Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400046405
CDS Infomation

pacid=37433063 polypeptide=PGSC0003DMP400031411 locus=PGSC0003DMG400018009 ID=PGSC0003DMT400046405.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAGGCAAAGAACCTTAATTACGAGGTCTTTGTCAATATTTAAGTCACAATGTCAATAT
TCAATTAGCTTTTCATCCATTGCTTACAAGTCTTTTGATCTCAAGACTTGCATTGTATCA
CTTCAATCATGTGGTAATGACAAGGACCTTACAGGAGGGAAACAAGTTCATTGCCACATG
CTTAGATGTGGCCATTTGGATTTATCTCCCGTGCCTACCACTAGCCTTATTAACATGTAC
TCGAAATGCAATTCGATATCCAATGCATTATCTGTATTCTATACTTCACCAATTGACCAT
AATGTGTTTGCTTATAATGCTATAATAGCAGGGTTAATTGCCAATGATTTGCCTAAAAGT
GCTTTTGAATTCTATTTGAAAATGAGGCTAGTTGGTGTCATGCCTGATAAGTTCACTTTT
CCTTGTGTGCTTAAGGCTTGTAAAAATGAAGTAGATGTGAAAAGGATTCACGGGTTGGTT
TTTAAATTTGGGCTTGAAGTTGATTTGTTCATCGGAAGTGCTTTGTTGCACAGTTATCTA
ATGTATAGGATGGTGGATTTTGCGTTAGATGTGTTTGAGGATTTGCCGGAGAGGGAAGAT
GTTGTGCTTTGGAATGCCATGATCAATGGATATGCTCAAACTGGAGAGTTTGGTAGTGCT
TTGATGGTTTTTAGGTGGATGATTGAGGATGGGGTTATTCCCAACAAGTTTAGCATAACA
GGTGTACTTTCAGCTCTGGCAAATTATGGGGAAGTTTATAATGGAAAGGTGATACATGGG
CTTGTGATAAAAAAGGGTTTTGATTTGGGGGTTGCCATTTCTAATGCATTAATAGACATG
TATGGTAAATGTAGCTGTGTTGCTGACGCTTTAGAGGTTTTCCAGACAATGGATGATAAG
GATATATTTTCATGGAACTCAATAATTTGTGTGCATGAACAATGTGGTAATCATGAGGGA
ACTTTGAGGCTTTTCAAAAGGATGTTGTCTGCTAGAGTTCGTCCTGATTTGGTGACTGTC
ACCACTACACTTCCTGCCTGTGCTCATTTAGCAGCGTTGAGGCATGGTAGAGAGATTCAT
GGATACATGATTGTTAATGGTCTGAGGAAAGATACAGCTGACAAAGAATATGATGATACT
TACATTGACAATGCAATTTTGGACATGTATGCCAAATGTGGAAGCATGCGTGAAGCTAAG
CTGATCTTTGATATGATGAATTTCAAAGATGTGGCGTCGTGGAATATTATGATTAAGGGG
TATGGCATGCATGGATTTGGCATCAAGGCATTAGAATTGTTTTCTGATATGTGTAAGGCA
GAATTGAGGCCTGATGATGTCACATTTGTTGGGGTTTTGTCAGCTTGCAGCCATTCAGGG
CTTGTAAAACAGGGGAGAGAATTTCTTGCCCATATGCAGCCGAAGTATGGTGTTGTGCCT
TCTATTGAACATTACACCTCTGTGATTGACATGCTAGGTCGTGCTGGGCAGCTTGAAGCT
GCTTATGAGTTATTATTAACAATGCCCATTAAGACCAATTCTGTTGTATGGAGAGCGTTC
TTGGCTGCCTGCCGTCTACATGGTAATGATGATCTTGCTAAGGTTGCTGCAAAACAGGTA
CTTGATCTTGAACCAGATCATTGTGGAAGTTATGTCATATTATCAAATGTTTATGGACAG
ACTGGTCGCTATGAAGAGGTATTAGAGATAAGAGATGCAATGAAGCTACAAAATGTAAGG
AAGACACCTGGTTGTAGCTGGATTGAACTTCATAATGGTGTCCATGTCTTTATTATTGCT
GATAAATCACATCCTGAAGCCAACCTTATTTATGCTGGATTGAATTCTTTGACAGCGCGA
TTGTGTGAGCATGGTTATACACCAGAATCTGATGCCTTGGAAAGCAGTCCATGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400031411
PEP Infomation

