Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400041762
CDS Infomation

pacid=37465422 polypeptide=PGSC0003DMP400028295 locus=PGSC0003DMG400016198 ID=PGSC0003DMT400041762.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAAGGTGGGTCAAACTCAGAAATGAAAGGTAGAATGGAGAGGCAAAAGGGGGTAAAT
CCAAAGATTGAGCCTTTTGTACCAAAGAAAGGTTATGATCCTAGAGAGTTGAAATCTTGG
GCTAAGAGGACTGGTTTTGTGTCAACAACTTTTTCTGGTGAGACTGAAAGAGGTGGTGGT
CATAGTAGGAGGGATTTTGATAATGGTAGAGATCTGAATGTGAGTAGTAATGAGAATGTT
GGATTTGATTTGGAAAGAGGGGTTGATAAAACTGAAACTGTATCTCCAAAGATTGAGCTT
GATCCTATTTTAGGAAGGGCAAGGAATAGAGGGGTTGAAATTGAGCCAATTTCGGGGTCT
ACCGACCAGGGTTTGAGAAATGGAAGAGGAAGAGGAAGAGGTGAAAATCTTGGGAGGAGA
ACTGAGATGGAGCCTATTTTGAGAGGTCATAATGAGGAGAGGAAAGATGCTAGGAATGAG
AATGGCAATGATGGTAATAGTGCTAATGGAGCTGTTAATGGGAGTGGGAATGGACACATA
GCTCAAGCAGCTACTCCAGTTACAGAAGTACCAAGGAAGGATGATGGCAATGTGGATGAA
GAAGTGGGAATGGGCGTATATCCCGATGGCGAGGATCCTAGTTATGGAGGGTGGCATCAG
TCTCCGCGGATGAAATGTGGATTAAGGGAAAATCCGGGTGTTGTGCCTCTTATGTTCTAT
GGGTTGCAGCACTATTTGTCATTGGCTGGTTCACTTATTTTTATCCCTCTGATTACTGTT
CCCACCATGGGTGGAAGTGATAAAGACACTGCCGATGTGGTTTCCACAATGCTGCTAGTG
TCTGGCCTTACCACAATACTGCACTCATATTTTGGCACCCGTCTGCCATTAGTTCAAGGG
AGTTCCTTTGTATATTTGGCTCCTGCATTAGTTATCATGAATTCTGAGGAGTACCGGAAT
CTTGCTGATCATAAATTTAGGTACATAATGAGGGAGTTACAAGGAGCTATAATTGTTGGA
TCAATTTTCCAGAGCTTCTTGGGTTACAGTGGCTTGATGGCCCTTTTTCTACGGTTAGTA
AATCCCGTTGTGGTCGCACCAACAGTAGCTGCAGTGGGTTTAGCATTTTTTAGCTATGGC
TTTCCACAAGCTGGTAGTTGTGTAGAAATCAGCCTTCCTCAGATACTGCTTATCCTTATT
TTTACCTTGTACCTTGGAGGAATATCCATTTTTGGTTACAGAGTGTTTCGTATATATGCT
GTCCCTGTTAGTGTTATGATCATTTGGGCGTATGCGTTTTTCCTGACAGCTGGTGGTGCA
TATAACTTCAAGGGTTGTAACCCCGACATACCAAACTCCAACATCCTTATCGATGCTTGT
CAAAAGCATGCAGATACAATGAGGCATTGTAGGACTGATGTCTCCAATGCTATGAGAACT
GCTGCCTGGGTCAGGATTCCTTACCCTTTGCAATGGGGTATACCGACCTTCCGGTTACGG
ACTTCAATCATTATGGTTATTGTGTCGCTAGTTGCTTCCATTGACTCGATTGGAAATTAT
CACTCCGCCGCAATACGAATCAATTTGAAACCCCCAACCCCAGGTATAGTCAGCAGGGGG
ATTGGTCTGGAAGGTTTCTGTAGTGTTTTGGCTGGACTTTGGGGAACGGGTACTGGGGCA
ACAACTTTGACAGAGAATCTACACACGATCAATGCAACGAAAGTAGCAAACCGAAGGGCT
