Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400045498
CDS Infomation

pacid=37455503 polypeptide=PGSC0003DMP400030832 locus=PGSC0003DMG400017649 ID=PGSC0003DMT400045498.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAGTAAACATGCTTGGCTTATCAAGCTCGGCCTTGACACTAGTCCTCTTTACGCTACA
AATCTCATTGCTCACTATGTTTCCTCTCCAATCCCCAACTCCCTTACCATTGCCCAGAAG
GTGTTCGACCAAGTGCCTCACAAAGACACAACCTTATGGACCTCTCTCATCTCATCCTAC
GCTCGTTCCAATCAACCCCACAAAGCCCTTCACCTCTTCTCCGTCATGCTCAACCAATAT
CAATCCAATCCAGATACTGCTGCTCAGCCCAATCACTTCGTCTTCACAGCTGTTGCTCGC
GCCATTGCTTCTTCTCCACAGAACTTCAAATTGGGGCAAAACTTGCATGCCCATGTTATG
AAGTCTGGATTTTTGCCTGGAGATATTGTTGTTGAGACTGCTTTCTTGGATTTGTATTCG
AAATGTGGGGTAGTGGAATGTGCCCGGATGATGTTTGATGAAATGTGTAGGAGAAATTTG
GTGACGTGGAACGCTGTGATTTCTGGGTATGTTCAGAATGGACGGGAGTGTGAAGGGTTG
GAGTTGTTTTATCAAATGAAGTGTAGAGAATTTTACGTGCCTGATGAGTATACCGTTGCT
ACTGTTTTATCTGGTTGTGGCTATGTACAGGAGCTTTTTCTGGGCATGCAAGTTCATGGT
TATGCGTTTGTTAGTGGGTTTGAGTCGAGTTGTAGAAATTCAATTGCTAATATGTATTTT
TATTGTAGTAGAGTTGGATTGGCGGAGAAAGTTTTTGTCGGAACAGAGAGGGATGTTGTT
TCTAAGCTTGTAAAGATAAGGGGTTATGTATTTAATCATATGTATGCTGATGCTGTGAGG
TACATTTTGTCAATGGAGAATGCTGTTGAAATTTTAGTTATGGATCAGACTATTTTCGTG
CCTCTGCTATCTGCTTGCGCCAAGATGCGTTTGCTCAATGCTGGGAAGCAAGTCCATGGT
CTCTTTATCACTTTGGTGAATTCATATAAAACTGCTTGTTTATTAAAAGAGAGCAGAGCG
ATTATTGGCAGTGCACTCATAGACATGTACGGCAAGTGCAGTGATATTGGTAAAGCGCGA
AAAGTTTTTGAAAGTTGGCTACCTGAACGACATGCTCCACTGTGGAATTCTTTGTTGTCT
GGTTATATTAATAATGGACTAATCGAAGATGCCAAGGCACTCTTTGAGCATATGCCCGAG
AAAACTATTGTTTCTTGGACAAGCATGATGACAGGATATGTGCAAAAGGGCTTGCCCCGA
GAAGGCTTAAATTTATTGGCTAAGATGTATTCTGGAGAAGAAAGAGATAGGCTAGAAGGA
AACTGCTTGACCTTTGTGGTAGCTCTTGAAGCATGTTCCCATCTAACAGATTTGGACAAA
GGAAAGCAAATACATGCAAAAATTATTAGAGAGTTGCCGGATGCGGATGACAATGTAGCT
GTTGGAACAGCTTTAGTTGACATGTATTCAAAATCAGGTCACTTGTGTTACACATTACGA
CTTTTTGATGCGATGGAAGAGAAAAATGTTGTTTCATGGACTTCTGCAATCATGGGATTT
GCTGTTCATGGATTTGCTTTCCAAGCCCTTGAACTTTTTCAGCGTATGGTAAACATGGGA
