTTTGTTTAAAACTTGGTGTAGAGTCGAATGAT
CATGTAAGCAGTCTTCTTGTTAGTATGTATTCTAGGTGTAAATGTATGGGTTCAGCATTT
AGCGTCTTTGATAGTCTTGTAGAACCTGATTTAGTTACATGGTCTGCTTTAATAAGTGGT
ATTTCGCTGTGTGGGGATAGTGTCAAGGCCTTGGATTTCTTCAGAGAAATGAATATGAAA
GGTGGGAAGGCAGATGCATCGCTGATTACCACTGTACTAACTGCTTGTTCTCAGTTGGCA
AATGTGCAGCCAGGCATTGAGACACATGGTTATGCTTTTCGACATGGATATCACTCGGAA
GTTATGGTCTCCTCTGCTCTACTTGACATGTACTCGAAATGTGGGTTCTTGGAATTGGGA
TATCAAGTTTATGAGACTATGGTTTTCAAGAATATTGTTTCATACAATTCAATTATTTCA
AGTCTTGGTTTATATGGACTTGCATCTCAGGCCTTTGAGATATTCGAGAAGGCACTGGAG
GAAGGGCACAAACCTGATGAAGCTACTTTTTCTGCACTTCTTTGTGCATGTTGCCATGCT
GGTCTTGTCAATGATGGTCGAGAATATTTCAGAAGAATGAAAGATCAATTTGGCATCTCA
GCTAACACCGAACATTATATTTACATGGTAAAGCTTCTTGGAATGGAAGGACAATTAAGA
GAAGCTTATGAACTTGTTCAATCTCTGCAAGAACCAATTGACTCTGGCATTTGGGGGGCA
CTATTATCATGCTGTGATGCTCATAGAAATTATGAGGTCGCAGATATTGTAGCTTGTCGT
CTTTTTGGGAATAAGCTAGAGAATAATAGTTACAGAATTATGCTTTCAAATATGTATGCT
AGTGATGGGAGGTGGGATTTGGTAAATAAGTTGAGAGTAGATTCTGGATTAACAAAGTTG
AAACTTCCTGGAAAAAGCTGGATTACTAGTAAAAAACATTCCTTTGAAAGGAACTCTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400031682
PEP Infomation

pacid=37461486 transcript=PGSC0003DMT400046817 locus=PGSC0003DMG400018177 ID=PGSC0003DMT400046817.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MFIPFNSLLAQLSKPKLPISRTKELHAFIIKTHLSHDPFYATRIIRFYALNNDIISAHNL
FDKTPHRSIYLWNSLIRAYARAHKFRNAFSLFNDMLYSEIMPDNFTYACLVKASSENFDL
HSLRVLHGGVVLSGLQLDFICSSQLVSAYSRLGCIADASKVFSGITGPDLVLWNSMISGY
GGLGELEKGIELFSEMQIMGVRPDEYSMVGLIMTIDDPSVLIIGEAIHAFCLKLGVESND
HVSSLLVSMYSRCKCMGSAFSVFDSLVEPDLVTWSALISGISLCGDSVKALDFFREMNMK
GGKADASLITTVLTACSQLANVQPGIETHGYAFRHGYHSEVMVSSALLDMYSKCGFLELG
YQVYETMVFKNIVSYNSIISSLGLYGLASQAFEIFEKALEEGHKPDEATFSALLCACCHA
GLVNDGREYFRRMKDQFGISANTEHYIYMVKLLGMEGQLREAYELVQSLQEPIDSGIWGA
LLSCCDAHRNYEVADIVACRLFGNKLENNSYRIMLSNMYASDGRWDLVNKLRVDSGLTKL
KLPGKSWITSKKHSFERNS*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400046817
Transcript Infomation

pacid=37461486 locus=PGSC0003DMG400018177 ID=PGSC0003DMT400046817.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGTTCATCCCCTTCAACTCCCTTCTTGCTCAACTGTCAAAGCCGAAGCTTCCAATCTCA
AGAACCAAAGAGCTTCACGCTTTCATAATCAAGACTCATCTCTCACACGACCCATTTTAC
GCTACAAGAATTATAAGATTCTATGCTCTAAACAACGACATCATCTCAGCACACAACCTG
TTTGATAAAACTCCCCACCGAAGCATTTACCTGTGGAACTCCTTAATTCGAGCTTATGCT
AGAGCCCACAAATTTAGAAATGCATTTTCGCTGTTTAATGATATGCTTTATTCTGAAATA
ATGCCTGATAACTTCACTTATGCATGCCTTGTAAAAGCCAGCTCTGAGAATTTTGATTTG
CACAGCTTAAGAGTTTTACATGGAGGGGTTGTTCTATCTGGGTTGCAGTTGGACTTTATC
TGTAGTAGTCAACTGGTAAGTGCTTATTCAAGATTAGGCTGTATAGCTGATGCAAGCAAG
GTGTTTTCTGGGATAACGGGACCGGATTTGGTCCTATGGAATTCGATGATATCAGGTTAT
GGGGGTCTTGGGGAATTGGAGAAGGGGATAGAGTTGTTTAGTGAAATGCAGATAATGGGG
GTGCGGCCTGATGAGTACTCAATGGTAGGCCTGATTATGACTATAGATGATCCCAGTGTG
CTGATTATAGGTGAAGCAATCCATGCATTTTGTTTAAAACTTGGTGTAGAGTCGAATGAT
CATGTAAGCAGTCTTCTTGTTAGTATGTATTCTAGGTGTAAATGTATGGGTTCAGCATTT
AGCGTCTTTGATAGTCTTGTAGAACCTGATTTAGTTACATGGTCTGCTTTAATAAGTGGT
ATTTCGCTGTGTGGGGATAGTGTCAAGGCCTTGGATTTCTTCAGAGAAATGAATATGAAA
GGTGGGAAGGCAGATGCATCGCTGATTACCACTGTACTAACTGCTTGTTCTCAGTTGGCA
AATGTGCAGCCAGGCATTGAGACACATGGTTATGCTTTTCGACATGGATATCACTCGGAA
GTTATGGTCTCCTCTGCTCTACTTGACATGTACTCGAAATGTGGGTTCTTGGAATTGGGA
TATCAAGTTTATGAGACTATGGTTTTCAAGAATATTGTTTCATACAATTCAATTATTTCA
AGTCTTGGTTTATATGGACTTGCATCTCAGGCCTTTGAGATATTCGAGAAGGCACTGGAG
GAAGGGCACAAACCTGATGAAGCTACTTTTTCTGCACTTCTTTGTGCATGTTGCCATGCT
GGTCTTGTCAATGATGGTCGAGAATATTTCAGAAGAATGAAAGATCAATTTGGCATCTCA
GCTAACACCGAACATTATATTTACATGGTAAAGCTTCTTGGAATGGAAGGACAATTAAGA
GAAGCTTATGAACTTGTTCAATCTCTGCAAGAACCAATTGACTCTGGCATTTGGGGGGCA
CTATTATCATGCTGTGATGCTCATAGAAATTATGAGGTCGCAGATATTGTAGCTTGTCGT
CTTTTTGGGAATAAGCTAGAGAATAATAGTTACAGAATTATGCTTTCAAATATGTATGCT
AGTGATGGGAGGTGGGATTTGGTAAATAAGTTGAGAGTAGATTCTGGATTAACAAAGTTG
AAACTTCCTGGAAAAAGCTGGATTACTAGTAAAAAACATTCCTTTGAAAGGAACTCTTGA