Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400041054
CDS Infomation

pacid=37474498 polypeptide=PGSC0003DMP400027836 locus=PGSC0003DMG400015881 ID=PGSC0003DMT400041054.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGTTTTTCTCTTCCTTCTTATCACCTTATTCCCTTACTTCTTTATTAATCTTGATTCTA
TGTATTGTTGGTGTTGATTTTGTTACCACAACACAAACAAAGATTGGCCAAGGTTACAAG
TTGATCTCCATAGAAAAATCACAAGATGGAGGCCTTATAGGTCTCCTCCAAGTCAAAGAG
AAGAACAATATTTATGGGCTAGATATTCCTCATTTGAAGCTCTATGTTAAGCATGAGACG
GATAATCGTTTGAGGGTTCATATAACTGACGCAAAAGAGCAAAGATGGGAAGTTCCTTAC
AACTTATTACAAAGAAACACACCCCCATCATTGAAACAAAATGTTGGCGGTAAATCAAGA
AAGAACCTTTTCTCATCAGTAGCAGAATCAGAATATTCCGGGAATGAATTAATATTCAAT
TACAAAAATGACCCTTTTAGTTTTTCTGTGAAAAGAAAATCAAATGGAGAGACCCTTTTC
AATTCAAGCTTTGATGATTCAGACTCATATAACAATTTGGTTTTTAAAGATCAATATCTT
GAAATATCAACCCAATTGCCCAAAGATGCTTCTTTATATGGTCTAGGTGAAAATTCACAA
CCCCATGGGATTAAAATTTACCCAAATGACCCTTACACTTTGTATACAACTGATCAACCA
GCTATTAATTTGAATATGGATTTGTATGGATCACACCCTATGTATATGGATTTGAGGAAT
GTGAATGGAGTTGCAAATGCTCATGTTGTTTTGTTACTAAATAGCAATGGGATGGATGTG
TTTTACAAGGGAGATTCTTTAACATACAAAGTGATTGGGGGTGTTTTGGACTTTTACTTC
TTTTCTGGGCCCACACCACTTGATGTTGTTGATCAATATACTTCATTCATAGGAAGGCCT
GCTCCAATGCCTTATTGGTCTTTTGGATTCCATCAATGCAGATGGGGTTACCACAATTTA
TCAGTAATTGAAGATGTTGTTGAGAACTACAACAAAGCCAAAATCCCTCTTGATGTTATT
TGGAATGATGATGATCATATGGATGGTAAAAAAGATTTCACTCTCAATCCTGTTAACTAT
CCTCGTCCGAATTTGCTAGCTTTCTTGGACAAAATTCATGCTCGTGGCATGAAGTACATT
GTCATCGTTGATCCTGGAATCGGCGTTAACAACACTTATGGTGTTTACCAAAGAGGTATA
GCTAATGATGTTTTCATCAAATATGAAGGCAAGCCTTATTTAGCTCAAGTTTGGCCTGGT
GCTGTCAATTTCCCTGATTTTCTGAATCCGAAGACTGTTGAGTGGTGGGGTGATGAAATC
AGGAGGTTTCGCGAACTTGTGCCTGTTGATGGACTCTGGATTGACATGAATGAAGTTCCA
AACTTTTGTTCAGGTTTGTGTACAATCCCTGAAGGAAGGATATGTCCTACTGGCACTGGT
CCTGGTTGGATATGTTGCCTGGATTGCAAAAACATAACGAATACTAGATGGGATGATCCA
CCTTATAAGATTAATGCTAGTGGAATACAAGCACCAATTGGTTACAAAACCATAGCGACT
AGCGCGGTTCATTATAATGGAGTTAAGGAATATGATGCTCATAGCATTTACGGGTTTTCT
CAGTCCATTGCAACTCATAAGGCACTTCAAGGACTCGAGGGGAAGCGTCCTTTTATATTG
TCTCGTTCCACATTTGTTGGTTCGGGGCATTATGCTGCACATTGGACAGGGGATAACAGA
GGAACTTGGGATGATTTGAGGTATTCAATAACTACAGTGTTGAATTTTGGATTGTTTGGT
GTTCCTATGGTTGGTGCTGATATATGTGGATTCTATCCAGCACCAACGGAGGAGCTTTGC
AATCGTTGGATTGAAGTTGGTGCATTCTATCCATTCTCAAGGGATCACGCGAACTACTAT
TCACCAAGACAAGAGCTTTACCAATGGGAGAGTGTGGCTGAATCTGCGCGAAATGCTTTA
GGAATGAGGTACAAGTTACTACCATATTTCTATACTTTGAACTACGAGGCACATACTACT
GGTGCGCCAATTGCTCGTCCCCTCTTCTTCTCTTTCCCAACTCTACCAGAACTTTACGAC
GTGAGCACTCAATTCCTTGTAGGAAGCAGTGTCATGGTCTCACCAGTGTTAGATCAGGGG