ATTAATCCCAATGAAGTGACATTTACTGCAGTACTAACTGCTTGCCGTCATTGTGGTTTA
GTAGATGAGGGAATGCAATATTTTACGCTAATGTGGAAGCAGTATGGTTTGACCCCTGAT
GAAGAACATTATACATGTCTAATTGACTTATTGGGACGTAATGGAAGGCTTGAGGAAGCA
TGGCATTTGGTGGAGGGAATGGAAGAGAACCATCTAAATGATGGGTGCTCTACAGGTACC
ATTTGGGCTGCACTTCTAGGGGCCTGTCAGTTGTATGAAAACGTTGAAATTGGAAAGAAG
GTAGCTGAAAAGCTGTCGGAAAAGGAGATACTGATATCTACTGCTTCTATTGCGCTATCT
AATGTTTATGCAGCAGCTGGAATGTGGAATGAAGTGTACAGAGTGAGAGAGAGTTGGAGA
AAAAAAGGTCATGCTGATGGAGAGCCTGGTCTTAGCCGCATATGTACACAACCCTATTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400030832
PEP Infomation

pacid=37455503 transcript=PGSC0003DMT400045498 locus=PGSC0003DMG400017649 ID=PGSC0003DMT400045498.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MSKHAWLIKLGLDTSPLYATNLIAHYVSSPIPNSLTIAQKVFDQVPHKDTTLWTSLISSY
ARSNQPHKALHLFSVMLNQYQSNPDTAAQPNHFVFTAVARAIASSPQNFKLGQNLHAHVM
KSGFLPGDIVVETAFLDLYSKCGVVECARMMFDEMCRRNLVTWNAVISGYVQNGRECEGL
ELFYQMKCREFYVPDEYTVATVLSGCGYVQELFLGMQVHGYAFVSGFESSCRNSIANMYF
YCSRVGLAEKVFVGTERDVVSKLVKIRGYVFNHMYADAVRYILSMENAVEILVMDQTIFV
PLLSACAKMRLLNAGKQVHGLFITLVNSYKTACLLKESRAIIGSALIDMYGKCSDIGKAR
KVFESWLPERHAPLWNSLLSGYINNGLIEDAKALFEHMPEKTIVSWTSMMTGYVQKGLPR
EGLNLLAKMYSGEERDRLEGNCLTFVVALEACSHLTDLDKGKQIHAKIIRELPDADDNVA
VGTALVDMYSKSGHLCYTLRLFDAMEEKNVVSWTSAIMGFAVHGFAFQALELFQRMVNMG
INPNEVTFTAVLTACRHCGLVDEGMQYFTLMWKQYGLTPDEEHYTCLIDLLGRNGRLEEA
WHLVEGMEENHLNDGCSTGTIWAALLGACQLYENVEIGKKVAEKLSEKEILISTASIALS
NVYAAAGMWNEVYRVRESWRKKGHADGEPGLSRICTQPY*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400045498
Transcript Infomation

pacid=37455503 locus=PGSC0003DMG400017649 ID=PGSC0003DMT400045498.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAGTAAACATGCTTGGCTTATCAAGCTCGGCCTTGACACTAGTCCTCTTTACGCTACA
AATCTCATTGCTCACTATGTTTCCTCTCCAATCCCCAACTCCCTTACCATTGCCCAGAAG
GTGTTCGACCAAGTGCCTCACAAAGACACAACCTTATGGACCTCTCTCATCTCATCCTAC
GCTCGTTCCAATCAACCCCACAAAGCCCTTCACCTCTTCTCCGTCATGCTCAACCAATAT
