Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400040459
CDS Infomation

pacid=37464335 polypeptide=PGSC0003DMP400027450 locus=PGSC0003DMG400015666 ID=PGSC0003DMT400040459.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAGCTCAAAAATCTTGTTTTTATTCACCATTTCTGTATCAATTTTCACTCTTTTCTTG
CCGACAAACTCCGACATTGTTTCCGATCGAGCTACCCTTTTATCTATCCGATCTGCTCTT
CGTGGACGTTCACTTTTATGGAATATCACAAGTCCAACTTGTTCATGGCCTGGTGTTATT
TGTTCACCTGATAAATCTTCTGTTTTAGAGCTTCATCTACCTGGAATGGGACTTTTAGGC
CAAATCCCACCTGGGCTTTTCTCAAATTTGACTAAATTGAACTTTCTCAGTCTCCGGTAT
AATGCACTTTCCGGTGTAATTCCGGCGGACTTGTTTACTTCACTTCATGATTTGCGTAAC
TTGTACCTTCAAAATAATCTATTTTCCGGTCCAATTCCTGATTCAATCTTCTCTCTTACC
AATCTTGTCCGCCTTAATCTTGCTCATAACAATTTCTCCGGTTCAATACCGGAATCTTTC
AACAATTTGACTAGTTTGGGTACACTTTACTTGCAGGGAAATGGGTTTTCGGGTCAGATA
CCGGATCTGAATTTACCTGGTATGGTTCAGTTCAATGTATCGAATAATCAGCTAAACGGG
TCAATTCCTAGTAAACTTGCGGGTCAACCCAAGGATGCTTTTTTGGGTACTTCACTTTGT
GGTAAGCCACTTGATTCATGTGATGGTAGTAGTAGTAGTAGTAGTAGTATTGGAGAAGGT
AAAAAGAAGAAACTTTCTGGTGGAGCAATTGCTGGTATAGTAATTGGTTGTGTTGTTGGT
TTGCTTTTGCTTCTTTGTTTGCTGTTTTTCTGTTGTAGAAAAAGGGGTAAAAAAGAAACA
AGATCTGCTGATGTTGGTGCTGTTAGTAAGCAGGTTGAAGTTGAAATGCCTGAAGAAAGA
GGGGTTGAGAGTAATGGTGGAAAAGATGGATTCTTGGGTAGTGCAATTGCAGCTATTGGT
GTTGGAGGGGGTAATAAGGATAAAGGTAAAGCTGAGGCTGTTGTAAATGATGGAAAAAGT
TTGGTGTTTTTTGGGAAAATGGCCAAAAATTTCAATTTGGATGATTTGTTGAAAGCTTCT
GCTGAAGTTTTGGGAAAAGGGACATTTGGTACTGCTTATAAAGCTGCTTTGGAATCAGGG
ATTACATTAGTTGTGAAGAGATTGAGAGATGTTACTGTACCTGAGAAGGAGTTTAGAGAG
AAAATTGAAGATGTTGGGAAAATGAATCATGAGAATTTGGTTCCTTTGAGAGCTTATTAT
TATAGCAGAGATGAGAAGCTTCTTGTTTATGATTACATCTCAATGGGAAGCCTTTCTGCA
CTTTTACATGGCAACAAAGGAGCAGGTAGGACACCGTTGAATTGGGAAACAAGGGCTGGC
ATTGCCCTTGGAGCTGCACACGGGATTGCCTACCTTCATGCACAAGGGCCCTCAGTATCA
CATGGCAACATTAAGTCATCCAATATCCTCCTCACCAAATCATACGAGGCCCGTGTTTCA
GATTTTGGCCTTGCTCAACTCGTCGGTCCATCATCAACTCCCAACCGTGTTGCAGGTTAC
AGGGCACCAGAGGTAACTGACCCTCGTAAAGTCTCCCAGAAAGCAGATGTCTACAGCTTT
GGTGTCTTGTTGTTGGAACTTCTAACAGGGAAGGCTCCCACACATTCGGTACTGAATGAG
GAAGGTGTCGACCTACCAAGATGGGTGCAATCAGTGGTACGAGAGGAATGGACAGCCGAA
GTCTTTGACCTTGAGCTCCTTAGGTACCAAAACGTCGAGGAGGACATGGTCCAGCTATTG
CAAGTTGCAGTTGATTGCACTGCTCAGTACCCGGACAGACGCCCTTCAATGGCCGAGGTC
ACTACTCGCGTTGAAGAACTCTGTCGTATGGATTCTGGAGGTGGTGACATAATTGACAAT
GATGCAGAAGTGCAAACTGCATGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400027450
PEP Infomation

