Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400046810
CDS Infomation

pacid=37462255 polypeptide=PGSC0003DMP400031675 locus=PGSC0003DMG400018173 ID=PGSC0003DMT400046810.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCTTTCGTCAGTTATTTCTCGATATTCAACTTTCTTACCTTCTTCTTTGCTTCTCGCG
CAATTCGAAACCTTGCTTCATCATCACGGTTATCACTCCACCCCCTCCAATGCCCCAAAC
ACCACTTCCTTTCCCAACTATGATGACCCAAATTCATCCCCAAGTTCAACTAGTGCTTCC
TCTGACCCTCTGAACCCCACCATCATGCTGGAAACCCTCTCTTGTTACAACAATGACTGG
AGAAGAGCTTTAGAGTTCTTCAACTGGGCCGAGACGCAGTGTGGCTTCCATCACACCAGC
CAAACGTGCAACCAACTTATTGACATTCTGGGAAAGTTCTTTGAATTTGATGCAGCTTGG
AGCTTGATTGAGAAAATGAGAAGTGTATCCTCCATGCCTGACCACACCACTTTCCGAGTC
TTGTTCAAACGTTATGTGTCTGCTCACATGGTAAAAGAAGCAATTGATATGTTTGATAAG
ATGGAGGAATTTAATTTAAAAGATCAAGTTTCATTTTCAAATCTAATTGATGCTTTATGT
GAGTATAAGCATGTGATAGAGGCCGAAGACTTGTGCTTCCCTAAGAACAAGAATGATGTG
AAGTATTCATGTTTTAAGGTGGACACAAAAATATGTAATATGCTTCTTCGTGGGTGGTTC
AAGATGAGTTGGTGGGGTAAATGTAGACAGTTTTGGGAAGAGATGGATACAAGGGGTGTG
CAAAAGGATCTGTATTCGTACTCAATTTACATGGATGTACAGTGCAAGAGCGGAAAGCCA
TGGAAAGCTGTAAAATTATACAAAGAAATGAAGAAGAAAGGAATTAACTTGGATGTGATC
GCGTATAACACTGTTATCCGTGCTATTGGGATTTCAGATGGTGTTGATGTAGCAGCTAAG
CTCTGTCAAGAGATGATTGAGTTGGGGTGCAAACCAAATGTTTCTACGTACAACACACTG
ATCAAGCTTATGTGTGAAAATGGGAGGTATAGAGACGCATATAAAGTGCTTAGTCAAATG
CCTCACAAGGGTTGCGAGCCTAATGTCATTACATACAACAGCTTCTTTGGTTGCCTTGAA
AAGCCGAGAGAGATTCTCAAATTGTTTGATAGAATGATTGAAAGCGGAGTGCGACCTAGG
ATGGACACCTATGTCATGCTTATGAGGAAATTTGGAAGATGGGGATTTCTTCGACCGGTC
TTTATTCTTTGGGAAAAGATGGAAAAACAGGGATTGAGTCCAGATGCGTCTGCTTACAAT
GCATTAATTGATGCCTTGGTACAAAAGGGTATGGTTGATATGGCACGTAAATATGATGAA
GAGATGTTAGCAAAGGGCCTTTCAGCTAAGCCGAGGGTAGAACTGGGGACAAAGTTGACT
ACTCCTGACTGTGAAGGCACCTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400031675
PEP Infomation

