Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400044571
CDS Infomation

pacid=37432113 polypeptide=PGSC0003DMP400030233 locus=PGSC0003DMG400017301 ID=PGSC0003DMT400044571.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGTCACTTCCACTAAAAAATACAGTTTTTCCAATGATTTTACTAAAAGTAGCAGAATGG
TTTCTTTACAAACTCCTCGCAAATTCATGTTATAAAGCAGCAATGAAAGTTAAAAATTCT
CGAATTTTTTTCAAGAATTCATCTTTTAGATCATCTCATCAAATTCCTCTGTACCCAAAC
ATCTCGAAATGTAACAATATAAGAAAATCGGAAACAGTTATATGTGATATTCAATCTACA
TTACTTAGATCTGAATCATTTTTTCCGTATTTCATGTTAATTGCTTTCGAAGGTGGCAGT
ATATTAAGAGCTCTGTTTTTGCTTCTGTCAAGTCCTCTGTTATTCGTTCTTGATTTCGAA
GCTAAATTGAGAGTTATGGTGTTTATATCTTTTTGTGGGATGAAAATTAAGGATGTTGAA
TGTGTTGGTAGAGCTGTTTTACCTAAGTTTTATCTTGAAAATTTGAATGTTGGTGTTTAC
GAGGTGATGAAATCTGCAGGGGAAAGAATGGTGTTTACGAGTGTGCCTAGAGTTATGGTG
GAAAGTTTTTTGAAGGAATATTTGAGTGTTGATTGTGTTAAAGGGACTGAATTGCATTGT
TTTGGGAATTATTTTAGTGGATTTGTTTCATCTTCTGGGATTTTGATTAAGCATAGAGCA
TTGATGGAAGCTGTTGGTGAGAAAAAACCAGATATTGGTATTGGAAATTCAAGTCTTCAT
GATCATTTATTTATCTCCCTTTGCAAGGAAGCTTATGTGGTGAACAAAGAGGATGAAAAG
GCTAAGTCAATATTACCAAGGGAAAAATACCCAAAGCCATTAGTTTTTCATGATGGAAGG
CTAGCATTTCTACCTACACCTCTTGCAACATTAGCCATGTTTATGTGGCTACCAATTGGG
ATTCCACTATCCATTTTTAGAATCTTAATTGGCATATGTTTGCCATACAAAGTAGCTGTT
TTGTTGGGAAAATTAAGTGGTATAAGACTCAGAGTTAAAGGTACTGACCCTCCAAGATCT
GAAAATGACAAAGGAGTCCTATATGTTTGCACTCATAGAACACTTTTGGACCCTGTCTTT
CTTAGCACATCTTTGGGAAAGCCTTTAACAGCAGTGACTTATAGTTTAAGCAAAATGTCT
GAAATTCTTGCTCCTATTAAAACTGTGAGATTGACAAGATCAAGACAAAAAGATGGAGAA
GCCATGCAAAGATTGCTTAGTGAAGGTGACTTAGTGGTATGCCCAGAAGGGACAACATGT
AGAGAGCCATATCTATTAAGGTTCAGTTCACTATTTGCAGAATTAGCAGATGAGATTGTA
CCAGTGGCTATGAACACAAATGTTAGCATGTTTTATGGTACAACAGCTAGTGGGCTTAAA
TGTTTGGACCCAATTTTCTTCTTGATGAATCCAAGGCCTTGTTACAATGTTGAAATATTA
GGCAAATTACCAAAAGAATTGACTTGTGCTGGTGGAAAATCAAGTCATGAAGTGGCTAAT
TATATACAAAGACAATTAGGTGCTGCATTGGGATTTGAGTGCACTAATCTTACAAGAAGG
GACAAATATTTAATGCTTGCTGGTAATGAAGGGGTAGTTGAAGATCAAAATTCAAGAATA
AATACCCCTAATTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400030233
PEP Infomation

