Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400045127
CDS Infomation

pacid=37468658 polypeptide=PGSC0003DMP400030567 locus=PGSC0003DMG401017504 ID=PGSC0003DMT400045127.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGGAGGAGGGTTTTCGCAGCTGTTTCCGTGTTTTAACCCGGCGGTGAACCGGGGTGAA
ACGGAGGTGATCTTCACCGCCGGTGAACCGCTTGATGAAACCCTCGGCCATTCCTTCTGT
TATGTGAGGTCATCTGCGAGGTTTGTATCTCCCACTCACTCAGATCGATTTGTTTCACCT
TCTCAGTCGTTACGGTTTGATGAACCAGCTCCTCTGAGGTCGAGGCAGCTTGGTCCATCG
GAAACTGGGTTTCGTGCCATTTCTGGAGCTTCTGTCAGTGCTAACACTTCTACTCCCAGA
ACTGTCCTTCAACTTGACAATTTTTATGATGATGCCACTGGAAATGATGCTGGTGGTGGT
CTTGTGGGTTTTAATGGCGGTAATAATGTTAGGGGCAGTGTTGTAAATGGTTTCGAGAGT
ACGTCGTCGTTTAGTGCTTTGCCACTTCAGCCGGTGCCTCGAGGCGGAGTTAGCGGCGAA
CCGTCCGGTCCAATGGAGAGAGCCTTCTTCATGTCTGGTCCGATCGAGCGTGGGGCACTA
TCTGGACCGCTTGATGCTACCACCGGCTCAGACGGCGGCGGCGGAGGCAACCGGGTTCCG
TTCTCTGCTCCACTGGGTGGAGTTTATGTTAAAAAGAGGAGGAAAAAGGGCATTTCGGGA
ATTAAAAAAGCCTTCTACAGGAATTTCTCCGAGAAGAAACGGCCGTGGGTAGTACCGGTG
AGAAACTTTGTCAACGGCAGAAAGGACATTCCGATCGCCGGGGACTGTACACATGATTCG
GATATGGGCAGCGAATCCAATGTTCAATGGGCATTGGGTAAAGCGGGGGAGGATCGTGTG
CATGTGGTTGTATCGGAAGAGCATGGATGGCTATTTGTTGGAATTTATGATGGTTTTAAT
GGCCCTGATGCCCCGGAGTTTTTGATGAGTAATCTATACAAAGCTATGTATAAAGAATTG
GAGGGTTTATTTTGGGATAGTGAAGATACTAGTAATCCAGAAGGGGCAAATCCAAGTTCA
GAAAGCGAAGTGATTGCTGCGAATTCTAGCATACCTGATTCTAATTTAGTACCGGGGGAA
ACTAATAGCGGGGTTGAAGGAGTAGAAGAAGGTGAAAGTGAGGTGAATTTGCAGCAGGTG
GATAGAAGGCCGTCAAAGAAGGTGACTTTTGAGTCAGGGGAGATAGAAGTTAGGAGGAGG
AGATTGTGGGAATTTTTAGCAGAAGAGGATCCAGAAGATGGGCTTGATCTTTCGGGTTCA
GATAGATTTGCATTTTCAGTAGACGATGCATTAAGTGTAAATAATGCTGGTTCAGCAGTG
AATAGGAGGTCGTTGCTGTTGTCGAAATTGAAACATGGATTGTTAAGTAAGCACAAAGAG
AGTAAGAAATTATTCCCGTGGAAATTTGGATTGGAAGCTAAAGAGAAAGTTGAAGAGGAG
GAGAATAGAGTTGAGGAGGAAAGGACTAGTAGAAATGAGAAGAGGCGAAAGACGGGTCCA
GTTGATCATGAGTTGGTTTTGAGGGCAATGTCCAGGGCTCTTGAAGTTACTGAGTTAGCG
TACTTGGATATGACAGATAGAGTTCTTGATCGATATCCGGAGCTAGCACTTATGGGGTCT
TGTTTGTTGGTTGCTTTAATGAGAGATGAAGATGTGTATGTAATGAACGTAGGAGATAGT
CGTGCTATTGTGGCAAAATATGAGCCTGAGGAGGTTAGTTCTACTTCAGAATCCAAAGGT
CCACGTAATGGCGGGTTGACTGTTGAGGGCATTGTTGAAGAAACAACAAGTGCCTGCAAT
GAGGAGAATAAGGTGACAAATGAGGCACCTGTTCAGGGTATGAAGCTGACTGCATTGCAA
