Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400046698
CDS Infomation

pacid=37462676 polypeptide=PGSC0003DMP400031593 locus=PGSC0003DMG400018130 ID=PGSC0003DMT400046698.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCGGCTTCAGCTTCTTCAACTATGCTTTTATCTTCAAAATCTTCACGCGCCTCTCTC
TCATGGAAAAACCAGTTTGCTTCCACCTCTGTCTTTCGCGTCTCCGGGGTTACCCTCCCG
CGCAGAAGCCTCCGTCAGTGTCCATGGTTCATTGTTTTCTCTATGGACGCCAAACCTACG
GTTCTAGTTGCTGAAAAACTAGGTGAGGCAGGGTTAAAACTATTAAAGGAATTCGCGAAT
GTTGATTGCTCATATAACTTGAGTCCTGAGGAGCTGTGCACTAAGATCTCTCTTTGTGAT
GCGTTGGTTGTGCGGAGTGGAACAAAGGTGACCCGTGAGATCTTTGAATCTTCTGGTGGA
CGGCTGAAAGTTGTTGGACGTGCTGGTGTGGGGATTGATAACGTTGATCTTGCGGCGGCA
ACAGAGCATGGATGCCTTGTTGTTAATGCACCCACTGCTAATACAGTTGCAGCTGCCGAG
CATGGAATCGCCCTTCTCACTGCTATGGCTCGGAATGTTGCTCAAGCTGATGCTTCTGTC
AAGGCTGGGAAATGGTTGAGGAACAAATATGTTGGTGTCTCCCTAGTAGGCAAAACACTT
GCTGTGATGGGTTTTGGGAAGGTTGGATCAGAAGTCGCAAGGCGAGCTAAGGGGCTTGGC
ATGCATGTCATCGCTCATGACCCATACGCCCCTGCTGACCGTGCACGTGCTATTGGTGTG
CAGCTTGTGAGCTTTGATGAAGCCCTTGCATCTGCCGATTTCATCTCACTTCACATGCCA
CTGACCCCTGCTACAAAGCAGATCCTGAATGATGAAACTTTTGCGAAGATGAAAAAGGGT
GTACGGATTGTGAATGTTGCTCGTGGGGGTGTGATTGATGAAGAAGCTTTGGTGAGGGCA
CTTGATGCAGGCATTGTGGCACAGGCTGCACTTGATGTTTTCACTGTGGAGCCACCACCA
AAGGATAGCAAGTTGATTCAACATGAGAATGTGACTGCAACTCCACATCTTGGTGCTAGT
ACTACAGAGGCTCAGGAAGGTGTGGCAATTGAGGTCGCTGAAGCAGTTGTTGGCGCTTTG
AAAGGGGAGCTCTCAGCTACTGCTGTCAATGCACCTATGGTTCCTGCTGAGGTGCTATTA
GAGCTGAAGCCTTTTGTTGTACTTGCTGAAAAACTTGGTAGACTTGCTGTCCAGTTGGTT
GCCGGTGGAAGTGGTGTTAAATCAGTGAAAGTAACATATGGTTCAGCTAGAGCACCTGAT
GATCTTGATACAAGATTGCTTCGTGCCATGATAACTAAAGGCATGATTGAGCCAATTTCC
AGTGTTTTCATTAACTTGGTTAATGCAGATTTCACTGCTAAACAAAGGGGACTACAGATA
TCTGAAGAACGACTTCTCCTAGATGGTTCACCAGAAAGTCCAGTTGAGTTCATTCAGGTT
CAGATAGCGAATGTAGAATCCAAGTTTGCCAGTGCTATTTCTGACTCAGGAGAGATTAGA
GTGGAGGGTAGAGTTAAGGATGGAGTCCCTCATTTGACAAAGGTCGGGTCTTTTGAAGTG
GATGTGAGCTTGGAAGGCAGTATCATTCTTTGCAGTCAGGTTGATCAGCCAGGAATGATT
GGAAAAGTGGGTAGCGTCTTGGGTGAGGAGAATGTGAATGTCAGCTTCATGAGTGTTGGA
AGGGTTGCTCCTAGAAAGCAAGCTGTTATGGCTATTGGGGTGGATGAACAACCCAGCAAG
GAGTCACTAAAGAGGATTGGGGAAATTCCTGCCATCCAGGAGTTTGTTTACCTTGGATTG
TAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400031593
PEP Infomation