AAAACAGAGGTGAAAGCTCTGTTTCCCCCTGGTTCGTGGTACAATTTATTCGATATGACA
CAAGCAATTGTCACAAAAGACCTACATTACCTCACATTAGACGCGCCTCTAAATGTGGTC
AATGTACATGTCTACCAAAACACCATCATACCAATGCAGCGCGGTGGGATGATATCAAAA
GAAGCAAGAACGACACCTTTTACCCTCGTAGTCACCTTACCATCGGGTACAAATGACATA
GAAGCTAAAGGAAATCTTTTCCTTGACGATGATGAGCTTCCTGAGATGAAACTTGGAAAT
GGGCACTCAACGTATATCGATTTCCATGCAACAGCAAGTAATGGAACAGTGAAGTTGTGG
TCAGAAGTTCAAGAAAGCAAGTTTGCATTGGATAAAGGATGGTTCATTGAGAAGGTTATA
GTTTTAGGCACCAATGGTACTGATGGAGCTTTTGAAATAAACGTCGATGGACAACCGATC
GAAGATGCTTCAAGAGTGAAGTATAGCACAATAGAACACAAGTACATAAACAATTTGGAT
GATGAAGTTGATAAGAGAAAGAGTATGATGATGGATATTCATGGACTGGAATTGCCTTTA
GGGAAGAATTTTATTATGTCCTGGAAAATGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400027836
PEP Infomation

pacid=37474498 transcript=PGSC0003DMT400041054 locus=PGSC0003DMG400015881 ID=PGSC0003DMT400041054.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MFFSSFLSPYSLTSLLILILCIVGVDFVTTTQTKIGQGYKLISIEKSQDGGLIGLLQVKE
KNNIYGLDIPHLKLYVKHETDNRLRVHITDAKEQRWEVPYNLLQRNTPPSLKQNVGGKSR
KNLFSSVAESEYSGNELIFNYKNDPFSFSVKRKSNGETLFNSSFDDSDSYNNLVFKDQYL
EISTQLPKDASLYGLGENSQPHGIKIYPNDPYTLYTTDQPAINLNMDLYGSHPMYMDLRN
VNGVANAHVVLLLNSNGMDVFYKGDSLTYKVIGGVLDFYFFSGPTPLDVVDQYTSFIGRP
APMPYWSFGFHQCRWGYHNLSVIEDVVENYNKAKIPLDVIWNDDDHMDGKKDFTLNPVNY
PRPNLLAFLDKIHARGMKYIVIVDPGIGVNNTYGVYQRGIANDVFIKYEGKPYLAQVWPG
AVNFPDFLNPKTVEWWGDEIRRFRELVPVDGLWIDMNEVPNFCSGLCTIPEGRICPTGTG
PGWICCLDCKNITNTRWDDPPYKINASGIQAPIGYKTIATSAVHYNGVKEYDAHSIYGFS
QSIATHKALQGLEGKRPFILSRSTFVGSGHYAAHWTGDNRGTWDDLRYSITTVLNFGLFG
VPMVGADICGFYPAPTEELCNRWIEVGAFYPFSRDHANYYSPRQELYQWESVAESARNAL
GMRYKLLPYFYTLNYEAHTTGAPIARPLFFSFPTLPELYDVSTQFLVGSSVMVSPVLDQG
KTEVKALFPPGSWYNLFDMTQAIVTKDLHYLTLDAPLNVVNVHVYQNTIIPMQRGGMISK
EARTTPFTLVVTLPSGTNDIEAKGNLFLDDDELPEMKLGNGHSTYIDFHATASNGTVKLW
SEVQESKFALDKGWFIEKVIVLGTNGTDGAFEINVDGQPIEDASRVKYSTIEHKYINNLD
DEVDKRKSMMMDIHGLELPLGKNFIMSWKM*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400041054
Transcript Infomation

pacid=37474498 locus=PGSC0003DMG400015881 ID=PGSC0003DMT400041054.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGTTTTTCTCTTCCTTCTTATCACCTTATTCCCTTACTTCTTTATTAATCTTGATTCTA
TGTATTGTTGGTGTTGATTTTGTTACCACAACACAAACAAAGATTGGCCAAGGTTACAAG
TTGATCTCCATAGAAAAATCACAAGATGGAGGCCTTATAGGTCTCCTCCAAGTCAAAGAG
AAGAACAATATTTATGGGCTAGATATTCCTCATTTGAAGCTCTATGTTAAGCATGAGACG
GATAATCGTTTGAGGGTTCATATAACTGACGCAAAAGAGCAAAGATGGGAAGTTCCTTAC
AACTTATTACAAAGAAACACACCCCCATCATTGAAACAAAATGTTGGCGGTAAATCAAGA
AAGAACCTTTTCTCATCAGTAGCAGAATCAGAATATTCCGGGAATGAATTAATATTCAAT