TTATCCACTGATCACAGCACTAATATTGAAGAAGAAGTCATTAGAATTAAGAGTGAGCAC
CCAGATGACAGCAATTGCATTGTCAATGGTCGGGTAAAAGGTCGTTTGAAGGTCACTCGT
GCCTTTGGTGCAGGCTTCCTCAAACAGCCTAAATTCAACGATGTATTGCTAGAAATGTTT
CGGAATGTGTACATTGGCAATGCTCCTTATGTTTCTTGTACACCTTCGTTGCGCCACCAT
AGACTCTGTCCAGGGGATCAGTTTTTGGTACTCTCCTCTGATGGCTTATACCAAGACTTG
AGCAATGAGGAGGTGGTCTCTCATGTTGAGAATTTTATGGAGAAATTTCCAGATGGGGAT
CCTGCTCAACACCTGATTGAGGAGCTTTTATTCCGTGCAGCCAAGAAAGCTGGAATGGAA
TTGCATGAATTGCTGGATATCCCTCAAGGGGACCGCAGGAAGTACCATGATGATGTTACT
GTTATGGTGATATCTCTTGAAGGAAGAATTTGGAAGTCGTCAGGGAAATACCTCTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400030567
PEP Infomation

pacid=37468658 transcript=PGSC0003DMT400045127 locus=PGSC0003DMG401017504 ID=PGSC0003DMT400045127.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MGGGFSQLFPCFNPAVNRGETEVIFTAGEPLDETLGHSFCYVRSSARFVSPTHSDRFVSP
SQSLRFDEPAPLRSRQLGPSETGFRAISGASVSANTSTPRTVLQLDNFYDDATGNDAGGG
LVGFNGGNNVRGSVVNGFESTSSFSALPLQPVPRGGVSGEPSGPMERAFFMSGPIERGAL
SGPLDATTGSDGGGGGNRVPFSAPLGGVYVKKRRKKGISGIKKAFYRNFSEKKRPWVVPV
RNFVNGRKDIPIAGDCTHDSDMGSESNVQWALGKAGEDRVHVVVSEEHGWLFVGIYDGFN
GPDAPEFLMSNLYKAMYKELEGLFWDSEDTSNPEGANPSSESEVIAANSSIPDSNLVPGE
TNSGVEGVEEGESEVNLQQVDRRPSKKVTFESGEIEVRRRRLWEFLAEEDPEDGLDLSGS
DRFAFSVDDALSVNNAGSAVNRRSLLLSKLKHGLLSKHKESKKLFPWKFGLEAKEKVEEE
ENRVEEERTSRNEKRRKTGPVDHELVLRAMSRALEVTELAYLDMTDRVLDRYPELALMGS
CLLVALMRDEDVYVMNVGDSRAIVAKYEPEEVSSTSESKGPRNGGLTVEGIVEETTSACN
EENKVTNEAPVQGMKLTALQLSTDHSTNIEEEVIRIKSEHPDDSNCIVNGRVKGRLKVTR
AFGAGFLKQPKFNDVLLEMFRNVYIGNAPYVSCTPSLRHHRLCPGDQFLVLSSDGLYQDL
SNEEVVSHVENFMEKFPDGDPAQHLIEELLFRAAKKAGMELHELLDIPQGDRRKYHDDVT
VMVISLEGRIWKSSGKYL*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400045127
Transcript Infomation

pacid=37468658 locus=PGSC0003DMG401017504 ID=PGSC0003DMT400045127.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGGAGGAGGGTTTTCGCAGCTGTTTCCGTGTTTTAACCCGGCGGTGAACCGGGGTGAA
ACGGAGGTGATCTTCACCGCCGGTGAACCGCTTGATGAAACCCTCGGCCATTCCTTCTGT
TATGTGAGGTCATCTGCGAGGTTTGTATCTCCCACTCACTCAGATCGATTTGTTTCACCT
TCTCAGTCGTTACGGTTTGATGAACCAGCTCCTCTGAGGTCGAGGCAGCTTGGTCCATCG
GAAACTGGGTTTCGTGCCATTTCTGGAGCTTCTGTCAGTGCTAACACTTCTACTCCCAGA
