Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400045062
CDS Infomation

pacid=37428028 polypeptide=PGSC0003DMP400030525 locus=PGSC0003DMG400017472 ID=PGSC0003DMT400045062.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGACGAGCAGGACCCATCCCCTCGCAATTCTGCAAAAACAGATGAAACTGGAATTGAT
TGTATCAGTGCGTTGCCAGACTCTGTTATTGTTGAAATTCTTTCTAAAATCCCTATTACA
GATGCCTGCACAACAACTATTCTCTCTAAACATTGGCAATATCTGTGGACTTGTATCCAT
AACCTCCATTGTTACCGCTCCAACACTGGTTCTGGTTGGTCTGATAAGAGGCTTATTTCA
TTCATGGACAATGCATTACCTCTTCTTACCTCCTCTAAAATTAAAAGCTTCACTCTACAT
TTCACACCTAACATTGCTCTATCAAATTATCATTCCAAACTCCGTTCCAAACTCCACGAA
TGGCTTGAAATTGTATTGAAGAAAAAAGTGGAGAATCTTGACCTAGATTTATGGGGTTGC
GACTATTATTTGGATAGTGATCTGTATAGCTTGCCTCAGGAACTTTGCAGCAGTTCATCA
CTTGTAAAACTAAAATTCAAGTTTTGCAAAATACCAGAAGATCGTAAACTCAATTGGACA
TCCCTAAAGAGTTTAACACTAACATTTGTGCTTCTCACTGAGGAACACATGAAACAAATA
ACATCAAATTGTCATCACCTGGAATCTTTAAAGCTGTGTGATTTTTGTGGTTTTCATCGT
TTGCATTTAACTTCCCCAAAATGTACGACACTTGAATTGAGTAACCACACACATCCTCTT
GGCTATATGGGAGATGAGTGTTACTTTGAAATTGTTGCTCCATATGTTCAACATTTTAGG
ATTTCAGGGAATTTTGATGGTGTGGGAATTAGGCTCGGGGACATGTCGTCTTTGATCCAC
GCTGATCTTACTTACAACTTGTATGATGACCGTGGATTAGATGATGTAATTGACAAAAGC
ATAGTGAAAGATCACTTGACAAGCGTAGCTTGTGCTAATGAGCTAATCATCCCATCCTTG
TATATCGAGATGATTTCCATGTTGATATTGCAAAAAGAAGATGTCTCATTACCGTTGATG
GAGTGCAAACGATTGACGATAAATTCTTGGATTAGCAAATATACCTTCCTTGGCATCGAC
AGACTCTTAAGTTCAACTCCTTGTCTAGAGAATTTGACAATACATCTTAAAGTGGACTGC
ACTTTCTTAAATTACTGGTGTGAAGACATGGATGAGTTGGAAGACAACTATGAAAACATA
TTCATCATAGGTTCGTTGCGGAATCTGAAAATCTTAAAGGTTATTTTACAGTGGAGTCCC
TTCATAGAGGATGACACGACAACAGAGCTTACTGAACTGATGAAGTGTTTGTTTGAGCAC
GCAAAATATCTGGAGAAACTGGTTATAGTGGCAGAGACCAGAGATTGTTCAGAAGTGATA
CAAAATTTGTTAGCTCTTCCCAGAGTTTCTAATAGTACTGTAGTTGTTTCCTCAGAATCG
GTTGCTGGTGCTGAGTACTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400030525
PEP Infomation

