Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400042931
CDS Infomation

pacid=37451022 polypeptide=PGSC0003DMP400029116 locus=PGSC0003DMG400016645 ID=PGSC0003DMT400042931.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCGTTTCCTTTGCTTCAAATCCCGTCAATTTTCCGCTATCAATGCTGTGGTGTTAGTT
AATTCCAAAATCAAAGCATTTATCCAACAAGGAAACCATCTTCAAGCTCTGTTAGCTTAC
TCTAAAGAACCTCTTTTTCCTCTCCACACTTCAAAATTCACTTTTCCTCCTCTCCTAAAA
GCTTGCGCTTTTCTTCCAAATCTTCAAACTGGGAAAATAATCCATGGCACAATCATTCAA
ATGGGTCTTCACTATGATCCTTTCATCATCACTTCACTCATCAACATGTATGTAAAATGT
AGCTCACTTTGTAATGCAGTCCAAGTGTTTGATTTTATTTCTCAATGTGAAGATTTCGAT
CGAGATGTAACTATATGGAATGCTATGCTAGATGGGTATATCAGAAATGAGCTTACTGAG
GAGTGTATGGATTTGTTTAGAAGAATGCAAGAGATTGGTGTCAAGTCTGATGAGTACTCT
CTTAGTATTCTTCTGGGGTTGTTTAATGGTCGAATGGGGTTATCGAAAGCAAAAGAAGTT
CATGGTTATGTTATTAGAAACTCATTTGGGCATGATCCTTTTGTGGTTACTGCGTTGATT
GATATGTACTCAAATTGTGGTAGGCCAAAAGATGCTTGGTGCGTTTTTGAGAGTGTACAA
GACAAGGATAATATTGTCATGTGGAATGCATTGATTAGGGGCTTATCGGAGAATGGATTA
TGGAGAAACAGCATGAGACTCTATTCTTTAGCTAAGAATTGGGGCTGCAAACTTATGTCG
ACGACTTTTTCTTGTACTTTGAAGGCTTGTGCTGAGGGTGAAGATATAGATTTCGGCAGG
CAGATCCATTCGGATGTTGTCAAGATGGATTTTGAGAATGATCCTTATGTATGTACTTCG
GTGTTGTCTATGTACGCAAGGTTTGGACTGTTGGAAGATGCAGACAGGGCTTTTAATTCT
GTATTAAACAAAGAAGTTGAAGTGTGGAATTCTATGATCTCAGCTTATGTTGGCAAGGGC
AGAGGCGATGATGCTTTGTGTGTGTATAATGAGATGCGATCAAGAGGCATCCTTTCTGAT
TCTTTCACCTTGTCAAATATTCTTATATCATGTAGTATGACCGAATCTTATGATTTAGGC
AGTGCAATTCATGGTGAAATGATAAAGAAACCAATACAGAATAACATTGCGTTGCAAAGT
GCTCTAGTGACTATGTACTCAAAATGTGGAATGTTAAAGGATGCTCTTGACGTTTTCAGT
AGAATGGAGAAGAAGGATGTGGTCGCATGGGGTTCAATGATCTCAGGTCTCTGCCAAAAT
AAGAAATTCAATTTGGCACTGGAAATATATAAGGAAATGGAGACTCATAAGGTCAATCCA
GACGCTAATATAATGGCAATGGTGATAAATGCTAGTGCAGGACTAGAAAGCTTAGAATTG
GGTTGCAGTATCCATGCAATCACTGTTAAGAGCGGGGAGGAAGTAGATAGTTCAGTGAGC
TGTTCTCTTGTAGATATGTATTCTAATTGTGGCAAGCCAGAAATGGCTGAAAAGGTTTTT
TCGGGTGTTCCCCATAAGAATTTAGTGGCTTGGAATTCCCTGATCTCTTGTTATTCGAAA
AATGACTTACCAGAGCTTTCTTTAAATCTTCTTCCTCAACTTGTCCAACAAGGATTGTAT
CCAGACGCTGTTACAATAACTAGTGCCCTTGCTGCTGTTTCATCCTTAGCAACACTGATT
AAAGGAAAGGCAATTCATTGTTACCAAATAAGGCATCAAATTCTTGAAGACAACCAAGTG
GAAAATGCTCTTATTGATATGTACATAAAAAGCGGATGCCTAAAGTATGCAGAGTGTATA
TTCCAGTATATGTCCAAAAGGAACTTAGTAACATGGAATACAATGATTGCAGGGTATGGA
TCTCACAGTGAGTGTATGAAAGCTATCAACTTTTTCAATGACATGAGGAAATCCGGAGTG
