Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID	PGSC0003DMT400041804
CDS Infomation	pacid=37465989 polypeptide=PGSC0003DMP400028328 locus=PGSC0003DMG400016217 ID=PGSC0003DMT400041804.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGCTTTTTTTAATAGAAGGATGTTAGAAGAACATCTATTTGATATACAAAAAAGTGTT AAATGTTTGAGTTGTACAGCATATGTTTGTACAAATGATTGTGGAGATGATGATACATCT GTTCCTCCTCCTCCTCTCCCTAATGTGACAAGTGAAAAATATCATATGCCTTCTTATTTT ATCATAATGCTTTGTATGTTTGGGGCTTTTTTTATGTTCATATGTTATATGATTATACTT AAGAGGAATAGGTCAAATTCAAGATCAATTGGGAGAAATAATGTTTCACAATTTGATGAA ACTAGAGAGGATTTTGTTATAGATGAGAATTTGGGCCCAATTTTGGATCATCCGATTTGG TATATTCGCACTGTGGGACTTGGACAAGATGTTATTGATTCAATTTCAGTGTTTAAGTAT AAAAAAGATGAGTTTTTGATTGATGGGAGTGATTGTTCTGTTTGTTTGACTGAATTTGAG GAGGATGAGAGTTTAAGGTTGTTGCCTAAATGTAGTCATGCTTTTCATATTCCTTGTATT GATACTTGGTTAAGGTCACACAAGAATTGCCCGTTGTGTCGTGCTCCTATTGTATCCGAG ATGGATAATTCCCCTCGAATGGATCATGTTGTGGAAGTTGTATCGATTACTAGTGTAGGT GATGATGGCTCTAGTACGAATGATGTTGATCAAGACGATGATCTTGAATTGGATGGAGAG GGGAATAATCAAGAAATGAGGTGTGGAGTAGTTGAGAATCTTGATGAGGAGGAGGAGGAA GGGAGATCAATGATGGACTTATCGATGAAAAATGCACGAGTTAATCTTGATGGAAGGAGG AAAAGGGGTCGTGTTTTTAGTGATTTGGTTGATCAACATAGGGTGAAGGAGATCATCAAC AATGAACTACAACCAGCACGAAGATCGGTCTCAATGGATTCCTCTGTTGCTCAAGTGATT CACCTCACGATGAACGAGATGAATGAGATGAATTCGAGGAAAATTGATCAAGGGTGTTCG AGTAATTCAAAGAGAGGAGATAGAAATTCGAGTTTGTATAAAGCAATGAAGAGTTCTTCC TTTGGGCGTTCATTGCAAAAAGTTCCTATTAGTATGAAGAGGTCTTTTTCTACTAGTGGA AAATGTTCATTGCCTACAACTAGCACAAGACAAACAATGTAA

Peptide Sequence

PEP ID	PGSC0003DMP400028328
PEP Infomation	pacid=37465989 transcript=PGSC0003DMT400041804 locus=PGSC0003DMG400016217 ID=PGSC0003DMT400041804.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	MAFFNRRMLEEHLFDIQKSVKCLSCTAYVCTNDCGDDDTSVPPPPLPNVTSEKYHMPSYF IIMLCMFGAFFMFICYMIILKRNRSNSRSIGRNNVSQFDETREDFVIDENLGPILDHPIW YIRTVGLGQDVIDSISVFKYKKDEFLIDGSDCSVCLTEFEEDESLRLLPKCSHAFHIPCI DTWLRSHKNCPLCRAPIVSEMDNSPRMDHVVEVVSITSVGDDGSSTNDVDQDDDLELDGE GNNQEMRCGVVENLDEEEEEGRSMMDLSMKNARVNLDGRRKRGRVFSDLVDQHRVKEIIN NELQPARRSVSMDSSVAQVIHLTMNEMNEMNSRKIDQGCSSNSKRGDRNSSLYKAMKSSS FGRSLQKVPISMKRSFSTSGKCSLPTTSTRQTM*

Transcript Sequence

Transcript ID	PGSC0003DMT400041804
Transcript Infomation	pacid=37465989 locus=PGSC0003DMG400016217 ID=PGSC0003DMT400041804.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGCTTTTTTTAATAGAAGGATGTTAGAAGAACATCTATTTGATATACAAAAAAGTGTT AAATGTTTGAGTTGTACAGCATATGTTTGTACAAATGATTGTGGAGATGATGATACATCT GTTCCTCCTCCTCCTCTCCCTAATGTGACAAGTGAAAAATATCATATGCCTTCTTATTTT ATCATAATGCTTTGTATGTTTGGGGCTTTTTTTATGTTCATATGTTATATGATTATACTT AAGAGGAATAGGTCAAATTCAAGATCAATTGGGAGAAATAATGTTTCACAATTTGATGAA ACTAGAGAGGATTTTGTTATAGATGAGAATTTGGGCCCAATTTTGGATCATCCGATTTGG TATATTCGCACTGTGGGACTTGGACAAGATGTTATTGATTCAATTTCAGTGTTTAAGTAT AAAAAAGATGAGTTTTTGATTGATGGGAGTGATTGTTCTGTTTGTTTGACTGAATTTGAG GAGGATGAGAGTTTAAGGTTGTTGCCTAAATGTAGTCATGCTTTTCATATTCCTTGTATT GATACTTGGTTAAGGTCACACAAGAATTGCCCGTTGTGTCGTGCTCCTATTGTATCCGAG ATGGATAATTCCCCTCGAATGGATCATGTTGTGGAAGTTGTATCGATTACTAGTGTAGGT GATGATGGCTCTAGTACGAATGATGTTGATCAAGACGATGATCTTGAATTGGATGGAGAG GGGAATAATCAAGAAATGAGGTGTGGAGTAGTTGAGAATCTTGATGAGGAGGAGGAGGAA GGGAGATCAATGATGGACTTATCGATGAAAAATGCACGAGTTAATCTTGATGGAAGGAGG AAAAGGGGTCGTGTTTTTAGTGATTTGGTTGATCAACATAGGGTGAAGGAGATCATCAAC AATGAACTACAACCAGCACGAAGATCGGTCTCAATGGATTCCTCTGTTGCTCAAGTGATT CACCTCACGATGAACGAGATGAATGAGATGAATTCGAGGAAAATTGATCAAGGGTGTTCG AGTAATTCAAAGAGAGGAGATAGAAATTCGAGTTTGTATAAAGCAATGAAGAGTTCTTCC TTTGGGCGTTCATTGCAAAAAGTTCCTATTAGTATGAAGAGGTCTTTTTCTACTAGTGGA AAATGTTCATTGCCTACAACTAGCACAAGACAAACAATGTAA