pacid=37428028 transcript=PGSC0003DMT400045062 locus=PGSC0003DMG400017472 ID=PGSC0003DMT400045062.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MDEQDPSPRNSAKTDETGIDCISALPDSVIVEILSKIPITDACTTTILSKHWQYLWTCIH
NLHCYRSNTGSGWSDKRLISFMDNALPLLTSSKIKSFTLHFTPNIALSNYHSKLRSKLHE
WLEIVLKKKVENLDLDLWGCDYYLDSDLYSLPQELCSSSSLVKLKFKFCKIPEDRKLNWT
SLKSLTLTFVLLTEEHMKQITSNCHHLESLKLCDFCGFHRLHLTSPKCTTLELSNHTHPL
GYMGDECYFEIVAPYVQHFRISGNFDGVGIRLGDMSSLIHADLTYNLYDDRGLDDVIDKS
IVKDHLTSVACANELIIPSLYIEMISMLILQKEDVSLPLMECKRLTINSWISKYTFLGID
RLLSSTPCLENLTIHLKVDCTFLNYWCEDMDELEDNYENIFIIGSLRNLKILKVILQWSP
FIEDDTTTELTELMKCLFEHAKYLEKLVIVAETRDCSEVIQNLLALPRVSNSTVVVSSES
VAGAEY*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400045062
Transcript Infomation

pacid=37428028 locus=PGSC0003DMG400017472 ID=PGSC0003DMT400045062.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGACGAGCAGGACCCATCCCCTCGCAATTCTGCAAAAACAGATGAAACTGGAATTGAT
TGTATCAGTGCGTTGCCAGACTCTGTTATTGTTGAAATTCTTTCTAAAATCCCTATTACA
GATGCCTGCACAACAACTATTCTCTCTAAACATTGGCAATATCTGTGGACTTGTATCCAT
AACCTCCATTGTTACCGCTCCAACACTGGTTCTGGTTGGTCTGATAAGAGGCTTATTTCA
TTCATGGACAATGCATTACCTCTTCTTACCTCCTCTAAAATTAAAAGCTTCACTCTACAT
TTCACACCTAACATTGCTCTATCAAATTATCATTCCAAACTCCGTTCCAAACTCCACGAA
TGGCTTGAAATTGTATTGAAGAAAAAAGTGGAGAATCTTGACCTAGATTTATGGGGTTGC
GACTATTATTTGGATAGTGATCTGTATAGCTTGCCTCAGGAACTTTGCAGCAGTTCATCA
CTTGTAAAACTAAAATTCAAGTTTTGCAAAATACCAGAAGATCGTAAACTCAATTGGACA
TCCCTAAAGAGTTTAACACTAACATTTGTGCTTCTCACTGAGGAACACATGAAACAAATA
ACATCAAATTGTCATCACCTGGAATCTTTAAAGCTGTGTGATTTTTGTGGTTTTCATCGT
TTGCATTTAACTTCCCCAAAATGTACGACACTTGAATTGAGTAACCACACACATCCTCTT
GGCTATATGGGAGATGAGTGTTACTTTGAAATTGTTGCTCCATATGTTCAACATTTTAGG
ATTTCAGGGAATTTTGATGGTGTGGGAATTAGGCTCGGGGACATGTCGTCTTTGATCCAC
GCTGATCTTACTTACAACTTGTATGATGACCGTGGATTAGATGATGTAATTGACAAAAGC
ATAGTGAAAGATCACTTGACAAGCGTAGCTTGTGCTAATGAGCTAATCATCCCATCCTTG
TATATCGAGATGATTTCCATGTTGATATTGCAAAAAGAAGATGTCTCATTACCGTTGATG
GAGTGCAAACGATTGACGATAAATTCTTGGATTAGCAAATATACCTTCCTTGGCATCGAC
AGACTCTTAAGTTCAACTCCTTGTCTAGAGAATTTGACAATACATCTTAAAGTGGACTGC
ACTTTCTTAAATTACTGGTGTGAAGACATGGATGAGTTGGAAGACAACTATGAAAACATA
TTCATCATAGGTTCGTTGCGGAATCTGAAAATCTTAAAGGTTATTTTACAGTGGAGTCCC
TTCATAGAGGATGACACGACAACAGAGCTTACTGAACTGATGAAGTGTTTGTTTGAGCAC
GCAAAATATCTGGAGAAACTGGTTATAGTGGCAGAGACCAGAGATTGTTCAGAAGTGATA
CAAAATTTGTTAGCTCTTCCCAGAGTTTCTAATAGTACTGTAGTTGTTTCCTCAGAATCG
GTTGCTGGTGCTGAGTACTGA