GTACAGCTTGGAGCAGCACTTTTAATCCTATTCTCCTTTGTAGGTAAAATTGGTGCCATT
CTTGCTTCTATACCACAAGCATTAGCAGCTGCGGTACTATGCTTCACATGGGCTCTTATT
GTTGCTCTGGGACTATCTACATTACAGTATACACAAAATGCAAGTTCCCGAAACATTATA
ATTGTTGGTGTATCCTTGTTCTTTGGTTTGTCGGTCCCCGCTTATTTTCAGCAGTATGCA
CCAGAGACCGGCCTAATCTTGCCTGGCTATCTAATTCCTTATGCAGCAGCATCCAATGGA
CCAGTACATACCGGGAATGCACAATTCAATTTTGCAATGAATGCACTTCTGTCCTTGAAC
ATGGTGGTCACACTATTAGTGGCATTCGTATTAGACAACACCGTCCCTGGAAGCAGACAA
GAACGAGGAGTGTACGTTTGGTCAAAGGCTGAAGACATTATGACAGATCCTTCTTCCCTG
TTAGACTACTCGTTACCGAGTAGAGTAGCAAGGTGTTTCCACTGGGCTAAATGTGTCGGC
ACATGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400028295
PEP Infomation

pacid=37465422 transcript=PGSC0003DMT400041762 locus=PGSC0003DMG400016198 ID=PGSC0003DMT400041762.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MEGGSNSEMKGRMERQKGVNPKIEPFVPKKGYDPRELKSWAKRTGFVSTTFSGETERGGG
HSRRDFDNGRDLNVSSNENVGFDLERGVDKTETVSPKIELDPILGRARNRGVEIEPISGS
TDQGLRNGRGRGRGENLGRRTEMEPILRGHNEERKDARNENGNDGNSANGAVNGSGNGHI
AQAATPVTEVPRKDDGNVDEEVGMGVYPDGEDPSYGGWHQSPRMKCGLRENPGVVPLMFY
GLQHYLSLAGSLIFIPLITVPTMGGSDKDTADVVSTMLLVSGLTTILHSYFGTRLPLVQG
SSFVYLAPALVIMNSEEYRNLADHKFRYIMRELQGAIIVGSIFQSFLGYSGLMALFLRLV
NPVVVAPTVAAVGLAFFSYGFPQAGSCVEISLPQILLILIFTLYLGGISIFGYRVFRIYA
VPVSVMIIWAYAFFLTAGGAYNFKGCNPDIPNSNILIDACQKHADTMRHCRTDVSNAMRT
AAWVRIPYPLQWGIPTFRLRTSIIMVIVSLVASIDSIGNYHSAAIRINLKPPTPGIVSRG
IGLEGFCSVLAGLWGTGTGATTLTENLHTINATKVANRRAVQLGAALLILFSFVGKIGAI
LASIPQALAAAVLCFTWALIVALGLSTLQYTQNASSRNIIIVGVSLFFGLSVPAYFQQYA
PETGLILPGYLIPYAAASNGPVHTGNAQFNFAMNALLSLNMVVTLLVAFVLDNTVPGSRQ
ERGVYVWSKAEDIMTDPSSLLDYSLPSRVARCFHWAKCVGT*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400041762
Transcript Infomation

pacid=37465422 locus=PGSC0003DMG400016198 ID=PGSC0003DMT400041762.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAAGGTGGGTCAAACTCAGAAATGAAAGGTAGAATGGAGAGGCAAAAGGGGGTAAAT
CCAAAGATTGAGCCTTTTGTACCAAAGAAAGGTTATGATCCTAGAGAGTTGAAATCTTGG
GCTAAGAGGACTGGTTTTGTGTCAACAACTTTTTCTGGTGAGACTGAAAGAGGTGGTGGT
CATAGTAGGAGGGATTTTGATAATGGTAGAGATCTGAATGTGAGTAGTAATGAGAATGTT
GGATTTGATTTGGAAAGAGGGGTTGATAAAACTGAAACTGTATCTCCAAAGATTGAGCTT