ACGCCTGATGCTGTAACTTTCCTTTCCTTGATTTCCTCTTGCAACCATGCTGGTTTAATG
GATGAAGGCCTTAAACTGTTTCACTTAATGGCATTAGAGTATGGAATCAAACCACAAATG
GACCACTACATAAACGTGGTTGACCTTCTAGGCCGTGCTGGACGCTTGGAAGATGCTTAC
AATTTCATACAGAATTTGGAAGTGGAACCTGAGAGGGGGGTGTGGCTATGTCTTTTGTCA
GCCTGTCGGGTTCATCAAAACGTGAAGCTTGGAGAAATAGCAGCCAAGAACCTTCTGAAG
ATGGAACCAAACAGAGGCAGCAATTACGTTCAACTTTTAAATCTCTATGTGGAAGGTGGG
ATGAGGGAAGAAGCAGCAAGTTTGAGGACTCTGATGAGGCAGAAAGGGTTGAAGAAGAAC
CCTGGATGTAGCTGGATTGAGGTGAAAAATGAACTTGAGGTTTTCTACTCCTGTGATTCA
TCCTCCACCAAGACAATTGAGATCTATGAGACACTACAAAGTCTCAGAAGTATTATGAAA
AAGAGAGGAGATTATGAGACTGAGGCAATATGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400029116
PEP Infomation

pacid=37451022 transcript=PGSC0003DMT400042931 locus=PGSC0003DMG400016645 ID=PGSC0003DMT400042931.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MRFLCFKSRQFSAINAVVLVNSKIKAFIQQGNHLQALLAYSKEPLFPLHTSKFTFPPLLK
ACAFLPNLQTGKIIHGTIIQMGLHYDPFIITSLINMYVKCSSLCNAVQVFDFISQCEDFD
RDVTIWNAMLDGYIRNELTEECMDLFRRMQEIGVKSDEYSLSILLGLFNGRMGLSKAKEV
HGYVIRNSFGHDPFVVTALIDMYSNCGRPKDAWCVFESVQDKDNIVMWNALIRGLSENGL
WRNSMRLYSLAKNWGCKLMSTTFSCTLKACAEGEDIDFGRQIHSDVVKMDFENDPYVCTS
VLSMYARFGLLEDADRAFNSVLNKEVEVWNSMISAYVGKGRGDDALCVYNEMRSRGILSD
SFTLSNILISCSMTESYDLGSAIHGEMIKKPIQNNIALQSALVTMYSKCGMLKDALDVFS
RMEKKDVVAWGSMISGLCQNKKFNLALEIYKEMETHKVNPDANIMAMVINASAGLESLEL
GCSIHAITVKSGEEVDSSVSCSLVDMYSNCGKPEMAEKVFSGVPHKNLVAWNSLISCYSK
NDLPELSLNLLPQLVQQGLYPDAVTITSALAAVSSLATLIKGKAIHCYQIRHQILEDNQV
ENALIDMYIKSGCLKYAECIFQYMSKRNLVTWNTMIAGYGSHSECMKAINFFNDMRKSGV
TPDAVTFLSLISSCNHAGLMDEGLKLFHLMALEYGIKPQMDHYINVVDLLGRAGRLEDAY
NFIQNLEVEPERGVWLCLLSACRVHQNVKLGEIAAKNLLKMEPNRGSNYVQLLNLYVEGG
MREEAASLRTLMRQKGLKKNPGCSWIEVKNELEVFYSCDSSSTKTIEIYETLQSLRSIMK
KRGDYETEAI*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400042931
Transcript Infomation

pacid=37451022 locus=PGSC0003DMG400016645 ID=PGSC0003DMT400042931.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCGTTTCCTTTGCTTCAAATCCCGTCAATTTTCCGCTATCAATGCTGTGGTGTTAGTT
AATTCCAAAATCAAAGCATTTATCCAACAAGGAAACCATCTTCAAGCTCTGTTAGCTTAC
TCTAAAGAACCTCTTTTTCCTCTCCACACTTCAAAATTCACTTTTCCTCCTCTCCTAAAA
GCTTGCGCTTTTCTTCCAAATCTTCAAACTGGGAAAATAATCCATGGCACAATCATTCAA
ATGGGTCTTCACTATGATCCTTTCATCATCACTTCACTCATCAACATGTATGTAAAATGT
AGCTCACTTTGTAATGCAGTCCAAGTGTTTGATTTTATTTCTCAATGTGAAGATTTCGAT
