Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400042442
CDS Infomation

pacid=37425151 polypeptide=PGSC0003DMP400028792 locus=PGSC0003DMG400016458 ID=PGSC0003DMT400042442.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGGAAAAGTCCTGGAGTCTGAAGCTGAGCAGCCTTTGTTGGCTGCTCATGGGGCGAGC
TCTGAGCTCGAGGAGGTGCTCTCCGATTTCCAATTACCTTACTTTCAACGCCTTAGGTCC
GCCTTTTGGATCGAATTCCAGTTACTTTTTCGACTTGCAGCACCTGCAATAGCTGTGTAC
ATGATCAATAATGCTATGTCCATGTCTACTCGAATCTTTTCGGGTCAACTTGGGAACCTT
CAGCTTGCTGCAGCCTCTCTTGGCAATCAAGGCATCCAATTATGTGCTTATGGACTTATG
CTAGGAATGGGAAGTGCAGTGGAAACTCTTTGTGGACAAGCATATGGAGCTAATAGATAT
GACATGTTAGGAGTTTACCTACAAAGATCAACAATAGTACTTTCCATAACAGGCATCCCA
CTAGCTGTGGTATATTTATTTTCCAAGAACATACTGCTCGCGCTTGGTGAATCGAAACAA
GTTGCATCAGAAGCAGCAGTATTTGTGTATGGTCTAATCCCTCAAATATTCGCTTACGCG
GTGAACTTCCCTATACAGAAGTTCTTGCAATCTCAGAGTATTGTAGCCCCTAGTGCCTAT
ATTTCACTAGGGACTTTGTTTGTGCACTTATTGCTGAGTTGGATTGTTGTATACAAAATT
GGACTGGGATTGATAGGGGCATCACTGGTGCTGAGTCTTTCTTGGTGGATTATTGTGGCA
GCTCAGTTTATATACATATTGAGAAGTGAAAGTTGTAAGACTACTTGGACAGGTTTTCGA
TGGGAGGCCTTTAGTGGATTATGGGAATTCGTGAAGTTATCGGCTGCTTCAGCTGTTATG
TTGTGTTTGGAAACATGGTATTTTCAAATTCTAGTGTTGCTTTCAGGTTTACTCAAGAAT
CCTGAGCTTGCATTGGATTCTATCTCAGTTTGCATGGCAGTGAATGGGCTGATGTTCATG
GTTTCAGTGGGATTCAATGCTGCTGCTAGTGTGAGAGTGAGCAATGAGCTAGGAGCAGCA
CATCCAAAGTCAGCAGCATTCTCAGTGTTTGTGGTGACATTAATTTCATTTCTCATAGCT
GTGGTGGAAGCTATAATTGTGCTATGTTTGCGCAATGTTATCAGCTATGCATTCACTGAG
GGTGAAATTGTGGCCAATGCAGTTTCTGATTTGTGCCCTTTTTTAGCTGTCACACTTATT
CTTAATGGCGTTCAACCAGTCTTGTCTGGTGTTGCTGTTGGTTGTGGATGGCAGGCATTT
GTTGCATACGTGAATGTAGGGTGTTATTATGGTGTAGGAATTCCATTGGGATGTCTTCTT
GGCTTCAAATATGACCTTGGTGCTAAGGGAATATGGACTGGGATGATTGGAGGGACTGTC
ATGCAAACCTTCATTCTGATTTGGTTCACATTCCGTGCAGATTGGAACAAAGAGGTAGAG
AAAGCTAAAAAACATTTGGACAAATGGGAAAATGTAAAAGAAACTCTAAGCAAGGAATGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400028792
PEP Infomation