pacid=37462255 transcript=PGSC0003DMT400046810 locus=PGSC0003DMG400018173 ID=PGSC0003DMT400046810.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MLSSVISRYSTFLPSSLLLAQFETLLHHHGYHSTPSNAPNTTSFPNYDDPNSSPSSTSAS
SDPLNPTIMLETLSCYNNDWRRALEFFNWAETQCGFHHTSQTCNQLIDILGKFFEFDAAW
SLIEKMRSVSSMPDHTTFRVLFKRYVSAHMVKEAIDMFDKMEEFNLKDQVSFSNLIDALC
EYKHVIEAEDLCFPKNKNDVKYSCFKVDTKICNMLLRGWFKMSWWGKCRQFWEEMDTRGV
QKDLYSYSIYMDVQCKSGKPWKAVKLYKEMKKKGINLDVIAYNTVIRAIGISDGVDVAAK
LCQEMIELGCKPNVSTYNTLIKLMCENGRYRDAYKVLSQMPHKGCEPNVITYNSFFGCLE
KPREILKLFDRMIESGVRPRMDTYVMLMRKFGRWGFLRPVFILWEKMEKQGLSPDASAYN
ALIDALVQKGMVDMARKYDEEMLAKGLSAKPRVELGTKLTTPDCEGT*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400046810
Transcript Infomation

pacid=37462255 locus=PGSC0003DMG400018173 ID=PGSC0003DMT400046810.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCTTTCGTCAGTTATTTCTCGATATTCAACTTTCTTACCTTCTTCTTTGCTTCTCGCG
CAATTCGAAACCTTGCTTCATCATCACGGTTATCACTCCACCCCCTCCAATGCCCCAAAC
ACCACTTCCTTTCCCAACTATGATGACCCAAATTCATCCCCAAGTTCAACTAGTGCTTCC
TCTGACCCTCTGAACCCCACCATCATGCTGGAAACCCTCTCTTGTTACAACAATGACTGG
AGAAGAGCTTTAGAGTTCTTCAACTGGGCCGAGACGCAGTGTGGCTTCCATCACACCAGC
CAAACGTGCAACCAACTTATTGACATTCTGGGAAAGTTCTTTGAATTTGATGCAGCTTGG
AGCTTGATTGAGAAAATGAGAAGTGTATCCTCCATGCCTGACCACACCACTTTCCGAGTC
TTGTTCAAACGTTATGTGTCTGCTCACATGGTAAAAGAAGCAATTGATATGTTTGATAAG
ATGGAGGAATTTAATTTAAAAGATCAAGTTTCATTTTCAAATCTAATTGATGCTTTATGT
GAGTATAAGCATGTGATAGAGGCCGAAGACTTGTGCTTCCCTAAGAACAAGAATGATGTG
AAGTATTCATGTTTTAAGGTGGACACAAAAATATGTAATATGCTTCTTCGTGGGTGGTTC
AAGATGAGTTGGTGGGGTAAATGTAGACAGTTTTGGGAAGAGATGGATACAAGGGGTGTG
CAAAAGGATCTGTATTCGTACTCAATTTACATGGATGTACAGTGCAAGAGCGGAAAGCCA
TGGAAAGCTGTAAAATTATACAAAGAAATGAAGAAGAAAGGAATTAACTTGGATGTGATC
GCGTATAACACTGTTATCCGTGCTATTGGGATTTCAGATGGTGTTGATGTAGCAGCTAAG
CTCTGTCAAGAGATGATTGAGTTGGGGTGCAAACCAAATGTTTCTACGTACAACACACTG
ATCAAGCTTATGTGTGAAAATGGGAGGTATAGAGACGCATATAAAGTGCTTAGTCAAATG
CCTCACAAGGGTTGCGAGCCTAATGTCATTACATACAACAGCTTCTTTGGTTGCCTTGAA
AAGCCGAGAGAGATTCTCAAATTGTTTGATAGAATGATTGAAAGCGGAGTGCGACCTAGG
ATGGACACCTATGTCATGCTTATGAGGAAATTTGGAAGATGGGGATTTCTTCGACCGGTC
TTTATTCTTTGGGAAAAGATGGAAAAACAGGGATTGAGTCCAGATGCGTCTGCTTACAAT
GCATTAATTGATGCCTTGGTACAAAAGGGTATGGTTGATATGGCACGTAAATATGATGAA
GAGATGTTAGCAAAGGGCCTTTCAGCTAAGCCGAGGGTAGAACTGGGGACAAAGTTGACT
ACTCCTGACTGTGAAGGCACCTGA