pacid=37433063 transcript=PGSC0003DMT400046405 locus=PGSC0003DMG400018009 ID=PGSC0003DMT400046405.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MRQRTLITRSLSIFKSQCQYSISFSSIAYKSFDLKTCIVSLQSCGNDKDLTGGKQVHCHM
LRCGHLDLSPVPTTSLINMYSKCNSISNALSVFYTSPIDHNVFAYNAIIAGLIANDLPKS
AFEFYLKMRLVGVMPDKFTFPCVLKACKNEVDVKRIHGLVFKFGLEVDLFIGSALLHSYL
MYRMVDFALDVFEDLPEREDVVLWNAMINGYAQTGEFGSALMVFRWMIEDGVIPNKFSIT
GVLSALANYGEVYNGKVIHGLVIKKGFDLGVAISNALIDMYGKCSCVADALEVFQTMDDK
DIFSWNSIICVHEQCGNHEGTLRLFKRMLSARVRPDLVTVTTTLPACAHLAALRHGREIH
GYMIVNGLRKDTADKEYDDTYIDNAILDMYAKCGSMREAKLIFDMMNFKDVASWNIMIKG
YGMHGFGIKALELFSDMCKAELRPDDVTFVGVLSACSHSGLVKQGREFLAHMQPKYGVVP
SIEHYTSVIDMLGRAGQLEAAYELLLTMPIKTNSVVWRAFLAACRLHGNDDLAKVAAKQV
LDLEPDHCGSYVILSNVYGQTGRYEEVLEIRDAMKLQNVRKTPGCSWIELHNGVHVFIIA
DKSHPEANLIYAGLNSLTARLCEHGYTPESDALESSP*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400046405
Transcript Infomation

pacid=37433063 locus=PGSC0003DMG400018009 ID=PGSC0003DMT400046405.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAGGCAAAGAACCTTAATTACGAGGTCTTTGTCAATATTTAAGTCACAATGTCAATAT
TCAATTAGCTTTTCATCCATTGCTTACAAGTCTTTTGATCTCAAGACTTGCATTGTATCA
CTTCAATCATGTGGTAATGACAAGGACCTTACAGGAGGGAAACAAGTTCATTGCCACATG
CTTAGATGTGGCCATTTGGATTTATCTCCCGTGCCTACCACTAGCCTTATTAACATGTAC
TCGAAATGCAATTCGATATCCAATGCATTATCTGTATTCTATACTTCACCAATTGACCAT
AATGTGTTTGCTTATAATGCTATAATAGCAGGGTTAATTGCCAATGATTTGCCTAAAAGT
GCTTTTGAATTCTATTTGAAAATGAGGCTAGTTGGTGTCATGCCTGATAAGTTCACTTTT
CCTTGTGTGCTTAAGGCTTGTAAAAATGAAGTAGATGTGAAAAGGATTCACGGGTTGGTT
TTTAAATTTGGGCTTGAAGTTGATTTGTTCATCGGAAGTGCTTTGTTGCACAGTTATCTA
ATGTATAGGATGGTGGATTTTGCGTTAGATGTGTTTGAGGATTTGCCGGAGAGGGAAGAT
GTTGTGCTTTGGAATGCCATGATCAATGGATATGCTCAAACTGGAGAGTTTGGTAGTGCT
TTGATGGTTTTTAGGTGGATGATTGAGGATGGGGTTATTCCCAACAAGTTTAGCATAACA
GGTGTACTTTCAGCTCTGGCAAATTATGGGGAAGTTTATAATGGAAAGGTGATACATGGG
CTTGTGATAAAAAAGGGTTTTGATTTGGGGGTTGCCATTTCTAATGCATTAATAGACATG
TATGGTAAATGTAGCTGTGTTGCTGACGCTTTAGAGGTTTTCCAGACAATGGATGATAAG
GATATATTTTCATGGAACTCAATAATTTGTGTGCATGAACAATGTGGTAATCATGAGGGA
ACTTTGAGGCTTTTCAAAAGGATGTTGTCTGCTAGAGTTCGTCCTGATTTGGTGACTGTC
ACCACTACACTTCCTGCCTGTGCTCATTTAGCAGCGTTGAGGCATGGTAGAGAGATTCAT
GGATACATGATTGTTAATGGTCTGAGGAAAGATACAGCTGACAAAGAATATGATGATACT
TACATTGACAATGCAATTTTGGACATGTATGCCAAATGTGGAAGCATGCGTGAAGCTAAG
CTGATCTTTGATATGATGAATTTCAAAGATGTGGCGTCGTGGAATATTATGATTAAGGGG
TATGGCATGCATGGATTTGGCATCAAGGCATTAGAATTGTTTTCTGATATGTGTAAGGCA
GAATTGAGGCCTGATGATGTCACATTTGTTGGGGTTTTGTCAGCTTGCAGCCATTCAGGG
CTTGTAAAACAGGGGAGAGAATTTCTTGCCCATATGCAGCCGAAGTATGGTGTTGTGCCT
TCTATTGAACATTACACCTCTGTGATTGACATGCTAGGTCGTGCTGGGCAGCTTGAAGCT
GCTTATGAGTTATTATTAACAATGCCCATTAAGACCAATTCTGTTGTATGGAGAGCGTTC
TTGGCTGCCTGCCGTCTACATGGTAATGATGATCTTGCTAAGGTTGCTGCAAAACAGGTA
CTTGATCTTGAACCAGATCATTGTGGAAGTTATGTCATATTATCAAATGTTTATGGACAG
ACTGGTCGCTATGAAGAGGTATTAGAGATAAGAGATGCAATGAAGCTACAAAATGTAAGG
AAGACACCTGGTTGTAGCTGGATTGAACTTCATAATGGTGTCCATGTCTTTATTATTGCT
GATAAATCACATCCTGAAGCCAACCTTATTTATGCTGGATTGAATTCTTTGACAGCGCGA
TTGTGTGAGCATGGTTATACACCAGAATCTGATGCCTTGGAAAGCAGTCCATGA