Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400041975
CDS Infomation

pacid=37453793 polypeptide=PGSC0003DMP400028444 locus=PGSC0003DMG400016279 ID=PGSC0003DMT400041975.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAATCAAGCTGTTTCCCATCTTCTCCAAACTTGCAAAACTCTACACAGGTTAAAATCC
GTCCACGCCCATTTATTAGTATGTGGATCCATTGCCTCATCAGACCTTGTTCTGAACAAA
ATTATTCGCCTTTATTCTCGTTTCGGTGCCACAAACTATGCTCGCAAGGTGTTTGATGAA
ATTCCTGAACGAAACCCTTTTCTTTGGACTTCAATAATTCATGGGTATGTTGAAAATTCT
CAGCATACTGAAGCTTTTTCTCTCTTCCGTGATATGCGTATTGGCGATGTTACGCCTTTG
AATTTTACTATATCATCTATACTTAAGGCATTAGGACGGCTGAAATGGCCGAGAGATGGT
GAGGGGATGTTAGGGCTAATATGGAAATGTGGGTTTGGTTTTGATTTACTTGTGCAAAAT
TCTGTGATTGACTGTTTCATGAGATGTGGGGAAGTTGATTGTGCCAGACGAGTATTTGAT
GGGATGGAGGAAAAGGATGTTGTTTCTTGGAATTCAATGGTATCGGGGTATGTGACTAAT
GATAGACTCGAAATTGCACGAGAGTTGTTTGATAGCATGGATGAGAAAAATGTAGTTTCT
TGGACTAGTGTGATATGTGGCTATGTTAGGAAGGGAGATATGGAGGAGGCTAGGAACCTT
TTCAACAATATGCCTACTAAGGATATGGCTGCTTGGAATGTGATGATTTCAGGGTATACA
GATGTTGGTGATATGCAGACAGCGAATTCTCTGTTTCAGGCAATGCCTGTTCGTGACACT
GGAACATGGAATTTGATGTTATCAGGGTATTGTAAGGTGGCCGAGTTAGAAAGAGCAAGG
GACTACTTTGAACGAATTCCCTGTAGGAATGTGGTGTCATGGACTATGATGATAGATGGT
TATGTTAAGTCTGGGAAATTGCATGAAGCAAGGTGTTTATTTGATGAAATGCCTCAGAAA
AATCTTATTACATGGTCAACCATGATTAGTGGTTATGCTAAGAATGGGAAACCTTCTGCT
GCTTTGGAATTGTTCAAAAACTTCAAAAAGCAAAGTCTTGAACTGGATGAGACTTTTATT
TTGAGTATCATCTCAGCTTGCTCTCAATTAGGGATTGTAGATGCAGTTGAGTCAGTCATG
AGTGTTGATGTAGGATCCAGATATTTTTCTGATACACGTGTTGTTAACAGTTTGGTAGAC
CTCTATGCAAAATGTGGAAATATTGAGAAAGCCTCGCAAGTATTTGAAATGGCAGATAAA
AAAGATTTCTATTGTTATAGTACTATGATTGCTGCGTTTGCTAATCATGGCTTGGTTGAA
AAAGCATTATATTTATTTGAGGATATGCAAAGAGAGAATATAGAGCCCGATGAAGTAACT
TTCCTCGCAGTTTTGAGTGCTTGCAACCATGGAGGACTTATTGATAAAGGGAGGAGGTAC
TTTAAACACATGACTGAAGAATTCAGAATTCAGCCCACAGAAAAACATTATGCATGCATG
GTAGATATCCTTGGTCGTGGTGGGTTCTTTGAAGAGGCCCATGAGATGATATTGAGTATG
CATGTGGCTCCCACTTCAGCCGTTTGGGGTGCAATGCTTGCAGCTTGCAATGTTCACTGC
AATGTCCAGATGGCTGAAGTTGCAGCATCTGAGTTATTCAAGATTGAGCCTGAGAATTCT
GGAAATTACATTCTCCTGTCCAATATTTATGCTGCTGCAGGAAGATGGCATGATGTAGCT
AGAGTAAGGGCACTGATCAGAGAGCATCATGTGAAAAAAAATCGGGGATCTAGCTGGATT
GAGTTGGATTCTGCAGTGCACGAGTTTGTAATGGGAGATGTGTCACATGTGGATGTAGAC
AGGATATGCTTCATATTGAGTCTACTAAATGAAGATATGAAGCTTTCAGGATATACCAAA
GATAAGGATCTGCATCGAATTTCGACGTGGTACCCCTCTTATCTATCTCTTTCAAGTGAT
TCTGAAATGGACGAGGAACTGTTTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400028444
PEP Infomation

