Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400041388
CDS Infomation

pacid=37432617 polypeptide=PGSC0003DMP400028048 locus=PGSC0003DMG400016037 ID=PGSC0003DMT400041388.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGACATATCATTGCCGCTGGATCAGTTACGGAACAGTTGTAGGTATGCGGCTTTCTTG
ACAGACCCTCATGTTCTGCAGGAAAGACTTGTCCTTTCTGGGAATTGCTCCTTATTCAGC
AAGAAAAGGTATAGAAATGTGTTTTCTCAGATTAGAGCTTCTCTTTCTGAACATGGGTTT
ATAAAGCCAAGACCCATGATGAAACCTTCCAAGAGGGAGGAAAATTTATGTGAAGAAACC
ATTTCAAAAGTAAACCAAATTGGGGATCCAGGTTCAGGGATTAGTGCTCAAATAGAGAAG
CTAGTTTTTCATAAGAGGTATCATGAGGCTCTTGATTTTTTTGAGCTGTTAGAGTGTGAA
GGTGATTGTCAGTTAGATAGTAGCACGTATGATGCTTTGATAACTGCCTGTATTGGGTTA
AGGTCGATTAGAGGGGTTAAGCGGGTGCATAATCATATGGTTAGTTCTGGATTGGTATTA
GACCAGTATTTATGGAACAGGGTTTTGTCTATGCATGTCAAATGTAAGATGATGTTAGAT
GCACGTAGCATATTTGATGATATGCCTGAGAGGAACTCGATTTCTTGGAATACAATGGTT
GGAGGGCTAGTTGATTTGGGGGATTATTTGGAGGCGTTTAGATTGTTTTTTATGATGTGG
GAAGAGAATTCTGCTGCTGATCCTCGGATATTTGCGACGATGATTCGAGCATGTTCTGGA
TTAGAGGTTATTTCTTTGGGACAGCAATTGCATTCTTGTGCTTTGAAAATGGGGGAAGGT
GACAATCGTTTTATATCTTGTGCTTTAATTGATATGTATAGCAAGTGCGGTAGCATAGAG
GATGCTCAGTTTGTTTTTGATAATATGCCAGAGAAGACCACAGTAGGATGGAATACGATT
ATTGCTGGTTACGCTCTCCATGGCTATAGTGAGGAGGCTTTATGTTTGTACTATGAGATG
CGAGATGCTGGTGTCAAAATGGATCACTTCACATTTTCAATCATTATTAGAGTTTGCACG
AGATTAGCTTCACTGGAGCATGCTAAACAAGCTCATGCTGGGCTAGTTCGACATGGATTT
GGATTAGATATTGTTGCCAATACAGCATTAGTGGATTTCTATATCAAATGGGGGAGGATA
GAAGATGCTCGTAATGTTTTTGAGGGGATGCCCCAAAAGAATGTTATTTCTTGGAATGCC
TTAATTGGTGGATATGGTAATCATGGCCGAGGGATTGAGGCTGTTGAACTATTTGAGCGT
ATGGTTCACGAAGGAATGATGCCCAATCATGTTACTTTTTTGGCTGTTTTATCTGCATGT
CGCTATTCAGGTTTATCAGATTATGGGTGGGAAATATTTGAATCAATGAGTAGAGATTAC
AAGGTGAAGCCTAGAGCAATGCACTATGCATGTATGATTGAATTGTTGGGTAGAGAAGGG
CTTTTAGATGAAGCTTTTGCGTTAATCAGGGATGCTCCTTTTAGGCCTACTATAAATATG
TGGGCAGCCTTACTGACAGCCTGTAGAGTCCACAAGAATTTTGAGCTAGGAAAATTTGCA
GCTGAGAAACTTTATGGAATGGAACCAGAAAAACTCAGCAACTATGTGATGCTTTTGAAT
ATCTATAACAGCTCAGGCAAGCAAGATGAAGCTGCTGCAGTTGTTCAAACATTGAAGAGA
AAAGGACTCAGAATAAAGCCTGCATGCACATGGATAGAAATAAAGAAGCAACCACATGTT
TTCCTGTCTGGAGATAAGTGCCATGTGCAAACCAAGGAGATATATGAAAAAGTGGACGAG
CTTATGCTGGAGATCTCTAAGTATGGCTATGTTACGGGGGGGAAAACCTTACTACCCGAC
GTAGATGAACAGGAACAAAAATCACCACATTATCACAGTGAAAAGTTGGCAATATCTTTT
GGGCTCATAAGCACGTCTAGTTCAACCTCACTGCAACTTGTTCAGAGTCATAGGATTTGC
AACAATTGCCACAATGCAATTAAGTTGATAGCCATGATTACTAAACGAGAAATTGTTATT
AGGGATGCCAGCAGGTTTCATCGATTCAAGAACGGCACTTGTTCTTGCGGTGACTACTGG
TGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400028048
PEP Infomation

