Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400040963
CDS Infomation

pacid=37453051 polypeptide=PGSC0003DMP400027774 locus=PGSC0003DMG400015846 ID=PGSC0003DMT400040963.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCGCCCACCACCATCCGAAAGGCCATAGGGGCTGTGAAGGACCAGACAAGCATAGGA
ATTGCCAAAGTTGCCAGCAACATGGCACCAGAGCTGGAAGTTGCTATTGTTAAGGCTACT
AGCCACGATGATGAACCAGCTGGAGAGAAGTACATAAGGGAGATTCTCCAATTGACTTCA
TCTTCACGGGGTTATGTCACTGCCTGCATGTCTGCAATTTCCAAAAGGTTGGGAAAAACC
CGAGATTGGATTGTTGCTCTCAAGTGTTTGATGCTAATTCACCGACTTCTCAATGATGGA
GATGCTGTATTTCAGCAAGAAATTATGTATGCTACCAGGAGGGGAACAAGGCTGCTAAAT
TTGTTGGATTTCAGAGATGAGGCTCACGCCAGTTCATGGGATCATTCCGCTTTTGTAAGG
ACTTATGCTTTGTATTTGGATCAGAGGTTAGAATTGATGGTTTTTGAGAGGAAGCAAAAT
GGTGGAGAGATGGAAAGGTATGGATCTAAGGATGAACAATGGAGATCGCCCCAGAGTTCT
AACCACGGATATGATTATGATCATGGGGACTTTAGAGATGAGCCTGGTTATGGAATGAGG
AGGTCCAGATCTTCAGGTGATGTGAGAGAGTCCATACAGGAGAAGAAAGATGTGACTCCA
TTGAGAGAGATGAAGCCTGAAAGGATTTTTGGGAAAATGACTCATTTGCAGAGACTGCTA
GATCGCTTTTTGTCTTGTCGGCCAACTGGTTTGGCTAAGAATGAAAGGATGGTCCTGGTT
GCTTTGTACCCTGTGGTTAAAGAAAGTTACAAAATTTACATGGATATATGTGATGTTTTG
GCTGTTCTGTTGGATAAATTTTTTGATATGGAGTATGAGGATTGTGTCAAGGCCTTTGAT
GCCTATTCTAGTGCAGCCAAGCAGATAGATGAGTTGGTGGGATTCTATAACTGGTGCAAG
GATATAGGTGTGTCAAGGTCGTCAGAATACCCAGAAGTGTCGAGGATTACAAGCAAGCTA
TTAGATACATTAGAGGAGTTTGTGAGAGATAGAGCCAAGGTGATGAAGAGTCCTGAAAGG
AAAGTAGAGAGCCAGCCAGCTCCACAGGAAGAGGAGCCAATACCGGATATGAATGAAATT
AAAGCATTGCCACCACCAGAGGATTATACTGCTCCACCGCCTCCTGAACCAGAGCCTCCT
AAGCCTAAGCCTGTTATTCAGGAAACCAGAGATTTGGTGGATTTGAGGGAGGAGGGTGTT
ACTGCTGATGATCAGGGGAATAAATTTGCCTTGGCATTATTTGCAGGACCAGGAACAAGC
AATGCAAATGGGTCGTGGGAAGCATTCCCATCCAATGGGGAACCAGAGGTTACATCTGCT
TGGCAGAATCCAGCAGCTGAGAGTGGTAAGGCTGATTGGGAACTGGCTTTGGTGGAGACA
GCAAGTAATTTGTCTAAGCAGAAGGCGGCATTGGGTGGCGGTCTTGATCCACTATTGTTG
AATGGCATGTATGATCAGGGTGTTGTTAGGCAACATGTAGCCACTGCGCAATCAAGTGGT
GGCAGTGCCAGCAGTGTGGCATTGCCAGGAGTAGGGAAGAGTGCTACACCAGTTTTGGCA
CTCCCTGCACCTGATGGAACAGTCCAGACAGTTGGACAAGACCCCTTTGCCGCATCTTTG
AGTGTTCCACCACCCTCTTATGTGCAAATGGCAGATTTGCAGAAGAAAGAGCAATTGCTA
GTGCAGGAACAGATGGTATGGCAGCAGTATAGCAGAGATGGCATGCAAGGTCAAACGAGT
TTGGCCAAGATCACTACCGGAGGATACTATGGTCCAGGGCAACCCCCTGTGATGCCTTAT
GGAATGCCACCAGTAAACGGCGTTGGAATACCACCTGCTGCAGGGTACTACTACAATCCT
TACTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400027774
PEP Infomation

