Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID	PGSC0003DMT400042395
CDS Infomation	pacid=37426076 polypeptide=PGSC0003DMP400028759 locus=PGSC0003DMG400016439 ID=PGSC0003DMT400042395.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGCTTCTTTAGCACTTGTACTTACTCTTCTTTTATTGGGTATCTCAACTTTACAAGCC GAGTACTATGCACCAAGTAAAAACTATGCACCTTCTACTACTAAAAAAACTATGAACGTG ATCGATTCATGTTGGCGTGCCAAGTCAAACTGGGACAAGAATCGCTATGCATTAGCCGAT TGTGCTGTCGGCTACGGCAAAGCAGCTATCGGTGGGAAAAACGGTGCGATATACGTCGTT ACTAATCCGTCCGACGACCCGGTTAACCCTAAACCGGGTACACTAAGATATGGTGCAATC CAATCTAAACCACTATGGATTATTTTCAACAAGGATATGGTTATAACGTTAAAGAATGAA CTTATGATCAATAGTTACAAGACTATTGATGGAAGGGGTGCAGAAGTTGAAATTGCATAT GGACCTTGTATAACAATCCAACATGTTAGTCATGTGATTATACATGGGATAAGTATACAT GATTGTAAGCCGGGGAAAAAAGGTATCGTCCGGGATAGTCCGGTGCATGCCGGCCATCGT AACGGCGCCGACGGAGACGGCATTGATATATTTCAATCGACCCATGTTTGGATCGACCAT TGTTATCTTGCACGTTGCACCGATGGACTTATTGACGTTATCCATGCTTCTACTGGTGTT ACCATTTCAAATAACTACTTCACTCAGCATGATAAAGTTATGTTATTTGGGCACAATGAT AACAATATAGAAGATAAGGTTATGAAAGTCACAGTAGCCTTCAACTACTTTGGCCCTGGT TTAATTGAAAGAATGCCAAGAGTGAGGCTAGGTTATGCTCATGTGGCCAACAATCGTTAC GAAAAATGGTTGATGTATGCTATTGGTGGAAGCGCTAATCCAACCATCTTTAGTGAAGGA AATTATTTCTTGGCATCTAAATCCACACAAGTTACAAAAAGGGAATCTAAGAATGGATGG CAAAATTGGAAGTGGAGGTCTTCAAAAGATAAATTCTTGAATGGAGCCTATTTTATACCA TCTGGTTATGGGACTACTAATCCATATTACTCAAAGGCTCAATCATTTCCTGTGGCTGAT GGATCTATGGTTCCTTCTTTAACTGCTGATGCTGGACCTTTGCGTTGTACTTCTTATAAA TGTTGA

Peptide Sequence

PEP ID	PGSC0003DMP400028759
PEP Infomation	pacid=37426076 transcript=PGSC0003DMT400042395 locus=PGSC0003DMG400016439 ID=PGSC0003DMT400042395.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	MASLALVLTLLLLGISTLQAEYYAPSKNYAPSTTKKTMNVIDSCWRAKSNWDKNRYALAD CAVGYGKAAIGGKNGAIYVVTNPSDDPVNPKPGTLRYGAIQSKPLWIIFNKDMVITLKNE LMINSYKTIDGRGAEVEIAYGPCITIQHVSHVIIHGISIHDCKPGKKGIVRDSPVHAGHR NGADGDGIDIFQSTHVWIDHCYLARCTDGLIDVIHASTGVTISNNYFTQHDKVMLFGHND NNIEDKVMKVTVAFNYFGPGLIERMPRVRLGYAHVANNRYEKWLMYAIGGSANPTIFSEG NYFLASKSTQVTKRESKNGWQNWKWRSSKDKFLNGAYFIPSGYGTTNPYYSKAQSFPVAD GSMVPSLTADAGPLRCTSYKC*

Transcript Sequence

Transcript ID	PGSC0003DMT400042395
Transcript Infomation	pacid=37426076 locus=PGSC0003DMG400016439 ID=PGSC0003DMT400042395.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGCTTCTTTAGCACTTGTACTTACTCTTCTTTTATTGGGTATCTCAACTTTACAAGCC GAGTACTATGCACCAAGTAAAAACTATGCACCTTCTACTACTAAAAAAACTATGAACGTG ATCGATTCATGTTGGCGTGCCAAGTCAAACTGGGACAAGAATCGCTATGCATTAGCCGAT TGTGCTGTCGGCTACGGCAAAGCAGCTATCGGTGGGAAAAACGGTGCGATATACGTCGTT ACTAATCCGTCCGACGACCCGGTTAACCCTAAACCGGGTACACTAAGATATGGTGCAATC CAATCTAAACCACTATGGATTATTTTCAACAAGGATATGGTTATAACGTTAAAGAATGAA CTTATGATCAATAGTTACAAGACTATTGATGGAAGGGGTGCAGAAGTTGAAATTGCATAT GGACCTTGTATAACAATCCAACATGTTAGTCATGTGATTATACATGGGATAAGTATACAT GATTGTAAGCCGGGGAAAAAAGGTATCGTCCGGGATAGTCCGGTGCATGCCGGCCATCGT AACGGCGCCGACGGAGACGGCATTGATATATTTCAATCGACCCATGTTTGGATCGACCAT TGTTATCTTGCACGTTGCACCGATGGACTTATTGACGTTATCCATGCTTCTACTGGTGTT ACCATTTCAAATAACTACTTCACTCAGCATGATAAAGTTATGTTATTTGGGCACAATGAT AACAATATAGAAGATAAGGTTATGAAAGTCACAGTAGCCTTCAACTACTTTGGCCCTGGT TTAATTGAAAGAATGCCAAGAGTGAGGCTAGGTTATGCTCATGTGGCCAACAATCGTTAC GAAAAATGGTTGATGTATGCTATTGGTGGAAGCGCTAATCCAACCATCTTTAGTGAAGGA AATTATTTCTTGGCATCTAAATCCACACAAGTTACAAAAAGGGAATCTAAGAATGGATGG CAAAATTGGAAGTGGAGGTCTTCAAAAGATAAATTCTTGAATGGAGCCTATTTTATACCA TCTGGTTATGGGACTACTAATCCATATTACTCAAAGGCTCAATCATTTCCTGTGGCTGAT GGATCTATGGTTCCTTCTTTAACTGCTGATGCTGGACCTTTGCGTTGTACTTCTTATAAA TGTTGA