Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID	PGSC0003DMT400039802
CDS Infomation	pacid=37448002 polypeptide=PGSC0003DMP400026974 locus=PGSC0003DMG400015382 ID=PGSC0003DMT400039802.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGACTCGATGAAGAAGAGGAAGCTTGAGGACAACGGCGTCGTCACTGACGTTCCTGTT GCGAGTAGGCTTTCAATCGAAGATGCCCGGAAGATTCTTGAATCTGTTACACCAGAACAA ATGTTAGAAATCTTACAAAATGCTGTCGTTCGTCATCCTGACGTGCTTGATCAAGTTCGA GAAATCGTCGATCGTGACGCTACTAAAAGAAAGCTCTTTGTTCGTGGGCTTGGCTGGGAA ACTACCACTGAAAAAATCAGGTCAATTTTTGGGACATTCGGTGAGTTAGAAGAAGCTGTT GTTATTCTCGATAAAAATACTGGGAAGAGCAAAGGTTATGGATTTGTTACGTTTAAGCAT GTTGATGGAGCTTTACTTGCGTTAAAGCAACCGAGTAAACATATTGATGGTCGAGTTACG GTCACTCAGCTTGCTTCAGCTGGGATTCAAGGTGGGCCAGGTGGTGGGAGTTCGAATAAT CCAGTGGATGTGTCGTTGAGGAAGATTTATGTATCTAATGTGCCGTATGATATGCAGTCC GAGAGGATTTTACAGCATTTTTTGATGTATGGGGAGATAGAGGAAGGACCGTTAGGGTTT GATAAGGCCACTGGGAAGTCAAAAGGGTATGCGTTGTTTGTGTACAAGACAGCGGAGGCA GCACAGTCTTCGTTGGTGGATCCTGTTAAGAATATTGATGGGCATCAATTGAACTGTAAG CTGGCTATTGATGGGAAGAAAAAGCCTGGTGTAGGAGGTCCAGGAGGAGCTCAGGTCCAA ACAGATGGACATGGTGATCCGATGGGTCCTGGGCAATATGGTGCGCCTAGTGGTTATGGT GGATTTTCAGGGCATTCTTCATATGGAGGGTATGGACATGGTCCCAATTCGGCATTGGCT AGTGGAAATGGTATTGGTGTGGGTGGTCCTGGTGGTTCATCTTATGGGAACCAATCTGTG GGTGGTGGGTACGGTTCAGGGATTGGTGGTCCATATGGCGGGGGGTCTCATTATGGTGGG GCTGGTTCAGCTGGATATGGCGGGTTGACCGGAGGTGCTGCTGCTGGCGGTGGTGGTTAT AGCGGTGCTGGGGCATTGGGAGGTGCTGGTGGTGGACTACCTGGTGCTGGTAGTACATTA GGTGGTGCTGGCCGTGGATCTTCAATGTATGGGCAACCCCCAAGCTCAGCCGGGATGCCA TCAGGAGATTATCCACCACAGGGTTCTCATTACGGTTCTTTACATCAACCTCACGGGCTA CAAAACCAAGGCCCCGGGGCATCAGCTGCACCTAGAGTTGCACCTGGGGGTATGTACCAG GGGATGCATTCATATTACTGA