pacid=37432113 transcript=PGSC0003DMT400044571 locus=PGSC0003DMG400017301 ID=PGSC0003DMT400044571.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MSLPLKNTVFPMILLKVAEWFLYKLLANSCYKAAMKVKNSRIFFKNSSFRSSHQIPLYPN
ISKCNNIRKSETVICDIQSTLLRSESFFPYFMLIAFEGGSILRALFLLLSSPLLFVLDFE
AKLRVMVFISFCGMKIKDVECVGRAVLPKFYLENLNVGVYEVMKSAGERMVFTSVPRVMV
ESFLKEYLSVDCVKGTELHCFGNYFSGFVSSSGILIKHRALMEAVGEKKPDIGIGNSSLH
DHLFISLCKEAYVVNKEDEKAKSILPREKYPKPLVFHDGRLAFLPTPLATLAMFMWLPIG
IPLSIFRILIGICLPYKVAVLLGKLSGIRLRVKGTDPPRSENDKGVLYVCTHRTLLDPVF
LSTSLGKPLTAVTYSLSKMSEILAPIKTVRLTRSRQKDGEAMQRLLSEGDLVVCPEGTTC
REPYLLRFSSLFAELADEIVPVAMNTNVSMFYGTTASGLKCLDPIFFLMNPRPCYNVEIL
GKLPKELTCAGGKSSHEVANYIQRQLGAALGFECTNLTRRDKYLMLAGNEGVVEDQNSRI
NTPN*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400044571
Transcript Infomation

pacid=37432113 locus=PGSC0003DMG400017301 ID=PGSC0003DMT400044571.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGTCACTTCCACTAAAAAATACAGTTTTTCCAATGATTTTACTAAAAGTAGCAGAATGG
TTTCTTTACAAACTCCTCGCAAATTCATGTTATAAAGCAGCAATGAAAGTTAAAAATTCT
CGAATTTTTTTCAAGAATTCATCTTTTAGATCATCTCATCAAATTCCTCTGTACCCAAAC
ATCTCGAAATGTAACAATATAAGAAAATCGGAAACAGTTATATGTGATATTCAATCTACA
TTACTTAGATCTGAATCATTTTTTCCGTATTTCATGTTAATTGCTTTCGAAGGTGGCAGT
ATATTAAGAGCTCTGTTTTTGCTTCTGTCAAGTCCTCTGTTATTCGTTCTTGATTTCGAA
GCTAAATTGAGAGTTATGGTGTTTATATCTTTTTGTGGGATGAAAATTAAGGATGTTGAA
TGTGTTGGTAGAGCTGTTTTACCTAAGTTTTATCTTGAAAATTTGAATGTTGGTGTTTAC
GAGGTGATGAAATCTGCAGGGGAAAGAATGGTGTTTACGAGTGTGCCTAGAGTTATGGTG
GAAAGTTTTTTGAAGGAATATTTGAGTGTTGATTGTGTTAAAGGGACTGAATTGCATTGT
TTTGGGAATTATTTTAGTGGATTTGTTTCATCTTCTGGGATTTTGATTAAGCATAGAGCA
TTGATGGAAGCTGTTGGTGAGAAAAAACCAGATATTGGTATTGGAAATTCAAGTCTTCAT
GATCATTTATTTATCTCCCTTTGCAAGGAAGCTTATGTGGTGAACAAAGAGGATGAAAAG
GCTAAGTCAATATTACCAAGGGAAAAATACCCAAAGCCATTAGTTTTTCATGATGGAAGG
CTAGCATTTCTACCTACACCTCTTGCAACATTAGCCATGTTTATGTGGCTACCAATTGGG
ATTCCACTATCCATTTTTAGAATCTTAATTGGCATATGTTTGCCATACAAAGTAGCTGTT
TTGTTGGGAAAATTAAGTGGTATAAGACTCAGAGTTAAAGGTACTGACCCTCCAAGATCT
GAAAATGACAAAGGAGTCCTATATGTTTGCACTCATAGAACACTTTTGGACCCTGTCTTT
CTTAGCACATCTTTGGGAAAGCCTTTAACAGCAGTGACTTATAGTTTAAGCAAAATGTCT
GAAATTCTTGCTCCTATTAAAACTGTGAGATTGACAAGATCAAGACAAAAAGATGGAGAA
GCCATGCAAAGATTGCTTAGTGAAGGTGACTTAGTGGTATGCCCAGAAGGGACAACATGT
AGAGAGCCATATCTATTAAGGTTCAGTTCACTATTTGCAGAATTAGCAGATGAGATTGTA
CCAGTGGCTATGAACACAAATGTTAGCATGTTTTATGGTACAACAGCTAGTGGGCTTAAA
TGTTTGGACCCAATTTTCTTCTTGATGAATCCAAGGCCTTGTTACAATGTTGAAATATTA
GGCAAATTACCAAAAGAATTGACTTGTGCTGGTGGAAAATCAAGTCATGAAGTGGCTAAT
TATATACAAAGACAATTAGGTGCTGCATTGGGATTTGAGTGCACTAATCTTACAAGAAGG
GACAAATATTTAATGCTTGCTGGTAATGAAGGGGTAGTTGAAGATCAAAATTCAAGAATA
AATACCCCTAATTAA