pacid=37453051 transcript=PGSC0003DMT400040963 locus=PGSC0003DMG400015846 ID=PGSC0003DMT400040963.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MAPTTIRKAIGAVKDQTSIGIAKVASNMAPELEVAIVKATSHDDEPAGEKYIREILQLTS
SSRGYVTACMSAISKRLGKTRDWIVALKCLMLIHRLLNDGDAVFQQEIMYATRRGTRLLN
LLDFRDEAHASSWDHSAFVRTYALYLDQRLELMVFERKQNGGEMERYGSKDEQWRSPQSS
NHGYDYDHGDFRDEPGYGMRRSRSSGDVRESIQEKKDVTPLREMKPERIFGKMTHLQRLL
DRFLSCRPTGLAKNERMVLVALYPVVKESYKIYMDICDVLAVLLDKFFDMEYEDCVKAFD
AYSSAAKQIDELVGFYNWCKDIGVSRSSEYPEVSRITSKLLDTLEEFVRDRAKVMKSPER
KVESQPAPQEEEPIPDMNEIKALPPPEDYTAPPPPEPEPPKPKPVIQETRDLVDLREEGV
TADDQGNKFALALFAGPGTSNANGSWEAFPSNGEPEVTSAWQNPAAESGKADWELALVET
ASNLSKQKAALGGGLDPLLLNGMYDQGVVRQHVATAQSSGGSASSVALPGVGKSATPVLA
LPAPDGTVQTVGQDPFAASLSVPPPSYVQMADLQKKEQLLVQEQMVWQQYSRDGMQGQTS
LAKITTGGYYGPGQPPVMPYGMPPVNGVGIPPAAGYYYNPY*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400040963
Transcript Infomation

pacid=37453051 locus=PGSC0003DMG400015846 ID=PGSC0003DMT400040963.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCGCCCACCACCATCCGAAAGGCCATAGGGGCTGTGAAGGACCAGACAAGCATAGGA
ATTGCCAAAGTTGCCAGCAACATGGCACCAGAGCTGGAAGTTGCTATTGTTAAGGCTACT
AGCCACGATGATGAACCAGCTGGAGAGAAGTACATAAGGGAGATTCTCCAATTGACTTCA
TCTTCACGGGGTTATGTCACTGCCTGCATGTCTGCAATTTCCAAAAGGTTGGGAAAAACC
CGAGATTGGATTGTTGCTCTCAAGTGTTTGATGCTAATTCACCGACTTCTCAATGATGGA
GATGCTGTATTTCAGCAAGAAATTATGTATGCTACCAGGAGGGGAACAAGGCTGCTAAAT
TTGTTGGATTTCAGAGATGAGGCTCACGCCAGTTCATGGGATCATTCCGCTTTTGTAAGG
ACTTATGCTTTGTATTTGGATCAGAGGTTAGAATTGATGGTTTTTGAGAGGAAGCAAAAT
GGTGGAGAGATGGAAAGGTATGGATCTAAGGATGAACAATGGAGATCGCCCCAGAGTTCT
AACCACGGATATGATTATGATCATGGGGACTTTAGAGATGAGCCTGGTTATGGAATGAGG
AGGTCCAGATCTTCAGGTGATGTGAGAGAGTCCATACAGGAGAAGAAAGATGTGACTCCA
TTGAGAGAGATGAAGCCTGAAAGGATTTTTGGGAAAATGACTCATTTGCAGAGACTGCTA
GATCGCTTTTTGTCTTGTCGGCCAACTGGTTTGGCTAAGAATGAAAGGATGGTCCTGGTT
GCTTTGTACCCTGTGGTTAAAGAAAGTTACAAAATTTACATGGATATATGTGATGTTTTG
GCTGTTCTGTTGGATAAATTTTTTGATATGGAGTATGAGGATTGTGTCAAGGCCTTTGAT
GCCTATTCTAGTGCAGCCAAGCAGATAGATGAGTTGGTGGGATTCTATAACTGGTGCAAG
GATATAGGTGTGTCAAGGTCGTCAGAATACCCAGAAGTGTCGAGGATTACAAGCAAGCTA
TTAGATACATTAGAGGAGTTTGTGAGAGATAGAGCCAAGGTGATGAAGAGTCCTGAAAGG
AAAGTAGAGAGCCAGCCAGCTCCACAGGAAGAGGAGCCAATACCGGATATGAATGAAATT
AAAGCATTGCCACCACCAGAGGATTATACTGCTCCACCGCCTCCTGAACCAGAGCCTCCT
AAGCCTAAGCCTGTTATTCAGGAAACCAGAGATTTGGTGGATTTGAGGGAGGAGGGTGTT
ACTGCTGATGATCAGGGGAATAAATTTGCCTTGGCATTATTTGCAGGACCAGGAACAAGC
AATGCAAATGGGTCGTGGGAAGCATTCCCATCCAATGGGGAACCAGAGGTTACATCTGCT
TGGCAGAATCCAGCAGCTGAGAGTGGTAAGGCTGATTGGGAACTGGCTTTGGTGGAGACA
GCAAGTAATTTGTCTAAGCAGAAGGCGGCATTGGGTGGCGGTCTTGATCCACTATTGTTG
AATGGCATGTATGATCAGGGTGTTGTTAGGCAACATGTAGCCACTGCGCAATCAAGTGGT
GGCAGTGCCAGCAGTGTGGCATTGCCAGGAGTAGGGAAGAGTGCTACACCAGTTTTGGCA
CTCCCTGCACCTGATGGAACAGTCCAGACAGTTGGACAAGACCCCTTTGCCGCATCTTTG
AGTGTTCCACCACCCTCTTATGTGCAAATGGCAGATTTGCAGAAGAAAGAGCAATTGCTA
GTGCAGGAACAGATGGTATGGCAGCAGTATAGCAGAGATGGCATGCAAGGTCAAACGAGT
TTGGCCAAGATCACTACCGGAGGATACTATGGTCCAGGGCAACCCCCTGTGATGCCTTAT
GGAATGCCACCAGTAAACGGCGTTGGAATACCACCTGCTGCAGGGTACTACTACAATCCT
TACTGA