Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400041014
CDS Infomation

pacid=37471564 polypeptide=PGSC0003DMP400027807 locus=PGSC0003DMG401015867 ID=PGSC0003DMT400041014.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCGTTAAATTTTTCGCATCGGCCCATATTTCCGGCACATATATCTGAGGATAATTTG
GTATCACCCATGAGAATTGTGAATGGGTGTTTAGTCGAGGGTGTTCCGGAGAATAATGTG
GAGAATTTTCCTTGGTCGTGGCGTGTTTGTCGAGAACCGCATGACGGGTTTGAATATGGT
TATGGGGGGAAAAGAAGAGACAAGTGTGATTATTCTGAGTTGGTATCGGAGGATATCATT
GATCTTCTCCCTGCTGATCCATTTGGGATGGATATAAGCACCACTATCACAGCCATTACG
GGTTGGCTTGAGGATTTGGAAGTTGATTATGGAGGATGTAGGAGAAACCATGCCGGTCCA
AGTAATGAGGACTATGGTTTATTTGCCGGTTTTGATTTTATTTGGAACGATTCTATGAGG
TTCCAATCATTCCCTATTAATCACGTTCGGTCTGATGACAAACTGAATAGAGGTGATCCA
GTGAATTGGCTTATTGGGGAGAGAGATATGAGGGACGCCTTGGCCCATGTTGGTCTTGGC
TCAGCTTGCAATGTGGGGGACACTGCAGGCTTCAATAATGTAGGTTCAGTCAGTTTTCTT
CCCCAGACCATGGAAACAGGGTCTGGGGCGATGTCTTGCTCTGGTGAAGATGAAGGAGCC
CCTCATGAGGCTTTATCTTTTGCTCTTGGTTACCTTGGAGTGAAGGATCTTTTGATGGTA
GAAAGTGTTTGCAGGTCCTTGCGGCTTACTGTAAAAAATGATCCTTTATTATGGAAAAGC
ATTCACATTGAAAATTCATTGACTGAGATCAGCGATGATATCCTCTTGCAATTGACTAGC
AGGGCTCAAGGTAACTTACAATGCTTGAGTTTGTTAGAGTGTACCCGCATCACAGATGAC
GGTTTGAGGCGGGTACTTGACTCTAATCCACATTTGACAAAGTTATTTGTTCCTGCATGT
ACAAGACTCAGTATTGAAGGCATTGTAAATATGTTGAAGTCTTTTAACTGTCAAAGAGGT
AAAATGGGTATAAAGAACCTGTGGATTGGCGGTCTTTATGGAGTGATGCATGAACATTTT
GAAGAGCTGGAGTTTCTTCTAGGTGCAGATAGCCAGACGAGGCAAAATGTTTACAAACCC
CATTTCTTTTCTCGAAGGAATATTTATCGTTTGGTTGATGACAGTCGGGCTATTGATGTT
CAACTTTGCCCTATATGTAAAAAAGTAAGGTTGGTCTATGATTGTCCTGCAGAGGGTTGC
CTAGTGAAAGATGAAGCTACTAAAGAATGTAGGGCCTGCTCACTTTGCATCTTACGGTGT
AGTGAATGTGGGAGATGTATAAATAACACTGAATATGTGGAGACTTTTTGTTTGGAATTG
CTTTGTTCTGATTGCTCTAAGCAGCCTTTGGAGTGCAAAGATGAGCAGAAGTGCTGCCTT
TGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400027807
PEP Infomation