CGAGATGTAACTATATGGAATGCTATGCTAGATGGGTATATCAGAAATGAGCTTACTGAG
GAGTGTATGGATTTGTTTAGAAGAATGCAAGAGATTGGTGTCAAGTCTGATGAGTACTCT
CTTAGTATTCTTCTGGGGTTGTTTAATGGTCGAATGGGGTTATCGAAAGCAAAAGAAGTT
CATGGTTATGTTATTAGAAACTCATTTGGGCATGATCCTTTTGTGGTTACTGCGTTGATT
GATATGTACTCAAATTGTGGTAGGCCAAAAGATGCTTGGTGCGTTTTTGAGAGTGTACAA
GACAAGGATAATATTGTCATGTGGAATGCATTGATTAGGGGCTTATCGGAGAATGGATTA
TGGAGAAACAGCATGAGACTCTATTCTTTAGCTAAGAATTGGGGCTGCAAACTTATGTCG
ACGACTTTTTCTTGTACTTTGAAGGCTTGTGCTGAGGGTGAAGATATAGATTTCGGCAGG
CAGATCCATTCGGATGTTGTCAAGATGGATTTTGAGAATGATCCTTATGTATGTACTTCG
GTGTTGTCTATGTACGCAAGGTTTGGACTGTTGGAAGATGCAGACAGGGCTTTTAATTCT
GTATTAAACAAAGAAGTTGAAGTGTGGAATTCTATGATCTCAGCTTATGTTGGCAAGGGC
AGAGGCGATGATGCTTTGTGTGTGTATAATGAGATGCGATCAAGAGGCATCCTTTCTGAT
TCTTTCACCTTGTCAAATATTCTTATATCATGTAGTATGACCGAATCTTATGATTTAGGC
AGTGCAATTCATGGTGAAATGATAAAGAAACCAATACAGAATAACATTGCGTTGCAAAGT
GCTCTAGTGACTATGTACTCAAAATGTGGAATGTTAAAGGATGCTCTTGACGTTTTCAGT
AGAATGGAGAAGAAGGATGTGGTCGCATGGGGTTCAATGATCTCAGGTCTCTGCCAAAAT
AAGAAATTCAATTTGGCACTGGAAATATATAAGGAAATGGAGACTCATAAGGTCAATCCA
GACGCTAATATAATGGCAATGGTGATAAATGCTAGTGCAGGACTAGAAAGCTTAGAATTG
GGTTGCAGTATCCATGCAATCACTGTTAAGAGCGGGGAGGAAGTAGATAGTTCAGTGAGC
TGTTCTCTTGTAGATATGTATTCTAATTGTGGCAAGCCAGAAATGGCTGAAAAGGTTTTT
TCGGGTGTTCCCCATAAGAATTTAGTGGCTTGGAATTCCCTGATCTCTTGTTATTCGAAA
AATGACTTACCAGAGCTTTCTTTAAATCTTCTTCCTCAACTTGTCCAACAAGGATTGTAT
CCAGACGCTGTTACAATAACTAGTGCCCTTGCTGCTGTTTCATCCTTAGCAACACTGATT
AAAGGAAAGGCAATTCATTGTTACCAAATAAGGCATCAAATTCTTGAAGACAACCAAGTG
GAAAATGCTCTTATTGATATGTACATAAAAAGCGGATGCCTAAAGTATGCAGAGTGTATA
TTCCAGTATATGTCCAAAAGGAACTTAGTAACATGGAATACAATGATTGCAGGGTATGGA
TCTCACAGTGAGTGTATGAAAGCTATCAACTTTTTCAATGACATGAGGAAATCCGGAGTG
ACGCCTGATGCTGTAACTTTCCTTTCCTTGATTTCCTCTTGCAACCATGCTGGTTTAATG
GATGAAGGCCTTAAACTGTTTCACTTAATGGCATTAGAGTATGGAATCAAACCACAAATG
GACCACTACATAAACGTGGTTGACCTTCTAGGCCGTGCTGGACGCTTGGAAGATGCTTAC
AATTTCATACAGAATTTGGAAGTGGAACCTGAGAGGGGGGTGTGGCTATGTCTTTTGTCA
GCCTGTCGGGTTCATCAAAACGTGAAGCTTGGAGAAATAGCAGCCAAGAACCTTCTGAAG
ATGGAACCAAACAGAGGCAGCAATTACGTTCAACTTTTAAATCTCTATGTGGAAGGTGGG
ATGAGGGAAGAAGCAGCAAGTTTGAGGACTCTGATGAGGCAGAAAGGGTTGAAGAAGAAC
CCTGGATGTAGCTGGATTGAGGTGAAAAATGAACTTGAGGTTTTCTACTCCTGTGATTCA
TCCTCCACCAAGACAATTGAGATCTATGAGACACTACAAAGTCTCAGAAGTATTATGAAA
AAGAGAGGAGATTATGAGACTGAGGCAATATGA