ACTGTCCTTCAACTTGACAATTTTTATGATGATGCCACTGGAAATGATGCTGGTGGTGGT
CTTGTGGGTTTTAATGGCGGTAATAATGTTAGGGGCAGTGTTGTAAATGGTTTCGAGAGT
ACGTCGTCGTTTAGTGCTTTGCCACTTCAGCCGGTGCCTCGAGGCGGAGTTAGCGGCGAA
CCGTCCGGTCCAATGGAGAGAGCCTTCTTCATGTCTGGTCCGATCGAGCGTGGGGCACTA
TCTGGACCGCTTGATGCTACCACCGGCTCAGACGGCGGCGGCGGAGGCAACCGGGTTCCG
TTCTCTGCTCCACTGGGTGGAGTTTATGTTAAAAAGAGGAGGAAAAAGGGCATTTCGGGA
ATTAAAAAAGCCTTCTACAGGAATTTCTCCGAGAAGAAACGGCCGTGGGTAGTACCGGTG
AGAAACTTTGTCAACGGCAGAAAGGACATTCCGATCGCCGGGGACTGTACACATGATTCG
GATATGGGCAGCGAATCCAATGTTCAATGGGCATTGGGTAAAGCGGGGGAGGATCGTGTG
CATGTGGTTGTATCGGAAGAGCATGGATGGCTATTTGTTGGAATTTATGATGGTTTTAAT
GGCCCTGATGCCCCGGAGTTTTTGATGAGTAATCTATACAAAGCTATGTATAAAGAATTG
GAGGGTTTATTTTGGGATAGTGAAGATACTAGTAATCCAGAAGGGGCAAATCCAAGTTCA
GAAAGCGAAGTGATTGCTGCGAATTCTAGCATACCTGATTCTAATTTAGTACCGGGGGAA
ACTAATAGCGGGGTTGAAGGAGTAGAAGAAGGTGAAAGTGAGGTGAATTTGCAGCAGGTG
GATAGAAGGCCGTCAAAGAAGGTGACTTTTGAGTCAGGGGAGATAGAAGTTAGGAGGAGG
AGATTGTGGGAATTTTTAGCAGAAGAGGATCCAGAAGATGGGCTTGATCTTTCGGGTTCA
GATAGATTTGCATTTTCAGTAGACGATGCATTAAGTGTAAATAATGCTGGTTCAGCAGTG
AATAGGAGGTCGTTGCTGTTGTCGAAATTGAAACATGGATTGTTAAGTAAGCACAAAGAG
AGTAAGAAATTATTCCCGTGGAAATTTGGATTGGAAGCTAAAGAGAAAGTTGAAGAGGAG
GAGAATAGAGTTGAGGAGGAAAGGACTAGTAGAAATGAGAAGAGGCGAAAGACGGGTCCA
GTTGATCATGAGTTGGTTTTGAGGGCAATGTCCAGGGCTCTTGAAGTTACTGAGTTAGCG
TACTTGGATATGACAGATAGAGTTCTTGATCGATATCCGGAGCTAGCACTTATGGGGTCT
TGTTTGTTGGTTGCTTTAATGAGAGATGAAGATGTGTATGTAATGAACGTAGGAGATAGT
CGTGCTATTGTGGCAAAATATGAGCCTGAGGAGGTTAGTTCTACTTCAGAATCCAAAGGT
CCACGTAATGGCGGGTTGACTGTTGAGGGCATTGTTGAAGAAACAACAAGTGCCTGCAAT
GAGGAGAATAAGGTGACAAATGAGGCACCTGTTCAGGGTATGAAGCTGACTGCATTGCAA
TTATCCACTGATCACAGCACTAATATTGAAGAAGAAGTCATTAGAATTAAGAGTGAGCAC
CCAGATGACAGCAATTGCATTGTCAATGGTCGGGTAAAAGGTCGTTTGAAGGTCACTCGT
GCCTTTGGTGCAGGCTTCCTCAAACAGCCTAAATTCAACGATGTATTGCTAGAAATGTTT
CGGAATGTGTACATTGGCAATGCTCCTTATGTTTCTTGTACACCTTCGTTGCGCCACCAT
AGACTCTGTCCAGGGGATCAGTTTTTGGTACTCTCCTCTGATGGCTTATACCAAGACTTG
AGCAATGAGGAGGTGGTCTCTCATGTTGAGAATTTTATGGAGAAATTTCCAGATGGGGAT
CCTGCTCAACACCTGATTGAGGAGCTTTTATTCCGTGCAGCCAAGAAAGCTGGAATGGAA
TTGCATGAATTGCTGGATATCCCTCAAGGGGACCGCAGGAAGTACCATGATGATGTTACT
GTTATGGTGATATCTCTTGAAGGAAGAATTTGGAAGTCGTCAGGGAAATACCTCTGA