pacid=37425151 transcript=PGSC0003DMT400042442 locus=PGSC0003DMG400016458 ID=PGSC0003DMT400042442.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MGKVLESEAEQPLLAAHGASSELEEVLSDFQLPYFQRLRSAFWIEFQLLFRLAAPAIAVY
MINNAMSMSTRIFSGQLGNLQLAAASLGNQGIQLCAYGLMLGMGSAVETLCGQAYGANRY
DMLGVYLQRSTIVLSITGIPLAVVYLFSKNILLALGESKQVASEAAVFVYGLIPQIFAYA
VNFPIQKFLQSQSIVAPSAYISLGTLFVHLLLSWIVVYKIGLGLIGASLVLSLSWWIIVA
AQFIYILRSESCKTTWTGFRWEAFSGLWEFVKLSAASAVMLCLETWYFQILVLLSGLLKN
PELALDSISVCMAVNGLMFMVSVGFNAAASVRVSNELGAAHPKSAAFSVFVVTLISFLIA
VVEAIIVLCLRNVISYAFTEGEIVANAVSDLCPFLAVTLILNGVQPVLSGVAVGCGWQAF
VAYVNVGCYYGVGIPLGCLLGFKYDLGAKGIWTGMIGGTVMQTFILIWFTFRADWNKEVE
KAKKHLDKWENVKETLSKE*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400042442
Transcript Infomation

pacid=37425151 locus=PGSC0003DMG400016458 ID=PGSC0003DMT400042442.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGGAAAAGTCCTGGAGTCTGAAGCTGAGCAGCCTTTGTTGGCTGCTCATGGGGCGAGC
TCTGAGCTCGAGGAGGTGCTCTCCGATTTCCAATTACCTTACTTTCAACGCCTTAGGTCC
GCCTTTTGGATCGAATTCCAGTTACTTTTTCGACTTGCAGCACCTGCAATAGCTGTGTAC
ATGATCAATAATGCTATGTCCATGTCTACTCGAATCTTTTCGGGTCAACTTGGGAACCTT
CAGCTTGCTGCAGCCTCTCTTGGCAATCAAGGCATCCAATTATGTGCTTATGGACTTATG
CTAGGAATGGGAAGTGCAGTGGAAACTCTTTGTGGACAAGCATATGGAGCTAATAGATAT
GACATGTTAGGAGTTTACCTACAAAGATCAACAATAGTACTTTCCATAACAGGCATCCCA
CTAGCTGTGGTATATTTATTTTCCAAGAACATACTGCTCGCGCTTGGTGAATCGAAACAA
GTTGCATCAGAAGCAGCAGTATTTGTGTATGGTCTAATCCCTCAAATATTCGCTTACGCG
GTGAACTTCCCTATACAGAAGTTCTTGCAATCTCAGAGTATTGTAGCCCCTAGTGCCTAT
ATTTCACTAGGGACTTTGTTTGTGCACTTATTGCTGAGTTGGATTGTTGTATACAAAATT
GGACTGGGATTGATAGGGGCATCACTGGTGCTGAGTCTTTCTTGGTGGATTATTGTGGCA
GCTCAGTTTATATACATATTGAGAAGTGAAAGTTGTAAGACTACTTGGACAGGTTTTCGA
TGGGAGGCCTTTAGTGGATTATGGGAATTCGTGAAGTTATCGGCTGCTTCAGCTGTTATG
TTGTGTTTGGAAACATGGTATTTTCAAATTCTAGTGTTGCTTTCAGGTTTACTCAAGAAT
CCTGAGCTTGCATTGGATTCTATCTCAGTTTGCATGGCAGTGAATGGGCTGATGTTCATG
GTTTCAGTGGGATTCAATGCTGCTGCTAGTGTGAGAGTGAGCAATGAGCTAGGAGCAGCA
CATCCAAAGTCAGCAGCATTCTCAGTGTTTGTGGTGACATTAATTTCATTTCTCATAGCT
GTGGTGGAAGCTATAATTGTGCTATGTTTGCGCAATGTTATCAGCTATGCATTCACTGAG
GGTGAAATTGTGGCCAATGCAGTTTCTGATTTGTGCCCTTTTTTAGCTGTCACACTTATT
CTTAATGGCGTTCAACCAGTCTTGTCTGGTGTTGCTGTTGGTTGTGGATGGCAGGCATTT
GTTGCATACGTGAATGTAGGGTGTTATTATGGTGTAGGAATTCCATTGGGATGTCTTCTT
GGCTTCAAATATGACCTTGGTGCTAAGGGAATATGGACTGGGATGATTGGAGGGACTGTC
ATGCAAACCTTCATTCTGATTTGGTTCACATTCCGTGCAGATTGGAACAAAGAGGTAGAG
AAAGCTAAAAAACATTTGGACAAATGGGAAAATGTAAAAGAAACTCTAAGCAAGGAATGA