TACAAAAATGACCCTTTTAGTTTTTCTGTGAAAAGAAAATCAAATGGAGAGACCCTTTTC
AATTCAAGCTTTGATGATTCAGACTCATATAACAATTTGGTTTTTAAAGATCAATATCTT
GAAATATCAACCCAATTGCCCAAAGATGCTTCTTTATATGGTCTAGGTGAAAATTCACAA
CCCCATGGGATTAAAATTTACCCAAATGACCCTTACACTTTGTATACAACTGATCAACCA
GCTATTAATTTGAATATGGATTTGTATGGATCACACCCTATGTATATGGATTTGAGGAAT
GTGAATGGAGTTGCAAATGCTCATGTTGTTTTGTTACTAAATAGCAATGGGATGGATGTG
TTTTACAAGGGAGATTCTTTAACATACAAAGTGATTGGGGGTGTTTTGGACTTTTACTTC
TTTTCTGGGCCCACACCACTTGATGTTGTTGATCAATATACTTCATTCATAGGAAGGCCT
GCTCCAATGCCTTATTGGTCTTTTGGATTCCATCAATGCAGATGGGGTTACCACAATTTA
TCAGTAATTGAAGATGTTGTTGAGAACTACAACAAAGCCAAAATCCCTCTTGATGTTATT
TGGAATGATGATGATCATATGGATGGTAAAAAAGATTTCACTCTCAATCCTGTTAACTAT
CCTCGTCCGAATTTGCTAGCTTTCTTGGACAAAATTCATGCTCGTGGCATGAAGTACATT
GTCATCGTTGATCCTGGAATCGGCGTTAACAACACTTATGGTGTTTACCAAAGAGGTATA
GCTAATGATGTTTTCATCAAATATGAAGGCAAGCCTTATTTAGCTCAAGTTTGGCCTGGT
GCTGTCAATTTCCCTGATTTTCTGAATCCGAAGACTGTTGAGTGGTGGGGTGATGAAATC
AGGAGGTTTCGCGAACTTGTGCCTGTTGATGGACTCTGGATTGACATGAATGAAGTTCCA
AACTTTTGTTCAGGTTTGTGTACAATCCCTGAAGGAAGGATATGTCCTACTGGCACTGGT
CCTGGTTGGATATGTTGCCTGGATTGCAAAAACATAACGAATACTAGATGGGATGATCCA
CCTTATAAGATTAATGCTAGTGGAATACAAGCACCAATTGGTTACAAAACCATAGCGACT
AGCGCGGTTCATTATAATGGAGTTAAGGAATATGATGCTCATAGCATTTACGGGTTTTCT
CAGTCCATTGCAACTCATAAGGCACTTCAAGGACTCGAGGGGAAGCGTCCTTTTATATTG
TCTCGTTCCACATTTGTTGGTTCGGGGCATTATGCTGCACATTGGACAGGGGATAACAGA
GGAACTTGGGATGATTTGAGGTATTCAATAACTACAGTGTTGAATTTTGGATTGTTTGGT
GTTCCTATGGTTGGTGCTGATATATGTGGATTCTATCCAGCACCAACGGAGGAGCTTTGC
AATCGTTGGATTGAAGTTGGTGCATTCTATCCATTCTCAAGGGATCACGCGAACTACTAT
TCACCAAGACAAGAGCTTTACCAATGGGAGAGTGTGGCTGAATCTGCGCGAAATGCTTTA
GGAATGAGGTACAAGTTACTACCATATTTCTATACTTTGAACTACGAGGCACATACTACT
GGTGCGCCAATTGCTCGTCCCCTCTTCTTCTCTTTCCCAACTCTACCAGAACTTTACGAC
GTGAGCACTCAATTCCTTGTAGGAAGCAGTGTCATGGTCTCACCAGTGTTAGATCAGGGG
AAAACAGAGGTGAAAGCTCTGTTTCCCCCTGGTTCGTGGTACAATTTATTCGATATGACA
CAAGCAATTGTCACAAAAGACCTACATTACCTCACATTAGACGCGCCTCTAAATGTGGTC
AATGTACATGTCTACCAAAACACCATCATACCAATGCAGCGCGGTGGGATGATATCAAAA
GAAGCAAGAACGACACCTTTTACCCTCGTAGTCACCTTACCATCGGGTACAAATGACATA
GAAGCTAAAGGAAATCTTTTCCTTGACGATGATGAGCTTCCTGAGATGAAACTTGGAAAT
GGGCACTCAACGTATATCGATTTCCATGCAACAGCAAGTAATGGAACAGTGAAGTTGTGG
TCAGAAGTTCAAGAAAGCAAGTTTGCATTGGATAAAGGATGGTTCATTGAGAAGGTTATA
GTTTTAGGCACCAATGGTACTGATGGAGCTTTTGAAATAAACGTCGATGGACAACCGATC
GAAGATGCTTCAAGAGTGAAGTATAGCACAATAGAACACAAGTACATAAACAATTTGGAT
GATGAAGTTGATAAGAGAAAGAGTATGATGATGGATATTCATGGACTGGAATTGCCTTTA
GGGAAGAATTTTATTATGTCCTGGAAAATGTGA