Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400040741
CDS Infomation

pacid=37444351 polypeptide=PGSC0003DMP400027628 locus=PGSC0003DMG400015752 ID=PGSC0003DMT400040741.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGTTGTCGCTGCAAAGCGATCCACGGCAGTATCAGCAACAGTTGTTGATTTCTAGGGTT
TCACATGATGGTGATCCGAGAAATGATTCGTCGTTTCCGTTTTATGCTGAGTCGGTTTTG
TCATCTGTGAATATCAAGTCTGACTTGTCTAGAGAAGTTGATGAGGACACACTCTTAACT
CTTGCTCATCAGAACTACAAAGCTGGAAACTATAAACAGGCTCTAGAGCATAGCAAGGCA
GTTTATGAGAGAAATCCCCAGCGCACTGATAATCTTCTTCTTTTGGGGGCTATATATTAT
CAGTTGCATGATTTTGATACATGCATTGCAAAAAATGAAGAAGCCCTCCGCGTTAATCCA
CAGTTTGCTGAGTGCTATGGAAATATGGCAAATGCTTGGAAGGAAAAGGACAATATCGAT
GTTGCAATACGCTATTATTTGATTGCAATAGAGCTGCGTCCCAATTTTGCTGATGCCTGG
TCAAATTTAGCTGGTGCATATATGAGGAAAGGAAGGCTGAGTGACGCAGCCCAATGTTGC
CATCAGGCTCTAGCTTTAAATCCTCGTCTGGTTGACGCACATAGCAATCTTGGAAATCTG
ATGAAAGCACAAGGTTTGGTGCAAGAGGCATACAATTGTTATGTGGAGGCACTGCGCATA
CAACCTACATTTGCTGTTGCATGGTCCAATCTTGCTGGCCTCTTCATGGATGCTGGCGAT
CTTAACAGGGCATTGCAGTACTACAAGGAAGCTGTCAAGCTAAAACCAAATTTTTCAGAC
GCATATTTGAACCTGGGAAATGTGTATAAGGCTCTCAGGATGCCACAGGAGGCCATTATG
TGTTACCAGCGTGCTCTCCTTGTGCGACCAGACTATGCTATGGCTTTTGGCAACTTAGCT
ACTGTGTACTATGAACAAGGCAACCTGGAGATGGCCATGCTTAATTACAGGAGAGCTATA
ACCTGTGATGCTGGATTCTTGGAGGCATATAACAATCTGGGTAATGCTCTGAAAGATGCT
GGTAAAGTTGAAGAAGCAATTCATTACTATCGTCAATGCCTCTCACTTCAGCCTAACCAT
CCTCAAGCACTGACTAATCTTGGAAACATTTATATGGAGTGGAACATGATGAGTGCTGCT
GCACAGTGTTACAAGGCAACTTTAGCTGTGACAACTGGGCTTTCAGCTCCTTTTAACAAT
TTAGCCATAATATACAAGCAGCAGGGTAACTATGCAGATGCCATATCTTGCTACAATGAG
GTACTCAGGATTGATCCCATGGCAGCTGATGGACTAGTCAATAGAGGTAACACATACAAG
GAGATTGGTAGAGTTAACGAAGCTATTCAGGACTATATGCTAGCTATTACCATAAGACCA
AATATGGCAGAGGCTCATGCAAATTTGGCTTCATCTTATAAGGACAGTGGCAATGTGGAG
GCAGCTATAAAAAGCTATAGACAAGCTTTGATGCTACGTCCCGACTTCCCAGAAGCAACT
TGTAATCTTCTTCACACGTTGCAGTGTGTCTGTGATTGGGATGATCGAGAGAAGATGTTT
ATTGAAGTTGAGGGGATCCTGAGAAGACAGATTAAGATGTCAGTTATCCCAAGTGTACAG
CCTTTTCATGCAATTGCTTACCCTCTCGATCCACTGCTAGCTCTAGAAATCAGTTGTAAG