pacid=37471564 transcript=PGSC0003DMT400041014 locus=PGSC0003DMG401015867 ID=PGSC0003DMT400041014.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MALNFSHRPIFPAHISEDNLVSPMRIVNGCLVEGVPENNVENFPWSWRVCREPHDGFEYG
YGGKRRDKCDYSELVSEDIIDLLPADPFGMDISTTITAITGWLEDLEVDYGGCRRNHAGP
SNEDYGLFAGFDFIWNDSMRFQSFPINHVRSDDKLNRGDPVNWLIGERDMRDALAHVGLG
SACNVGDTAGFNNVGSVSFLPQTMETGSGAMSCSGEDEGAPHEALSFALGYLGVKDLLMV
ESVCRSLRLTVKNDPLLWKSIHIENSLTEISDDILLQLTSRAQGNLQCLSLLECTRITDD
GLRRVLDSNPHLTKLFVPACTRLSIEGIVNMLKSFNCQRGKMGIKNLWIGGLYGVMHEHF
EELEFLLGADSQTRQNVYKPHFFSRRNIYRLVDDSRAIDVQLCPICKKVRLVYDCPAEGC
LVKDEATKECRACSLCILRCSECGRCINNTEYVETFCLELLCSDCSKQPLECKDEQKCCL
*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400041014
Transcript Infomation

pacid=37471564 locus=PGSC0003DMG401015867 ID=PGSC0003DMT400041014.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCGTTAAATTTTTCGCATCGGCCCATATTTCCGGCACATATATCTGAGGATAATTTG
GTATCACCCATGAGAATTGTGAATGGGTGTTTAGTCGAGGGTGTTCCGGAGAATAATGTG
GAGAATTTTCCTTGGTCGTGGCGTGTTTGTCGAGAACCGCATGACGGGTTTGAATATGGT
TATGGGGGGAAAAGAAGAGACAAGTGTGATTATTCTGAGTTGGTATCGGAGGATATCATT
GATCTTCTCCCTGCTGATCCATTTGGGATGGATATAAGCACCACTATCACAGCCATTACG
GGTTGGCTTGAGGATTTGGAAGTTGATTATGGAGGATGTAGGAGAAACCATGCCGGTCCA
AGTAATGAGGACTATGGTTTATTTGCCGGTTTTGATTTTATTTGGAACGATTCTATGAGG
TTCCAATCATTCCCTATTAATCACGTTCGGTCTGATGACAAACTGAATAGAGGTGATCCA
GTGAATTGGCTTATTGGGGAGAGAGATATGAGGGACGCCTTGGCCCATGTTGGTCTTGGC
TCAGCTTGCAATGTGGGGGACACTGCAGGCTTCAATAATGTAGGTTCAGTCAGTTTTCTT
CCCCAGACCATGGAAACAGGGTCTGGGGCGATGTCTTGCTCTGGTGAAGATGAAGGAGCC
CCTCATGAGGCTTTATCTTTTGCTCTTGGTTACCTTGGAGTGAAGGATCTTTTGATGGTA
GAAAGTGTTTGCAGGTCCTTGCGGCTTACTGTAAAAAATGATCCTTTATTATGGAAAAGC
ATTCACATTGAAAATTCATTGACTGAGATCAGCGATGATATCCTCTTGCAATTGACTAGC
AGGGCTCAAGGTAACTTACAATGCTTGAGTTTGTTAGAGTGTACCCGCATCACAGATGAC
GGTTTGAGGCGGGTACTTGACTCTAATCCACATTTGACAAAGTTATTTGTTCCTGCATGT
ACAAGACTCAGTATTGAAGGCATTGTAAATATGTTGAAGTCTTTTAACTGTCAAAGAGGT
AAAATGGGTATAAAGAACCTGTGGATTGGCGGTCTTTATGGAGTGATGCATGAACATTTT
GAAGAGCTGGAGTTTCTTCTAGGTGCAGATAGCCAGACGAGGCAAAATGTTTACAAACCC
CATTTCTTTTCTCGAAGGAATATTTATCGTTTGGTTGATGACAGTCGGGCTATTGATGTT
CAACTTTGCCCTATATGTAAAAAAGTAAGGTTGGTCTATGATTGTCCTGCAGAGGGTTGC
CTAGTGAAAGATGAAGCTACTAAAGAATGTAGGGCCTGCTCACTTTGCATCTTACGGTGT
AGTGAATGTGGGAGATGTATAAATAACACTGAATATGTGGAGACTTTTTGTTTGGAATTG
CTTTGTTCTGATTGCTCTAAGCAGCCTTTGGAGTGCAAAGATGAGCAGAAGTGCTGCCTT
TGA