Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID	PGSC0003DMT400043215
CDS Infomation	pacid=37453364 polypeptide=PGSC0003DMP400029311 locus=PGSC0003DMG402016772 ID=PGSC0003DMT400043215.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGAAGATAGAAGAGGTACAATCAACAATAAAGAATCAGAGAATTGCTACTCATACTCAC ATTAAAGGCCTTGGTCTTGAGCCCAATGGGAGACCACTACCATTGGCAGCTGGGTTTGTA GGTCAGGCAGCTGCCAGAGAAGCTGCGGGGCTTGTGGTGGATATGATACGCGAAAAGAAG ATGGCTGGTCGGGCTTTACTGCTAGCTGGTCCACCTGGTACGGGGAAGACAGCTCTTGCT CTTGGTATATCACAAGACCTTGGAAGCAAGGTTCCATTTTGTCCGATGGTTGGATCCGAA GTGTATTCATCAGAAGTGAAGAAAACTGAGGTCTTAATGGAAAACTTCCGGCGAGCTATT GGTCTCCGTATGAAGGAAAATAAGGAAGTTTATGAAGGAGAGGTGACTGAACTATCTCCA GAAGAGGGTGAGAGTGTGACAGGTGGATATGGTAAAAGCATTAGCCATGTTATAATTGGG TTAAAAACTGTCAAAGGTACCAAACAGTTGAAGCTTGACCCCACGATATATGATGCCTTA ATTAAAGAGAAGGTAGCTGTTGGTGATGTGATTTATATTGAATCGAACAGTGGAGCAGTC AAAAGAGTGGGCAGGAGTGATGCTTTTGCCACAGAATTTGATCTTGAGGCAGAAGAGTAT GTTCCACTTCCTAAAGGAGAGGTTCACAAGAAGAAGGAAATAGTCCAGGATGTTACATTG CATGATCTTGATGCTGCAAATGCACGGCCACAAGGAGGACAAGATATATTGTCCCTTATG GGTCAAATGATGAAACCTAGGAAAACCGAGATCACTGACAAGTTGCGGCAAGAGATAAAC AAGGTTGTCAACCGTTATGTTGATGAAGGTGTTGCAGAGCTTGTTCCTGGTGTCTTATTT ATCGATGAGGTTCATATGCTTGATATGGAATGCTTTTCATACTTGAATCGTGCCTTGGAG AGTTCACTGTCTCCAATTGTGATTTTTGCTACTAACAGAGGCATTTGTACTGTCAGAGGA ACAGATATGACTAGTCCACATGGCATTCCAGTTGACTTGTTGGATCGATTGGTGATTGTC AGAACTGAAACTTATGGTCCAGCTGAAATGATACAGATATTAGCTATACGTGCACAGGTG GAGGGACTAGAAATAGATGAAGAGAGCCTTGCGTGTTTAGGAGAGATTGGACAACAAGCT TCCTTAAGGCATGCTGTTCAGCTGCTATCCCCAGCTAGCATAGTTGCCAAAATGAATGGC CGCGACAAAATCTGCAAGGTGGATCTAGACGAAGTGAGTTCGTTGTACCTGGATGCAAAG TCTTCTGCAAGACTTCTTCAGGAGCAGCAAGATAGATACATCTCATGA

