Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400044880
CDS Infomation

pacid=37432638 polypeptide=PGSC0003DMP400030433 locus=PGSC0003DMG400017411 ID=PGSC0003DMT400044880.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGGTTATATATGTGAATATTGTGGGGAGCAACGATCAATTGTCTATTGCCGGTCTGAT
TCAGCTTGCTTGTGTTTGTCGTGTGATCGAAATATCCATTCTGCAAATGCCTTGTCACAA
CGTCATTCCAGAACACTTGTATGTGAAAGATGTAATTCCCAACCAGCTATTTTCAGATGT
GTCGAGGAGAGGGTCTCTCTATGCCAGAATTGTGATTGGATGGCTCATGCTAGTTCTAGT
ACATGTTTAACACATAAGAGACAAGCACTTAGTTGTTATACAGGGTGTCCTTCTGCGGTG
GAGCTTTCTACTATCTGGTCATTTCTTCTAGGTGACCCTTCAATTCGTGATTTGACTTGT
GAGCAAGGGATGGGTTCAATGAGCATCACTGATTGCCAACCTGGGGATAGCCAACATCCT
CAAGTAAAGGAAAAATCTCAAGACATGTCTTCTGCACTTGATGAAGCAAACGATTTGCAT
AATCTAGTCAAGTCTGCCCCTTTTATGGGATCGTCTATGCCTAGTCTTGATAACGAGCTT
CACAATGTTGAACTGCTTGTTGGATCCACAAATTTAACTTGGTCTAAGGTGAGAAATTCT
GGCACAAAAGGCTACGATGATCCTTTTTCTGATGATTTCAATATGGATGAAGTGGACTTA
AGTATTGAAAATTATGAAGAGCTATTTGGTGTTTCTATTGATAATCGTGATCGACTGTTT
AAGAATGAAGACATTGATGACTTCTTTGGGACAAAGGACATGTCAACTGCTGAGTCTAGC
TTCCAGGGTGTCAATGCTGTCGAGGTGGTTCATACTTTATAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400030433
PEP Infomation

pacid=37432638 transcript=PGSC0003DMT400044880 locus=PGSC0003DMG400017411 ID=PGSC0003DMT400044880.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MGYICEYCGEQRSIVYCRSDSACLCLSCDRNIHSANALSQRHSRTLVCERCNSQPAIFRC
VEERVSLCQNCDWMAHASSSTCLTHKRQALSCYTGCPSAVELSTIWSFLLGDPSIRDLTC
EQGMGSMSITDCQPGDSQHPQVKEKSQDMSSALDEANDLHNLVKSAPFMGSSMPSLDNEL
HNVELLVGSTNLTWSKVRNSGTKGYDDPFSDDFNMDEVDLSIENYEELFGVSIDNRDRLF
KNEDIDDFFGTKDMSTAESSFQGVNAVEVVHTL*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400044880
Transcript Infomation

pacid=37432638 locus=PGSC0003DMG400017411 ID=PGSC0003DMT400044880.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGGTTATATATGTGAATATTGTGGGGAGCAACGATCAATTGTCTATTGCCGGTCTGAT
TCAGCTTGCTTGTGTTTGTCGTGTGATCGAAATATCCATTCTGCAAATGCCTTGTCACAA
CGTCATTCCAGAACACTTGTATGTGAAAGATGTAATTCCCAACCAGCTATTTTCAGATGT
GTCGAGGAGAGGGTCTCTCTATGCCAGAATTGTGATTGGATGGCTCATGCTAGTTCTAGT
ACATGTTTAACACATAAGAGACAAGCACTTAGTTGTTATACAGGGTGTCCTTCTGCGGTG
GAGCTTTCTACTATCTGGTCATTTCTTCTAGGTGACCCTTCAATTCGTGATTTGACTTGT
GAGCAAGGGATGGGTTCAATGAGCATCACTGATTGCCAACCTGGGGATAGCCAACATCCT
CAAGTAAAGGAAAAATCTCAAGACATGTCTTCTGCACTTGATGAAGCAAACGATTTGCAT
AATCTAGTCAAGTCTGCCCCTTTTATGGGATCGTCTATGCCTAGTCTTGATAACGAGCTT
CACAATGTTGAACTGCTTGTTGGATCCACAAATTTAACTTGGTCTAAGGTGAGAAATTCT
GGCACAAAAGGCTACGATGATCCTTTTTCTGATGATTTCAATATGGATGAAGTGGACTTA
AGTATTGAAAATTATGAAGAGCTATTTGGTGTTTCTATTGATAATCGTGATCGACTGTTT
AAGAATGAAGACATTGATGACTTCTTTGGGACAAAGGACATGTCAACTGCTGAGTCTAGC
TTCCAGGGTGTCAATGCTGTCGAGGTGGTTCATACTTTATAG