Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400044793
CDS Infomation

pacid=37433263 polypeptide=PGSC0003DMP400030366 locus=PGSC0003DMG400017384 ID=PGSC0003DMT400044793.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAATTTGTACCTCTTATCCCCAATCAACCTGTCTGTAAGCGGTTTTGGCTTGTTACTA
CAAAAATGCTTGAAAGAGAAGTTGCTGCAACCGTGCAAGCAAATTCATGCATTAATGTTA
ACATCACACACTGACATGAATGCTTTGTCGTTGAATTCAAAGCTCATTGGTGCCTATGCA
AGTTGTGGGGATCTAGGTTCTGCTGAGCTTGTGTTCCAAAGAACAACAAACCTGAATATT
TTTGCGTTCAATTGGATGATTTCAGCTTTAGCATTCCATGGCTACCCTGAGAAATCCATT
GAATACTTCTCTCTTCTTCAACAATCAAGAACTATTCCAAACAAGTACACATTTGCTGTT
GTGTTAAAAGCGTGTGTTGGTCTAATGGATCTGAACAAAGGAAAGGAAGTGCAAAGTATG
ATATATAGAATGGGATTTGAGTCAGAGCTATCGGTTGCCAATGCCTTGATTGATATGTAT
GGTAAATGTGGCAATACGGAATATGCTCGTTTAGTTTTTAATGTAATGGTCGAGAGAGAT
ATTGTATCCTGGACATCAATGATATATTCATATGCTAACGTGGGGAAAATTGAAGAATCC
TTTATTTTGTTTGAAAAAATGAGGTTAGAAGGCATAAAGCCTAATGATTTTACATGGAAT
GTAATGATCGCTGGATATGCTAGGAGAGGAGACTGTGACACAGCTTTTATGTTACTCTCT
AAAATGAGTGAAGAGGGGTTGACTCCAGATTTGGTTACCTGGAATGCAATGGTTTCAGGG
TATGTTCAGAGCCACAGATCAACTGAAGCTCTAGCATTATTGCAGGATATGTTGGATGCT
GGAGTGAAGCCTAATGAAGTCACGCTCACTGGGCTTCTTCCCGTCTGTGGGTTGATTGAC
TCTGCGTATACAGGGAAAGAAATTCATGGCTTAGCATATAGATTAGAGCTTTTTGCTAAT
GTCTTTGTTGCTAGTGCTCTCATTGACATGTACAGTAGATGTGGGAGTGTAGAAGATGCT
TGGAATGTTTTCAGTTCTGTTCCTTTCAAGAATGTTGCATCATGGAATGCTATGATAGGT
TGTTATGGGAAGCATGGCAGAGTAGAAAATGCAATCAAACTTTTTGAGAAGATGCAGTAT
GAAGGAGTGCTGCCAAATGAAGTAACCTTAACTTCTCTTCTTTCTGCATGTAGTCATGGT
GGTTTAGTTGAGAAGGGTTTGAAGATCTTTTGGTCCATGGAGGAGTCTTATGGCATTAGA
GCAAGGAAAGAGCATTATGCTTGTGTTATTGATCTTTTGTGTCGTGTCGGGAGGCTGGAG
GAGGCTTACGATATAGTCAAAGATATGGCAATAGAAGTTACAGATTCAATTATTGGTGCT
TTCTTCAGTGGCTGTAAGGTCTATGCAAGGAGAGATCTTGCTGAAAAGATGGCTAAGGAT
ATATTGCAGATGGATCTGAAGAAGCCTGAAGGTCTTGTAGCCCTTTCAAACATTTATGCT
GCTGAGGGAGAGTGGGAGAATGTTGAGAATGTGAGGAACATGATGAAGCACAAGGGATTC
AATAAGATGCCTGGTTCCAGTTGGTTGTAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400030366
PEP Infomation