TATGCCCAGCACTGCTCTGTAATTGCAGCTCGTTTCTCACTTCCTCCTTTCAGTCATCCT
CCTCCATTGCCAATAAAGGGTGGTAGCAGGAGTGGTCGGCTTAGGGTTGGATATGTGAGT
AGTGATTTTGGCAACCACCCACTATCACATCTGATGGGTTCAGTGTTTGGCATGCACGAT
AGAGAAAATGTTGAGGTGTTCTGCTATGCTTTGAGTCCAAATGATGGCACTGAGTGGAGG
CTCCGCATTCAGTCAGAAGCAGAGCATTTTGTTGATGTATCGTCGTTGACATCTGATGTG
ATAGCTAGGATGATTAATGAGGATCAAATACAGATCCTAATCAATCTTAACGGTTATACT
AAGGGGGCCCGAAATGAGATCTTTGCAATGCAGCCTGCTCCTATCCAGGTTTCGTATATG
GGGTTTCCTGGAACCACTGGAGCTAACTATATACATTATTTGGTTACAGATGAGTTTGTG
TCACCTACGCGGTACTCACATATTTACTCAGAGAAGCTTGTCCATCTCCCTCATTGTTAT
TTTGTCAATGATTATAAGCAAAAAAACCGTGACGCGTTAGATCCAAGCTGCCAACCCAGG
CGCTCAGATTATGGGCTGCCAGAGGACAAATTCATTTTTGCTTGTTTTAATCAGCTCTAC
AAGATGGATCCTGAGATATTTAAGACATGGTGCAATATTCTTAAGCGTGTACCAAACAGT
GCTCTTTGGCTGCTTAGATTTCCAGCTGCAGGGGAAATGAGGGTTCGCGCACATGCTGCT
ACACATGGTGTGCAGCCGGATCAAATTATTTTCACAGATGTTGCGATGAAACAAGAGCAC
ATCAGACGCAGTTCCTTGGCAGATCTTTGCCTTGACACACCACTGTGCAATGCACATACC
ACTGGAACAGATGTACTTTGGGCTGGTCTTCCGATGGTCACCCTTCCCCTTGAGAAAATG
GCAACTAGAGTGGCTGGTTCGTTGTGTTTGGCCACAGGGGTTGGTGAGGAGATGGTTGTT
AGCAGTATGAAGGAGTATGAAGAGAAGGCAGTGTCACTGGCACTAAATCGTCCCAAGCTC
CAAGATCTCACCAATAGACTCAAGGCTGTGCGCCTGAGTTGCCCTCTGTTTGACACAGAG
CGCTGGGTACGGAATCTGGAGCGGTCTTATTTTAAGATGTGGAATCTCTATTGCTCTGGC
CAACATCCTCAACCGTTTAAAGTGACCGAGAACGACATGGAATTTCCTTATGACCGGTAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400027628
PEP Infomation

pacid=37444351 transcript=PGSC0003DMT400040741 locus=PGSC0003DMG400015752 ID=PGSC0003DMT400040741.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MLSLQSDPRQYQQQLLISRVSHDGDPRNDSSFPFYAESVLSSVNIKSDLSREVDEDTLLT
LAHQNYKAGNYKQALEHSKAVYERNPQRTDNLLLLGAIYYQLHDFDTCIAKNEEALRVNP
QFAECYGNMANAWKEKDNIDVAIRYYLIAIELRPNFADAWSNLAGAYMRKGRLSDAAQCC
HQALALNPRLVDAHSNLGNLMKAQGLVQEAYNCYVEALRIQPTFAVAWSNLAGLFMDAGD
LNRALQYYKEAVKLKPNFSDAYLNLGNVYKALRMPQEAIMCYQRALLVRPDYAMAFGNLA
TVYYEQGNLEMAMLNYRRAITCDAGFLEAYNNLGNALKDAGKVEEAIHYYRQCLSLQPNH