pacid=37432617 transcript=PGSC0003DMT400041388 locus=PGSC0003DMG400016037 ID=PGSC0003DMT400041388.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MDISLPLDQLRNSCRYAAFLTDPHVLQERLVLSGNCSLFSKKRYRNVFSQIRASLSEHGF
IKPRPMMKPSKREENLCEETISKVNQIGDPGSGISAQIEKLVFHKRYHEALDFFELLECE
GDCQLDSSTYDALITACIGLRSIRGVKRVHNHMVSSGLVLDQYLWNRVLSMHVKCKMMLD
ARSIFDDMPERNSISWNTMVGGLVDLGDYLEAFRLFFMMWEENSAADPRIFATMIRACSG
LEVISLGQQLHSCALKMGEGDNRFISCALIDMYSKCGSIEDAQFVFDNMPEKTTVGWNTI
IAGYALHGYSEEALCLYYEMRDAGVKMDHFTFSIIIRVCTRLASLEHAKQAHAGLVRHGF
GLDIVANTALVDFYIKWGRIEDARNVFEGMPQKNVISWNALIGGYGNHGRGIEAVELFER
MVHEGMMPNHVTFLAVLSACRYSGLSDYGWEIFESMSRDYKVKPRAMHYACMIELLGREG
LLDEAFALIRDAPFRPTINMWAALLTACRVHKNFELGKFAAEKLYGMEPEKLSNYVMLLN
IYNSSGKQDEAAAVVQTLKRKGLRIKPACTWIEIKKQPHVFLSGDKCHVQTKEIYEKVDE
LMLEISKYGYVTGGKTLLPDVDEQEQKSPHYHSEKLAISFGLISTSSSTSLQLVQSHRIC
NNCHNAIKLIAMITKREIVIRDASRFHRFKNGTCSCGDYW*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400041388
Transcript Infomation

pacid=37432617 locus=PGSC0003DMG400016037 ID=PGSC0003DMT400041388.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGACATATCATTGCCGCTGGATCAGTTACGGAACAGTTGTAGGTATGCGGCTTTCTTG
ACAGACCCTCATGTTCTGCAGGAAAGACTTGTCCTTTCTGGGAATTGCTCCTTATTCAGC
AAGAAAAGGTATAGAAATGTGTTTTCTCAGATTAGAGCTTCTCTTTCTGAACATGGGTTT
ATAAAGCCAAGACCCATGATGAAACCTTCCAAGAGGGAGGAAAATTTATGTGAAGAAACC
ATTTCAAAAGTAAACCAAATTGGGGATCCAGGTTCAGGGATTAGTGCTCAAATAGAGAAG
CTAGTTTTTCATAAGAGGTATCATGAGGCTCTTGATTTTTTTGAGCTGTTAGAGTGTGAA
GGTGATTGTCAGTTAGATAGTAGCACGTATGATGCTTTGATAACTGCCTGTATTGGGTTA
AGGTCGATTAGAGGGGTTAAGCGGGTGCATAATCATATGGTTAGTTCTGGATTGGTATTA
GACCAGTATTTATGGAACAGGGTTTTGTCTATGCATGTCAAATGTAAGATGATGTTAGAT
GCACGTAGCATATTTGATGATATGCCTGAGAGGAACTCGATTTCTTGGAATACAATGGTT
GGAGGGCTAGTTGATTTGGGGGATTATTTGGAGGCGTTTAGATTGTTTTTTATGATGTGG
GAAGAGAATTCTGCTGCTGATCCTCGGATATTTGCGACGATGATTCGAGCATGTTCTGGA
TTAGAGGTTATTTCTTTGGGACAGCAATTGCATTCTTGTGCTTTGAAAATGGGGGAAGGT
GACAATCGTTTTATATCTTGTGCTTTAATTGATATGTATAGCAAGTGCGGTAGCATAGAG
GATGCTCAGTTTGTTTTTGATAATATGCCAGAGAAGACCACAGTAGGATGGAATACGATT
ATTGCTGGTTACGCTCTCCATGGCTATAGTGAGGAGGCTTTATGTTTGTACTATGAGATG
CGAGATGCTGGTGTCAAAATGGATCACTTCACATTTTCAATCATTATTAGAGTTTGCACG
AGATTAGCTTCACTGGAGCATGCTAAACAAGCTCATGCTGGGCTAGTTCGACATGGATTT
GGATTAGATATTGTTGCCAATACAGCATTAGTGGATTTCTATATCAAATGGGGGAGGATA
GAAGATGCTCGTAATGTTTTTGAGGGGATGCCCCAAAAGAATGTTATTTCTTGGAATGCC
TTAATTGGTGGATATGGTAATCATGGCCGAGGGATTGAGGCTGTTGAACTATTTGAGCGT
ATGGTTCACGAAGGAATGATGCCCAATCATGTTACTTTTTTGGCTGTTTTATCTGCATGT
CGCTATTCAGGTTTATCAGATTATGGGTGGGAAATATTTGAATCAATGAGTAGAGATTAC
AAGGTGAAGCCTAGAGCAATGCACTATGCATGTATGATTGAATTGTTGGGTAGAGAAGGG
CTTTTAGATGAAGCTTTTGCGTTAATCAGGGATGCTCCTTTTAGGCCTACTATAAATATG
TGGGCAGCCTTACTGACAGCCTGTAGAGTCCACAAGAATTTTGAGCTAGGAAAATTTGCA
GCTGAGAAACTTTATGGAATGGAACCAGAAAAACTCAGCAACTATGTGATGCTTTTGAAT
ATCTATAACAGCTCAGGCAAGCAAGATGAAGCTGCTGCAGTTGTTCAAACATTGAAGAGA
AAAGGACTCAGAATAAAGCCTGCATGCACATGGATAGAAATAAAGAAGCAACCACATGTT
TTCCTGTCTGGAGATAAGTGCCATGTGCAAACCAAGGAGATATATGAAAAAGTGGACGAG
CTTATGCTGGAGATCTCTAAGTATGGCTATGTTACGGGGGGGAAAACCTTACTACCCGAC
GTAGATGAACAGGAACAAAAATCACCACATTATCACAGTGAAAAGTTGGCAATATCTTTT
GGGCTCATAAGCACGTCTAGTTCAACCTCACTGCAACTTGTTCAGAGTCATAGGATTTGC
AACAATTGCCACAATGCAATTAAGTTGATAGCCATGATTACTAAACGAGAAATTGTTATT
AGGGATGCCAGCAGGTTTCATCGATTCAAGAACGGCACTTGTTCTTGCGGTGACTACTGG
TGA