Peptide Sequence

PEP ID	PGSC0003DMP400029311
PEP Infomation	pacid=37453364 transcript=PGSC0003DMT400043215 locus=PGSC0003DMG402016772 ID=PGSC0003DMT400043215.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	MKIEEVQSTIKNQRIATHTHIKGLGLEPNGRPLPLAAGFVGQAAAREAAGLVVDMIREKK MAGRALLLAGPPGTGKTALALGISQDLGSKVPFCPMVGSEVYSSEVKKTEVLMENFRRAI GLRMKENKEVYEGEVTELSPEEGESVTGGYGKSISHVIIGLKTVKGTKQLKLDPTIYDAL IKEKVAVGDVIYIESNSGAVKRVGRSDAFATEFDLEAEEYVPLPKGEVHKKKEIVQDVTL HDLDAANARPQGGQDILSLMGQMMKPRKTEITDKLRQEINKVVNRYVDEGVAELVPGVLF IDEVHMLDMECFSYLNRALESSLSPIVIFATNRGICTVRGTDMTSPHGIPVDLLDRLVIV RTETYGPAEMIQILAIRAQVEGLEIDEESLACLGEIGQQASLRHAVQLLSPASIVAKMNG RDKICKVDLDEVSSLYLDAKSSARLLQEQQDRYIS*

Transcript Sequence

Transcript ID	PGSC0003DMT400043215
Transcript Infomation	pacid=37453364 locus=PGSC0003DMG402016772 ID=PGSC0003DMT400043215.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGAAGATAGAAGAGGTACAATCAACAATAAAGAATCAGAGAATTGCTACTCATACTCAC ATTAAAGGCCTTGGTCTTGAGCCCAATGGGAGACCACTACCATTGGCAGCTGGGTTTGTA GGTCAGGCAGCTGCCAGAGAAGCTGCGGGGCTTGTGGTGGATATGATACGCGAAAAGAAG ATGGCTGGTCGGGCTTTACTGCTAGCTGGTCCACCTGGTACGGGGAAGACAGCTCTTGCT CTTGGTATATCACAAGACCTTGGAAGCAAGGTTCCATTTTGTCCGATGGTTGGATCCGAA GTGTATTCATCAGAAGTGAAGAAAACTGAGGTCTTAATGGAAAACTTCCGGCGAGCTATT GGTCTCCGTATGAAGGAAAATAAGGAAGTTTATGAAGGAGAGGTGACTGAACTATCTCCA GAAGAGGGTGAGAGTGTGACAGGTGGATATGGTAAAAGCATTAGCCATGTTATAATTGGG TTAAAAACTGTCAAAGGTACCAAACAGTTGAAGCTTGACCCCACGATATATGATGCCTTA ATTAAAGAGAAGGTAGCTGTTGGTGATGTGATTTATATTGAATCGAACAGTGGAGCAGTC AAAAGAGTGGGCAGGAGTGATGCTTTTGCCACAGAATTTGATCTTGAGGCAGAAGAGTAT GTTCCACTTCCTAAAGGAGAGGTTCACAAGAAGAAGGAAATAGTCCAGGATGTTACATTG CATGATCTTGATGCTGCAAATGCACGGCCACAAGGAGGACAAGATATATTGTCCCTTATG GGTCAAATGATGAAACCTAGGAAAACCGAGATCACTGACAAGTTGCGGCAAGAGATAAAC AAGGTTGTCAACCGTTATGTTGATGAAGGTGTTGCAGAGCTTGTTCCTGGTGTCTTATTT ATCGATGAGGTTCATATGCTTGATATGGAATGCTTTTCATACTTGAATCGTGCCTTGGAG AGTTCACTGTCTCCAATTGTGATTTTTGCTACTAACAGAGGCATTTGTACTGTCAGAGGA ACAGATATGACTAGTCCACATGGCATTCCAGTTGACTTGTTGGATCGATTGGTGATTGTC AGAACTGAAACTTATGGTCCAGCTGAAATGATACAGATATTAGCTATACGTGCACAGGTG GAGGGACTAGAAATAGATGAAGAGAGCCTTGCGTGTTTAGGAGAGATTGGACAACAAGCT TCCTTAAGGCATGCTGTTCAGCTGCTATCCCCAGCTAGCATAGTTGCCAAAATGAATGGC CGCGACAAAATCTGCAAGGTGGATCTAGACGAAGTGAGTTCGTTGTACCTGGATGCAAAG TCTTCTGCAAGACTTCTTCAGGAGCAGCAAGATAGATACATCTCATGA