Peptide Sequence

PEP ID	PGSC0003DMP400026974
PEP Infomation	pacid=37448002 transcript=PGSC0003DMT400039802 locus=PGSC0003DMG400015382 ID=PGSC0003DMT400039802.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	MDSMKKRKLEDNGVVTDVPVASRLSIEDARKILESVTPEQMLEILQNAVVRHPDVLDQVR EIVDRDATKRKLFVRGLGWETTTEKIRSIFGTFGELEEAVVILDKNTGKSKGYGFVTFKH VDGALLALKQPSKHIDGRVTVTQLASAGIQGGPGGGSSNNPVDVSLRKIYVSNVPYDMQS ERILQHFLMYGEIEEGPLGFDKATGKSKGYALFVYKTAEAAQSSLVDPVKNIDGHQLNCK LAIDGKKKPGVGGPGGAQVQTDGHGDPMGPGQYGAPSGYGGFSGHSSYGGYGHGPNSALA SGNGIGVGGPGGSSYGNQSVGGGYGSGIGGPYGGGSHYGGAGSAGYGGLTGGAAAGGGGY SGAGALGGAGGGLPGAGSTLGGAGRGSSMYGQPPSSAGMPSGDYPPQGSHYGSLHQPHGL QNQGPGASAAPRVAPGGMYQGMHSYY*

Transcript Sequence

Transcript ID	PGSC0003DMT400039802
Transcript Infomation	pacid=37448002 locus=PGSC0003DMG400015382 ID=PGSC0003DMT400039802.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGACTCGATGAAGAAGAGGAAGCTTGAGGACAACGGCGTCGTCACTGACGTTCCTGTT GCGAGTAGGCTTTCAATCGAAGATGCCCGGAAGATTCTTGAATCTGTTACACCAGAACAA ATGTTAGAAATCTTACAAAATGCTGTCGTTCGTCATCCTGACGTGCTTGATCAAGTTCGA GAAATCGTCGATCGTGACGCTACTAAAAGAAAGCTCTTTGTTCGTGGGCTTGGCTGGGAA ACTACCACTGAAAAAATCAGGTCAATTTTTGGGACATTCGGTGAGTTAGAAGAAGCTGTT GTTATTCTCGATAAAAATACTGGGAAGAGCAAAGGTTATGGATTTGTTACGTTTAAGCAT GTTGATGGAGCTTTACTTGCGTTAAAGCAACCGAGTAAACATATTGATGGTCGAGTTACG GTCACTCAGCTTGCTTCAGCTGGGATTCAAGGTGGGCCAGGTGGTGGGAGTTCGAATAAT CCAGTGGATGTGTCGTTGAGGAAGATTTATGTATCTAATGTGCCGTATGATATGCAGTCC GAGAGGATTTTACAGCATTTTTTGATGTATGGGGAGATAGAGGAAGGACCGTTAGGGTTT GATAAGGCCACTGGGAAGTCAAAAGGGTATGCGTTGTTTGTGTACAAGACAGCGGAGGCA GCACAGTCTTCGTTGGTGGATCCTGTTAAGAATATTGATGGGCATCAATTGAACTGTAAG CTGGCTATTGATGGGAAGAAAAAGCCTGGTGTAGGAGGTCCAGGAGGAGCTCAGGTCCAA ACAGATGGACATGGTGATCCGATGGGTCCTGGGCAATATGGTGCGCCTAGTGGTTATGGT GGATTTTCAGGGCATTCTTCATATGGAGGGTATGGACATGGTCCCAATTCGGCATTGGCT AGTGGAAATGGTATTGGTGTGGGTGGTCCTGGTGGTTCATCTTATGGGAACCAATCTGTG GGTGGTGGGTACGGTTCAGGGATTGGTGGTCCATATGGCGGGGGGTCTCATTATGGTGGG GCTGGTTCAGCTGGATATGGCGGGTTGACCGGAGGTGCTGCTGCTGGCGGTGGTGGTTAT AGCGGTGCTGGGGCATTGGGAGGTGCTGGTGGTGGACTACCTGGTGCTGGTAGTACATTA GGTGGTGCTGGCCGTGGATCTTCAATGTATGGGCAACCCCCAAGCTCAGCCGGGATGCCA TCAGGAGATTATCCACCACAGGGTTCTCATTACGGTTCTTTACATCAACCTCACGGGCTA CAAAACCAAGGCCCCGGGGCATCAGCTGCACCTAGAGTTGCACCTGGGGGTATGTACCAG GGGATGCATTCATATTACTGA