Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400040809
CDS Infomation

pacid=37427402 polypeptide=PGSC0003DMP400027680 locus=PGSC0003DMG401015781 ID=PGSC0003DMT400040809.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCTCTACCAGCTTCAACACCTCTACTGATGGATCCTAGTATTCCGAGGTTGAAATCA
ATTCATGCAGGTACAAGTACAACGAATCCGGATGAACAAGATCAAACGCATCAACGACCA
ACCAGTTCTGAGGTTGTGGAGGAGGTGAAGTTGCTATATTCAATAGCTTTTCCCATCATT
GCTGCTGGATTGCTTGTCTATGGAAAATCAATGATATCAATGTTGTTTATGGGAAGATTA
GGTAAAGAAGCACTTGCTGGTGGATCTTTATCTATTGGCATAGCTAATATCACTGGCTTC
TCTGTTCTGTCTGGCCTAGCTATGGGTATGGAGGCTATATCTTCTCAAGCTTGTGGTGCT
AAACAATGGCCTCTTATGGGTCAAACTCTCCAACGTACAATCTTGATTCTGTTATTTTCA
TCTATCCCCATTTCTCTCTTGTGGATAAAGATTGAACCTTTACTCCTTTTCTGTGGCCAA
GATCCAACCATTTCATCAATTGCTTCTACTTATCTGTCCTTTTGTCTCCCTAATCTTTTC
TTTCAATCCATTATCAATCCTCTCAAAATCTACTTGAGAACTCAGAATGTCACTTTCCCT
GTTACTTTTAGTGCTGCTTTTTCACTTGCCCTGCATGCACCTATAAACTATTTCCTTATC
TATCACCTTGGCCTTGGTATTAAAGGTGTTGCTATGGCTGTGGTGATAGCTGATTTTAAT
CTCCTTGGTGTTCTTTTTCTTTATGTTAGTTTTTCTGGTGTTCATAGAAAATCTTGGCAA
GGTTGGTCAACTGAATGCTTTGAAGGGTGGAAACCAATTTTGATTCTTGCTGTCCCTAGC
TGTATTTCTGTATGCTTAGAGTGGTGGTGGTATGAGTTGATGATTTTGTTGTCAGGGGTT
CTTTTTAATGCTGCAGAGGCTGTGTCTACTATGGGAATTCTCTTGCAGGCAACTTCACTT
GCTTATATATTTCCATCAGCATTAAGTTTAGCTGTTTCAACAAGAGTTGGGAATGAGTTG
GGTGCCAATAGGCCTAATAAAGCAAAGACTTCATGCCATGTAGCAATTTTGTGCGCTACA
TTAACAAGCTTATTAGCAATGATATTTATGACAACACTAAGAAATGCTTGGGGCAAGGCT
TTTACAGACGACGAGTCGATTTTGTGGCTGACAGCAGCAGCAATGCCGGTGGTGGGGTTG
TGTGAGTTGGGCAACTGCCCACAGACCACCGGTTGTGGTGCTTTGAGGGGCAGTGCAAGG
CCAGCTTTGGCTGTTCATATAAACTTGGGCTCTTTCTATGGTGTTGGGTTGCCTCTAGCT
ATTGTACTGGGCTTTGTTATGAAGATGGGGTTGTTAGGCCTTTGTTTGGGCTTGTTGGCT
GCTCAAGGTGTTTGTGCATGTCTCATGGTTTTTGTGTTGAGTAGAACTGATTGGATGATA
CAAGCCCAGAGAGCTAGAGAGTTGATTGGTGTTGATGTGGAGACTCAAACTATAGCAATT
AAAACAGTGTGCTAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400027680
PEP Infomation