pacid=37462676 transcript=PGSC0003DMT400046698 locus=PGSC0003DMG400018130 ID=PGSC0003DMT400046698.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MAASASSTMLLSSKSSRASLSWKNQFASTSVFRVSGVTLPRRSLRQCPWFIVFSMDAKPT
VLVAEKLGEAGLKLLKEFANVDCSYNLSPEELCTKISLCDALVVRSGTKVTREIFESSGG
RLKVVGRAGVGIDNVDLAAATEHGCLVVNAPTANTVAAAEHGIALLTAMARNVAQADASV
KAGKWLRNKYVGVSLVGKTLAVMGFGKVGSEVARRAKGLGMHVIAHDPYAPADRARAIGV
QLVSFDEALASADFISLHMPLTPATKQILNDETFAKMKKGVRIVNVARGGVIDEEALVRA
LDAGIVAQAALDVFTVEPPPKDSKLIQHENVTATPHLGASTTEAQEGVAIEVAEAVVGAL
KGELSATAVNAPMVPAEVLLELKPFVVLAEKLGRLAVQLVAGGSGVKSVKVTYGSARAPD
DLDTRLLRAMITKGMIEPISSVFINLVNADFTAKQRGLQISEERLLLDGSPESPVEFIQV
QIANVESKFASAISDSGEIRVEGRVKDGVPHLTKVGSFEVDVSLEGSIILCSQVDQPGMI
GKVGSVLGEENVNVSFMSVGRVAPRKQAVMAIGVDEQPSKESLKRIGEIPAIQEFVYLGL
*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400046698
Transcript Infomation

pacid=37462676 locus=PGSC0003DMG400018130 ID=PGSC0003DMT400046698.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCGGCTTCAGCTTCTTCAACTATGCTTTTATCTTCAAAATCTTCACGCGCCTCTCTC
TCATGGAAAAACCAGTTTGCTTCCACCTCTGTCTTTCGCGTCTCCGGGGTTACCCTCCCG
CGCAGAAGCCTCCGTCAGTGTCCATGGTTCATTGTTTTCTCTATGGACGCCAAACCTACG
GTTCTAGTTGCTGAAAAACTAGGTGAGGCAGGGTTAAAACTATTAAAGGAATTCGCGAAT
GTTGATTGCTCATATAACTTGAGTCCTGAGGAGCTGTGCACTAAGATCTCTCTTTGTGAT
GCGTTGGTTGTGCGGAGTGGAACAAAGGTGACCCGTGAGATCTTTGAATCTTCTGGTGGA
CGGCTGAAAGTTGTTGGACGTGCTGGTGTGGGGATTGATAACGTTGATCTTGCGGCGGCA
ACAGAGCATGGATGCCTTGTTGTTAATGCACCCACTGCTAATACAGTTGCAGCTGCCGAG
CATGGAATCGCCCTTCTCACTGCTATGGCTCGGAATGTTGCTCAAGCTGATGCTTCTGTC
AAGGCTGGGAAATGGTTGAGGAACAAATATGTTGGTGTCTCCCTAGTAGGCAAAACACTT
GCTGTGATGGGTTTTGGGAAGGTTGGATCAGAAGTCGCAAGGCGAGCTAAGGGGCTTGGC
ATGCATGTCATCGCTCATGACCCATACGCCCCTGCTGACCGTGCACGTGCTATTGGTGTG
CAGCTTGTGAGCTTTGATGAAGCCCTTGCATCTGCCGATTTCATCTCACTTCACATGCCA
CTGACCCCTGCTACAAAGCAGATCCTGAATGATGAAACTTTTGCGAAGATGAAAAAGGGT
GTACGGATTGTGAATGTTGCTCGTGGGGGTGTGATTGATGAAGAAGCTTTGGTGAGGGCA
CTTGATGCAGGCATTGTGGCACAGGCTGCACTTGATGTTTTCACTGTGGAGCCACCACCA
AAGGATAGCAAGTTGATTCAACATGAGAATGTGACTGCAACTCCACATCTTGGTGCTAGT
ACTACAGAGGCTCAGGAAGGTGTGGCAATTGAGGTCGCTGAAGCAGTTGTTGGCGCTTTG
AAAGGGGAGCTCTCAGCTACTGCTGTCAATGCACCTATGGTTCCTGCTGAGGTGCTATTA
GAGCTGAAGCCTTTTGTTGTACTTGCTGAAAAACTTGGTAGACTTGCTGTCCAGTTGGTT
GCCGGTGGAAGTGGTGTTAAATCAGTGAAAGTAACATATGGTTCAGCTAGAGCACCTGAT
GATCTTGATACAAGATTGCTTCGTGCCATGATAACTAAAGGCATGATTGAGCCAATTTCC
AGTGTTTTCATTAACTTGGTTAATGCAGATTTCACTGCTAAACAAAGGGGACTACAGATA
TCTGAAGAACGACTTCTCCTAGATGGTTCACCAGAAAGTCCAGTTGAGTTCATTCAGGTT
CAGATAGCGAATGTAGAATCCAAGTTTGCCAGTGCTATTTCTGACTCAGGAGAGATTAGA
GTGGAGGGTAGAGTTAAGGATGGAGTCCCTCATTTGACAAAGGTCGGGTCTTTTGAAGTG
GATGTGAGCTTGGAAGGCAGTATCATTCTTTGCAGTCAGGTTGATCAGCCAGGAATGATT
GGAAAAGTGGGTAGCGTCTTGGGTGAGGAGAATGTGAATGTCAGCTTCATGAGTGTTGGA
AGGGTTGCTCCTAGAAAGCAAGCTGTTATGGCTATTGGGGTGGATGAACAACCCAGCAAG
GAGTCACTAAAGAGGATTGGGGAAATTCCTGCCATCCAGGAGTTTGTTTACCTTGGATTG
TAG