PQALTNLGNIYMEWNMMSAAAQCYKATLAVTTGLSAPFNNLAIIYKQQGNYADAISCYNE
VLRIDPMAADGLVNRGNTYKEIGRVNEAIQDYMLAITIRPNMAEAHANLASSYKDSGNVE
AAIKSYRQALMLRPDFPEATCNLLHTLQCVCDWDDREKMFIEVEGILRRQIKMSVIPSVQ
PFHAIAYPLDPLLALEISCKYAQHCSVIAARFSLPPFSHPPPLPIKGGSRSGRLRVGYVS
SDFGNHPLSHLMGSVFGMHDRENVEVFCYALSPNDGTEWRLRIQSEAEHFVDVSSLTSDV
IARMINEDQIQILINLNGYTKGARNEIFAMQPAPIQVSYMGFPGTTGANYIHYLVTDEFV
SPTRYSHIYSEKLVHLPHCYFVNDYKQKNRDALDPSCQPRRSDYGLPEDKFIFACFNQLY
KMDPEIFKTWCNILKRVPNSALWLLRFPAAGEMRVRAHAATHGVQPDQIIFTDVAMKQEH
IRRSSLADLCLDTPLCNAHTTGTDVLWAGLPMVTLPLEKMATRVAGSLCLATGVGEEMVV
SSMKEYEEKAVSLALNRPKLQDLTNRLKAVRLSCPLFDTERWVRNLERSYFKMWNLYCSG
QHPQPFKVTENDMEFPYDR*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400040741
Transcript Infomation

pacid=37444351 locus=PGSC0003DMG400015752 ID=PGSC0003DMT400040741.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGTTGTCGCTGCAAAGCGATCCACGGCAGTATCAGCAACAGTTGTTGATTTCTAGGGTT
TCACATGATGGTGATCCGAGAAATGATTCGTCGTTTCCGTTTTATGCTGAGTCGGTTTTG
TCATCTGTGAATATCAAGTCTGACTTGTCTAGAGAAGTTGATGAGGACACACTCTTAACT
CTTGCTCATCAGAACTACAAAGCTGGAAACTATAAACAGGCTCTAGAGCATAGCAAGGCA
GTTTATGAGAGAAATCCCCAGCGCACTGATAATCTTCTTCTTTTGGGGGCTATATATTAT
CAGTTGCATGATTTTGATACATGCATTGCAAAAAATGAAGAAGCCCTCCGCGTTAATCCA
CAGTTTGCTGAGTGCTATGGAAATATGGCAAATGCTTGGAAGGAAAAGGACAATATCGAT
GTTGCAATACGCTATTATTTGATTGCAATAGAGCTGCGTCCCAATTTTGCTGATGCCTGG
TCAAATTTAGCTGGTGCATATATGAGGAAAGGAAGGCTGAGTGACGCAGCCCAATGTTGC
CATCAGGCTCTAGCTTTAAATCCTCGTCTGGTTGACGCACATAGCAATCTTGGAAATCTG
ATGAAAGCACAAGGTTTGGTGCAAGAGGCATACAATTGTTATGTGGAGGCACTGCGCATA
CAACCTACATTTGCTGTTGCATGGTCCAATCTTGCTGGCCTCTTCATGGATGCTGGCGAT
CTTAACAGGGCATTGCAGTACTACAAGGAAGCTGTCAAGCTAAAACCAAATTTTTCAGAC
GCATATTTGAACCTGGGAAATGTGTATAAGGCTCTCAGGATGCCACAGGAGGCCATTATG
TGTTACCAGCGTGCTCTCCTTGTGCGACCAGACTATGCTATGGCTTTTGGCAACTTAGCT
ACTGTGTACTATGAACAAGGCAACCTGGAGATGGCCATGCTTAATTACAGGAGAGCTATA
ACCTGTGATGCTGGATTCTTGGAGGCATATAACAATCTGGGTAATGCTCTGAAAGATGCT
GGTAAAGTTGAAGAAGCAATTCATTACTATCGTCAATGCCTCTCACTTCAGCCTAACCAT