pacid=37464335 transcript=PGSC0003DMT400040459 locus=PGSC0003DMG400015666 ID=PGSC0003DMT400040459.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MSSKILFLFTISVSIFTLFLPTNSDIVSDRATLLSIRSALRGRSLLWNITSPTCSWPGVI
CSPDKSSVLELHLPGMGLLGQIPPGLFSNLTKLNFLSLRYNALSGVIPADLFTSLHDLRN
LYLQNNLFSGPIPDSIFSLTNLVRLNLAHNNFSGSIPESFNNLTSLGTLYLQGNGFSGQI
PDLNLPGMVQFNVSNNQLNGSIPSKLAGQPKDAFLGTSLCGKPLDSCDGSSSSSSSIGEG
KKKKLSGGAIAGIVIGCVVGLLLLLCLLFFCCRKRGKKETRSADVGAVSKQVEVEMPEER
GVESNGGKDGFLGSAIAAIGVGGGNKDKGKAEAVVNDGKSLVFFGKMAKNFNLDDLLKAS
AEVLGKGTFGTAYKAALESGITLVVKRLRDVTVPEKEFREKIEDVGKMNHENLVPLRAYY
YSRDEKLLVYDYISMGSLSALLHGNKGAGRTPLNWETRAGIALGAAHGIAYLHAQGPSVS
HGNIKSSNILLTKSYEARVSDFGLAQLVGPSSTPNRVAGYRAPEVTDPRKVSQKADVYSF
GVLLLELLTGKAPTHSVLNEEGVDLPRWVQSVVREEWTAEVFDLELLRYQNVEEDMVQLL
QVAVDCTAQYPDRRPSMAEVTTRVEELCRMDSGGGDIIDNDAEVQTA*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400040459
Transcript Infomation

pacid=37464335 locus=PGSC0003DMG400015666 ID=PGSC0003DMT400040459.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAGCTCAAAAATCTTGTTTTTATTCACCATTTCTGTATCAATTTTCACTCTTTTCTTG
CCGACAAACTCCGACATTGTTTCCGATCGAGCTACCCTTTTATCTATCCGATCTGCTCTT
CGTGGACGTTCACTTTTATGGAATATCACAAGTCCAACTTGTTCATGGCCTGGTGTTATT
TGTTCACCTGATAAATCTTCTGTTTTAGAGCTTCATCTACCTGGAATGGGACTTTTAGGC
CAAATCCCACCTGGGCTTTTCTCAAATTTGACTAAATTGAACTTTCTCAGTCTCCGGTAT
AATGCACTTTCCGGTGTAATTCCGGCGGACTTGTTTACTTCACTTCATGATTTGCGTAAC
TTGTACCTTCAAAATAATCTATTTTCCGGTCCAATTCCTGATTCAATCTTCTCTCTTACC
AATCTTGTCCGCCTTAATCTTGCTCATAACAATTTCTCCGGTTCAATACCGGAATCTTTC
AACAATTTGACTAGTTTGGGTACACTTTACTTGCAGGGAAATGGGTTTTCGGGTCAGATA
CCGGATCTGAATTTACCTGGTATGGTTCAGTTCAATGTATCGAATAATCAGCTAAACGGG
TCAATTCCTAGTAAACTTGCGGGTCAACCCAAGGATGCTTTTTTGGGTACTTCACTTTGT
GGTAAGCCACTTGATTCATGTGATGGTAGTAGTAGTAGTAGTAGTAGTATTGGAGAAGGT
AAAAAGAAGAAACTTTCTGGTGGAGCAATTGCTGGTATAGTAATTGGTTGTGTTGTTGGT
TTGCTTTTGCTTCTTTGTTTGCTGTTTTTCTGTTGTAGAAAAAGGGGTAAAAAAGAAACA
AGATCTGCTGATGTTGGTGCTGTTAGTAAGCAGGTTGAAGTTGAAATGCCTGAAGAAAGA
GGGGTTGAGAGTAATGGTGGAAAAGATGGATTCTTGGGTAGTGCAATTGCAGCTATTGGT
GTTGGAGGGGGTAATAAGGATAAAGGTAAAGCTGAGGCTGTTGTAAATGATGGAAAAAGT
TTGGTGTTTTTTGGGAAAATGGCCAAAAATTTCAATTTGGATGATTTGTTGAAAGCTTCT
GCTGAAGTTTTGGGAAAAGGGACATTTGGTACTGCTTATAAAGCTGCTTTGGAATCAGGG
ATTACATTAGTTGTGAAGAGATTGAGAGATGTTACTGTACCTGAGAAGGAGTTTAGAGAG
AAAATTGAAGATGTTGGGAAAATGAATCATGAGAATTTGGTTCCTTTGAGAGCTTATTAT
TATAGCAGAGATGAGAAGCTTCTTGTTTATGATTACATCTCAATGGGAAGCCTTTCTGCA
CTTTTACATGGCAACAAAGGAGCAGGTAGGACACCGTTGAATTGGGAAACAAGGGCTGGC
ATTGCCCTTGGAGCTGCACACGGGATTGCCTACCTTCATGCACAAGGGCCCTCAGTATCA
CATGGCAACATTAAGTCATCCAATATCCTCCTCACCAAATCATACGAGGCCCGTGTTTCA
GATTTTGGCCTTGCTCAACTCGTCGGTCCATCATCAACTCCCAACCGTGTTGCAGGTTAC
AGGGCACCAGAGGTAACTGACCCTCGTAAAGTCTCCCAGAAAGCAGATGTCTACAGCTTT
GGTGTCTTGTTGTTGGAACTTCTAACAGGGAAGGCTCCCACACATTCGGTACTGAATGAG
GAAGGTGTCGACCTACCAAGATGGGTGCAATCAGTGGTACGAGAGGAATGGACAGCCGAA
GTCTTTGACCTTGAGCTCCTTAGGTACCAAAACGTCGAGGAGGACATGGTCCAGCTATTG
CAAGTTGCAGTTGATTGCACTGCTCAGTACCCGGACAGACGCCCTTCAATGGCCGAGGTC
ACTACTCGCGTTGAAGAACTCTGTCGTATGGATTCTGGAGGTGGTGACATAATTGACAAT
GATGCAGAAGTGCAAACTGCATGA