Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400044953
CDS Infomation

pacid=37444624 polypeptide=PGSC0003DMP400030468 locus=PGSC0003DMG400017438 ID=PGSC0003DMT400044953.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCTCGTGTTGGTGAAAATGGAGTTAATAATGCAATCGATACAAGGACAAAGGAGCAA
AAAGCAATCGATGAATGGCTACCAATAACATCGAACCGGAATGCGAAGTGGTGGTACTCA
ACTATGCATAATGTTACCGCTATGGTTGGTGCTGGTGTTCTTAGTCTCCCTTACGCTATG
TCTCAGATGGGATGGGGAGCTGGTGTAACAGCAATGTTACTATCATGGATTATAACATTT
TACACAATCTGGCAAATGGTTGAGATGCATGAAATGATTCCGGGTAAGAGATTTGACAGA
TATCATGAACTAGGTCAATGCGCGTTTGGTGAAAAACTTGGCCTCTGGATTGTTGTTCCA
CAACAAATGATCGTAGAGGTCAGCACTTGTATCATCTACATGGTAACTGGTGGTAAATCA
TTGCAAAAATTTCAAGAAATTATATTCCCAAACATGAAACCACTCAAACTCACTTATTTC
ATCACCTTCTTTTCATCCATCGAGTTTGGCCTATCTCTGTTACCAAATTTCAACTCCCTC
TCCTCTGTTTCATTTGTCGCGGCTGTTTTATCCATAGCATATTCCTTTATAGCATGGACT
GCATCAATAAAAGAGCACGCGATTGGGACACAAGTAGTGAGTTATGGTCCAAGAAGTAGT
AAAAGTTCAGATAATGTGTTTATGTTTTTGAGTGCATTAGGTAATGTAGCATTTTCATAT
GCTGGACATAATGTTGTTCTTGAAATTCAAGCTACTATTCCTTCAACACCAGAGAATCCA
TCAAAGAAAGCTATGTGGAAAGGTGTATTGATAGCTTATATTATCGTCGCGATATGCTAT
TTGCCTGTTGCTTTCGTTGGATATTGGGTGTTTGGTAATGGAGTTGATGATAATATTTTG
CTAACACTATATAAACCTGTTTGGCTTGTTGCTGCTGCTAATATCTTCGTAGTCTTTCAT
GTCATTGGAAGTTACCAGGTTTATGCAATGCCAGTGTTTGACATGTTTGAGACATTCGCG
GTGAGGTCAATGAAATTCAAACCTTCATTTCGCCTACGTTTTGTCGTGCGTATGCTTTTT
GTTGCATTTACATTGTTTGTGGGTATCACAATTCCATTCTTTGGTGGTTTAATGGGATTC
TTTGGAGGCTTTGCTTTGGCACCAACTTCATACTATCTTCCATGTATCATTTGGCTTATA
CTCAAAAAGCCCAAGAGGTTTGGCTTGTCATGGACTATTAATTGGGTGTGTATCATAGTG
GGTGTACTTTTGACTCTTCTATCTCCTATTGGTGGAATGTGGAGCATCATTAAATCTGTC
AAGACTTATAAATTCTACCAATGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400030468
PEP Infomation

pacid=37444624 transcript=PGSC0003DMT400044953 locus=PGSC0003DMG400017438 ID=PGSC0003DMT400044953.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MARVGENGVNNAIDTRTKEQKAIDEWLPITSNRNAKWWYSTMHNVTAMVGAGVLSLPYAM
SQMGWGAGVTAMLLSWIITFYTIWQMVEMHEMIPGKRFDRYHELGQCAFGEKLGLWIVVP
QQMIVEVSTCIIYMVTGGKSLQKFQEIIFPNMKPLKLTYFITFFSSIEFGLSLLPNFNSL
SSVSFVAAVLSIAYSFIAWTASIKEHAIGTQVVSYGPRSSKSSDNVFMFLSALGNVAFSY
AGHNVVLEIQATIPSTPENPSKKAMWKGVLIAYIIVAICYLPVAFVGYWVFGNGVDDNIL
LTLYKPVWLVAAANIFVVFHVIGSYQVYAMPVFDMFETFAVRSMKFKPSFRLRFVVRMLF
VAFTLFVGITIPFFGGLMGFFGGFALAPTSYYLPCIIWLILKKPKRFGLSWTINWVCIIV
GVLLTLLSPIGGMWSIIKSVKTYKFYQ*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400044953
Transcript Infomation

pacid=37444624 locus=PGSC0003DMG400017438 ID=PGSC0003DMT400044953.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCTCGTGTTGGTGAAAATGGAGTTAATAATGCAATCGATACAAGGACAAAGGAGCAA
AAAGCAATCGATGAATGGCTACCAATAACATCGAACCGGAATGCGAAGTGGTGGTACTCA
ACTATGCATAATGTTACCGCTATGGTTGGTGCTGGTGTTCTTAGTCTCCCTTACGCTATG
TCTCAGATGGGATGGGGAGCTGGTGTAACAGCAATGTTACTATCATGGATTATAACATTT
TACACAATCTGGCAAATGGTTGAGATGCATGAAATGATTCCGGGTAAGAGATTTGACAGA
TATCATGAACTAGGTCAATGCGCGTTTGGTGAAAAACTTGGCCTCTGGATTGTTGTTCCA
CAACAAATGATCGTAGAGGTCAGCACTTGTATCATCTACATGGTAACTGGTGGTAAATCA
TTGCAAAAATTTCAAGAAATTATATTCCCAAACATGAAACCACTCAAACTCACTTATTTC
ATCACCTTCTTTTCATCCATCGAGTTTGGCCTATCTCTGTTACCAAATTTCAACTCCCTC
TCCTCTGTTTCATTTGTCGCGGCTGTTTTATCCATAGCATATTCCTTTATAGCATGGACT
GCATCAATAAAAGAGCACGCGATTGGGACACAAGTAGTGAGTTATGGTCCAAGAAGTAGT
AAAAGTTCAGATAATGTGTTTATGTTTTTGAGTGCATTAGGTAATGTAGCATTTTCATAT
GCTGGACATAATGTTGTTCTTGAAATTCAAGCTACTATTCCTTCAACACCAGAGAATCCA
TCAAAGAAAGCTATGTGGAAAGGTGTATTGATAGCTTATATTATCGTCGCGATATGCTAT
TTGCCTGTTGCTTTCGTTGGATATTGGGTGTTTGGTAATGGAGTTGATGATAATATTTTG
CTAACACTATATAAACCTGTTTGGCTTGTTGCTGCTGCTAATATCTTCGTAGTCTTTCAT
GTCATTGGAAGTTACCAGGTTTATGCAATGCCAGTGTTTGACATGTTTGAGACATTCGCG
GTGAGGTCAATGAAATTCAAACCTTCATTTCGCCTACGTTTTGTCGTGCGTATGCTTTTT
GTTGCATTTACATTGTTTGTGGGTATCACAATTCCATTCTTTGGTGGTTTAATGGGATTC
TTTGGAGGCTTTGCTTTGGCACCAACTTCATACTATCTTCCATGTATCATTTGGCTTATA
CTCAAAAAGCCCAAGAGGTTTGGCTTGTCATGGACTATTAATTGGGTGTGTATCATAGTG
GGTGTACTTTTGACTCTTCTATCTCCTATTGGTGGAATGTGGAGCATCATTAAATCTGTC
AAGACTTATAAATTCTACCAATGA