GATCCTATTTTAGGAAGGGCAAGGAATAGAGGGGTTGAAATTGAGCCAATTTCGGGGTCT
ACCGACCAGGGTTTGAGAAATGGAAGAGGAAGAGGAAGAGGTGAAAATCTTGGGAGGAGA
ACTGAGATGGAGCCTATTTTGAGAGGTCATAATGAGGAGAGGAAAGATGCTAGGAATGAG
AATGGCAATGATGGTAATAGTGCTAATGGAGCTGTTAATGGGAGTGGGAATGGACACATA
GCTCAAGCAGCTACTCCAGTTACAGAAGTACCAAGGAAGGATGATGGCAATGTGGATGAA
GAAGTGGGAATGGGCGTATATCCCGATGGCGAGGATCCTAGTTATGGAGGGTGGCATCAG
TCTCCGCGGATGAAATGTGGATTAAGGGAAAATCCGGGTGTTGTGCCTCTTATGTTCTAT
GGGTTGCAGCACTATTTGTCATTGGCTGGTTCACTTATTTTTATCCCTCTGATTACTGTT
CCCACCATGGGTGGAAGTGATAAAGACACTGCCGATGTGGTTTCCACAATGCTGCTAGTG
TCTGGCCTTACCACAATACTGCACTCATATTTTGGCACCCGTCTGCCATTAGTTCAAGGG
AGTTCCTTTGTATATTTGGCTCCTGCATTAGTTATCATGAATTCTGAGGAGTACCGGAAT
CTTGCTGATCATAAATTTAGGTACATAATGAGGGAGTTACAAGGAGCTATAATTGTTGGA
TCAATTTTCCAGAGCTTCTTGGGTTACAGTGGCTTGATGGCCCTTTTTCTACGGTTAGTA
AATCCCGTTGTGGTCGCACCAACAGTAGCTGCAGTGGGTTTAGCATTTTTTAGCTATGGC
TTTCCACAAGCTGGTAGTTGTGTAGAAATCAGCCTTCCTCAGATACTGCTTATCCTTATT
TTTACCTTGTACCTTGGAGGAATATCCATTTTTGGTTACAGAGTGTTTCGTATATATGCT
GTCCCTGTTAGTGTTATGATCATTTGGGCGTATGCGTTTTTCCTGACAGCTGGTGGTGCA
TATAACTTCAAGGGTTGTAACCCCGACATACCAAACTCCAACATCCTTATCGATGCTTGT
CAAAAGCATGCAGATACAATGAGGCATTGTAGGACTGATGTCTCCAATGCTATGAGAACT
GCTGCCTGGGTCAGGATTCCTTACCCTTTGCAATGGGGTATACCGACCTTCCGGTTACGG
ACTTCAATCATTATGGTTATTGTGTCGCTAGTTGCTTCCATTGACTCGATTGGAAATTAT
CACTCCGCCGCAATACGAATCAATTTGAAACCCCCAACCCCAGGTATAGTCAGCAGGGGG
ATTGGTCTGGAAGGTTTCTGTAGTGTTTTGGCTGGACTTTGGGGAACGGGTACTGGGGCA
ACAACTTTGACAGAGAATCTACACACGATCAATGCAACGAAAGTAGCAAACCGAAGGGCT
GTACAGCTTGGAGCAGCACTTTTAATCCTATTCTCCTTTGTAGGTAAAATTGGTGCCATT
CTTGCTTCTATACCACAAGCATTAGCAGCTGCGGTACTATGCTTCACATGGGCTCTTATT
GTTGCTCTGGGACTATCTACATTACAGTATACACAAAATGCAAGTTCCCGAAACATTATA
ATTGTTGGTGTATCCTTGTTCTTTGGTTTGTCGGTCCCCGCTTATTTTCAGCAGTATGCA
CCAGAGACCGGCCTAATCTTGCCTGGCTATCTAATTCCTTATGCAGCAGCATCCAATGGA
CCAGTACATACCGGGAATGCACAATTCAATTTTGCAATGAATGCACTTCTGTCCTTGAAC
ATGGTGGTCACACTATTAGTGGCATTCGTATTAGACAACACCGTCCCTGGAAGCAGACAA
GAACGAGGAGTGTACGTTTGGTCAAAGGCTGAAGACATTATGACAGATCCTTCTTCCCTG
TTAGACTACTCGTTACCGAGTAGAGTAGCAAGGTGTTTCCACTGGGCTAAATGTGTCGGC
ACATGA