pacid=37453793 transcript=PGSC0003DMT400041975 locus=PGSC0003DMG400016279 ID=PGSC0003DMT400041975.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MNQAVSHLLQTCKTLHRLKSVHAHLLVCGSIASSDLVLNKIIRLYSRFGATNYARKVFDE
IPERNPFLWTSIIHGYVENSQHTEAFSLFRDMRIGDVTPLNFTISSILKALGRLKWPRDG
EGMLGLIWKCGFGFDLLVQNSVIDCFMRCGEVDCARRVFDGMEEKDVVSWNSMVSGYVTN
DRLEIARELFDSMDEKNVVSWTSVICGYVRKGDMEEARNLFNNMPTKDMAAWNVMISGYT
DVGDMQTANSLFQAMPVRDTGTWNLMLSGYCKVAELERARDYFERIPCRNVVSWTMMIDG
YVKSGKLHEARCLFDEMPQKNLITWSTMISGYAKNGKPSAALELFKNFKKQSLELDETFI
LSIISACSQLGIVDAVESVMSVDVGSRYFSDTRVVNSLVDLYAKCGNIEKASQVFEMADK
KDFYCYSTMIAAFANHGLVEKALYLFEDMQRENIEPDEVTFLAVLSACNHGGLIDKGRRY
FKHMTEEFRIQPTEKHYACMVDILGRGGFFEEAHEMILSMHVAPTSAVWGAMLAACNVHC
NVQMAEVAASELFKIEPENSGNYILLSNIYAAAGRWHDVARVRALIREHHVKKNRGSSWI
ELDSAVHEFVMGDVSHVDVDRICFILSLLNEDMKLSGYTKDKDLHRISTWYPSYLSLSSD
SEMDEELF*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400041975
Transcript Infomation

pacid=37453793 locus=PGSC0003DMG400016279 ID=PGSC0003DMT400041975.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAATCAAGCTGTTTCCCATCTTCTCCAAACTTGCAAAACTCTACACAGGTTAAAATCC
GTCCACGCCCATTTATTAGTATGTGGATCCATTGCCTCATCAGACCTTGTTCTGAACAAA
ATTATTCGCCTTTATTCTCGTTTCGGTGCCACAAACTATGCTCGCAAGGTGTTTGATGAA
ATTCCTGAACGAAACCCTTTTCTTTGGACTTCAATAATTCATGGGTATGTTGAAAATTCT
CAGCATACTGAAGCTTTTTCTCTCTTCCGTGATATGCGTATTGGCGATGTTACGCCTTTG
AATTTTACTATATCATCTATACTTAAGGCATTAGGACGGCTGAAATGGCCGAGAGATGGT
GAGGGGATGTTAGGGCTAATATGGAAATGTGGGTTTGGTTTTGATTTACTTGTGCAAAAT
TCTGTGATTGACTGTTTCATGAGATGTGGGGAAGTTGATTGTGCCAGACGAGTATTTGAT
GGGATGGAGGAAAAGGATGTTGTTTCTTGGAATTCAATGGTATCGGGGTATGTGACTAAT
GATAGACTCGAAATTGCACGAGAGTTGTTTGATAGCATGGATGAGAAAAATGTAGTTTCT
TGGACTAGTGTGATATGTGGCTATGTTAGGAAGGGAGATATGGAGGAGGCTAGGAACCTT
TTCAACAATATGCCTACTAAGGATATGGCTGCTTGGAATGTGATGATTTCAGGGTATACA
GATGTTGGTGATATGCAGACAGCGAATTCTCTGTTTCAGGCAATGCCTGTTCGTGACACT
GGAACATGGAATTTGATGTTATCAGGGTATTGTAAGGTGGCCGAGTTAGAAAGAGCAAGG
GACTACTTTGAACGAATTCCCTGTAGGAATGTGGTGTCATGGACTATGATGATAGATGGT
TATGTTAAGTCTGGGAAATTGCATGAAGCAAGGTGTTTATTTGATGAAATGCCTCAGAAA
AATCTTATTACATGGTCAACCATGATTAGTGGTTATGCTAAGAATGGGAAACCTTCTGCT
GCTTTGGAATTGTTCAAAAACTTCAAAAAGCAAAGTCTTGAACTGGATGAGACTTTTATT
TTGAGTATCATCTCAGCTTGCTCTCAATTAGGGATTGTAGATGCAGTTGAGTCAGTCATG
AGTGTTGATGTAGGATCCAGATATTTTTCTGATACACGTGTTGTTAACAGTTTGGTAGAC
CTCTATGCAAAATGTGGAAATATTGAGAAAGCCTCGCAAGTATTTGAAATGGCAGATAAA
AAAGATTTCTATTGTTATAGTACTATGATTGCTGCGTTTGCTAATCATGGCTTGGTTGAA
AAAGCATTATATTTATTTGAGGATATGCAAAGAGAGAATATAGAGCCCGATGAAGTAACT
TTCCTCGCAGTTTTGAGTGCTTGCAACCATGGAGGACTTATTGATAAAGGGAGGAGGTAC
TTTAAACACATGACTGAAGAATTCAGAATTCAGCCCACAGAAAAACATTATGCATGCATG
GTAGATATCCTTGGTCGTGGTGGGTTCTTTGAAGAGGCCCATGAGATGATATTGAGTATG
CATGTGGCTCCCACTTCAGCCGTTTGGGGTGCAATGCTTGCAGCTTGCAATGTTCACTGC
AATGTCCAGATGGCTGAAGTTGCAGCATCTGAGTTATTCAAGATTGAGCCTGAGAATTCT
GGAAATTACATTCTCCTGTCCAATATTTATGCTGCTGCAGGAAGATGGCATGATGTAGCT
AGAGTAAGGGCACTGATCAGAGAGCATCATGTGAAAAAAAATCGGGGATCTAGCTGGATT
GAGTTGGATTCTGCAGTGCACGAGTTTGTAATGGGAGATGTGTCACATGTGGATGTAGAC
AGGATATGCTTCATATTGAGTCTACTAAATGAAGATATGAAGCTTTCAGGATATACCAAA
GATAAGGATCTGCATCGAATTTCGACGTGGTACCCCTCTTATCTATCTCTTTCAAGTGAT
TCTGAAATGGACGAGGAACTGTTTTGA