pacid=37433263 transcript=PGSC0003DMT400044793 locus=PGSC0003DMG400017384 ID=PGSC0003DMT400044793.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MNLYLLSPINLSVSGFGLLLQKCLKEKLLQPCKQIHALMLTSHTDMNALSLNSKLIGAYA
SCGDLGSAELVFQRTTNLNIFAFNWMISALAFHGYPEKSIEYFSLLQQSRTIPNKYTFAV
VLKACVGLMDLNKGKEVQSMIYRMGFESELSVANALIDMYGKCGNTEYARLVFNVMVERD
IVSWTSMIYSYANVGKIEESFILFEKMRLEGIKPNDFTWNVMIAGYARRGDCDTAFMLLS
KMSEEGLTPDLVTWNAMVSGYVQSHRSTEALALLQDMLDAGVKPNEVTLTGLLPVCGLID
SAYTGKEIHGLAYRLELFANVFVASALIDMYSRCGSVEDAWNVFSSVPFKNVASWNAMIG
CYGKHGRVENAIKLFEKMQYEGVLPNEVTLTSLLSACSHGGLVEKGLKIFWSMEESYGIR
ARKEHYACVIDLLCRVGRLEEAYDIVKDMAIEVTDSIIGAFFSGCKVYARRDLAEKMAKD
ILQMDLKKPEGLVALSNIYAAEGEWENVENVRNMMKHKGFNKMPGSSWL*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400044793
Transcript Infomation

pacid=37433263 locus=PGSC0003DMG400017384 ID=PGSC0003DMT400044793.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAATTTGTACCTCTTATCCCCAATCAACCTGTCTGTAAGCGGTTTTGGCTTGTTACTA
CAAAAATGCTTGAAAGAGAAGTTGCTGCAACCGTGCAAGCAAATTCATGCATTAATGTTA
ACATCACACACTGACATGAATGCTTTGTCGTTGAATTCAAAGCTCATTGGTGCCTATGCA
AGTTGTGGGGATCTAGGTTCTGCTGAGCTTGTGTTCCAAAGAACAACAAACCTGAATATT
TTTGCGTTCAATTGGATGATTTCAGCTTTAGCATTCCATGGCTACCCTGAGAAATCCATT
GAATACTTCTCTCTTCTTCAACAATCAAGAACTATTCCAAACAAGTACACATTTGCTGTT
GTGTTAAAAGCGTGTGTTGGTCTAATGGATCTGAACAAAGGAAAGGAAGTGCAAAGTATG
ATATATAGAATGGGATTTGAGTCAGAGCTATCGGTTGCCAATGCCTTGATTGATATGTAT
GGTAAATGTGGCAATACGGAATATGCTCGTTTAGTTTTTAATGTAATGGTCGAGAGAGAT
ATTGTATCCTGGACATCAATGATATATTCATATGCTAACGTGGGGAAAATTGAAGAATCC
TTTATTTTGTTTGAAAAAATGAGGTTAGAAGGCATAAAGCCTAATGATTTTACATGGAAT
GTAATGATCGCTGGATATGCTAGGAGAGGAGACTGTGACACAGCTTTTATGTTACTCTCT
AAAATGAGTGAAGAGGGGTTGACTCCAGATTTGGTTACCTGGAATGCAATGGTTTCAGGG
TATGTTCAGAGCCACAGATCAACTGAAGCTCTAGCATTATTGCAGGATATGTTGGATGCT
GGAGTGAAGCCTAATGAAGTCACGCTCACTGGGCTTCTTCCCGTCTGTGGGTTGATTGAC
TCTGCGTATACAGGGAAAGAAATTCATGGCTTAGCATATAGATTAGAGCTTTTTGCTAAT
GTCTTTGTTGCTAGTGCTCTCATTGACATGTACAGTAGATGTGGGAGTGTAGAAGATGCT
TGGAATGTTTTCAGTTCTGTTCCTTTCAAGAATGTTGCATCATGGAATGCTATGATAGGT
TGTTATGGGAAGCATGGCAGAGTAGAAAATGCAATCAAACTTTTTGAGAAGATGCAGTAT
GAAGGAGTGCTGCCAAATGAAGTAACCTTAACTTCTCTTCTTTCTGCATGTAGTCATGGT
GGTTTAGTTGAGAAGGGTTTGAAGATCTTTTGGTCCATGGAGGAGTCTTATGGCATTAGA
GCAAGGAAAGAGCATTATGCTTGTGTTATTGATCTTTTGTGTCGTGTCGGGAGGCTGGAG
GAGGCTTACGATATAGTCAAAGATATGGCAATAGAAGTTACAGATTCAATTATTGGTGCT
TTCTTCAGTGGCTGTAAGGTCTATGCAAGGAGAGATCTTGCTGAAAAGATGGCTAAGGAT
ATATTGCAGATGGATCTGAAGAAGCCTGAAGGTCTTGTAGCCCTTTCAAACATTTATGCT
GCTGAGGGAGAGTGGGAGAATGTTGAGAATGTGAGGAACATGATGAAGCACAAGGGATTC
AATAAGATGCCTGGTTCCAGTTGGTTGTAG