pacid=37427402 transcript=PGSC0003DMT400040809 locus=PGSC0003DMG401015781 ID=PGSC0003DMT400040809.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MALPASTPLLMDPSIPRLKSIHAGTSTTNPDEQDQTHQRPTSSEVVEEVKLLYSIAFPII
AAGLLVYGKSMISMLFMGRLGKEALAGGSLSIGIANITGFSVLSGLAMGMEAISSQACGA
KQWPLMGQTLQRTILILLFSSIPISLLWIKIEPLLLFCGQDPTISSIASTYLSFCLPNLF
FQSIINPLKIYLRTQNVTFPVTFSAAFSLALHAPINYFLIYHLGLGIKGVAMAVVIADFN
LLGVLFLYVSFSGVHRKSWQGWSTECFEGWKPILILAVPSCISVCLEWWWYELMILLSGV
LFNAAEAVSTMGILLQATSLAYIFPSALSLAVSTRVGNELGANRPNKAKTSCHVAILCAT
LTSLLAMIFMTTLRNAWGKAFTDDESILWLTAAAMPVVGLCELGNCPQTTGCGALRGSAR
PALAVHINLGSFYGVGLPLAIVLGFVMKMGLLGLCLGLLAAQGVCACLMVFVLSRTDWMI
QAQRARELIGVDVETQTIAIKTVC*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400040809
Transcript Infomation

pacid=37427402 locus=PGSC0003DMG401015781 ID=PGSC0003DMT400040809.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCTCTACCAGCTTCAACACCTCTACTGATGGATCCTAGTATTCCGAGGTTGAAATCA
ATTCATGCAGGTACAAGTACAACGAATCCGGATGAACAAGATCAAACGCATCAACGACCA
ACCAGTTCTGAGGTTGTGGAGGAGGTGAAGTTGCTATATTCAATAGCTTTTCCCATCATT
GCTGCTGGATTGCTTGTCTATGGAAAATCAATGATATCAATGTTGTTTATGGGAAGATTA
GGTAAAGAAGCACTTGCTGGTGGATCTTTATCTATTGGCATAGCTAATATCACTGGCTTC
TCTGTTCTGTCTGGCCTAGCTATGGGTATGGAGGCTATATCTTCTCAAGCTTGTGGTGCT
AAACAATGGCCTCTTATGGGTCAAACTCTCCAACGTACAATCTTGATTCTGTTATTTTCA
TCTATCCCCATTTCTCTCTTGTGGATAAAGATTGAACCTTTACTCCTTTTCTGTGGCCAA
GATCCAACCATTTCATCAATTGCTTCTACTTATCTGTCCTTTTGTCTCCCTAATCTTTTC
TTTCAATCCATTATCAATCCTCTCAAAATCTACTTGAGAACTCAGAATGTCACTTTCCCT
GTTACTTTTAGTGCTGCTTTTTCACTTGCCCTGCATGCACCTATAAACTATTTCCTTATC
TATCACCTTGGCCTTGGTATTAAAGGTGTTGCTATGGCTGTGGTGATAGCTGATTTTAAT
CTCCTTGGTGTTCTTTTTCTTTATGTTAGTTTTTCTGGTGTTCATAGAAAATCTTGGCAA
GGTTGGTCAACTGAATGCTTTGAAGGGTGGAAACCAATTTTGATTCTTGCTGTCCCTAGC
TGTATTTCTGTATGCTTAGAGTGGTGGTGGTATGAGTTGATGATTTTGTTGTCAGGGGTT
CTTTTTAATGCTGCAGAGGCTGTGTCTACTATGGGAATTCTCTTGCAGGCAACTTCACTT
GCTTATATATTTCCATCAGCATTAAGTTTAGCTGTTTCAACAAGAGTTGGGAATGAGTTG
GGTGCCAATAGGCCTAATAAAGCAAAGACTTCATGCCATGTAGCAATTTTGTGCGCTACA
TTAACAAGCTTATTAGCAATGATATTTATGACAACACTAAGAAATGCTTGGGGCAAGGCT
TTTACAGACGACGAGTCGATTTTGTGGCTGACAGCAGCAGCAATGCCGGTGGTGGGGTTG
TGTGAGTTGGGCAACTGCCCACAGACCACCGGTTGTGGTGCTTTGAGGGGCAGTGCAAGG
CCAGCTTTGGCTGTTCATATAAACTTGGGCTCTTTCTATGGTGTTGGGTTGCCTCTAGCT
ATTGTACTGGGCTTTGTTATGAAGATGGGGTTGTTAGGCCTTTGTTTGGGCTTGTTGGCT
GCTCAAGGTGTTTGTGCATGTCTCATGGTTTTTGTGTTGAGTAGAACTGATTGGATGATA
CAAGCCCAGAGAGCTAGAGAGTTGATTGGTGTTGATGTGGAGACTCAAACTATAGCAATT
AAAACAGTGTGCTAG