CCTCAAGCACTGACTAATCTTGGAAACATTTATATGGAGTGGAACATGATGAGTGCTGCT
GCACAGTGTTACAAGGCAACTTTAGCTGTGACAACTGGGCTTTCAGCTCCTTTTAACAAT
TTAGCCATAATATACAAGCAGCAGGGTAACTATGCAGATGCCATATCTTGCTACAATGAG
GTACTCAGGATTGATCCCATGGCAGCTGATGGACTAGTCAATAGAGGTAACACATACAAG
GAGATTGGTAGAGTTAACGAAGCTATTCAGGACTATATGCTAGCTATTACCATAAGACCA
AATATGGCAGAGGCTCATGCAAATTTGGCTTCATCTTATAAGGACAGTGGCAATGTGGAG
GCAGCTATAAAAAGCTATAGACAAGCTTTGATGCTACGTCCCGACTTCCCAGAAGCAACT
TGTAATCTTCTTCACACGTTGCAGTGTGTCTGTGATTGGGATGATCGAGAGAAGATGTTT
ATTGAAGTTGAGGGGATCCTGAGAAGACAGATTAAGATGTCAGTTATCCCAAGTGTACAG
CCTTTTCATGCAATTGCTTACCCTCTCGATCCACTGCTAGCTCTAGAAATCAGTTGTAAG
TATGCCCAGCACTGCTCTGTAATTGCAGCTCGTTTCTCACTTCCTCCTTTCAGTCATCCT
CCTCCATTGCCAATAAAGGGTGGTAGCAGGAGTGGTCGGCTTAGGGTTGGATATGTGAGT
AGTGATTTTGGCAACCACCCACTATCACATCTGATGGGTTCAGTGTTTGGCATGCACGAT
AGAGAAAATGTTGAGGTGTTCTGCTATGCTTTGAGTCCAAATGATGGCACTGAGTGGAGG
CTCCGCATTCAGTCAGAAGCAGAGCATTTTGTTGATGTATCGTCGTTGACATCTGATGTG
ATAGCTAGGATGATTAATGAGGATCAAATACAGATCCTAATCAATCTTAACGGTTATACT
AAGGGGGCCCGAAATGAGATCTTTGCAATGCAGCCTGCTCCTATCCAGGTTTCGTATATG
GGGTTTCCTGGAACCACTGGAGCTAACTATATACATTATTTGGTTACAGATGAGTTTGTG
TCACCTACGCGGTACTCACATATTTACTCAGAGAAGCTTGTCCATCTCCCTCATTGTTAT
TTTGTCAATGATTATAAGCAAAAAAACCGTGACGCGTTAGATCCAAGCTGCCAACCCAGG
CGCTCAGATTATGGGCTGCCAGAGGACAAATTCATTTTTGCTTGTTTTAATCAGCTCTAC
AAGATGGATCCTGAGATATTTAAGACATGGTGCAATATTCTTAAGCGTGTACCAAACAGT
GCTCTTTGGCTGCTTAGATTTCCAGCTGCAGGGGAAATGAGGGTTCGCGCACATGCTGCT
ACACATGGTGTGCAGCCGGATCAAATTATTTTCACAGATGTTGCGATGAAACAAGAGCAC
ATCAGACGCAGTTCCTTGGCAGATCTTTGCCTTGACACACCACTGTGCAATGCACATACC
ACTGGAACAGATGTACTTTGGGCTGGTCTTCCGATGGTCACCCTTCCCCTTGAGAAAATG
GCAACTAGAGTGGCTGGTTCGTTGTGTTTGGCCACAGGGGTTGGTGAGGAGATGGTTGTT
AGCAGTATGAAGGAGTATGAAGAGAAGGCAGTGTCACTGGCACTAAATCGTCCCAAGCTC
CAAGATCTCACCAATAGACTCAAGGCTGTGCGCCTGAGTTGCCCTCTGTTTGACACAGAG
CGCTGGGTACGGAATCTGGAGCGGTCTTATTTTAAGATGTGGAATCTCTATTGCTCTGGC
CAACATCCTCAACCGTTTAAAGTGACCGAGAACGACATGGAATTTCCTTATGACCGGTAG