CAATCCAATCCAGATACTGCTGCTCAGCCCAATCACTTCGTCTTCACAGCTGTTGCTCGC
GCCATTGCTTCTTCTCCACAGAACTTCAAATTGGGGCAAAACTTGCATGCCCATGTTATG
AAGTCTGGATTTTTGCCTGGAGATATTGTTGTTGAGACTGCTTTCTTGGATTTGTATTCG
AAATGTGGGGTAGTGGAATGTGCCCGGATGATGTTTGATGAAATGTGTAGGAGAAATTTG
GTGACGTGGAACGCTGTGATTTCTGGGTATGTTCAGAATGGACGGGAGTGTGAAGGGTTG
GAGTTGTTTTATCAAATGAAGTGTAGAGAATTTTACGTGCCTGATGAGTATACCGTTGCT
ACTGTTTTATCTGGTTGTGGCTATGTACAGGAGCTTTTTCTGGGCATGCAAGTTCATGGT
TATGCGTTTGTTAGTGGGTTTGAGTCGAGTTGTAGAAATTCAATTGCTAATATGTATTTT
TATTGTAGTAGAGTTGGATTGGCGGAGAAAGTTTTTGTCGGAACAGAGAGGGATGTTGTT
TCTAAGCTTGTAAAGATAAGGGGTTATGTATTTAATCATATGTATGCTGATGCTGTGAGG
TACATTTTGTCAATGGAGAATGCTGTTGAAATTTTAGTTATGGATCAGACTATTTTCGTG
CCTCTGCTATCTGCTTGCGCCAAGATGCGTTTGCTCAATGCTGGGAAGCAAGTCCATGGT
CTCTTTATCACTTTGGTGAATTCATATAAAACTGCTTGTTTATTAAAAGAGAGCAGAGCG
ATTATTGGCAGTGCACTCATAGACATGTACGGCAAGTGCAGTGATATTGGTAAAGCGCGA
AAAGTTTTTGAAAGTTGGCTACCTGAACGACATGCTCCACTGTGGAATTCTTTGTTGTCT
GGTTATATTAATAATGGACTAATCGAAGATGCCAAGGCACTCTTTGAGCATATGCCCGAG
AAAACTATTGTTTCTTGGACAAGCATGATGACAGGATATGTGCAAAAGGGCTTGCCCCGA
GAAGGCTTAAATTTATTGGCTAAGATGTATTCTGGAGAAGAAAGAGATAGGCTAGAAGGA
AACTGCTTGACCTTTGTGGTAGCTCTTGAAGCATGTTCCCATCTAACAGATTTGGACAAA
GGAAAGCAAATACATGCAAAAATTATTAGAGAGTTGCCGGATGCGGATGACAATGTAGCT
GTTGGAACAGCTTTAGTTGACATGTATTCAAAATCAGGTCACTTGTGTTACACATTACGA
CTTTTTGATGCGATGGAAGAGAAAAATGTTGTTTCATGGACTTCTGCAATCATGGGATTT
GCTGTTCATGGATTTGCTTTCCAAGCCCTTGAACTTTTTCAGCGTATGGTAAACATGGGA
ATTAATCCCAATGAAGTGACATTTACTGCAGTACTAACTGCTTGCCGTCATTGTGGTTTA
GTAGATGAGGGAATGCAATATTTTACGCTAATGTGGAAGCAGTATGGTTTGACCCCTGAT
GAAGAACATTATACATGTCTAATTGACTTATTGGGACGTAATGGAAGGCTTGAGGAAGCA
TGGCATTTGGTGGAGGGAATGGAAGAGAACCATCTAAATGATGGGTGCTCTACAGGTACC
ATTTGGGCTGCACTTCTAGGGGCCTGTCAGTTGTATGAAAACGTTGAAATTGGAAAGAAG
GTAGCTGAAAAGCTGTCGGAAAAGGAGATACTGATATCTACTGCTTCTATTGCGCTATCT
AATGTTTATGCAGCAGCTGGAATGTGGAATGAAGTGTACAGAGTGAGAGAGAGTTGGAGA
AAAAAAGGTCATGCTGATGGAGAGCCTGGTCTTAGCCGCATATGTACACAACCCTATTAA